Geobacillus kaustophilus HTA426 [gbbct]: 3540 CDS's (1017788 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 27.1( 27603)  UCU  4.1(  4167)  UAU 18.7( 19028)  UGU  2.5(  2569)
UUC 14.4( 14653)  UCC  8.4(  8597)  UAC 14.9( 15142)  UGC  6.1(  6226)
UUA 10.0( 10165)  UCA  5.1(  5189)  UAA  1.6(  1584)  UGA  1.3(  1368)
UUG 29.3( 29805)  UCG 15.6( 15872)  UAG  0.6(   588)  UGG 12.9( 13156)

CUU 18.9( 19193)  CCU  4.1(  4169)  CAU 15.3( 15544)  CGU  7.2(  7285)
CUC 18.0( 18305)  CCC  3.6(  3696)  CAC  7.9(  7992)  CGC 26.2( 26624)
CUA  3.1(  3160)  CCA  6.6(  6735)  CAA 22.2( 22581)  CGA  5.7(  5825)
CUG 20.3( 20617)  CCG 28.3( 28815)  CAG 14.3( 14581)  CGG 16.1( 16429)

AUU 27.9( 28381)  ACU  3.1(  3200)  AAU 11.8( 11968)  AGU  3.0(  3081)
AUC 32.7( 33294)  ACC 10.0( 10145)  AAC 19.1( 19424)  AGC 12.8( 13068)
AUA  2.9(  2941)  ACA  9.0(  9134)  AAA 38.8( 39488)  AGA  3.2(  3233)
AUG 25.6( 26077)  ACG 27.5( 27986)  AAG 17.4( 17716)  AGG  2.4(  2406)

GUU 12.8( 13053)  GCU 12.0( 12260)  GAU 25.2( 25672)  GGU  6.9(  6992)
GUC 29.9( 30438)  GCC 30.2( 30710)  GAC 23.2( 23606)  GGC 32.3( 32874)
GUA  5.6(  5716)  GCA  9.4(  9522)  GAA 44.3( 45105)  GGA 14.6( 14897)
GUG 28.0( 28500)  GCG 40.2( 40954)  GAG 29.6( 30116)  GGG 18.2( 18568)

Coding GC 52.84% 1st letter GC 58.02% 2nd letter GC 38.88% 3rd letter GC 61.60%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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