# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj07289.fasta.huge -Q ../query/FLJ00236.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00236, 702 aa vs ./tmplib.10216 library 2210292 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5299+/-0.00744; mu= -2.2698+/- 0.496 mean_var=409.9790+/-96.162, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.063342 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380) 310 43.0 0.00028 FLJ00154 ( 1471 res) sh06142 (1471) 217 34.5 0.1 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 217 34.5 0.11 KIAA0756 ( 1222 res) ff01911 (1222) 198 32.7 0.31 KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092) 201 33.2 0.36 KIAA1628 ( 980 res) fh14247(revised) ( 980) 183 31.2 0.71 KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073) 181 31.0 0.85 KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023) 172 30.2 1.5 KIAA1514 ( 1598 res) fh00815(revised) (1598) 171 30.3 2 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 175 31.0 2.1 KIAA0522 ( 1555 res) hg01393 (1555) 168 30.1 2.4 FLJ00148 ( 572 res) sh05404 ( 572) 148 27.7 4.7 KIAA0616 ( 634 res) hg03623 ( 634) 147 27.6 5.3 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 151 28.3 5.6 KIAA1029 ( 1015 res) fh00363 (1015) 150 28.2 5.8 KIAA0269 ( 567 res) ha06751 ( 567) 144 27.3 6 KIAA1496 ( 920 res) fj09513 ( 920) 145 27.6 7.5 FLJ00386 ( 811 res) sj04204 ( 811) 142 27.3 8.5 KIAA0181 ( 2079 res) ha02522s1 (2079) 149 28.5 9.6 KIAA0992 ( 772 res) hk07554 ( 772) 138 26.9 11 KIAA0235 ( 1064 res) ha04677s1 (1064) 141 27.4 11 KIAA0434 ( 1571 res) hh02165 (1571) 144 27.9 11 FLJ00308 ( 233 res) sh05935 ( 233) 125 25.0 12 KIAA0343 ( 1187 res) hg01457 (1187) 139 27.2 13 KIAA1858 ( 2469 res) ae00147 (2469) 145 28.2 14 KIAA0418 ( 989 res) hh00988 ( 989) 136 26.9 14 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 140 27.5 14 KIAA1744 ( 855 res) pj01516 ( 855) 134 26.6 14 KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 135 26.8 14 KIAA1355 ( 1189 res) fj01564 (1189) 135 26.9 17 KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217) 135 26.9 17 KIAA1902 ( 1112 res) hj04383 (1112) 134 26.8 17 FLJ00420 ( 613 res) sj09535 ( 613) 128 25.9 17 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 139 27.6 19 KIAA1203 ( 727 res) fg03361 ( 727) 128 26.0 19 KIAA1113 ( 1131 res) hj06379(revised) (1131) 132 26.6 19 KIAA0691 ( 762 res) hk03735 ( 762) 128 26.0 20 KIAA1002 ( 962 res) hk09859 ( 962) 130 26.3 20 KIAA0947 ( 2330 res) ef03552 (2330) 138 27.5 21 KIAA0618 ( 1052 res) hg03971 (1052) 130 26.4 21 KIAA0505 ( 200 res) hh00043 ( 200) 114 23.9 21 KIAA0775 ( 639 res) hk05255 ( 639) 125 25.6 21 KIAA1375 ( 546 