Bordetella pertussis Tohama I [gbbct]: 3447 CDS's (1130431 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  4.0(  4507)  UCU  0.7(   803)  UAU  6.7(  7596)  UGU  1.0(  1121)
UUC 28.7( 32458)  UCC  9.8( 11106)  UAC 17.9( 20243)  UGC  8.0(  8987)
UUA  0.2(   242)  UCA  0.8(   894)  UAA  0.5(   521)  UGA  1.9(  2100)
UUG  8.5(  9638)  UCG 19.0( 21512)  UAG  0.7(   826)  UGG 14.2( 15998)

CUU  2.0(  2240)  CCU  2.5(  2874)  CAU  8.0(  9052)  CGU  4.9(  5551)
CUC 12.3( 13866)  CCC 20.2( 22876)  CAC 15.9( 17944)  CGC 54.8( 61946)
CUA  1.2(  1340)  CCA  1.5(  1700)  CAA  6.6(  7479)  CGA  2.4(  2716)
CUG 82.9( 93673)  CCG 29.1( 32859)  CAG 34.5( 39056)  CGG 12.2( 13749)

AUU  4.1(  4606)  ACU  1.3(  1444)  AAU  5.4(  6140)  AGU  1.1(  1209)
AUC 38.2( 43165)  ACC 28.6( 32322)  AAC 19.1( 21637)  AGC 17.3( 19539)
AUA  1.4(  1626)  ACA  1.1(  1286)  AAA  4.0(  4539)  AGA  0.5(   581)
AUG 23.2( 26222)  ACG 17.4( 19623)  AAG 23.1( 26138)  AGG  1.5(  1711)

GUU  2.9(  3244)  GCU  4.2(  4747)  GAU 12.9( 14606)  GGU  4.2(  4692)
GUC 27.7( 31289)  GCC 75.9( 85790)  GAC 40.2( 45389)  GGC 67.0( 75728)
GUA  2.9(  3244)  GCA  4.3(  4815)  GAA 20.0( 22651)  GGA  3.5(  4003)
GUG 42.9( 48487)  GCG 51.4( 58057)  GAG 29.2( 33046)  GGG 10.1( 11382)

Coding GC 68.12% 1st letter GC 69.01% 2nd letter GC 47.21% 3rd letter GC 88.13%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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