Acidobacteria bacterium Ellin345 [gbbct]: 9554 CDS's (3368168 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 10.2( 34478)  UCU  4.4( 14970)  UAU 10.0( 33556)  UGU  2.1(  6908)
UUC 30.2(101600)  UCC 11.8( 39602)  UAC 18.0( 60716)  UGC  7.0( 23430)
UUA  2.4(  7988)  UCA  4.3( 14356)  UAA  0.9(  3162)  UGA  0.8(  2660)
UUG 14.2( 47888)  UCG 19.8( 66848)  UAG  1.1(  3732)  UGG 13.5( 45620)

CUU 11.1( 37222)  CCU  5.7( 19136)  CAU  7.8( 26262)  CGU  8.8( 29696)
CUC 30.8(103812)  CCC 12.7( 42702)  CAC 14.6( 49052)  CGC 30.9(104064)
CUA  3.2( 10796)  CCA  6.2( 20866)  CAA 11.1( 37276)  CGA  5.7( 19228)
CUG 31.8(107198)  CCG 25.5( 85754)  CAG 26.2( 88162)  CGG 10.2( 34222)

AUU 15.3( 51616)  ACU  6.8( 23016)  AAU 11.1( 37368)  AGU  4.9( 16638)
AUC 34.6(116626)  ACC 24.1( 81264)  AAC 24.2( 81546)  AGC 17.1( 57476)
AUA  2.0(  6616)  ACA  5.5( 18426)  AAA 14.3( 48008)  AGA  1.8(  5908)
AUG 22.7( 76580)  ACG 22.1( 74484)  AAG 30.4(102256)  AGG  2.2(  7494)

GUU 12.8( 42986)  GCU 12.4( 41756)  GAU 21.6( 72620)  GGU 11.4( 38426)
GUC 24.1( 81242)  GCC 32.8(110620)  GAC 30.9(103924)  GGC 41.1(138578)
GUA  7.2( 24316)  GCA 15.6( 52660)  GAA 28.7( 96812)  GGA 14.9( 50176)
GUG 31.3(105286)  GCG 43.8(147436)  GAG 28.2( 95076)  GGG 11.3( 37970)

Coding GC 58.88% 1st letter GC 61.02% 2nd letter GC 43.71% 3rd letter GC 71.92%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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