Nocardia farcinica IFM 10152 [gbbct]: 5936 CDS's (1891876 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  0.6(  1136)  UCU  0.5(   956)  UAU  2.6(  4897)  UGU  0.9(  1723)
UUC 27.5( 52117)  UCC 13.3( 25158)  UAC 17.7( 33398)  UGC  6.6( 12460)
UUA  0.2(   292)  UCA  0.9(  1779)  UAA  0.1(   215)  UGA  2.6(  4840)
UUG  7.1( 13503)  UCG 17.2( 32580)  UAG  0.5(   881)  UGG 14.6( 27705)

CUU  1.0(  1972)  CCU  1.2(  2217)  CAU  3.2(  6019)  CGU  5.0(  9544)
CUC 31.4( 59436)  CCC 22.4( 42372)  CAC 19.1( 36185)  CGC 42.5( 80369)
CUA  0.8(  1499)  CCA  1.8(  3344)  CAA  2.5(  4721)  CGA  3.6(  6774)
CUG 60.6(114741)  CCG 36.5( 69070)  CAG 24.4( 46188)  CGG 27.3( 51620)

AUU  1.3(  2486)  ACU  1.2(  2191)  AAU  2.0(  3841)  AGU  1.7(  3306)
AUC 35.5( 67169)  ACC 45.2( 85486)  AAC 15.8( 29918)  AGC 12.8( 24148)
AUA  0.4(   712)  ACA  1.8(  3479)  AAA  2.3(  4433)  AGA  0.6(  1112)
AUG 17.0( 32230)  ACG 13.1( 24752)  AAG 15.7( 29775)  AGG  3.0(  5693)

GUU  1.8(  3366)  GCU  3.1(  5868)  GAU 10.0( 18948)  GGU 11.6( 21911)
GUC 37.4( 70732)  GCC 72.4(136907)  GAC 50.9( 96274)  GGC 56.3(106582)
GUA  1.5(  2895)  GCA  5.9( 11163)  GAA 14.2( 26805)  GGA  5.7( 10858)
GUG 47.0( 89005)  GCG 59.8(113090)  GAG 41.3( 78132)  GGG 15.3( 28898)

Coding GC 71.04% 1st letter GC 71.75% 2nd letter GC 50.64% 3rd letter GC 90.73%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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