# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj08895.fasta.huge -Q ../query/FLJ00251.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00251, 1007 aa vs ./tmplib.10216 library 2209987 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.7383+/-0.00403; mu= 25.3158+/- 0.274 mean_var=89.0814+/-19.151, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/39 Lambda= 0.135888 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0325 ( 4658 res) hg00575y2 (4658) 436 97.3 5.8e-20 KIAA0357 ( 2992 res) hh00016y2 (2992) 209 52.5 1.2e-06 KIAA1410 ( 4293 res) pg00933y4 (4293) 195 50.0 9.4e-06 KIAA1503 ( 4464 res) hk03643y1 (4464) 195 50.0 9.5e-06 KIAA2017 ( 3051 res) fk13965y1 (3051) 190 48.8 1.6e-05 KIAA0944 ( 4031 res) hj04408s1 (4031) 189 48.8 2e-05 FLJ00114 ( 348 res) as00114 ( 348) 101 29.8 0.92 FLJ00247 ( 925 res) sj08552 ( 925) 98 29.9 2.3 KIAA0216 ( 2067 res) hf00331s1 (2067) 101 31.1 2.3 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 95 29.0 2.7 KIAA0240 ( 1087 res) fg03390 (1087) 97 29.8 2.8 KIAA1539 ( 543 res) fg02356 ( 543) 90 28.0 5.1 FLJ00354 ( 1041 res) sh02128 (1041) 91 28.6 6.3 KIAA1988 ( 636 res) fk07519s1 ( 636) 87 27.5 8.4 KIAA1688 ( 1094 res) fh26207 (1094) 89 28.3 8.4 FLJ00398 ( 660 res) sj06617 ( 660) 87 27.5 8.5 FLJ00348 ( 778 res) sg00015 ( 778) 87 27.6 9.3 FLJ00329 ( 349 res) sj02919 ( 349) 83 26.3 11 FLJ00324 ( 376 res) sj01157 ( 376) 83 26.3 11 KIAA1150 ( 499 res) hg02066 ( 499) 84 26.7 11 KIAA0202 ( 508 res) ha02944 ( 508) 84 26.7 11 FLJ00256 ( 856 res) sj09675 ( 856) 85 27.3 13 KIAA0250 ( 1122 res) ha02790 (1122) 86 27.7 13 KIAA0791 ( 1357 res) hk05655 (1357) 86 27.8 14 KIAA1075 ( 1505 res) hj06716s1 (1505) 86 27.9 15 KIAA0498 ( 111 res) hg00157 ( 111) 76 24.1 15 KIAA0164 ( 929 res) ha02373 ( 929) 83 27.0 18 KIAA1083 ( 584 res) hj07423 ( 584) 81 26.2 18 KIAA1401 ( 853 res) hk09639 ( 853) 82 26.7 19 KIAA1287 ( 1209 res) hh13365(revised) (1209) 83 27.2 20 KIAA1167 ( 834 res) hj01786(revised) ( 834) 81 26.5 22 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 81 26.5 22 KIAA0502 ( 144 res) hh00007 ( 144) 74 23.9 23 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 81 26.7 24 FLJ00269 ( 1383 res) sj06049 (1383) 82 27.1 25 KIAA1166 ( 165 res) hk01743 ( 165) 74 24.0 25 KIAA1510 ( 1140 res) fg02934(revised) (1140) 81 26.7 25 KIAA0243 ( 699 res) ha04782 ( 699) 79 26.0 26 KIAA1262 ( 1362 res) hh15990 (1362) 81 