res) fj04426 ( 546) 123 25.3 22 KIAA1733 ( 509 res) ph00321 ( 509) 122 25.2 23 KIAA1743 ( 1036 res) pj01380s1 (1036) 128 26.2 24 KIAA1511 ( 1253 res) fg04486(revised) (1253) 129 26.4 25 KIAA1935 ( 441 res) fk03135(revised) ( 441) 119 24.9 25 KIAA0442 ( 1266 res) hh03913 (1266) 129 26.4 25 FLJ00034 ( 1343 res) as00034 (1343) 129 26.4 26 KIAA0819 ( 989 res) hh01037 ( 989) 126 26.0 26 >>KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380 aa) initn: 569 init1: 295 opt: 310 Z-score: 170.2 bits: 43.0 E(): 0.00028 Smith-Waterman score: 455; 26.379% identity (52.931% similar) in 580 aa overlap (126-685:635-1157) 100 110 120 130 140 150 FLJ002 MCVATNSAGHRESRAARVSIQEPQDYTEPVELLAVRIQLENVTLLNPDPAEGPKPRPAVW :: : ..:.: ..:.: .: KIAA15 LSDPSPMSDPVRTQDISPPAQGVDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTP---------TTVQ 610 620 630 640 650 160 170 180 190 200 210 FLJ002 LSWKVSGPAAPAQSYTALFRTQTAPGGQGAPWA--EELLAGWQSAELGGLHWGQDYEFKV ..: :. :.: ...: ::. . : . . .:: : .:. : ::.:: KIAA15 VTWTVDRQPQFIQGYRVMYR-QTSGLQATSSWQNLDAKVPTERSAVLVNLKKGVTYEIKV 660 670 680 690 700 710 220 230 240 250 260 FLJ002 RPSSGRARGPDSNVLLLRLPEKVPSAPPQEVT-LKPG--NGT-VFVSWVPPPAENHNGII :: .. .: ::. .: :..:::::: :: : : :.: . ::: ::: ...:::: KIAA15 RPYFNEFQGMDSESKTVRTTEEAPSAPPQSVTVLTVGSYNSTSISVSWDPPPPDHQNGII 720 730 740 750 760 770 270 280 290 300 310 320 FLJ002 RGYQVWSLGNTSLPPANWTVVGEQTQLEIATHMPG-SYCVQVAAVTGAGAGEPSRPVCLL . :..: ::: . : :: . .. :. .:: .: :.::: :.::.: :.: .. KIAA15 QEYKIWCLGNETRFHINKTVDAAIRSVIIGGLFPGIQYRVEVAASTSAGVGVKSEPQPII 780 790 800 810 820 830 330 340 350 360 370 380 FLJ002 LEQAMERATQEPSEHGPWTLEQLRATLKRPEVIATCGVALWLLLLGTAVCIHRRRRARVH . . : . : .. ::. ..:.: :: : : :..:.: .. .. ::. : KIAA15 IGRRNEVVITENNNS---ITEQITDVVKQPAFIAGIGGACWVILMGFSIWLYWRRKKRKG 840 850 860 870 880 890 390 400 410 420 430 440 FLJ002 LGPGLYRYTSEDAILKHR------MDHSDSQ--WLADTWRSTSGSRDLSSSSSLSSRLGA :. . :. : .. .: . ::::.: .: : ...:.: ...: KIAA15 LSNYAVTFQRGDGGLMSNGSRPGLLNAGDPSYPWLADSWPAT--SLPVNNSNSGPNEIGN 900 910 920 930 940 450 460 470 480 490 500 FLJ002 DARDPLDCRRSLLSWDSRSPGVPLLPDTSTFYGSLIAELPSSTPARPSPQVPAVRRLPPQ .: : . . ... . .: : ...:.:. .. ..: : :. KIAA15 FGRG--DVLPPVPGQGDKT--ATMLSD-GAIYSSI--DFTTKTSYNSSSQITQ------- 950 960 970 980 990 510 520 530 540 550 FLJ002 LAQLSSPCSSSDSLCSRRGLSSPRLSLA-PAEAWKAKKKQELQHANSSPLLRDSHSLELR ..: .... : : : .:.. : ::.. .:. . . . : :... 