# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj08543.fasta.huge -Q ../query/FLJ00246.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00246, 1486 aa vs ./tmplib.10216 library 2209508 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6245+/-0.00609; mu= 6.3357+/- 0.409 mean_var=223.8294+/-52.957, 0's: 0 Z-trim: 30 B-trim: 153 in 1/39 Lambda= 0.085727 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486) 3010 386.8 3.4e-107 KIAA1250 ( 1777 res) pf01137 (1777) 568 84.6 2.3e-16 KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059) 539 80.7 1.9e-15 KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089) 505 76.5 3.6e-14 KIAA1636 ( 1864 res) ff02660 (1864) 406 64.6 2.5e-10 KIAA0957 ( 693 res) hj05670 ( 693) 377 60.5 1.6e-09 KIAA0229 ( 1180 res) ha02570 (1180) 365 59.3 6.2e-09 KIAA1785 ( 617 res) fh12727 ( 617) 320 53.4 1.9e-07 KIAA1334 ( 989 res) fh15842 ( 989) 323 54.0 2e-07 KIAA1876 ( 803 res) pf01162s1 ( 803) 316 53.0 3.2e-07 FLJ00040 ( 1060 res) as00040 (1060) 304 51.7 1.1e-06 KIAA0823 ( 578 res) hh02763s1 ( 578) 269 47.0 1.5e-05 KIAA1977 ( 606 res) fh18284(revised) ( 606) 269 47.1 1.5e-05 KIAA1758 ( 1662 res) fh20539(revised) (1662) 262 46.7 5.3e-05 KIAA0396 ( 627 res) hg00180s1 ( 627) 251 44.8 7.2e-05 KIAA0865 ( 1900 res) hk06640y1 (1900) 259 46.4 7.5e-05 KIAA1728 ( 1644 res) pg00239 (1644) 250 45.2 0.00015 KIAA1561 ( 1416 res) fh20178s1 (1416) 248 44.9 0.00016 KIAA0172 ( 1366 res) ha02512s1 (1366) 239 43.8 0.00034 KIAA1074 ( 1715 res) hj06637 (1715) 240 44.0 0.00036 KIAA1981 ( 862 res) fk03148(revised) ( 862) 228 42.2 0.00064 KIAA1518 ( 876 res) sh00483 ( 876) 221 41.3 0.0012 KIAA1146 ( 271 res) hg00368 ( 271) 203 38.5 0.0026 KIAA2015 ( 996 res) fk09763 ( 996) 205 39.4 0.005 KIAA1255 ( 1232 res) hh14633s1 (1232) 186 37.1 0.03 FLJ00160 ( 1696 res) sh06621 (1696) 188 37.6 0.031 KIAA1323 ( 396 res) fh13878 ( 396) 168 34.4 0.066 KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 ( 781) 172 35.2 0.073 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 165 34.5 0.17 KIAA0946 ( 667 res) hj04787 ( 667) 159 33.5 0.2 KIAA0771 ( 948 res) hk05113 ( 948) 160 33.8 0.23 KIAA1716 ( 804 res) hj06603 ( 804) 158 33.5 0.25 KIAA1121 ( 1390 res) hh10147 (1390) 161 34.1 0.27 KIAA0050 ( 796 res) ha01557 ( 796) 148 32.2 0.58 KIAA0517 ( 792 res) hg00752 ( 792) 144 31.7 0.81 KIAA0148 ( 704 res) fh23975 ( 704) 143 31.5 0.82 KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022) 142 31.6 1.1 KIAA1407 ( 744 res) fh00894(revised) ( 