26.8 28 KIAA1520 ( 810 res) ah05473 ( 810) 79 26.1 28 KIAA0802 ( 1578 res) hh07536 (1578) 81 27.0 30 KIAA0128 ( 424 res) ha03961 ( 424) 76 25.0 30 KIAA0482 ( 1332 res) hj01880 (1332) 80 26.6 31 FLJ00059 ( 477 res) as00059 ( 477) 76 25.1 32 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 76 25.1 32 FLJ00379 ( 487 res) sj00523 ( 487) 76 25.1 32 KIAA1409 ( 2461 res) af00533 (2461) 82 27.5 33 KIAA1733 ( 509 res) ph00321 ( 509) 76 25.2 33 KIAA1929 ( 410 res) fj08985(revised) ( 410) 75 24.8 34 FLJ00009 ( 540 res) as00009 ( 540) 76 25.2 34 >>KIAA0325 ( 4658 res) hg00575y2 (4658 aa) initn: 498 init1: 198 opt: 436 Z-score: 451.7 bits: 97.3 E(): 5.8e-20 Smith-Waterman score: 701; 24.547% identity (55.381% similar) in 827 aa overlap (45-839:1638-2375) 20 30 40 50 60 70 FLJ002 QLQQLLQAGSVELEGIIMSLESVLYGVCAHFPRLFFLSDSELVALLAARLESCEAQLWVR :::..:..: .:. ... . . : . 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KIAA03 GVEG----------VAHIIDPKAISKDHLYGTLDPNTREWTDGLFTHVLRKIIDSVRGEL 2260 2270 2280 2290 2300 770 780 790 800 810 820 FLJ002 QKRQTEESIGIQHWIICDGASNGAWLDSITCLLSELPQLSLPSGQQIARPPGTFLLMEVA :::: ::. :: . :..... .:.. :.::.:.... ::.. ...:: KIAA03 QKRQ---------WIVFDGDVDPEWVENLNSVLDDNKLLTLPNGERLSLPPNVRIMFEVQ 2310 2320 2330 2340 2350 830 840 850 860 870 880 FLJ002 DTTGISPTVVGCCALVWCGGEQTWQCILSALMASLPYEYRLQHRTVAELNHMAEVLVPAT : . ..:. :..:: KIAA03 DLKYATLATVSRCGMVWFSEDVLSTDMIFNNFLARLRSIPLDEGEDEAQRRRKGKEDEGE 2360 2370 2380 2390 2400 2410 >>KIAA0357 ( 2992 res) hh00016y2 (2992 aa) initn: 409 init1: 181 opt: 209 Z-score: 212.9 bits: 52.5 E(): 1.2e-06 Smith-Waterman score: 507; 22.045% identity (52.386% similar) in 880 aa overlap (45-904:183-931) 20 30 40 50 60 70 FLJ002 QLQQLLQAGSVELEGIIMSLESVLYGVCAHFPRLFFLSDSELVALLAARLESCEAQLWVR :::..:::.:.:. .:. ..: . 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KIAA03 NPSVGIFITMNPGYAGRTELPENLKSLFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFIEAQSLARK 550 560 570 580 590 600 550 560 570 580 590 600 FLJ002 LSKFFSLERELVSGPLPCRLPL--LKQILEDTIRTLNVTKEEPKCQKPRSLAAIEEAALL . ...: .::.: : .:..: . . .. . .: ..: :. .:. KIAA03 FITLYQLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVL---VVAGSLKRGDP--DRP------EDQVLM 610 620 630 640 650 610 620 630 640 650 660 FLJ002 HALLRSPLFSILNGLHLHNLRGLLCALFPSAS-QVLAEPMTYKLMKPLVVEELQQVGLDP ..: . .:.. . . ::. :::. . .: :.. .:. . :. KIAA03 RSLRDFNIPKIVTD-DMPIFMGLIGDLFPALDVPRRRDPNFEALVRKAIVD----LKLQA 