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KIAA15 EHYA--VEQQENGYDSDSWCPPLPVQTYLHQGLEDELEEDDDRVPTPPVRGVASSPAISF 1090 1100 1110 1120 1130 1140 680 690 700 FLJ002 GEDQDSVLTPEEVALCLELSEGEETPR :... ..::: KIAA15 GQQSTATLTPSPREEMQPMLQAHLDELTRAYQFDIAKQTWHIQSNNQPPQPPVPPLGYVS 1150 1160 1170 1180 1190 1200 >>FLJ00154 ( 1471 res) sh06142 (1471 aa) initn: 235 init1: 110 opt: 217 Z-score: 124.0 bits: 34.5 E(): 0.1 Smith-Waterman score: 221; 34.228% identity (58.389% similar) in 149 aa overlap (200-336:8-149) 170 180 190 200 210 220 FLJ002 YTALFRTQTAPGGQGAPWAEELLAGWQSAELGGLHWGQDYEFKVRPSSGRARGPDS-NVL ..:: .. :.:.: . .:: : .. FLJ001 PEMTGVTVSGLTPARTYQFRVCAVNEVGRGQYSAETS 10 20 30 230 240 250 260 270 FLJ002 LLRLPEKVPSAPPQEVTLKP-GNGTVFVSWVPPPAENHNGIIRGYQV----------WSL : :::. :::::.... . : ...:.: ::: .:::..::: . .. 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KIAA02 PPRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNIDSVHATAFIIV 390 400 410 420 430 440 120 130 140 150 160 170 FLJ002 IQEPQDYTEPVELLAVRIQLENVTLLNPDPAEGPKPRPAVWLSWKVSGPAAPAQSYTALF :: . : . :. .:. :. :.: : .: KIAA02 QALPQFTVTPQD----RVVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQLSVDRRHLVLSSG 450 460 470 480 490 500 180 190 200 210 220 230 FLJ002 RTQTAPGGQGAPWAEELLAGWQSAELGGLHWGQDYEFKVRPSSGRARGPDSNVLLLRLPE KIAA02 TLRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVFASIPSDTTVEVGANVQLP 510 520 530 540 550 560 >>KIAA0756 ( 1222 res) ff01911 (1222 aa) initn: 164 init1: 85 opt: 198 Z-score: 115.5 bits: 32.7 E(): 0.31 Smith-Waterman score: 198; 32.773% identity (62.185% similar) in 119 aa overlap (31-142:497-613) 10 20 30 40 50 FLJ002 MGSGGDSLLGGRGSLPLLLLLIMVLREDFQIQPRDMV--AVVGEQFTLECGPPWGHPEPT ..::... ... .. :.: : .: : :: KIAA07 RAVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTRLDC-PFFGSPIPT 470 480 490 500 510 520 60 70 80 90 100 110 FLJ002 VSWWKDGKPLALQPGR-HTVSGGSLLMARAEKSDEGTYMCVATNSAGHRESRAARVSIQE . :.:.:. :. : :. .::: . .: :.: : ::::: :. :... :. ... KIAA07 LRWFKNGQGSNLDGGNYHVYENGSLEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQV-RLEVKD 530 540 550 560 570 580 120 130 140 150 160 170 FLJ002 PQD-YTEPVELLAVR---IQLENVTLLNPDPAEGPKPRPAVWLSWKVSGPAAPAQSYTAL : : : . .: : .::: . .: KIAA07 PTRIYRMPEDQVARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLYIGNRMKKEDDSLTIF 590 600 610 620 630 640 >>KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092 aa) initn: 248 init1: 89 opt: 201 Z-score: 114.4 bits: 33.2 E(): 0.36 Smith-Waterman score: 208; 21.053% identity (51.524% similar) in 361 aa overlap (21-366:723-1057) 10 20 30 40 50 FLJ002 MGSGGDSLLGGRGSLPLLLLLIMVLREDFQIQPRDMVAVVGEQFTLECGP ::. . : .:: .. .. :. .:.:. KIAA11 LQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSV 700 710 720 730 740 750 60 70 80 90 100 FLJ002 PWGHPEPTVSWWK---DGKPLALQP----GR-HTVSGGSLLMARAEKSDEGTYMCVATNS :.: : : : . .:.: .: :: . . ..:::. .. . : : :.: :.:. KIAA11 D-GYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNG 760 770 780 790 800 810 110 120 130 140 