744) 136 30.7 1.5 KIAA0646 ( 486 res) hj03808 ( 486) 126 29.3 2.8 KIAA0167 ( 844 res) ha01026 ( 844) 129 29.9 3.1 KIAA1386 ( 1214 res) fj06274 (1214) 131 30.3 3.3 KIAA0127 ( 315 res) ha03921 ( 315) 119 28.2 3.8 KIAA0257 ( 1805 res) ha07065 (1805) 132 30.7 3.9 KIAA1538 ( 1029 res) fg06773 (1029) 126 29.6 4.5 KIAA1743 ( 1036 res) pj01380s1 (1036) 125 29.5 4.9 KIAA1286 ( 1214 res) hh11961(revised) (1214) 126 29.7 5 KIAA0363 ( 1522 res) hh00103 (1522) 126 29.8 5.8 FLJ00277 ( 357 res) sh01540 ( 357) 112 27.4 7.5 KIAA1537 ( 619 res) fj02581s1 ( 619) 115 28.0 8.3 KIAA0048 ( 627 res) ha01311 ( 627) 115 28.0 8.4 >>KIAA0697 ( 2486 res) hk04486s1 (2486 aa) initn: 5513 init1: 2924 opt: 3010 Z-score: 2017.8 bits: 386.8 E(): 3.4e-107 Smith-Waterman score: 6845; 79.076% identity (90.115% similar) in 1386 aa overlap (110-1486:9-1364) 80 90 100 110 120 130 FLJ002 SGTGGGDAALDFKLAAAVLRTGGGGGASGSDEDEVSEVESFILDQEDLDNPVLKTTSEIF .:.::::::::::::.::.::.:.:.:... 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KIAA06 GVGE-QLSEGDYARLQQVDPVLLKD----EPQQT---AAQMGFAPIQPLAMPQALPLAAG 800 810 820 830 840 850 980 990 1000 1010 1020 1030 FLJ002 LGSNGT--NSLELQKVSGNQQIVGQPQIAITGHDQGLLVQEPDGLMVATPAQTLTDTLDD :. : ::: : .: ..:: :.: : ::.:.. .:::::.:::::.::::: KIAA06 PLPPGSIANLTELQGVIVGQPVLGQAQLA--GLGQGILTETQQGLMVASPAQTLNDTLDD 860 870 880 890 900 1040 1050 1060 1070 1080 1090 FLJ002 LIAAVSTRVPTGSNSSSQTTECLTPESCSQTTSNVASQS-MPPVYPSVDIDAHTESNHDT ..: :: :. . ::. ... . . : : . : : : :.::..::::.::::::: KIAA06 IMA-VSGRASAMSNTPTHSIAASISQPQTPTPSPIISPSAMLPIYPAIDIDAQTESNHDT 910 920 930 940 950 960 1100 1110 1120 1130 1140 1150 FLJ002 ALTLACAGGHEELVSVLIARDAKIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDKGGDIEAQ ::::::::::::::..:. : :.:::::::::::::::::::::::::::::.:.::::: KIAA06 ALTLACAGGHEELVQTLLERGASIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDNGADIEAQ 970 980 990 1000 1010 1020 1160 1170 1180 1190 1200 1210 FLJ002 SERTKDTPLSLACSGGRQEVVDLLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIKILLNA :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA06 SERTKDTPLSLACSGGRQEVVELLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIKILLNA 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1220 1230 1240 1250 1260 1270 FLJ002 GAEINSRTGSKLGISPLMLAAMNGHVPAVKLLLDMGSDINAQIETNRNTALTLACFQGRA :::::::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::. 