660 670 680 690 700 670 680 690 700 710 720 FLJ002 SPDILGSLEQLSQALSRASGILLLGPAGSGKTTCWHSLFKIQNRLAAMEDTSTQGCQPVE ... .. :: . :. .....: ::.::. .:: : . . .:: KIAA03 EDNFVLKVVQLEELLAVRHSVFVVGGAGTGKSQVLRSLHKTYQIMKR---------RPVW 710 720 730 740 750 730 740 750 760 770 FLJ002 ITHLYPSGLSPQEFLGWLEGSC--WHHGIFPKVLRAAGQCNNMGQKRQTEESIGIQHWII : : :.... .:..: .. . :. :.: ...: .. .. : : ::. KIAA03 -TDLNPKAVTNDELFGIINPATGEWKDGLFSSIMRELANTTHDGPK-----------WIL 760 770 780 790 800 780 790 800 810 820 830 FLJ002 CDGASNGAWLDSITCLLSELPQLSLPSGQQIARPPGTFLLMEVADTTGISPTVVGCCALV :: . :..:.. .... :.: :...: : ::.:.. .:..:. ... KIAA03 LDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIPLNPTMKLLFEISHLRTATPATVSRAGIL 810 820 830 840 850 860 840 850 860 870 880 890 FLJ002 WCG-GEQTWQCILSALMASLPYEYRLQHRTVAELNHMAEVLVPATLRFLTCQGVSSLLQV . . .. :. .:. . : : . :.:. . . .:. : : . .... . KIAA03 YINPADLGWNPPVSSWI-----EKREIQTERANLTILFDKYLPTCLDTLRTR-FKKIIPI 870 880 890 900 910 920 900 910 920 930 940 950 FLJ002 HGQ---QAVCAGVAEVTSMARILHSLLDLHLRLKEEKAPGPEDLSYSDPVAQSFRSSKSS : : :: KIAA03 PEQSMVQMVCHLLECLLTTEDIPADCPKEIYEHYFVFAAIWAFGGAMVQDQLVDYRAEFS 930 940 950 960 970 980 >>KIAA1410 ( 4293 res) pg00933y4 (4293 aa) initn: 490 init1: 193 opt: 195 Z-score: 196.7 bits: 50.0 E(): 9.4e-06 Smith-Waterman score: 684; 24.087% identity (52.169% similar) in 876 aa overlap (45-897:1353-2102) 20 30 40 50 60 70 FLJ002 QLQQLLQAGSVELEGIIMSLESVLYGVCAHFPRLFFLSDSELVALLAARLESCEAQLWVR :::..::::.::. .:. . .: .: KIAA14 RMLDSLRDCNKILDLVQKGLSEYLETKRSAFPRFYFLSDDELLEILSQTKDPTAVQPHLR 1330 1340 1350 1360 1370 1380 80 90 100 110 120 130 FLJ002 RCFPHVHAVSFRSCPTGEKNTDDWESSPNTQTQVEALAVLGAGGEEVKLQGPLPLHPDLP .:: .. . : : ..: . .: ::::.: . .. KIAA14 KCFENIARLLF-------------------QEDLEITHMYSAEGEEVQLCFSIYPSSNVE 1390 1400 1410 1420 140 150 160 170 180 190 FLJ002 KWLASLEKCLRLALVHMLQGCVAARLARGPSLGEALKQLPKQNKLYLQLYVQHWIDLVQA :: .:. .. : :: . . .:.. : . . .: .: KIAA14 DWLREVERSMK-ASVHDI-------------IEKAIRAYPTMPRTQ---WVLNW------ 1430 1440 1450 1460 200 210 220 230 240 250 FLJ002 FPWQCVLVAEEVVWRAEMEEALLEWGTL--AMVSMHMRKLEVLVNFMRAQRASQGGQSLP : : .... .. : :. ::: : :.: . . ..: :: ..:.. . . KIAA14 -PGQVTIAGCQTYWTMEVAEAL-EAGNLRSQLFPQLCQQLSDLVALVRGKLSRM------ 1470 1480 1490 1500 1510 260 270 280 290 300 310 FLJ002 SVRQTSLLSALLVMAVTHRDIAQLLEQHQVSDLTDFHWVRQLKYHLGSPHIIPKSPLQSL : ..::::.:. : .:... : :..: ...::.:. ::.:. . . KIAA14 ---QRAVLSALIVIEVHAKDVVSKLIQENVVSVNDFQWISQLRYYWTNNDL--------- 1520 1530 1540 1550 1560 320 330 340 350 360 370 FLJ002 KTIASSEPSLSPAACWIDVLGRSFLYNYEYLGP--RLGPLPSLLPERPALVLLLALEEVA .: ... :.:.::::: :: : : .: :.: ::. KIAA14 ---------------YIRAVNAEFIYGYEYLGNSGRLVITP--LTDRCYLTLTGALHLKF 1570 1580 1590 1600 380 390 400 410 420 430 FLJ002 CGTVLGPNGVGKRAIVNSLAQALGRQLVMLPCSPQIEAQCLSNYLNGALQGGAWLLLEKV :. :: :.:: ...:..::. : :.. :: :.. . ......: ..::: ... KIAA14 GGAPAGPAGTGKTETTKDLGKALAIQTVVFNCSDQLDFMAMGKFFKGLASAGAWACFDEF 1610 1620 1630 1640 1650 1660 440 450 460 470 480 490 FLJ002 HQLPPGLLSALGQRLGELHHLYAPLYQEASRNTSTIDPTQPQLLGSSFFEKHHVSVRLGY ... .::...:.. .::. .: : . .:: : . : KIAA14 NRIDIEVLSVVAQQI------------------TTIQKAQQQRVERFMFEG--VEIPLVP 1670 1680 1690 1700 500 510 520 530 540 FLJ002 GCLLVLR-----ALSSAVPANLHLLLRPVALALPDLRQVAELTLLGAGMRDAFQMATRLS .: . . : . .: ::. :.::::. .:: ...:..: . :. .: .: ... KIAA14 SCAVFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPVAMMVPDYAMITEISLYSFGFNEASVLAKKIT 1710 1720 1730 1740 1750 1760 550 560 570 580 590 600 FLJ002 KFFSLERELVSGPLPCRLPLLKQILEDTIRTL-NVTKEEPKCQKPRSLAAIEEAALLHAL :.: : .:. . . . .. .: . :. .:.:. . :: :.:. KIAA14 TTFKLSSEQLSSQDHYDFGM--RAVKTVISAAGNLKRENPSMN--------EELICLRAI 1770 1780 1790 1800 1810 610 620 630 640 650 660 FLJ002 --LRSPLFSILNGLHLHNLRGLLCALFPSASQVLAEPMTYKLMKPLVVEELQQVGLDPSP . : : . . :.: . :.. :::. .. : : .. . : .. .: KIAA14 RDVNVPKF-LQEDLKLFS--GIVSDLFPTIKE---EDTDYGILDEAIREACRNSNLKDVE 1820 1830 1840 1850 1860 670 680 690 700 710 720 FLJ002 DILGSLEQLSQALSRASGILLLGPAGSGKTTCWHSLFKIQNRLAAMEDTSTQGCQPVEIT .: . :: .. :..:.::.::::.::.. : .. : .. . : . :. KIAA14 GFLTKCIQLYETTVVRHGLMLVGPTGSGKSTCYRVLAAAMTSLKGQPSISGGMYEAVNYY 1870 1880 1890 1900 1910 1920 730 740 750 760 770 780 FLJ002 HLYPSGLSPQEFLGWLE--GSCWHHGIFPKVLRAAGQCNNMGQKRQTEESIGIQHWIICD : :.... .. : .. : ::: . .::.. .. ..: : . : KIAA14 VLNPKSITMGQLYGEFDLLTHEWTDGIFSSFIRAGAITSDTNKK-----------WYMFD 1930 1940 1950 1960 1970 790 800 810 820 830 840 FLJ002 GASNGAWLDSITCLLSELPQLSLPSGQQIARPPGTFLLMEVADTTGISPTVVGCCALVWC : .. :..... .:.. .: : ::. : . ...:: : . ::..:. :..:. KIAA14 GPVDAIWIENMNTVLDDNKKLCLSSGEIIKLTEAMTMMFEVQDLAVASPATVSRCGMVYL 1980 1990 2000 2010 2020 2030 850 860 870 880 890 FLJ002 -----GGEQTWQCILSALMASL-PYEYRLQHRTVAELNHMAEVL---VPATLRFLTCQGV : .: : : : ::: ... :. :.. . : .. .:. . KIAA14 EPSILGLMPFIECWLRKLPPLLKPYEEHFKALFVSFLEESISFVRSSVKEVIASTNCNLT 