Pyrobaculum aerophilum str. IM2 [gbbct]: 2605 CDS's (658445 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 19.3( 12704)  UCU 10.2(  6719)  UAU 17.2( 11344)  UGU  4.0(  2625)
UUC 16.9( 11124)  UCC  8.3(  5435)  UAC 25.7( 16905)  UGC  4.7(  3089)
UUA 20.5( 13469)  UCA  6.9(  4566)  UAA  1.7(  1140)  UGA  1.0(   685)
UUG 18.1( 11894)  UCG  7.6(  5004)  UAG  1.2(   780)  UGG 14.7(  9670)

CUU 14.7(  9686)  CCU  9.7(  6372)  CAU  3.7(  2435)  CGU  3.2(  2082)
CUC 20.0( 13188)  CCC 17.8( 11716)  CAC 11.4(  7474)  CGC  9.0(  5930)
CUA 13.1(  8598)  CCA  8.3(  5448)  CAA 10.1(  6644)  CGA  1.8(  1201)
CUG 19.1( 12580)  CCG 13.9(  9155)  CAG 10.7(  7025)  CGG  5.6(  3712)

AUU 22.5( 14817)  ACU 13.5(  8860)  AAU  9.8(  6465)  AGU  4.0(  2616)
AUC 11.3(  7413)  ACC  7.6(  4981)  AAC 16.1( 10616)  AGC 12.2(  8014)
AUA 28.9( 19023)  ACA 10.6(  6966)  AAA 28.7( 18883)  AGA 18.6( 12263)
AUG 17.7( 11652)  ACG 12.3(  8087)  AAG 27.9( 18371)  AGG 27.0( 17752)

GUU 18.6( 12261)  GCU 15.6( 10267)  GAU 15.1(  9933)  GGU  4.9(  3255)
GUC 17.8( 11733)  GCC 39.0( 25675)  GAC 27.7( 18241)  GGC 36.6( 24123)
GUA 20.5( 13501)  GCA 14.7(  9711)  GAA 19.8( 13049)  GGA 12.7(  8352)
GUG 37.2( 24497)  GCG 29.2( 19232)  GAG 49.9( 32833)  GGG 22.2( 14604)

Coding GC 51.90% 1st letter GC 55.36% 2nd letter GC 40.73% 3rd letter GC 59.61%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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