Lactobacillus plantarum WCFS1 [gbbct]: 3057 CDS's (934462 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 25.8( 24142)  UCU  6.4(  5943)  UAU 21.5( 20111)  UGU  3.4(  3206)
UUC 13.7( 12804)  UCC  5.1(  4787)  UAC 13.6( 12664)  UGC  1.7(  1574)
UUA 33.4( 31184)  UCA 12.9( 12076)  UAA  1.9(  1765)  UGA  0.6(   524)
UUG 25.3( 23642)  UCG  7.5(  7014)  UAG  0.8(   768)  UGG 11.8( 10982)

CUU  8.9(  8337)  CCU  6.4(  5965)  CAU 13.7( 12777)  CGU 11.7( 10893)
CUC  8.7(  8136)  CCC  5.6(  5240)  CAC 10.0(  9310)  CGC  8.8(  8231)
CUA 11.5( 10782)  CCA 15.6( 14618)  CAA 33.5( 31319)  CGA  7.1(  6615)
CUG 12.3( 11457)  CCG 10.2(  9509)  CAG 18.8( 17567)  CGG 12.9( 12049)

AUU 41.1( 38362)  ACU 17.4( 16256)  AAU 26.6( 24810)  AGU 17.4( 16279)
AUC 21.4( 19976)  ACC 15.9( 14820)  AAC 17.5( 16316)  AGC  8.5(  7905)
AUA  2.9(  2752)  ACA 12.5( 11713)  AAA 25.9( 24202)  AGA  1.7(  1580)
AUG 26.1( 24430)  ACG 24.9( 23253)  AAG 25.6( 23944)  AGG  0.8(   775)

GUU 26.9( 25174)  GCU 24.6( 23015)  GAU 37.2( 34765)  GGU 26.4( 24694)
GUC 20.8( 19443)  GCC 23.7( 22141)  GAC 19.2( 17910)  GGC 17.3( 16175)
GUA  8.8(  8223)  GCA 21.2( 19850)  GAA 33.9( 31668)  GGA 10.0(  9347)
GUG 17.3( 16158)  GCG 22.2( 20727)  GAG 11.0( 10270)  GGG 12.3( 11538)

Coding GC 45.47% 1st letter GC 52.85% 2nd letter GC 38.45% 3rd letter GC 45.11%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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