2040 2050 2060 2070 2080 2090 900 910 920 930 940 950 FLJ002 SSLLQVHGQQAVCAGVAEVTSMARILHSLLDLHLRLKEEKAPGPEDLSYSDPVAQSFRSS :::.. KIAA14 MSLLKLLDCFFKPFLPREGLKKIPSEKLSRIVELIEPWFIFSLIWSVGATGDSSGRTSFS 2100 2110 2120 2130 2140 2150 >>KIAA1503 ( 4464 res) hk03643y1 (4464 aa) initn: 500 init1: 185 opt: 195 Z-score: 196.5 bits: 50.0 E(): 9.5e-06 Smith-Waterman score: 691; 23.934% identity (54.208% similar) in 915 aa overlap (4-904:1529-2325) 10 20 30 FLJ002 PVPSAERSPYFQGQQLQQLLQAGSVELEGIIMS .: :: . : :. :.. ... :: : : KIAA15 IRKQLPNESTLFDQVNSNWKAIMDRMNKDNNALRSTHHPGL-LDTLIEMNTI-LEDIQKS 1500 1510 1520 1530 1540 1550 40 50 60 70 80 90 FLJ002 LESVLYGVCAHFPRLFFLSDSELVALLAARLESCEAQLWVRRCFPHVHAVSFRSCPTGEK :. : :::..:::...:. .:. . .: ...:: ... . ... KIAA15 LDMYLETKRHIFPRFYFLSNDDLLEILGQSRNPEAVQPHLKKCFDNIKLLRIQKV----- 1560 1570 1580 1590 1600 1610 100 110 120 130 140 150 FLJ002 NTDDWESSPNTQTQVEALAVLGAGGEEVKLQGPLPLHPDLPKWLASLEKCLRLALVHMLQ ..:... ::...... :: . . . :. . .::...:. .:..: .:. KIAA15 ------GGPSSKW--EAVGMFSGDGEYIDFLHSVFLEGPVESWLGDVEQTMRVTLRDLLR 1620 1630 1640 1650 1660 160 170 180 190 200 210 FLJ002 GC-VAARLARGPSLGEALKQLPKQNKLYLQLYVQHWIDLVQAFPWQCVLVAEEVVWRAEM .: .: : : : :..: .:..: : :..: .. : :.. KIAA15 NCHLALR-----------KFLNKRDK-----WVKEWAG-------QVVITASQIQWTADV 1670 1680 1690 1700 220 230 240 250 260 270 FLJ002 EEALLEWGTLA--MVSMHMRKLEVLVNFMRAQRASQGGQSLPSVRQTSLLSALLVMAVTH . :: : . :.: .: . . . ..: .: .: .. . ... ::... . KIAA15 TKCLLTAKERADKKILKVMKKNQVSI-LNKYSEAIRG--NLTKIMRLKIV-ALVTIEIHA 1710 1720 1730 1740 1750 280 290 300 310 320 330 FLJ002 RDIAQLLEQHQVSDLTDFHWVRQLKYHLGSPHIIPKSPLQSLKTIASSEPSLSPAACWID ::. . : . . :...: :. ::... : .:. : : KIAA15 RDVLEKLYKSGLMDVNSFDWLSQLRFYW--------------------EKDLDD--CVIR 1760 1770 1780 1790 340 350 360 370 380 FLJ002 VLGRSFLYNYEYLGP--RLGPLPSLLPERPALVLLLALEEVACGTVLGPNGVGKRAIVNS . .: ::::::: :: : : .: ..: ::. :. :: :.:: :.. KIAA15 QTNTQFQYNYEYLGNSGRLVITP--LTDRCYMTLTTALHLHRGGSPKGPAGTGKTETVKD 1800 1810 1820 1830 1840 1850 390 400 410 420 430 440 FLJ002 LAQALGRQLVMLPCSPQIEAQCLSNYLNGALQGGAWLLLEKVHQLPPGLLSALGQRLGEL :..::: .... :: .. . .. . .: : ::: ... ... .::... KIAA15 LGKALGIYVIVVNCSEGLDYKSMGRMYSGLAQTGAWGCFDEFNRINIEVLSVVA------ 1860 1870 1880 1890 1900 450 460 470 480 490 500 FLJ002 HHLYAPLYQEASRNTST-IDPTQPQLLGS-SFFEKHHVSVRLGYGCLLVLRALSSAVPAN :.. : :. : .: . .:. : ..: ... :: : . .: : KIAA15 