Monkeypox virus [gbvrl]: 1897 CDS's (561789 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 30.9( 17342)  UCU 24.9( 13988)  UAU 37.6( 21137)  UGU 17.3(  9702)
UUC 13.1(  7338)  UCC  9.0(  5075)  UAC 15.9(  8939)  UGC  4.4(  2447)
UUA 25.2( 14163)  UCA 16.3(  9156)  UAA  2.1(  1155)  UGA  0.8(   430)
UUG 17.4(  9766)  UCG  7.5(  4223)  UAG  0.6(   312)  UGG  6.7(  3778)

CUU 11.7(  6600)  CCU 10.7(  6008)  CAU 15.1(  8482)  CGU  6.2(  3496)
CUC  6.1(  3410)  CCC  4.2(  2375)  CAC  5.5(  3080)  CGC  1.8(  1021)
CUA 17.8( 10017)  CCA 13.1(  7364)  CAA 15.6(  8766)  CGA  5.5(  3064)
CUG  6.8(  3828)  CCG  5.8(  3276)  CAG  6.1(  3424)  CGG  1.6(   887)

AUU 38.0( 21362)  ACU 24.3( 13648)  AAU 47.8( 26846)  AGU 16.0(  9008)
AUC 18.2( 10247)  ACC  9.7(  5462)  AAC 18.8( 10567)  AGC  5.8(  3249)
AUA 38.4( 21579)  ACA 24.5( 13741)  AAA 49.5( 27836)  AGA 21.8( 12238)
AUG 26.7( 15009)  ACG  8.4(  4737)  AAG 21.9( 12311)  AGG  4.0(  2247)

GUU 20.2( 11335)  GCU 13.2(  7397)  GAU 52.4( 29425)  GGU 13.3(  7447)
GUC  8.9(  5016)  GCC  6.0(  3353)  GAC 17.1(  9598)  GGC  3.1(  1718)
GUA 23.4( 13153)  GCA 12.1(  6786)  GAA 39.4( 22159)  GGA 20.8( 11671)
GUG  8.9(  4973)  GCG  6.5(  3664)  GAG 15.0(  8403)  GGG  2.8(  1555)

Coding GC 33.95% 1st letter GC 39.65% 2nd letter GC 32.79% 3rd letter GC 29.42%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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