Rat coronavirus [gbvrl]: 6 CDS's (2649 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 41.5(   110)  UCU 21.9(    58)  UAU 52.1(   138)  UGU 19.3(    51)
UUC 16.2(    43)  UCC 11.7(    31)  UAC  8.7(    23)  UGC 11.3(    30)
UUA 20.8(    55)  UCA  9.8(    26)  UAA  2.3(     6)  UGA  0.0(     0)
UUG 22.3(    59)  UCG  6.4(    17)  UAG  0.0(     0)  UGG 11.3(    30)

CUU 18.1(    48)  CCU 20.0(    53)  CAU 14.7(    39)  CGU  7.6(    20)
CUC 10.2(    27)  CCC 14.3(    38)  CAC  5.7(    15)  CGC  6.0(    16)
CUA 12.1(    32)  CCA  9.8(    26)  CAA 14.7(    39)  CGA  3.8(    10)
CUG 12.8(    34)  CCG  6.8(    18)  CAG 21.9(    58)  CGG  1.1(     3)

AUU 21.5(    57)  ACU 21.9(    58)  AAU 52.5(   139)  AGU 21.9(    58)
AUC  5.7(    15)  ACC 13.2(    35)  AAC 15.1(    40)  AGC 13.2(    35)
AUA 14.7(    39)  ACA 11.3(    30)  AAA 18.1(    48)  AGA  6.4(    17)
AUG 18.9(    50)  ACG  3.4(     9)  AAG 25.3(    67)  AGG 14.3(    38)

GUU 28.7(    76)  GCU 29.8(    79)  GAU 34.4(    91)  GGU 32.5(    86)
GUC  8.7(    23)  GCC 16.6(    44)  GAC 22.3(    59)  GGC 19.6(    52)
GUA 15.1(    40)  GCA  9.4(    25)  GAA 16.6(    44)  GGA 16.2(    43)
GUG 14.0(    37)  GCG  5.3(    14)  GAG 11.7(    31)  GGG  6.4(    17)

Coding GC 41.68% 1st letter GC 46.70% 2nd letter GC 40.28% 3rd letter GC 38.05%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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