150 160 FLJ002 AGHRESRAARVSIQEPQDYT-EPVELLAVRIQLENVTLLNPDPAEGPKPRPAVWLSWKVS .: :.. .... : : .: .:.. . .... :.: .: . . :. . KIAA11 VGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNC----TARGERP---IIIRWE-K 820 830 840 850 860 170 180 190 200 210 FLJ002 GPAAPAQSYTALFRTQTAPGGQGAPWAEELLAGWQSAELGGLHWGQDYEFKVRP--SSGR : .. . . . : .: .:... . .: :.. :. . : :. KIAA11 GDTVIDPDRVMRYAIATKDNG------DEVVS---TLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGE 870 880 890 900 910 220 230 240 250 260 270 FLJ002 ARGPDSNVLLLRLPEKVPSAPPQEVTLKPGNGTVFVSWVPPPAENHNGIIRGYQVWSLGN :: :..: . : ::. . .. . :. . :.:: :... .. KIAA11 DRG------LIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQ--RFDGNSIITGFDIEYKNK 920 930 940 950 960 280 290 300 310 320 330 FLJ002 TS---LPPANWTVVGEQTQLEIATHMPGS-YCVQVAAVTGAGAGEPSRPVCLLLEQAMER .. . .. .. .: .:. :.: : ... . . : .:::. . . :.: KIAA11 SDSWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPD 970 980 990 1000 1010 1020 340 350 360 370 380 390 FLJ002 ATQEPSEHGPWTLEQLRATLKRPEVIATCGVALWLLLLGTAVCIHRRRRARVHLGPGLYR . : : .....: : :. :: KIAA11 GPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGD 1030 1040 1050 1060 1070 1080 400 410 420 430 440 450 FLJ002 YTSEDAILKHRMDHSDSQWLADTWRSTSGSRDLSSSSSLSSRLGADARDPLDCRRSLLSW KIAA11 SEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVA 1090 1100 1110 1120 1130 1140 >>KIAA1628 ( 980 res) fh14247(revised) (980 aa) initn: 237 init1: 119 opt: 183 Z-score: 109.1 bits: 31.2 E(): 0.71 Smith-Waterman score: 287; 26.667% identity (53.939% similar) in 330 aa overlap (2-323:42-344) 10 20 FLJ002 MGSGGDSLLGG--RGSLPLLLLLIMVLREDF :.:: .: : :.. :: : .. . KIAA16 RSSLERVNQGEVKVIGRGAREGGGGQAWGTGGGGRDLSCGIPRSASPLAPLAAPAITQAP 20 30 40 50 60 70 30 40 50 60 70 80 FLJ002 QIQPRDMVAVVGEQFTLECGPPWGHPEPTVSWWKDGKPLALQP-GRHTVSGG--SLLMAR . : .... .:. : :.:.:.. : ..: :: .: :: :.:: ::.... KIAA16 EALSRTRASTA--RFV--CRAS-GEPRPALRWLHNGAPL--RPNGRVKVQGGGGSLVITQ 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 FLJ002 AEKSDEGTYMCVATNSAGHRESRAARVSIQEPQDYTEPVELLAVRIQLENVTLLNPDPAE .: : :.::: :::: . :. . . . . :... :. KIAA16 IGLQDAGYYQCVAENSAGMACAAASLAVVVREGLPSAPTRVTAT---------------- 130 140 150 160 150 160 170 180 190 200 FLJ002 GPKPRPAVWLSWKVSGPAAPAQSYTAL-FRTQTAPGGQGAPWAEELLAGWQSAELGGLHW : :: ..:. : ... .. .. : : : ... . . .. :. KIAA16 -PLSSSAVLVAWER--PEMHSEQIIGFSLHYQKARGMDNVEYQFAVNNDTTELQVRDLEP 170 180 190 200 210 220 210 220 230 240 250 260 FLJ002 GQDYEFKVRPSSGRARGPDSNVLLLRLPEKVPSAPPQEVTLKPGNGTVFVSWVPPPAENH . :::: : : . . :. :.. . :::: :: .:. . . :.:.: : KIAA16 NTDYEFYVVAYSQLGASRTSTPALVHTLDDVPSAAPQLSLSSPNPSDIRVAWLPLPPSLS 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 FLJ002 