Vibrio cholerae O1 biovar eltor str. N16961 [gbbct]: 3828 CDS's (1166034 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 26.8( 31200)  UCU 11.3( 13152)  UAU 15.8( 18397)  UGU  6.0(  6992)
UUC 13.9( 16177)  UCC  5.9(  6928)  UAC 13.7( 16015)  UGC  4.5(  5254)
UUA 20.0( 23273)  UCA 10.7( 12437)  UAA  2.0(  2343)  UGA  0.7(   818)
UUG 23.5( 27380)  UCG  9.3( 10882)  UAG  0.6(   667)  UGG 13.2( 15367)

CUU 12.8( 14896)  CCU 11.1( 12969)  CAU 13.1( 15320)  CGU 19.8( 23060)
CUC 14.9( 17382)  CCC  6.0(  7016)  CAC 10.8( 12577)  CGC 17.6( 20472)
CUA  8.8( 10256)  CCA 12.2( 14232)  CAA 33.5( 39070)  CGA  5.2(  6021)
CUG 28.8( 33545)  CCG 10.7( 12474)  CAG 18.1( 21072)  CGG  2.8(  3229)

AUU 31.0( 36179)  ACU 12.9( 15037)  AAU 19.6( 22830)  AGU 11.9( 13820)
AUC 25.0( 29119)  ACC 20.1( 23387)  AAC 19.3( 22546)  AGC 14.0( 16370)
AUA  4.2(  4916)  ACA  7.7(  9023)  AAA 35.9( 41814)  AGA  2.9(  3399)
AUG 26.2( 30543)  ACG 11.0( 12865)  AAG 13.3( 15530)  AGG  1.1(  1317)

GUU 16.0( 18660)  GCU 20.1( 23414)  GAU 36.4( 42462)  GGU 25.8( 30136)
GUC 14.4( 16805)  GCC 21.7( 25301)  GAC 13.6( 15840)  GGC 24.2( 28212)
GUA 11.0( 12829)  GCA 18.9( 21985)  GAA 37.9( 44220)  GGA  7.8(  9133)
GUG 29.0( 33839)  GCG 30.5( 35602)  GAG 23.9( 27831)  GGG  8.7( 10197)

Coding GC 48.09% 1st letter GC 56.61% 2nd letter GC 38.64% 3rd letter GC 49.03%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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