mitochondrion Rattus norvegicus [gbrod]: 182 CDS's (49936 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 26.6(  1327)  UCU 12.1(   605)  UAU 14.7(   735)  UGU  2.8(   138)
UUC 37.9(  1894)  UCC 18.8(   941)  UAC 18.8(   941)  UGC  5.0(   250)
UUA 29.6(  1479)  UCA 32.1(  1601)  UAA  3.1(   154)  UGA 25.3(  1262)
UUG  4.6(   230)  UCG  0.4(    20)  UAG  0.6(    28)  UGG  0.8(    40)

CUU 21.2(  1058)  CCU 10.9(   546)  CAU  8.0(   401)  CGU  2.4(   119)
CUC 23.5(  1174)  CCC 15.4(   768)  CAC 15.8(   787)  CGC  4.0(   200)
CUA 71.2(  3554)  CCA 26.5(  1321)  CAA 20.5(  1026)  CGA  9.1(   456)
CUG  2.9(   145)  CCG  1.6(    81)  CAG  1.4(    68)  CGG  1.0(    49)

AUU 49.9(  2493)  ACU 16.7(   836)  AAU 15.3(   764)  AGU  3.7(   184)
AUC 47.3(  2361)  ACC 24.0(  1200)  AAC 29.3(  1461)  AGC  9.7(   486)
AUA 48.5(  2424)  ACA 40.4(  2018)  AAA 25.6(  1280)  AGA  0.0(     0)
AUG  8.4(   420)  ACG  1.8(    89)  AAG  1.2(    61)  AGG  0.0(     0)

GUU  6.2(   311)  GCU 14.1(   704)  GAU  6.8(   339)  GGU  6.3(   317)
GUC 10.1(   502)  GCC 27.3(  1362)  GAC 14.1(   704)  GGC 13.6(   677)
GUA 24.4(  1219)  GCA 20.2(  1008)  GAA 22.0(  1099)  GGA 25.4(  1266)
GUG  4.0(   198)  GCG  1.6(    81)  GAG  3.3(   163)  GGG 10.2(   511)

Coding GC 39.55% 1st letter GC 44.48% 2nd letter GC 38.32% 3rd letter GC 35.83%

Format:
Genetic codes (NCBI)
Codon Usage Table with Amino Acids
A style like CodonFrequency output in GCG Wisconsin PackageTM

CDS Search:

Keyword example: ribosomal protein / MAP kinase
List of codon usage for each CDS (format)
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