Streptococcus pneumoniae TIGR4 [gbbct]: 2125 CDS's (602990 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number]) 
UUU 32.7( 19701)  UCU 16.9( 10190)  UAU 25.2( 15187)  UGU  4.4(  2659)
UUC 13.7(  8264)  UCC  5.1(  3060)  UAC 13.2(  7957)  UGC  1.7(  1010)
UUA 20.0( 12071)  UCA 15.9(  9588)  UAA  2.1(  1274)  UGA  0.6(   340)
UUG 28.8( 17338)  UCG  3.8(  2307)  UAG  0.8(   511)  UGG  9.1(  5486)

CUU 20.4( 12320)  CCU 11.9(  7148)  CAU 12.1(  7316)  CGU 17.9( 10807)
CUC 12.4(  7492)  CCC  2.9(  1762)  CAC  7.2(  4313)  CGC  6.6(  4005)
CUA 11.5(  6913)  CCA 15.0(  9016)  CAA 26.7( 16112)  CGA  4.7(  2843)
CUG  9.0(  5434)  CCG  2.9(  1752)  CAG 13.8(  8331)  CGG  1.9(  1167)

AUU 39.5( 23814)  ACU 18.1( 10908)  AAU 29.5( 17790)  AGU 15.1(  9126)
AUC 25.1( 15159)  ACC 12.0(  7258)  AAC 14.1(  8494)  AGC  8.2(  4943)
AUA  7.1(  4270)  ACA 18.5( 11181)  AAA 43.2( 26042)  AGA  7.0(  4247)
AUG 24.0( 14464)  ACG  6.0(  3647)  AAG 24.5( 14787)  AGG  2.0(  1205)

GUU 27.4( 16537)  GCU 30.4( 18337)  GAU 36.7( 22135)  GGU 26.8( 16178)
GUC 15.1(  9103)  GCC 15.8(  9531)  GAC 17.8( 10763)  GGC  9.1(  5459)
GUA 14.4(  8689)  GCA 20.4( 12322)  GAA 51.1( 30792)  GGA 20.4( 12278)
GUG 12.2(  7344)  GCG  8.0(  4814)  GAG 20.8( 12558)  GGG  8.5(  5141)
Coding GC 40.54% 1st letter GC 51.20% 2nd letter GC 34.78% 3rd letter GC 35.63%
Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM
CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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