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KIAA12 ALMWACYKGRTDVVELLLSHGANPSVTGLYSVYPIIWAAGRGHADIVHLLLQNGAKVNCS 120 130 140 150 160 170 490 500 510 520 530 540 FLJ002 NDEGYTPLMEAAREGHEEMVALLLAQGANINAQTEETQETALTLACCGGFSEVADFLIKA . : :::. :::.:: : : :::.::... : .. ::: .: ::... . ..: KIAA12 DKYGTTPLVWAARKGHLECVKHLLAMGADVD-QEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKR 180 190 200 210 220 230 550 560 570 580 590 FLJ002 GADIEL---GCSTPLMEASQEGHLELVKYLLASGANVHATTATGDTALTYACENGHTDVA . ...: .: :: ::.::: :.:. :: .:. :. .:::.: : ..::.... KIAA12 NPNVNLTDKDGNTALMIASKEGHTEIVQDLLDAGTYVNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIV 240 250 260 270 280 290 600 610 620 630 640 FLJ002 DVLLQAGADLD-KQEDMKTIL-----EG--------IDPAKHQEHESEGGRTPLMKAARA .::: ::.: . .: :: : .: .. : .. :.:::.::.. KIAA12 RALLQKYADIDIRGQDNKTALYWAVEKGNATMVRDILQCNPDTEICTKDGETPLIKATKM 300 310 320 330 340 350 650 660 670 680 690 700 FLJ002 GHLCTVQFLISKGANVNRATANNDHTVVSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTM .. .:..:..:::.:. . ..: : . .: : ..:::: .: ::: . KIAA12 RNIEVVELLLDKGAKVSAVDKKGD-TPLHIAIRGRSRKLAELLL---RNP----KDGR-L 360 370 380 390 400 710 720 730 740 750 760 FLJ002 LIEAAKGGHTNVVSYLLD--YPNNVLSVPTTDVSQLPPPSQDQSQVPRVPTHTLAMVVPP : . :.:.: : .: . ...:. . .: : : ... .. :.. KIAA12 LYRPNKAGET---PYNIDCSHQKSILT-QIFGARHLSPTETDGDMLGY-DLYSSALADIL 410 420 430 440 450 770 780 790 800 810 FLJ002 QEPDRTSQENSPALLGV--QKGTSKQKSSSLQVADQDLLPSFHPYQ--PLECIVEETEGK .:: : : : .:. : :..: : : .: . .: : :: KIAA12 SEP--TMQ--PPICVGLYAQWGSGK---SFLLKKLEDEMKTFAGQQIEPLFQFSWLIVFL 460 470 480 490 500 510 820 830 840 850 860 870 FLJ002 LNELGQRISAIEKAQLKSLELIQGEPLNKDKIEELKKNREEQVQKKKKILKELQKVERQL KIAA12 TLLLCGGLGLLFAFTVHPNLGIAVSLSFLALLYIFFIVIYFGGRREGESWNWAWVLSTRL 520 530 540 550 560 570 >>KIAA0379 ( 1059 res) hh00505s1 (1059 aa) initn: 987 init1: 325 opt: 539 Z-score: 370.5 bits: 80.7 E(): 1.9e-15 Smith-Waterman score: 727; 25.845% identity (52.968% similar) in 1095 aa overlap (219-1298:14-973) 190 200 210 220 230 240 FLJ002 LTSSVSCALDEAAAALTRMKAENSHNAGQVDTRSLAEACSDGDVNAVRKLLDEGRSVNEH : ::..: .:: . :: :. . ..:: . KIAA03 GAEATAMAFLKLRDQPSLVQAIFNGDPDEVRALIFKKEDVNFQ 10 20 30 40 250 260 270 280 290 300 FLJ002 TEEGESLLCLACSAGYYELAQVLLAMHANVEDRGNKGDITPLMAASSGGYLDIVKLLLLH .: .. : : : :. ..:. : :. . .: .::: : .. . :..:: : KIAA03 DNEKRTPLHAAAYLGDAEIIELLILSGARVNAKDSKW-LTPLHRAVASCSEEAVQVLLKH 50 60 70 80 90 100 310 320 330 340 350 360 FLJ002 DADVNSQSATGNTALTYACAGGFVDIVKVLLNEGANIEDHNENGHTPLMEAASAGHVEVA .::::... . .: : : :. : ...:. .:.. .. :.: : .:: .:: :.. KIAA03 SADVNARDKNWQTPLHIAAANKAVKCAEALVPLLSNVNVSDRAGRTALHHAAFSGHGEMV 