HQILCILSALAAGLTHFHFDGFEINLVWSCGIF----ITMNPGY-------AGRTELPEN 1910 1920 1930 1940 1950 510 520 530 540 550 560 FLJ002 LHLLLRPVALALPDLRQVAELTLLGAGMRDAFQMATRLSKFFSLERELVSGPLPCRLPLL :. ..::.:...:: .::. :.: :. . .: .. ..:: . .: KIAA15 LKSMFRPIAMVVPDSTLIAEIILFGEGFGNCKILAKKVYTLYSLAVQQLS---------- 1960 1970 1980 1990 2000 570 580 590 600 610 620 FLJ002 KQILEDT-IRTL-NVTKEEPKCQKPRSLAAIEEAALLHALLRSPLFSILNGLHLHNLRGL .: : .:.: .. . : .. . . ::. :: .:. .. :... . .. KIAA15 RQDHYDFGLRALTSLLRYAGKKRRLQPDLTDEEVLLLS--MRDMNIAKLTSVDAPLFNAI 2010 2020 2030 2040 2050 2060 630 640 650 660 670 680 FLJ002 LCALFPSASQVLAEPMTYKLMKPLVVEELQQVGLDPSPDILGSLEQLSQALSRASGILLL . :::. . . : .. : .:....::. .: : .. :: .. . . ... KIAA15 VQDLFPN---IELPVIDYGKLRETVEQEIRDMGLQSTPFTLTKVFQLYETKNSRHSTMIV 2070 2080 2090 2100 2110 2120 690 700 710 720 730 740 FLJ002 GPAGSGKTTCWHSLFKIQNRLAAMEDTSTQGCQPVEITHLYPSGLSPQEFLGWLEGSC-- : .:::::. :. : : :... .. . . :. : :..:: :. : . : KIAA15 GCTGSGKTASWRIL---QASLSSLCRAGDPNFNIVREFPLNPKALSLGELYGEYDLSTNE 2130 2140 2150 2160 2170 750 760 770 780 790 800 FLJ002 WHHGIFPKVLRAAGQCNNMGQKRQTEESIGIQHWIICDGASNGAWLDSITCLLSELPQLS : ::. .:.:.: : . .. .:. ::. :: . :..... .... :. KIAA15 WTDGILSSVMRTA--CAD----EKPDEK-----WILFDGPVDTLWIENMNSVMDDNKVLT 2180 2190 2200 2210 2220 810 820 830 840 850 860 FLJ002 LPSGQQIARPPGTFLLMEVADTTGISPTVVGCCALVWCG-GEQTWQCILSALMASLPYEY : .:..:: : . ::.:: : . ::..:. :..:. .. :. ... . . : KIAA15 LINGERIAMPEQVSLLFEVEDLAMASPATVSRCGMVYTDYADLGWKPYVQSWLEKRP--- 2230 2240 2250 2260 2270 2280 870 880 890 900 910 FLJ002 RLQHRTVAELNHMAEVLVPATLRFL--TCQGVSSLLQVHGQQAVCAGVAEVTSMARILHS . : :..: : :. : : .:. . : . : ..: KIAA15 ---KAEVEPLQRMFEKLINKMLAFKKDNCKELVPLPEYSGITSLCKLYSALATPENGVNP 2290 2300 2310 2320 2330 2340 920 930 940 950 960 970 FLJ002 LLDLHLRLKEEKAPGPEDLSYSDPVAQSFRSSKSSFLNRSQVDSDDVPDKCREHLLAVSS KIAA15 ADGENYVTMVEMTFVFSMIWSVCASVDEEGRKRIDSYLREIEGSFPNKDTVYEYFVDPKI 2350 2360 2370 2380 2390 2400 >>KIAA2017 ( 3051 res) fk13965y1 (3051 aa) initn: 371 init1: 173 opt: 190 Z-score: 192.7 bits: 48.8 E(): 1.6e-05 Smith-Waterman score: 516; 21.824% identity (52.552% similar) in 921 aa overlap (20-922:120-909) 10 20 30 40 FLJ002 PVPSAERSPYFQGQQLQQLLQAGSVELEGIIMSLESVLYGVCAHFPRLF :: : :: ::.. : . :::.: KIAA20 IDKVFKRIMGETLKDPVIKRCCEAPNRLSDLQNVSEGLEKCQKSLNDYLDSKRNAFPRFF 90 100 110 120 130 140 50 60 70 80 90 100 FLJ002 FLSDSELVALLAARLESCEAQLWVRRCFPHVHAVSFRSCPTGEKNTDDWESSPNTQTQVE :.::.::...:.. : . .. . .. .. : . .::: .. KIAA20 