# /usr/local/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/sj09675.fasta.nr -Q ../query/FLJ00256.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00256, 856 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7824901 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3363+/-0.000188; mu= 13.5230+/- 0.011 mean_var=86.3430+/-16.510, 0's: 41 Z-trim: 47 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.138026 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|18676714|dbj|BAB85009.1| FLJ00256 protein [Homo ( 856) 5819 1169.2 0 gi|166788576|dbj|BAG06736.1| MYO7B variant protein (1031) 5034 1012.9 0 gi|182667924|sp|Q6PIF6.2|MYO7B_HUMAN RecName: Full (2116) 5037 1013.8 0 gi|119615729|gb|EAW95323.1| hCG42606, isoform CRA_ ( 750) 4966 999.3 0 gi|73984142|ref|XP_540987.2| PREDICTED: similar to (2141) 4367 880.4 0 gi|194222110|ref|XP_001499101.2| PREDICTED: myosin (2202) 4352 877.4 0 gi|148664633|gb|EDK97049.1| myosin VIIb, isoform C (1604) 4105 828.1 0 gi|13506797|gb|AAK28339.1|AF242411_1 myosin-VIIb [ (2113) 4105 828.2 0 gi|182667925|sp|Q99MZ6.2|MYO7B_MOUSE RecName: Full (2113) 4105 828.2 0 gi|148664634|gb|EDK97050.1| myosin VIIb, isoform C (2115) 4105 828.2 0 gi|109506410|ref|XP_574117.2| PREDICTED: similar t (2114) 4102 827.6 0 gi|60360186|dbj|BAD90338.1| mFLJ00256 protein [Mus (1000) 4026 812.2 0 gi|119615728|gb|EAW95322.1| hCG42606, isoform CRA_ (1715) 3814 770.2 0 gi|20072914|gb|AAH26416.1| Myo7b protein [Mus musc ( 921) 3518 711.0 5.7e-202 gi|149017130|gb|EDL76181.1| rCG49445 [Rattus norve (1215) 3143 636.4 2.1e-179 gi|57999405|emb|CAI45981.1| hypothetical protein [ ( 972) 2838 575.6 3.4e-161 gi|211827247|gb|AAH35615.2| MYO7B protein [Homo sa ( 671) 2678 543.6 1e-151 gi|189520249|ref|XP_687345.3| PREDICTED: similar t (2254) 2626 533.7 3.2e-148 gi|118085270|ref|XP_417277.2| PREDICTED: similar t (2204) 2582 525.0 1.4e-145 gi|210122478|gb|EEA70184.1| hypothetical protein B (2174) 2550 518.6 1.1e-143 gi|190339980|gb|AAI63570.1| Myosin VIIa [Danio rer (2179) 2548 518.2 1.5e-143 gi|9944235|emb|CAC05418.1| myosin VIIA [Danio reri (2179) 2548 518.2 1.5e-143 gi|9944237|emb|CAC05419.1| myosin VIIA [Danio reri (2179) 2548 518.2 1.5e-143 gi|189533820|ref|XP_001921522.1| PREDICTED: simila (2176) 2539 516.4 5.2e-143 gi|210122472|gb|EEA70178.1| hypothetical protein B (2144) 2537 516.0 6.8e-143 gi|194673825|ref|XP_870166.3| PREDICTED: similar t (2042) 2525 513.6 3.4e-142 gi|56405237|gb|AAV87212.1| myosin VIIa isoform 1 [ (2166) 2523 513.2 4.7e-142 gi|56405239|gb|AAV87213.1| myosin VIIa isoform 2 [ (2172) 2523 513.2 4.7e-142 gi|162318586|gb|AAI56495.1| Myosin VIIa [synthetic (2177) 2523 513.2 4.7e-142 gi|73988121|ref|XP_542292.2| PREDICTED: similar to (2172) 2522 513.0 5.4e-142 gi|146741344|dbj|BAF62327.1| myosin VIIA [Sus scro (2177) 2514 511.4 1.6e-141 gi|166788574|dbj|BAG06735.1| MYO7A variant protein (1357) 2511 510.6 1.7e-141 gi|149068904|gb|EDM18456.1| myosin VIIA, isoform C (2117) 2511 510.8 2.4e-141 gi|23263405|dbj|BAC16515.1| myosin VIIA [Rattus no (2177) 2511 510.8 2.5e-141 gi|189083802|ref|NP_001120652.1| myosin VIIA isofo (2175) 2500 508.6 1.1e-140 gi|1613788|gb|AAC50927.1| myosin VIIa [Homo sapien (2175) 2494 507.4 2.6e-140 gi|119595428|gb|EAW75022.1| myosin VIIA, isoform C (2177) 2494 507.4 2.6e-140 gi|47208044|emb|CAF92932.1| unnamed protein produc (1912) 2462 501.0 1.9e-138 gi|163775724|gb|EDQ89347.1| predicted protein [Mon (1871) 2347 478.1 1.5e-131 gi|109108048|ref|XP_001087868.1| PREDICTED: simila (2196) 2344 477.6 2.5e-131 gi|212515177|gb|EEB17358.1| myosin VII, putative [ (2188) 2339 476.6 5.1e-131 gi|122095550|sp|Q17LW0.1|MYO7A_AEDAE RecName: Full (2163) 2335 475.8 8.7e-131 gi|193610678|ref|XP_001950498.1| PREDICTED: simila (2164) 2333 475.4 1.2e-130 gi|193912911|gb|EDW11778.1| GI17331 [Drosophila mo (2167) 2319 472.6 8e-130 gi|167878596|gb|EDS41979.1| myosin-VIIa [Culex qui (2173) 2318 472.4 9.2e-130 gi|190615188|gb|EDV30712.1| GF14995 [Drosophila an (2167) 2314 471.6 1.6e-129 gi|193903976|gb|EDW02843.1| GH10819 [Drosophila gr (2167) 2312 471.2 2.1e-129 gi|27819990|gb|AAL39583.2| LD14917p [Drosophila me (1279) 2305 469.6 3.7e-129 gi|189237589|ref|XP_975112.2| PREDICTED: similar t (2165) 2307 470.2 4.2e-129 gi|122098255|sp|Q29P71.1|MYO7A_DROPS RecName: Full (2168) 2307 470.2 4.2e-129 >>gi|18676714|dbj|BAB85009.1| FLJ00256 protein [Homo sap (856 aa) initn: 5819 init1: 5819 opt: 5819 Z-score: 6259.0 bits: 1169.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 5819; 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