110 120 130 140 150 160 370 380 390 400 410 420 FLJ002 RVLLDHGAGINTHSNEFKESALTLACYKGHLDMVRFLLEAGADQEHKTDEMHTALMEACM ..::..::.::. ... . :. : : ::...:..:. ::. : . .: : : KIAA03 KLLLSRGANINAFDKK-DRRAIHWAAYMGHIEVVKLLVSHGAEVTCKDKKSYTPLHAAAS 170 180 190 200 210 220 430 440 450 460 470 480 FLJ002 DGHVEVARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTLAACGGHVELAALLIERGANLEEVNDEGYTP .: . :.. ::: :...: : ..:: .: .:. .. ::. :: ... :..:.:: KIAA03 SGMISVVKYLLDLGVDMNEPNAYGNTPLHVACYNGQDVVVNELIDCGAIVNQKNEKGFTP 230 240 250 260 270 280 490 500 510 520 530 540 FLJ002 LMEAAREGHEEM-VALLLAQGANINAQTEETQETALTLACCGGFSEVADFLIKAGADIEL : :: : . . ::...::..: .... . : : ::. .. .:..:: :. KIAA03 LHFAAASTHGALCLELLVGNGADVNMKSKDGKTPLHMTALHGRFSR-SQTIIQSGAVID- 290 300 310 320 330 550 560 570 580 590 600 FLJ002 GC-----STPLMEASQEGHLELVKYLLASGANVHATTATGDTALTYACENGHTDVADVLL : .::: :.. :: :.. :..:::.. : : : .: .: :: KIAA03 -CEDKNGNTPLHIAARYGHELLINTLITSGADTAKRGIHGMFPLHLAALSGFSDCCRKLL 340 350 360 370 380 390 610 620 630 640 650 660 FLJ002 QAGADLDKQEDMKTILEGIDPAKHQEHESEGGRTPLMKAARAGHLCTVQFLISKGANVNR ..: :.: .:. ::: : :: .:.: ...:.. ::. :. KIAA03 SSGFDIDTPDDF-------------------GRTCLHAAAAGGNLECLNLLLNTGADFNK 400 410 420 430 670 680 690 700 710 720 FLJ002 ATANNDHTVVSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTN-VVSYLL . .. . : :. . . :.. ::. . . : : : :: . . . ::: KIAA03 KD-KFGRSPLHYAAANCNYQCLFALVGSGASVNDLDERGCTPLHYAATSDTDGKCLEYLL 440 450 460 470 480 490 730 740 750 760 770 780 FLJ002 DYPNNVLSVPTTDVSQLPPPSQDQSQVPRVPTHTLAM-VVPPQEPDRTSQENSPALLGVQ : : .: . . . . : : . .. . : . .:.: KIAA03 RNDAN----PGIRDKQ----GYNAVHYSAAYGHRLCLQLIASETPLDVLMETS------- 500 510 520 530 540 790 800 810 820 830 FLJ002 KGTSKQKSSSLQVADQDL-LPSFHPY-QPLECIVEETEGKLNELGQRISAIEKAQLKSLE ::. ..:. ... . : : ..: . : :: .:. .: .: : :. .. : .: KIAA03 -GTDMLSDSDNRATISPLHLAAYHGHHQALEVLVQ----SLLDLDVRNSS-GRTPL-DLA 550 560 570 580 590 840 850 860 870 880 890 FLJ002 LIQGEPLNKDKIEELKKNREEQVQKKKKILKELQKVERQLQMKTQQQFTKEYLETKGQKD ..:. : . :. .. : :::. : . KIAA03 AFKGHVECVDVL----INQGASILVKDYILKR----------------------TPIHAA 600 610 620 630 900 910 920 930 940 950 FLJ002 TVSLHQQCSHRGVFPEGEGDGSLPEDHFSELPQVDTILFKDNDVDDEQQSPPSAEQIDFV ... :..: : .. ..: :: ... ..:.. :.: .. KIAA03 ATNGHSECL-RLLIGNAE-------------PQ-NAVDIQDGN----GQTPLMLSVLN-- 640 650 660 960 970 980 990 1000 1010 FLJ002 PVQPLSSPQCNFSSDLGSNGTNSLELQKVSGNQQIVGQPQIAITGHDQGLLVQEPDGLMV . .: .: : ..:.: .: . . : :.:::.. . :.:. KIAA03 -----GHTDCVYS--LLNKGANVDAKDKWGRTALHRG----AVTGHEECV-----DALLQ 670 680 690 700 710 1020 1030 1040 1050 1060 1070 FLJ002 ATPAQTLTDTLDDLIAAVSTRVPTGSNSSSQTTECLTPESCSQTTSNVASQSMPPVYPSV : :. :.: ... :.. .: . . . :. KIAA03 HGAKCLLRDS--------RGRTPIHLSAA-----------CGHI--GVLGALLQSA-ASM 720 730 740 750 1080 1090 1100 1110 1120 1130 FLJ002 DIDAHTESNHD-TALTLACAGGHEELVSVLIARDAKIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVV : . : .:: ::: :: .::: : .:. ... ... . ..:.:: :. . :.. KIAA03 DANPATADNHGYTALHWACYNGHETCVELLLEQEV-FQKTEGNAFSPLHCAVINDNEGAA 760 770 780 790 800 810 1140 1150 1160 1170 1180 1190 FLJ002 EILLDK-GGDIEAQSERTKDTPLSLACSGGRQEVVDLLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAA :.:.: :..: .. ::: : . : ..:::...:. . . . ::: .:: KIAA03 EMLIDTLGASIVNATDSKGRTPLHAAAFTDHVECLQLLLSHNAQVNSVDSTGKTPLMMAA 820 830 840 850 860 870 1200 1210 1220 1230 1240 1250 FLJ002 SGGYVNIIKILLN-AGAEINSRTGSKLGISPLMLAAMNGHVPAVKLLLDMGSDINAQIET .: .: ...:.. :.::.. . .:: . : :: .:: .. :.:. .: : : KIAA03 ENGQTNTVEMLVSSASAELTLQDNSK--NTALHLACSKGHETSALLILEKITDRNLINAT 880 890 900 910 920 1260 1270 1280 1290 1300 1310 FLJ002 NR--NTALTLACFQGRAEVVSLLLDRKANVEHRAKTGLTPLMEAASGGYAEVGRVLLDKG : .: : .: .: . ::. :: . :.: ..: :: . : KIAA03 NAALQTPLHVAARNGLTMVVQELLGKGASVLAVDENGYTPALACAPNKDVADCLALILAT 930 940 950 960 970 980 1320 1330 1340 1350 1360 1370 FLJ002 ADVNAPPVPSSRDTALTIAADKGHYKFCELLIHRGAHIDVRNKKGNTPLWLASNGGHFDV KIAA03 MMPVSSSSPLSSLTFNAINRYTNTSKTVSFEALPIMRNEPSSYCSFNNIGGEQEYLYTDV 990 1000 1010 1020 1030 1040 >>KIAA1223 ( 1089 res) pg00513 (1089 aa) initn: 1162 init1: 268 opt: 505 Z-score: 347.7 bits: 76.5 E(): 3.6e-14 Smith-Waterman score: 868; 27.494% identity (57.178% similar) in 822 aa overlap (211-1007:263-1049) 190 200 210 220 230 240 FLJ002 ADPEVLRRLTSSVSCALDEAAAALTRMKAENSHNAGQVDTRSLAEACSDGDVNAVRKLLD : ... : .: : : ...: :: KIAA12 IEDAHGHTPLTLAARQGHTKVVNCLIGCGANINHTDQDGWTALRSAAWGGHTEVVSALLY 240 250 260 270 280 290 250 260 270 280 290 300 FLJ002 EGRSVNEHTEEGESLLCLACSAGYYELAQVLLAMHANVEDRGNKGDITPLMAASSGGYLD : .:. .....: : .:. ... :: :.:. :.: : :.::. :. . KIAA12 AGVKVDCADADSRTVLRAAAWGGHEDIVLNLLQHGAEVNKADNEGR-TALIAAAYMGHRE 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 FLJ002 IVKLLLLHDADVNSQSATGNTALTYA--C---AGGFVDIVKVLLNEGANIEDHNENGHTP ::. :: : :.:: ... : :::. : : . : ...:..:...::... ...: :: KIAA12 IVEHLLDHGAEVNHEDVDGRTALSVAALCVPASKGHASVVSLLIDRGAEVDHCDKDGMTP 360 370 380 390 400 410 360 370 380 390 400 410 FLJ002 LMEAASAGHVEVARVLLDHGAGINTHSNEFKESALTLACYKGHLDMVRFLLEAGADQEHK :. :: :::.:. .::. :: .. :... .. : : :: ..: :: :: . KIAA12 LLVAAYEGHVDVVDLLLEGGADVD-HTDNNGRTPLLAAASMGHASVVNTLLFWGAAVDSI 420 430 440 450 460 470 420 430 440 450 460 470 FLJ002 TDEMHTALMEACMDGHVEVARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTLAACGGHVELAALLIERG .: .:.: : .:.:::.: ::: : . : :. .:: .:: :: . :::.: KIAA12 DSEGRTVLSIASAQGNVEVVRTLLDRGLDENHRDDAGWTPLHMAAFEGHRLICEALIEQG 480 490 500 510 520 530 480 490 500 510 520 530 FLJ002 ANLEEVNDEGYTPLMEAAREGHEEMVALLLAQGANINAQTEETQETALTLACCGGFSEVA : .:....: :.. :..::: . : .:: . .::. : ..:: .: : ... KIAA12 ARTNEIDNDGRIPFILASQEGHYDCVQILLENKSNID-QRGYDGRNALRVAALEGHRDIV 540 550 560 570 580 540 550 560 570 580 590 FLJ002 DFLIKAGADIELGCST----PLMEA-SQEGHLELVKYLLASGANVHATTATGDTALTYAC ..:.. :::.. :. : . . :..: ...:.: .::::.:. : : ::: .: KIAA12 ELLFSHGADVN--CKDADGRPTLYILALENQLTMAEYFLENGANVEASDAEGRTALHVSC 590 600 610 620 630 640 600 610 620 630 640 650 FLJ002 ENGHTDVADVLLQAGADLDKQEDMKTILEGIDPAKHQEHESEGGRTPLMKAARAGHLCTV .:: ....::. ::.. .. : :. :..:: ::. .: KIAA12 WQGHMEMVQVLIAYHADVNAADNEK-------------------RSALQSAAWQGHVKVV 650 660 670 680 660 670 680 690 700 710 FLJ002 QFLISKGANVNRATANNDHTVVSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAK :.:: .:: :.. : :. :.. .: ::. ::..:: :::::.: . : : . ::: KIAA12 QLLIEHGAVVDH-TCNQGATALCIAAQEGHIDVVQVLLEHGADPNHADQFGRTAMRVAAK 690 700 710 720 730 740 720 730 740 750 760 770 FLJ002 GGHTNVVSYLLDYPNNVLSVPTTDVSQLPPPSQDQSQVPRVPTHTLAMVVPPQEPDRTSQ .::..... : : . :. : : ...:. . . ... .... . :. KIAA12 NGHSQIIKLLEKYGASSLN----GCSPSPVHTMEQKPLQSLSSKVQSLTIKSNSSGSTGG 750 760 770 780 790 800 780 790 800 810 820 FLJ002 -ENSPALLGVQKGTSKQKSSSLQVADQDLLPSFHPYQPLECIVEETEGKLNELGQRISAI . .:.: :. .: .. :: . :. . : . ... : . :. KIAA12 GDMQPSLRGLPNGPTHAFSSPSESPDSTV-----DRQKSSLSNNSLKSSKNSSLRTTSST 810 820 830 840 850 830 840 850 860 870 880 FLJ002 EKAQLKSLELIQGEPLNKDKIEE--LKKNREEQ-VQKKKKILKELQKVERQLQMKTQQQF :: .. ... .. ..:.. : ..: .: . . .. . : . . . . . . . KIAA12 ATAQTVPIDSFHNLSFT-EQIQQHSLPRSRSRQSIVSPSSTTQSLGQSHNSPSSEFEWSQ 860 870 880 890 900 910 890 900 910 920 930 940 FLJ002 TKEYLE-TKGQKDTVSLHQQCSHRGVFPEGEGDGSLPEDHFSELPQVDT--ILFKDNDVD .: :. ::..: : .. : . ....: :. :. : : . :.. . KIAA12 VKPSLKSTKASKGGKSENSAKSGSAGKKAKQSNSSQPKVLEYEMTQFDRRGPIAKSGTAA 920 930 940 950 960 970 950 960 970 980 990 FLJ002 DEQQSPPSAEQIDFVPV--QPLSSPQCNFSSDLGS------NGTNSLELQKVSGNQQIVG .: : .. ..: : .. : .: : :: . ....:: ..: KIAA12 PPKQMPAESQCKIMIPSAQQEIGRSQQQFLIHQQSGEQKKRNGIMTNPNYHLQSNQVFLG 980 990 1000 1010 1020 