Herminiimonas arsenicoxydans [gbbct]: 3349 CDS's (1013629 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 15.7( 15887)  UCU  4.5(  4551)  UAU 13.1( 13238)  UGU  2.5(  2532)
UUC 22.4( 22725)  UCC 11.1( 11293)  UAC 12.1( 12226)  UGC  6.9(  7023)
UUA  4.2(  4234)  UCA  5.3(  5346)  UAA  1.4(  1423)  UGA  1.4(  1449)
UUG 24.1( 24422)  UCG 16.0( 16220)  UAG  0.5(   477)  UGG 12.7( 12870)

CUU  6.9(  6953)  CCU  7.4(  7520)  CAU 13.4( 13552)  CGU 14.3( 14480)
CUC 11.5( 11681)  CCC  7.3(  7431)  CAC  9.2(  9375)  CGC 30.2( 30654)
CUA  3.1(  3155)  CCA  6.7(  6806)  CAA 16.3( 16516)  CGA  3.2(  3205)
CUG 53.7( 54430)  CCG 23.6( 23925)  CAG 24.0( 24375)  CGG  5.8(  5874)

AUU 18.5( 18704)  ACU  7.3(  7361)  AAU 19.0( 19223)  AGU  6.2(  6245)
AUC 32.8( 33221)  ACC 21.3( 21613)  AAC 15.1( 15315)  AGC 15.6( 15814)
AUA  7.4(  7491)  ACA  7.6(  7709)  AAA 22.7( 23057)  AGA  2.4(  2431)
AUG 27.1( 27432)  ACG 17.7( 17940)  AAG 22.2( 22454)  AGG  2.3(  2325)

GUU 10.6( 10704)  GCU 13.6( 13815)  GAU 32.0( 32452)  GGU 18.3( 18574)
GUC 23.6( 23905)  GCC 36.1( 36580)  GAC 20.4( 20666)  GGC 42.9( 43468)
GUA 10.4( 10503)  GCA 28.0( 28427)  GAA 39.2( 39690)  GGA  7.3(  7387)
GUG 26.6( 27013)  GCG 33.9( 34315)  GAG 15.9( 16103)  GGG  5.8(  5844)

Coding GC 55.23% 1st letter GC 60.12% 2nd letter GC 42.52% 3rd letter GC 63.04%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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