Trichodesmium erythraeum IMS101 [gbbct]: 4475 CDS's (1555193 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 34.0( 52842)  UCU 20.8( 32276)  UAU 26.9( 41878)  UGU  7.3( 11391)
UUC  7.1( 11104)  UCC  5.1(  7900)  UAC  7.2( 11167)  UGC  2.1(  3281)
UUA 45.4( 70580)  UCA 11.6( 18038)  UAA  1.6(  2457)  UGA  0.5(   843)
UUG 19.9( 30933)  UCG  2.6(  4024)  UAG  0.8(  1175)  UGG 14.0( 21761)

CUU 11.8( 18386)  CCU 18.1( 28092)  CAU 12.1( 18762)  CGU 10.1( 15722)
CUC  6.6( 10201)  CCC  6.3(  9755)  CAC  4.1(  6328)  CGC  5.1(  8008)
CUA 14.0( 21800)  CCA 15.1( 23493)  CAA 35.9( 55777)  CGA  6.7( 10490)
CUG  7.5( 11649)  CCG  3.1(  4745)  CAG 12.3( 19125)  CGG  4.3(  6636)

AUU 44.8( 69666)  ACU 27.0( 41997)  AAU 41.4( 64439)  AGU 19.8( 30720)
AUC  9.4( 14601)  ACC  7.1( 11118)  AAC 12.7( 19689)  AGC  6.0(  9288)
AUA 21.4( 33240)  ACA 18.0( 28005)  AAA 49.2( 76449)  AGA 12.1( 18799)
AUG 17.1( 26620)  ACG  2.9(  4476)  AAG 14.9( 23127)  AGG  5.0(  7744)

GUU 24.4( 37931)  GCU 31.2( 48566)  GAU 37.5( 58376)  GGU 27.8( 43301)
GUC  6.5( 10172)  GCC  8.2( 12737)  GAC 12.3( 19203)  GGC  7.2( 11141)
GUA 20.6( 32095)  GCA 21.6( 33588)  GAA 52.1( 81074)  GGA 22.1( 34380)
GUG  9.9( 15361)  GCG  4.7(  7369)  GAG 16.8( 26129)  GGG  8.5( 13173)

Coding GC 36.78% 1st letter GC 48.45% 2nd letter GC 36.19% 3rd letter GC 25.70%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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