NGIIRGYQV-WSLGNTSLPPANWTVVGEQTQLEIATHMPGS-YCVQVAAVTGAGAGEPSR :: . :.. ..::. . .. : :..::: . . .:.. : :...: :.:: : ::. KIAA16 NGQVVKYKIEYGLGKEDQIFST-EVRGNETQLMLNSLQPNKVYRVRISAGTAAGFGAPSQ 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 FLJ002 PVCLLLEQAMERATQEPSEHGPWTLEQLRATLKRPEVIATCGVALWLLLLGTAVCIHRRR KIAA16 WMHHRTPSMHNQSHVPFAPAELKVQAKMESLVVSWQPPPHPTQISGYKLYWREVGAEEEA 350 360 370 380 390 400 >>KIAA0806 ( 1073 res) hk04165(revised) (1073 aa) initn: 81 init1: 81 opt: 181 Z-score: 107.7 bits: 31.0 E(): 0.85 Smith-Waterman score: 181; 30.000% identity (54.286% similar) in 140 aa overlap (29-163:612-743) 10 20 30 40 50 FLJ002 MGSGGDSLLGGRGSLPLLLLLIMVLREDFQIQPRDMVAVVGEQFTLECGPPWGHPEPT : : :.. .: . :::. ::: : KIAA08 DEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMDLTIRTGAMARLECAAE-GHPAPQ 590 600 610 620 630 640 60 70 80 90 100 110 FLJ002 VSWWKDGK---PLALQPGRHTVSGGSLL-MARAEKSDEGTYMCVATNSAGHRESRAARVS .:: ::: : : . :.. ... .: .. : : : :.: :.:: : : .. KIAA08 ISWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGL-SANASLT 650 660 670 680 690 120 130 140 150 160 170 FLJ002 IQEPQDYTEPVELLAVRIQLENVTLLNPDPAEGPKPRPAVWLSW-KVSGPAAPAQSYTAL . : .. .:.: . ....:. . .: :: :.: : .:: KIAA08 VLETPSFIRPLE--DKTVTRGETAVLQCIAGGSPAPR----LNWTKDDGPLLVTERHFFA 700 710 720 730 740 750 180 190 200 210 220 230 FLJ002 FRTQTAPGGQGAPWAEELLAGWQSAELGGLHWGQDYEFKVRPSSGRARGPDSNVLLLRLP KIAA08 AANQLLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTLGTERGHIYLNVISSPNCDSSQSSIGHEDDGWTT 760 770 780 790 800 810 >>KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023 aa) initn: 128 init1: 90 opt: 172 Z-score: 103.4 bits: 30.2 E(): 1.5 Smith-Waterman score: 172; 28.099% identity (57.851% similar) in 121 aa overlap (38-155:643-760) 10 20 30 40 50 60 FLJ002 LLGGRGSLPLLLLLIMVLREDFQIQPRDMVAVVGEQFTLECGPPWGHPEPTVSWWKDGKP :..: . :..: : : :.:...: : : KIAA12 AEAPVILSVERNITKPEHNHLSVVVGGIVEAALGANVTIRC-PVKGVPQPNITWLKRGG- 620 630 640 650 660 670 70 80 90 100 110 120 FLJ002 LALQPGRHTVSGGSLLMARAEKSDEGTYMCVATNSAGHRESRAARVSIQEPQDYTEPVEL .:. . . .::::. . .::::.:.:::. :. . .. ... .. : : KIAA12 -SLSGNVSLLFNGSLLLQNVSLENEGTYVCIATNALGKAVATSVLHLLERRWPESRIVFL 680 690 700 710 720 130 140 150 160 170 180 FLJ002 LAVR---IQLENVTLLNPDPAEGPKPRPAVWLSWKVSGPAAPAQSYTALFRTQTAPGGQG . . .: :. . ::. : :. : KIAA12 QGHKKYILQATNTRTNSNDPTGEPPPQEPFWEPGNWSHCSATCGHLGARIQRPQCVMANG 730 740 750 760 770 780 190 200 210 220 230 240 FLJ002 APWAEELLAGWQSAELGGLHWGQDYEFKVRPSSGRARGPDSNVLLLRLPEKVPSAPPQEV KIAA12 QEVSEALCDHLQKPLAGFEPCNIRDCPARWFTSVWSQCSVSCGEGYHSRQVTCKRTKANG 790 800 810 820 830 840 >>KIAA1514 ( 1598 res) fh00815(revised) (1598 aa) initn: 260 init1: 94 opt: 171 Z-score: 100.9 bits: 30.3 E(): 2 Smith-Waterman