Rhodococcus sp. RHA1 [gbbct]: 9201 CDS's (2917064 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU  1.7(  5008)  UCU  1.7(  4966)  UAU  2.9(  8496)  UGU  1.6(  4752)
UUC 28.5( 83113)  UCC 16.5( 48208)  UAC 17.3( 50381)  UGC  7.0( 20535)
UUA  0.4(  1160)  UCA  2.7(  7752)  UAA  0.3(   743)  UGA  2.2(  6543)
UUG  7.8( 22730)  UCG 21.0( 61113)  UAG  0.7(  1915)  UGG 14.4( 42006)

CUU  3.6( 10406)  CCU  2.8(  8292)  CAU  4.2( 12266)  CGU  8.2( 24058)
CUC 40.6(118328)  CCC 20.4( 59381)  CAC 19.2( 56066)  CGC 30.0( 87603)
CUA  1.5(  4310)  CCA  3.4(  9892)  CAA  4.2( 12365)  CGA  7.4( 21522)
CUG 43.7(127500)  CCG 30.8( 89750)  CAG 23.8( 69395)  CGG 25.1( 73236)

AUU  3.5( 10130)  ACU  3.0(  8791)  AAU  3.3(  9734)  AGU  3.6( 10513)
AUC 37.2(108574)  ACC 35.9(104787)  AAC 17.4( 50736)  AGC 12.7( 36907)
AUA  1.0(  2971)  ACA  4.5( 13028)  AAA  3.4(  9962)  AGA  1.5(  4282)
AUG 18.0( 52647)  ACG 20.3( 59202)  AAG 17.4( 50833)  AGG  3.4(  9889)

GUU  5.0( 14633)  GCU  6.3( 18416)  GAU 11.5( 33649)  GGU 16.0( 46778)
GUC 44.7(130448)  GCC 55.2(161001)  GAC 50.9(148603)  GGC 42.4(123579)
GUA  2.9(  8421)  GCA 13.1( 38261)  GAA 17.5( 51184)  GGA 13.2( 38638)
GUG 35.8(104519)  GCG 49.5(144469)  GAG 37.0(107931)  GGG 17.1( 49757)

Coding GC 67.39% 1st letter GC 68.72% 2nd letter GC 49.29% 3rd letter GC 84.16%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS [CAUTION: The file is big (> 1000 entries).] (format)
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