# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj08681.fasta.huge -Q ../query/FLJ00248.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00248, 501 aa vs ./tmplib.10216 library 2210493 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7911+/-0.00786; mu= 14.2899+/- 0.529 mean_var=377.1796+/-84.718, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.066039 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00201 ( 705 res) sj04110 ( 705) 235 36.0 0.012 FLJ00386 ( 811 res) sj04204 ( 811) 179 30.8 0.53 KIAA0812 ( 1364 res) hg01044 (1364) 182 31.5 0.54 FLJ00093 ( 977 res) as00093 ( 977) 175 30.6 0.74 FLJ00020 ( 1142 res) as00020 (1142) 176 30.8 0.75 KIAA0616 ( 634 res) hg03623 ( 634) 172 30.0 0.75 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 176 31.3 1 KIAA1683 ( 832 res) fh24307 ( 832) 154 28.5 2.8 KIAA0147 ( 1630 res) ha01022s1 (1630) 154 29.0 3.7 KIAA1076 ( 804 res) hj06779 ( 804) 149 28.0 3.8 KIAA0992 ( 772 res) hk07554 ( 772) 147 27.7 4.3 KIAA0749 ( 678 res) hk04328 ( 678) 145 27.4 4.6 FLJ00281 ( 1495 res) sh01915 (1495) 149 28.5 5 FLJ00169 ( 432 res) sh07709 ( 432) 140 26.6 5.2 KIAA1419 ( 2464 res) ff01653 (2464) 151 29.0 5.5 KIAA1743 ( 1036 res) pj01380s1 (1036) 145 27.8 5.5 FLJ00315 ( 925 res) sh06842 ( 925) 144 27.6 5.6 KIAA1531 ( 1206 res) ph00937 (1206) 144 27.8 6.3 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 140 27.1 6.9 FLJ00084 ( 641 res) as00084 ( 641) 138 26.7 7.1 KIAA1086 ( 902 res) hj08218 ( 902) 138 27.0 8.3 KIAA0945 ( 797 res) hj04760 ( 797) 135 26.6 9.5 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 137 27.2 10 KIAA1438 ( 1075 res) hk07374s1 (1075) 135 26.9 11 KIAA0613 ( 734 res) hg01088b ( 734) 132 26.3 11 KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800) 141 28.2 11 KIAA1075 ( 1505 res) hj06716s1 (1505) 136 27.2 12 KIAA0665 ( 760 res) hk02064 ( 760) 130 26.1 13 KIAA0899 ( 939 res) hk09548s1 ( 939) 131 26.4 13 FLJ00198 ( 677 res) sj03504 ( 677) 127 25.7 15 FLJ00330 ( 246 res) sj03258 ( 246) 120 24.3 15 KIAA1138 ( 1239 res) hj05928 (1239) 130 26.5 16 KIAA1862 ( 1070 res) aj00563 (1070) 129 26.3 16 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 129 26.6 19 KIAA1810 ( 579 res) fk03376 ( 579) 122 25.1 19 KIAA0306 ( 1451 res) hg00063 (1451) 128 26.4 20 KIAA1741 ( 1777 res) fh23254 (1777) 129 26.7 20 KIAA1684 ( 762 res) fh24594 ( 762) 123 25.4 21 FLJ00173 ( 1269 res) sj00667 (1269) 126 26.1 21 FLJ00089 ( 349 res) as00089 ( 349) 117 24.2 22 KIAA0269 ( 567 res) ha06751 ( 567) 120 24.9 22 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 122 25.4 23 KIAA1120 ( 1024 res) hg02941 (1024) 123 25.7 24 FLJ00328 ( 238 res) sj02853 ( 238) 113 23.6 24 KIAA1546 ( 684 res) fh12289 ( 684) 120 25.1 24 KIAA0705 ( 1483 res) hg03359s1 (1483) 125 26.2 24 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 123 25.9 27 FLJ00104 ( 287 res) as00104 ( 287) 112 23.6 27 KIAA0900 ( 503 res) hk09606s1 ( 503) 115 24.3 29 FLJ00094 ( 376 res) as00094 ( 376) 113 23.9 29 >>FLJ00201 ( 705 res) sj04110 (705 aa) initn: 155 init1: 78 opt: 235 Z-score: 140.7 bits: 36.0 E(): 0.012 Smith-Waterman score: 257; 28.709% identity (45.279% similar) in 519 aa overlap (1-493:85-549) 10 20 FLJ002 GWPGP-GHPWPAGLAAS---GVEGLGGRTA : ::: : : : :. .. : :: :. 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KIAA17 LPTATVPPVPPPQY-FSPAVILPS-LAAPLPPASPALPLQAVKLPHPPGAPLAMPCRTIV 820 830 840 850 860 870 310 320 330 340 350 360 FLJ002 PLAPWDPKYEAKAGPRPVWGANCSSGASFSGRTLCHPSFWPLYEAASGRGLRPVAPATGH : :: : : : . . :. :.. :. . .:. .: . .. : .: KIAA17 PNAPATIPLLAVAPPGVAALSIHSAVAQLPGQPV-YPAAFPQMAPTD----VPPSPHHTV 880 890 900 910 920 370 380 390 400 410 420 FLJ002 WNGQQAPPDAGFP---VVCCEDVFLSDPLLPRGQRVPLYLSKAPQQMMGSLKLLPPPPIM : . .::. ..: .. . :. .: :: .: .. :: .. .::: :.. KIAA17 QNMRATPPQPALPPQPTLPPQPVLPPQPTLPPQPVLPPQPTRPPQPVLPPQPMLPPQPVL 930 940 950 960 970 980 430 440 450 460 470 FLJ002 SAR-VLP-RPSPSRGPSTAWLSGPELIALTGLLQMSQGEPRPSSSAVGPPDHTSD-PPSP . .:: :: : . : ..: : : :. :.: : . :. : ::. KIAA17 PPQPALPVRPEPLQ-PHLPEQAAP---AATPGSQILLGHPAPYAVDVAAQVPTVPVPPAA 990 1000 1010 1020 1030 1040 480 490 500 FLJ002 CGSPSSSQ----GADLSLPQTPDTHCP :: . .: ::: :.. 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KIAA10 RSPPSMLSLDGPLVRPPAGAAL-GRELLLLPGQPQTPVFPSTHDPRTVTLDFRNAGIPAP 370 380 390 400 410 420 470 480 490 500 FLJ002 SAVGPPDHTSDPPSPCGSPSSSQGADLSLPQTPDTHCP ::. :: : :.. .:. : :. : KIAA10 PPPLPPQPPPPPPPPPVEPTKLPFKELD-NQWPSEAIPPGPRGRDEVTEEYMELAKSRGP 430 440 450 460 470 KIAA10 WRRPPKKRHEDLVPPAGSPELSPPQPLFRPRSEFEEMTILYDIWNGGIDEEDIRFLCVTY 480 490 500 510 520 530 501 residues in 1 query sequences 2210493 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:46:57 2009 done: Fri Feb 27 10:46:58 2009 Total Scan time: 0.580 Total Display time: 0.160 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]