FISDDELLSILGSSDPLCVQEHMIKM-YDNIASLRFNDGDSGEKLVS------------- 150 160 170 180 190 110 120 130 140 150 160 FLJ002 ALAVLGAGGEEVKLQGPLPLHPDLPKWLASLEKCLRLALVHMLQGCVAARLARGPSLGEA :...: :: .... . . . :.... . .: : : . KIAA20 --AMISAEGEVMEFRKIVRAEGRVEDWMTAVLNEMR-------------RTNRLITKEAI 200 210 220 230 240 170 180 190 200 210 220 FLJ002 LKQLPKQNKLYLQLYVQHWIDLVQAFPWQCVLVAEEVVWRAEMEEAL--LEWGTLAMVSM .. .... :. : :. . ::.: .: : :.:... . : .. KIAA20 FRYCEDRSRV-------DWMLLYQG---MVVLAASQVWWTWEVEDVFHKAQKGEKQAMKN 250 260 270 280 290 230 240 250 260 270 280 FLJ002 HMRKLEVLVNFMRAQRASQGGQSLP-SVRQTSLLSALLVMAVTHRDIAQLLEQHQVSDLT . ::.. .. . . : . .: : . . ...:.. : :::.. . . .. . KIAA20 YGRKMHRQIDEL-VTRIT-----MPLSKNDRKKYNTVLIIDVHARDIVDSFIRGSILEAR 300 310 320 330 340 290 300 310 320 330 340 FLJ002 DFHWVRQLKYHLGSPHIIPKSPLQSLKTIASSEPS-LSPAACWIDVLGRSFLYNYEYLG- .: : ::... . ::. :. : : .: :.:::.: KIAA20 EFDWESQLRFYW------------------DREPDELNIRQC----TG-TFGYGYEYMGL 350 360 370 380 350 360 370 380 390 400 FLJ002 -PRLGPLPSLLPERPALVLLLALEEVACGTVLGPNGVGKRAIVNSLAQALGRQLVMLPCS :: : : .: :.: :: :. :: :.:: ...::.::: :. :. KIAA20 NGRLVITP--LTDRIYLTLTQALSMYLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALGLLCVVTNCG 390 400 410 420 430 410 420 430 440 450 460 FLJ002 PQIEAQCLSNYLNGALQGGAWLLLEKVHQLPPGLLSALGQRLGELHHLYAPLYQEASRNT .. . ... ..: : ::: ... ... ..::...... ... : ..: KIAA20 EGMDYRAVGKIFSGLAQCGAWGCFDEFNRIDASVLSVISSQIQTIRN--ALIHQ------ 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 FLJ002 STIDPTQPQLLGSSFFEKHHVSVRLGYGCLLVLR---ALSSAVPANLHLLLRPVALALPD : . :: ...:. .: .... : . .: ... :.:::.. .:: KIAA20 ----------LTTFQFEGQEISLDSRMGIFITMNPGYAGRTELPESVKALFRPVVVIVPD 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 FLJ002 LRQVAELTLLGAGMRDAFQMATRLSKFFSLERELVSGPLPCRLPLLKQILEDT-IRTLNV :.:. :. :.. :. .: .: ... ...: :: .: :: : .:.:. KIAA20 LQQICEIMLFSEGFLEAKTLAKKMTVLYKLAREQLS----------KQYHYDFGLRALKS 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 FLJ002 TKEEPKCQKPRSLAAIEEAALLHAL--LRSPLFSILNGLHLHNLRGLLCALFPSASQVLA . : : :...:..:: . : : ... . : . ::. :::. : KIAA20 VLVMAGELKRGSSDLREDVVLMRALRDMNLPKF-VFEDVPL--FLGLISDLFPG----LD 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 FLJ002 EP-MTYKLMKPLVVEELQQVGLDPSPDILGSLEQLSQALSRASGILLLGPAGSGKTTCWH : . : .. : . :.. : : . .. :. ... ...::. .::.. . KIAA20 CPRVRYPDFNDAVEQVLEENGYAVLPIQVDKVVQMFETMLTRHTTMVVGPTRGGKSVVIN 