Acidovorax sp. JS42 [gbbct]: 4156 CDS's (1342062 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  7.0(  9436)  UCU  2.0(  2676)  UAU  4.8(  6487)  UGU  1.0(  1293)
UUC 25.7( 34536)  UCC 11.1( 14860)  UAC 16.9( 22641)  UGC  8.8( 11812)
UUA  0.5(   682)  UCA  1.8(  2354)  UAA  0.5(   686)  UGA  2.2(  3015)
UUG 10.1( 13525)  UCG 13.1( 17571)  UAG  0.3(   455)  UGG 15.3( 20584)

CUU  3.8(  5146)  CCU  4.3(  5756)  CAU  6.8(  9136)  CGU  6.6(  8910)
CUC 16.5( 22141)  CCC 24.0( 32239)  CAC 17.7( 23764)  CGC 49.7( 66707)
CUA  1.4(  1906)  CCA  3.6(  4870)  CAA  8.0( 10753)  CGA  2.3(  3078)
CUG 75.1(100802)  CCG 22.1( 29679)  CAG 37.2( 49968)  CGG 11.1( 14947)

AUU  5.7(  7610)  ACU  2.1(  2857)  AAU  4.2(  5578)  AGU  2.3(  3088)
AUC 33.8( 45323)  ACC 26.4( 35447)  AAC 20.0( 26888)  AGC 19.6( 26288)
AUA  1.0(  1330)  ACA  2.7(  3667)  AAA  5.0(  6676)  AGA  0.7(   923)
AUG 24.3( 32547)  ACG 19.8( 26522)  AAG 27.0( 36239)  AGG  1.5(  2076)

GUU  3.6(  4875)  GCU  7.6( 10152)  GAU 11.9( 15920)  GGU  8.0( 10729)
GUC 17.0( 22828)  GCC 65.2( 87551)  GAC 39.3( 52705)  GGC 58.5( 78512)
GUA  3.1(  4135)  GCA 12.2( 16411)  GAA 17.6( 23630)  GGA  4.0(  5330)
GUG 51.9( 69674)  GCG 46.7( 62717)  GAG 35.1( 47085)  GGG 10.7( 14334)

Coding GC 66.72% 1st letter GC 68.28% 2nd letter GC 46.72% 3rd letter GC 85.16%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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