1030 1000 1010 1020 1030 1040 1050 FLJ002 QPQIAITGHDQGLLVQEPDGLMVATPAQTLTDTLDDLIAAVSTRVPTGSNSSSQTTECLT . .. : .:.: KIAA12 RVSVPRTMQDRGHQEVLEGYPSSETELSLKQALKLQIEGSDPSFNYKKETPL 1040 1050 1060 1070 1080 >>KIAA1636 ( 1864 res) ff02660 (1864 aa) initn: 483 init1: 254 opt: 406 Z-score: 278.8 bits: 64.6 E(): 2.5e-10 Smith-Waterman score: 519; 32.048% identity (57.590% similar) in 415 aa overlap (299-692:737-1097) 270 280 290 300 310 320 FLJ002 QVLLAMHANVEDRGNKGDITPLMAASSGGYLDIVKLLLLHDADVNSQSATGNTA--LTYA . . .::.: :..: .. . :.: : KIAA16 SSILQGLWISYSTEGLSMALASLRNLYTPNIKVSRLLILGGANINYRTEVLNNAPILCVQ 710 720 730 740 750 760 330 340 350 360 370 380 FLJ002 CAGGFVDIVKVLLNEGANIEDHNENGHTPLMEAASAGHVEVARVLLDHGAGINTHSNEFK :....: .::. :::.. .:.: ::: ::.::.. .. .: . : .. : .. KIAA16 SHLGYTEMVALLLEFGANVDASSESGLTPLGYAAAAGYLSIVVLLCKKRAKVD-HLDKNG 770 780 790 800 810 820 390 400 410 420 430 FLJ002 ESALTLACYKGHLDMVRFLLE-----AGADQE--HKTDEMHTALMEACMDGHVEVARLLL . ::. : .:::..:.::.. :: .: .:. .. ::. : :..:.. :: KIAA16 QCALVHAALRGHLEVVKFLIQCDWTMAGQQQGVFKKSHAIQQALIAAASMGYTEIVSYLL 830 840 850 860 870 880 440 450 460 470 480 FLJ002 D---------SGAQVNMPADSF--ESPLTLAACGGHVELAALLIERGANLEEVNDEGYTP : ::.: ::. :. :: :: :..:. ::.:.:: . . : .: .: KIAA16 DLPEKDEEEVERAQIN-SFDSLWGETALTAAAGRGKLEVCRLLLEQGAAVAQPNRRGAVP 890 900 910 920 930 940 490 500 510 520 530 540 FLJ002 LMEAAREGHEEMVALLLAQGANINAQTEETQETALTLACCGGFSEVADFLIKAGADIELG :. ..:.:: ..: :::..::..: .:: : : KIAA16 LFSTVRQGHWQIVDLLLTHGADVN---------------------MAD---KQG------ 950 960 970 550 560 570 580 590 600 FLJ002 CSTPLMEASQEGHLELVKYLLASGANVHATTATGDTALTYACENGHTDVADVLLQAGADL :::: :..:::: : .:::.::.. : :::..:: .:: .:. :.. :: KIAA16 -RTPLMMAASEGHLGTVDFLLAQGASIALMDKEGLTALSWACLKGHLSVVRSLVDNGAAT 980 990 1000 1010 1020 1030 610 620 630 640 650 660 FLJ002 DKQEDMKTILEGIDPAKHQEHESEGGRTPLMKAARAGHLCTVQFLISKGANVNRATANND : : ...::::: :: : .::::...:: .... .. KIAA16 D-------------------HADKNGRTPLDLAAFYGDAEVVQFLVDHGAMIEHVDYSGM 1040 1050 1060 1070 670 680 690 700 710 720 FLJ002 HTV-VSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTNVVSYLLDYPNNV . . ...: . .:: :: .:: KIAA16 RPLDRAVGCR--NTSVVVTLLKKGAKIGPATWAMATSKPDIMIILLSKLMEEGDMFYKKG 1080 1090 1100 1110 1120 1130 >>KIAA0957 ( 693 res) hj05670 (693 aa) initn: 422 init1: 200 opt: 377 Z-score: 264.4 bits: 60.5 E(): 1.6e-09 Smith-Waterman score: 381; 27.651% identity (54.886% similar) in 481 aa overlap (456-902:15-464) 430 440 450 460 470 480 FLJ002 ACMDGHVEVARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTLAACGGHVELAALLIERGANLEEVNDEG : .:: :..: .. ::..:: . :. .: KIAA09 FMSQQDAVAALSERLLVAAYKGQTENVVQLINKGARVA-VTKHG 10 20 30 40 490 500 510 520 530 540 FLJ002 YTPLMEAAREGHEEMVALLLAQGANINAQTEETQETALTLACCGGFSEVADFLIKAGADI ::: :: .:: .: .:: : ....: .. ..::: : : .:. ::. : . KIAA09 RTPLHLAANKGHLPVVQILLKAGCDLDVQ-DDGDQTALHRATVVGNTEIIAALIHEGCAL 50 60 70 80 90 100 550 560 570 580 590 600 FLJ002 EL---GCSTPLMEASQEGHLELVKYLLASGANVHATTATGDTALTYACENGHTDVADVLL . .: : ::: .: . .: :. .:::: : . .:.::: ::.:.:.. . ::: KIAA09 DRQDKDGNTALHEASWHGFSQSAKLLVKAGANVLAKNKAGNTALHLACQNSHSQSTRVLL 110 120 130 140 150 160 610 620 630 640 650 660 FLJ002 QAGADLDKQEDMKTILEGIDPAKHQEHESEGGRTPLMKAARAGHLCTVQFLISKGANVNR ::. . :.: ...: : : ::: .:: ...:.. .:.. KIAA09 LAGS----RADLK---------------NNAGDTCLHVAARYNHLSIIRLLLTAFCSVHE 170 180 190 200 670 680 690 700 710 720 FLJ002 ATANNDHTVVSLACAGGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTNVVSYLLD . .: :.. .: : .: :...:: ::: : . :.: : : .. .:. : KIAA09 KNQAGD-TALHVAAALNHKKVAKILLEAGADTTIVNNAGQTPLETARYHNNPEVALLLTK 210 220 230 240 250 260 730 740 750 760 FLJ002 YPNNVLSV---PTTD-------------VSQLPPP--SQDQSQVPRVPTHTLAMVVPPQE :.. .:. :... .: : : ..:. . : . ... .:: . KIAA09 APQGSVSAGDTPSSEQAVARKEEAREEFLSASPEPRAKDDRRRKSRPKVSAFSDPTPPAD 270 280 290 300 310 320 770 780 790 800 810 820 FLJ002 PDRTSQENSPALLGVQKGTSKQKSSSLQVADQDLLPSFHPYQPLECIVEETEGKLNEL-- . :.: : . : .... :: . :. :: : . . .::. . 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KIAA02 KRLSSGFGGGGGGGSGGGGGGSGGGGGGLGSSSHPLSSLLSMWRGPNVNCVDSTGYTPLH 80 90 100 110 120 130 1090 1100 1110 1120 1130 1140 FLJ002 HDTALTLACAGGHEELVSVLIARDAKIEHRDKKGFTPLILAATAGHVGVVEILLDKGGDI : : .::...: ::. :: . :.:: :: ::: : . .:..:. .: . KIAA02 H------AALNGHKDVVEVLLRNDALTNVADSKGCYPLHLAAWKGDAQIVRLLIHQGPSH 140 150 160 170 180 1150 1160 1170 1180 1190 1200 FLJ002 EAQSERTKDTPLSLACSG--GRQEVVDLLLARGANKEHRNVSDYTPLSLAASGGYVNIIK .:...:. .: :.. :. ::: .:: . .. :: . :::.::: : ....: KIAA02 TRVNEQNNDNETALHCAAQYGHTEVVKVLLEELTDPTMRNNKFETPLDLAALYGRLEVVK 190 200 210 220 230 240 1210 1220 1230 1240 1250 1260 FLJ002 ILLNAGAEINSRTGSKLGISPLMLAAMNGHVPAVKLLLDMGSDINAQIETNRNTALTLAC .:::: .. : . .: .:: ::: ::: .:..::: : : : : : . .:: : KIAA02 MLLNAHPNLLSCNTKKH--TPLHLAARNGHKAVVQVLLDAGMDSNYQTEMG--SALHEAA 250 260 270 280 290 300 1270 1280 1290 1300 1310 FLJ002 FQGRAEVVSLLLDRKANVEHRAKTGLTPL---MEAASGGYAEVGRVLLD--------KGA . :...::..:: ..:. . . ::: : : : ... .. : : . 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