Streptococcus mutans UA159 [gbbct]: 1960 CDS's (581662 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 38.0( 22094)  UCU 17.4( 10106)  UAU 30.2( 17580)  UGU  4.0(  2347)
UUC  9.4(  5480)  UCC  5.0(  2911)  UAC  8.2(  4767)  UGC  1.7(   965)
UUA 30.6( 17774)  UCA 14.5(  8427)  UAA  2.1(  1210)  UGA  0.7(   385)
UUG 21.5( 12504)  UCG  3.3(  1922)  UAG  0.6(   365)  UGG  8.7(  5049)

CUU 24.0( 13960)  CCU 13.7(  7986)  CAU 15.3(  8894)  CGU 16.4(  9535)
CUC  7.6(  4401)  CCC  3.4(  1950)  CAC  4.2(  2449)  CGC  6.5(  3776)
CUA  7.7(  4457)  CCA 10.5(  6099)  CAA 27.5( 15998)  CGA  3.8(  2211)
CUG  9.9(  5735)  CCG  3.9(  2248)  CAG 13.2(  7663)  CGG  2.3(  1349)

AUU 53.4( 31063)  ACU 19.3( 11201)  AAU 39.0( 22663)  AGU 15.2(  8840)
AUC 15.9(  9245)  ACC  9.9(  5751)  AAC  9.4(  5464)  AGC  7.3(  4236)
AUA  7.9(  4586)  ACA 19.9( 11563)  AAA 51.3( 29825)  AGA  7.4(  4319)
AUG 23.9( 13915)  ACG  7.0(  4045)  AAG 22.7( 13178)  AGG  2.5(  1471)

GUU 34.5( 20087)  GCU 37.0( 21515)  GAU 45.1( 26234)  GGU 27.4( 15921)
GUC 12.1(  7046)  GCC 12.2(  7087)  GAC 11.3(  6570)  GGC 11.7(  6798)
GUA 10.4(  6022)  GCA 19.2( 11188)  GAA 49.2( 28614)  GGA 17.0(  9880)
GUG  8.8(  5126)  GCG  5.9(  3446)  GAG 14.6(  8467)  GGG  6.4(  3699)

Coding GC 37.46% 1st letter GC 49.24% 2nd letter GC 34.08% 3rd letter GC 29.07%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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