score: 297; 28.261% identity (54.969% similar) in 322 aa overlap (21-325:167-459) 10 20 30 40 50 FLJ002 MGSGGDSLLGGRGSLPLLLLLIMVLREDFQIQPRDMVAVVGEQFTLECGP :.. : . :.:. .. : : .. :: KIAA15 LLISPTHISDAGTYTCLATNSRGVDEASADLVVWARTRITKPPQDQSVIKGTQASMVCGV 140 150 160 170 180 190 60 70 80 90 100 FLJ002 PWGHPEPTVS--WWKDGKPLALQ--PGRHTVSGGSLLMARAEKSDEGTYMCVATNSAGHR :. :. : ::: :. . : . .::: .... ..: ::: : . ::: KIAA15 T-HDPRVTIRYIWEKDGATLGTESHPRIRLDRNGSLHISQTWSGDIGTYTCRVI-SAGGN 200 210 220 230 240 250 110 120 130 140 150 160 FLJ002 ESRAARVSI-QEPQDYTEPVELLAVRIQLENVTLLNPDPAEGPKPRPAVWLSWKVSGPAA .::.:.. . : :. .:: :.. .: : :. :.: . KIAA15 DSRSAHLRVRQLPHAPEHPVATLST---VE---------------RRAINLTW-----TK 260 270 280 290 170 180 190 200 210 220 FLJ002 PAQSYTALFRTQTAPGGQGAPWAEELLAGWQ----SAELGGLHWGQDYEFKVRPSSGRAR : .. . :.: . ..:::. :::. . :. . :: ...:.:.. . .. KIAA15 PFDGNSPLIRYILEMSENNAPWTV-LLASVDPKATSVTVKGLVPARSYQFRLCAVNDVGK 300 310 320 330 340 350 230 240 250 260 270 FLJ002 GPDS-NVLLLRLPEKVPSAPPQEVTLKPG--NGTVFVSWVPPPAENHNGIIRGYQV-WSL : : .. . :::. :.::::.: . : : .....: ::: ..:::..:: . . : KIAA15 GQFSKDTERVSLPEEPPTAPPQNV-IASGRTNQSIMIQWQPPPESHQNGILKGYIIRYCL 360 370 380 390 400 280 290 300 310 320 330 FLJ002 GNTSLPPA----NWTVVGEQTQLEIATHMPGSYCVQVAAVTGAGAGEPSRPVCLLLEQAM .. :: . : : . .. : . .: ..::: ..:: : : : KIAA15 AG--LPVGYQFKNITDADVNNLLLEDLIIWTNYEIEVAAYNSAGLGVYSSKVTEWTLQGV 410 420 430 440 450 460 340 350 360 370 380 390 FLJ002 ERATQEPSEHGPWTLEQLRATLKRPEVIATCGVALWLLLLGTAVCIHRRRRARVHLGPGL KIAA15 PTVPPGNVHAEATNSTTIRFTWNAPSPQFINGINQGYKLIAWEPEQEEEVTMVTARPNFQ 470 480 490 500 510 520 >>KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584 aa) initn: 148 init1: 60 opt: 175 Z-score: 100.6 bits: 31.0 E(): 2.1 Smith-Waterman score: 175; 32.353% identity (57.843% similar) in 102 aa overlap (28-125:631-730) 10 20 30 40 50 FLJ002 MGSGGDSLLGGRGSLPLLLLLIMVLREDFQIQPRDMVAVVGEQFTLECGPPWGHPEP ::. . : .: .:: : : : :.: KIAA16 QARTAIIKSSWVKEICGIQQRLALPVWRPPDFEEELADCTAELGETVKLACRVT-GTPKP 610 620 630 640 650 60 70 80 90 100 110 FLJ002 TVSWWKDGKPLALQPGRHTVSG--GS--LLMARAEKSDEGTYMCVATNSAGHRESRAARV ..::.:::: . ..: . . :: :.. : : ::: :...::. : ... KIAA16 VISWYKDGKAVQVDPHHILIEDPDGSCALILDSLTGVDSGQYMCFAASAAGN-CSTLGKI 660 670 680 690 700 710 120 130 140 150 160 170 FLJ002 SIQEPQDYTEPVELLAVRIQLENVTLLNPDPAEGPKPRPAVWLSWKVSGPAAPAQSYTAL .: : ... : KIAA16 LVQVPPRFVNKVRASPFVEGEDAQFTCTIEGAPYPQIRWYKDGALLTTGNKFQTLSEPRS 720 730 740 750 760 770 702 residues in 1 query sequences 2210292 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:45:53 2009 done: Fri Feb 27 10:45:54 2009 Total Scan time: 0.690 Total Display time: 0.220 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]