Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10 [gbbct]: 4353 CDS's (1474502 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU  2.6(  3815)  UCU  0.8(  1243)  UAU  3.8(  5545)  UGU  1.1(  1567)
UUC 26.7( 39402)  UCC 12.7( 18772)  UAC 17.5( 25744)  UGC  7.5( 11069)
UUA  0.5(   721)  UCA  1.5(  2242)  UAA  0.3(   461)  UGA  1.9(  2755)
UUG 10.7( 15842)  UCG 20.4( 30041)  UAG  0.8(  1137)  UGG 14.8( 21881)

CUU  2.5(  3622)  CCU  1.5(  2153)  CAU  4.1(  5981)  CGU  4.2(  6211)
CUC 17.2( 25296)  CCC 20.3( 29958)  CAC 19.1( 28155)  CGC 36.4( 53620)
CUA  1.0(  1475)  CCA  2.1(  3084)  CAA  5.1(  7469)  CGA  4.2(  6172)
CUG 66.5( 98115)  CCG 37.6( 55431)  CAG 25.9( 38133)  CGG 30.4( 44837)

AUU  2.8(  4075)  ACU  1.4(  2079)  AAU  2.6(  3852)  AGU  1.7(  2480)
AUC 37.2( 54840)  ACC 38.9( 57409)  AAC 19.2( 28342)  AGC 15.1( 22262)
AUA  0.8(  1115)  ACA  2.0(  2902)  AAA  3.9(  5694)  AGA  0.6(   930)
AUG 18.6( 27383)  ACG 15.0( 22076)  AAG 17.4( 25624)  AGG  2.1(  3050)

GUU  3.2(  4791)  GCU  3.8(  5551)  GAU  9.1( 13435)  GGU  9.5( 14065)
GUC 34.7( 51197)  GCC 70.6(104061)  GAC 52.0( 76703)  GGC 54.5( 80387)
GUA  1.4(  2132)  GCA  5.6(  8269)  GAA 13.4( 19701)  GGA  6.3(  9245)
GUG 45.9( 67737)  GCG 54.0( 79613)  GAG 36.5( 53752)  GGG 18.9( 27801)
Coding GC 69.65% 1st letter GC 69.73% 2nd letter GC 49.73% 3rd letter GC 89.50%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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