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 FLJ002 SLFKIQNRLAAMEDTSTQGCQPVEITHLYPSGLSPQEFLGWLEGSC--WHHGIFPKVLRA .: . :..:. .:. . : :...: :. : :. . : :.. ...: KIAA20 TLCQAQTKLG----LTTK------LYILNPKAVSVIELYGILDPTTRDWTDGVLSNIFR- 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 FLJ002 AGQCNNMGQKRQTEESIGIQHWIICDGASNGAWLDSITCLLSELPQLSLPSGQQIARPPG . :. .:.. ...:. :: .. :..... .... :.: .:..: KIAA20 --EINKPTDKKE-------RKYILFDGDVDALWVENMNSVMDDNRLLTLANGERIRLQAH 760 770 780 790 800 820 830 840 850 860 870 FLJ002 TFLLMEVADTTGISPTVVGCCALVWCGGEQT-WQCILSALMASLPYEYRLQHRTVAELNH ::.::.: ::..:. :..:. .. .. . . ..: . . :. .:: KIAA20 CALLFEVGDLQYASPATVSRCGMVYVDPKNLKYRPYWKKWVNQIPNKVE-QY----NLNS 810 820 830 840 850 880 890 900 910 920 930 FLJ002 MAEVLVPATLRFLTCQGVSSLLQVHGQQAVC--AGVAEVTSMARILHSLLDLHLRLKEEK . : :: . .. .:. . :.. ... . . ::..:..: .::. KIAA20 LFEKYVPYLMDVIV-EGIVDGRQAEKLKTIVPQTDLNMVTQLAKMLDALLEGEIEDLDLL 860 870 880 890 900 910 940 950 960 970 980 990 FLJ002 APGPEDLSYSDPVAQSFRSSKSSFLNRSQVDSDDVPDKCREHLLAVSSFLFALIWGFGAH KIAA20 ECYFLEALYCSLGASLLEDGRMKFDEYIKRLASLSTVDTEGVWANPGELPGQLPTLYDFH 920 930 940 950 960 970 >>KIAA0944 ( 4031 res) hj04408s1 (4031 aa) initn: 481 init1: 175 opt: 189 Z-score: 190.5 bits: 48.8 E(): 2e-05 Smith-Waterman score: 571; 22.197% identity (52.435% similar) in 883 aa overlap (15-886:1045-1804) 10 20 30 40 FLJ002 PVPSAERSPYFQGQQLQQLLQAGSVELEGIIMSLESVLYGVCAH .. . :. .. :: :. .:. : KIAA09 RRFTAVDKTWRDTMRSVMQDKHVLTVVTIDRMLERLKKSNELLELILKGLNEYLEKKRLF 1020 1030 1040 1050 1060 1070 50 60 70 80 90 100 FLJ002 FPRLFFLSDSELVALLAARLESCEAQLWVRRCFPHVHAVSFRSCPTGEKNTDDWESSPNT :::.::::..::. .:. . ..: ...:: . : : : . .:: . KIAA09 FPRFFFLSNDELLEILSETKDPTRVQPHLKKCFEGIAKVEF----TETLDITHMKSSEGE 1080 1090 1100 1110 1120 1130 110 120 130 140 150 160 FLJ002 QTQVEALAVLGAGGEEVKLQGPLPLHPDLPKWLASLEKCLRLALVHMLQGCVAARLARGP :: . ..... : .: .. :::. ::. . . .: . : KIAA09 V--VELIEIISTA----KARG------QVEKWLVELERVM-INSIHKVTG---------- 1140 1150 1160 170 180 190 200 210 220 FLJ002 SLGEALKQLPKQNKLYLQLYVQHWIDLVQAFPWQCVLVAEEVVWRAEMEEALLEWGTLAM .: : ... .: :. .: : :: . .. : :.. :. : :. KIAA09 ---DATFAYTKYERI-------NW---VRDWPGQTVLCVSQIFWTKEVQTAI-PMGIKAL 1170 1180 1190 1200 1210 230 240 250 260 270 280 FLJ002 ---VSMHMRKLEVLVNFMRAQRASQGGQSLPSVRQTSLLSALLVMAVTHRDIAQLLEQHQ .. :... .:...:.. . :. : : :.::.:. : ::. . : ... 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