Haemophilus ducreyi 35000HP [gbbct]: 1717 CDS's (482032 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 34.0( 16378)  UCU 11.4(  5477)  UAU 25.9( 12463)  UGU  7.6(  3655)
UUC  9.0(  4335)  UCC  3.4(  1618)  UAC  6.0(  2887)  UGC  3.0(  1469)
UUA 58.7( 28299)  UCA 15.0(  7242)  UAA  2.6(  1271)  UGA  0.3(   163)
UUG 15.5(  7476)  UCG  4.7(  2288)  UAG  0.6(   283)  UGG 11.0(  5288)

CUU 12.8(  6156)  CCU 11.3(  5424)  CAU 15.3(  7378)  CGU 21.1( 10163)
CUC  4.3(  2095)  CCC  3.7(  1773)  CAC  6.8(  3261)  CGC 10.2(  4923)
CUA  9.8(  4747)  CCA 13.7(  6584)  CAA 41.6( 20074)  CGA  5.4(  2620)
CUG  4.8(  2337)  CCG  7.8(  3754)  CAG  9.4(  4550)  CGG  3.4(  1623)

AUU 50.1( 24127)  ACU 16.0(  7702)  AAU 36.8( 17756)  AGU 13.4(  6439)
AUC 14.0(  6759)  ACC 12.0(  5774)  AAC 11.0(  5304)  AGC  9.4(  4555)
AUA  8.4(  4064)  ACA 15.8(  7605)  AAA 52.5( 25304)  AGA  4.2(  2024)
AUG 24.1( 11631)  ACG 10.5(  5046)  AAG  9.1(  4391)  AGG  1.1(   525)

GUU 21.7( 10453)  GCU 23.1( 11142)  GAU 40.7( 19618)  GGU 28.7( 13823)
GUC  8.6(  4153)  GCC 13.0(  6257)  GAC  8.0(  3874)  GGC 19.0(  9145)
GUA 18.4(  8867)  GCA 31.5( 15190)  GAA 48.4( 23316)  GGA  8.0(  3840)
GUG 15.9(  7657)  GCG 18.2(  8771)  GAG 11.8(  5678)  GGG  6.6(  3188)
Coding GC 38.74% 1st letter GC 50.29% 2nd letter GC 36.32% 3rd letter GC 29.60%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
Homepage