Bdellovibrio bacteriovorus HD100 [gbbct]: 3583 CDS's (1172532 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 19.5( 22893)  UCU 13.3( 15640)  UAU 16.5( 19376)  UGU  4.1(  4810)
UUC 25.2( 29526)  UCC 19.8( 23237)  UAC 14.0( 16362)  UGC  5.5(  6409)
UUA  3.9(  4612)  UCA  6.5(  7609)  UAA  1.6(  1836)  UGA  0.6(   684)
UUG 23.8( 27956)  UCG  8.0(  9424)  UAG  0.9(  1063)  UGG 12.0( 14116)

CUU 17.0( 19988)  CCU  9.1( 10632)  CAU  7.9(  9236)  CGU 14.8( 17384)
CUC  3.8(  4500)  CCC  7.6(  8932)  CAC 11.1( 12967)  CGC 20.3( 23764)
CUA  2.6(  3090)  CCA  7.7(  9017)  CAA 13.7( 16029)  CGA  3.0(  3521)
CUG 46.5( 54576)  CCG 17.5( 20494)  CAG 25.7( 30143)  CGG  3.6(  4169)

AUU 20.5( 24005)  ACU 13.1( 15409)  AAU 17.9( 20967)  AGU  8.2(  9593)
AUC 33.4( 39168)  ACC 21.2( 24881)  AAC 23.4( 27421)  AGC 13.3( 15564)
AUA  2.0(  2324)  ACA  9.4( 10985)  AAA 41.0( 48106)  AGA  4.6(  5364)
AUG 26.1( 30562)  ACG 11.8( 13809)  AAG 24.2( 28355)  AGG  1.3(  1536)

GUU 18.2( 21325)  GCU 18.8( 22041)  GAU 26.4( 30934)  GGU 22.2( 26068)
GUC 15.3( 17997)  GCC 30.9( 36212)  GAC 24.8( 29047)  GGC 26.9( 31532)
GUA  4.6(  5427)  GCA 12.4( 14581)  GAA 42.8( 50211)  GGA 11.8( 13894)
GUG 33.1( 38779)  GCG 22.4( 26293)  GAG 19.9( 23300)  GGG 11.0( 12847)

Coding GC 51.01% 1st letter GC 55.34% 2nd letter GC 39.27% 3rd letter GC 58.42%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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