Deinococcus radiodurans R1 [gbbct]: 3106 CDS's (960935 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 10.8( 10361)  UCU  2.4(  2303)  UAU  3.9(  3745)  UGU  1.2(  1169)
UUC 20.7( 19905)  UCC  7.7(  7399)  UAC 19.1( 18347)  UGC  5.5(  5295)
UUA  0.8(   772)  UCA  1.9(  1817)  UAA  0.8(   799)  UGA  2.1(  1988)
UUG  7.7(  7362)  UCG 11.5( 11067)  UAG  0.3(   319)  UGG 13.8( 13299)

CUU  5.3(  5051)  CCU  5.5(  5248)  CAU  3.5(  3351)  CGU  7.0(  6691)
CUC 33.8( 32492)  CCC 27.0( 25936)  CAC 17.4( 16685)  CGC 40.2( 38620)
CUA  1.5(  1445)  CCA  3.2(  3101)  CAA  7.3(  6969)  CGA  2.4(  2311)
CUG 67.4( 64735)  CCG 24.7( 23709)  CAG 33.8( 32526)  CGG 20.6( 19779)

AUU 10.1(  9665)  ACU  3.8(  3667)  AAU  3.8(  3632)  AGU  4.6(  4459)
AUC 21.8( 20966)  ACC 34.5( 33146)  AAC 20.3( 19475)  AGC 23.8( 22842)
AUA  0.9(   829)  ACA  2.3(  2177)  AAA  8.0(  7690)  AGA  1.2(  1147)
AUG 17.6( 16952)  ACG 17.4( 16684)  AAG 19.2( 18497)  AGG  2.3(  2209)

GUU  3.9(  3716)  GCU  9.2(  8798)  GAU  5.7(  5432)  GGU  7.5(  7226)
GUC 23.3( 22368)  GCC 59.0( 56683)  GAC 44.7( 42970)  GGC 57.7( 55433)
GUA  2.4(  2314)  GCA  6.5(  6279)  GAA 25.1( 24152)  GGA  5.7(  5446)
GUG 47.9( 46018)  GCG 46.7( 44878)  GAG 32.0( 30715)  GGG 20.7( 19874)
Coding GC 67.25% 1st letter GC 69.82% 2nd letter GC 47.94% 3rd letter GC 84.00%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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