# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj05401.fasta.huge -Q ../query/FLJ00216.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00216, 270 aa vs ./tmplib.10216 library 2210724 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3718+/-0.00443; mu= 18.2880+/- 0.299 mean_var=108.3891+/-23.499, 0's: 0 Z-trim: 0 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.123192 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 36, opt: 24, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0909 ( 1234 res) hk10471 (1234) 102 28.5 2.1 KIAA1961 ( 943 res) hk07733 ( 943) 100 28.0 2.3 KIAA1758 ( 1662 res) fh20539(revised) (1662) 95 27.5 5.9 KIAA1608 ( 872 res) fj20142 ( 872) 91 26.3 6.8 FLJ00268 ( 695 res) sj05723 ( 695) 90 26.0 6.8 FLJ00224 ( 896 res) sj06244 ( 896) 91 26.4 6.9 KIAA1298 ( 738 res) fg04206 ( 738) 90 26.1 7 KIAA1614 ( 1208 res) fj12973 (1208) 92 26.7 7.2 KIAA0250 ( 1122 res) ha02790 (1122) 89 26.2 10 FLJ00128 ( 1546 res) sh01521 (1546) 90 26.5 10 KIAA0168 ( 331 res) ha02316 ( 331) 83 24.3 11 KIAA0337 ( 1609 res) hg01226 (1609) 89 26.4 12 FLJ00279 ( 563 res) sh01691 ( 563) 84 24.8 13 KIAA1236 ( 1840 res) pg00641 (1840) 88 26.3 15 KIAA0948 ( 531 res) hj05004 ( 531) 82 24.4 16 KIAA1059 ( 1297 res) hh12158 (1297) 85 25.5 18 KIAA1870 ( 832 res) hh05136b ( 832) 83 24.9 18 KIAA0401 ( 344 res) hg01095 ( 344) 79 23.6 18 KIAA0061 ( 903 res) ha01242 ( 903) 83 24.9 19 FLJ00068 ( 1194 res) as00068 (1194) 84 25.3 19 KIAA1306 ( 1154 res) fh05845 (1154) 83 25.1 21 KIAA1924 ( 613 res) hh01339 ( 613) 79 24.0 25 KIAA1983 ( 418 res) fk09737(revised) ( 418) 77 23.4 26 FLJ00165 ( 146 res) sh07210 ( 146) 72 21.8 27 KIAA1780 ( 1192 res) pf01012 (1192) 81 24.8 27 KIAA1097 ( 980 res) hk07058 ( 980) 80 24.5 28 KIAA1819 ( 1173 res) hh00456 (1173) 80 24.6 31 KIAA2011 ( 1091 res) pj02017 (1091) 79 24.4 33 KIAA1249 ( 949 res) hh04184 ( 949) 78 24.1 35 KIAA1825 ( 1203 res) fj04975 (1203) 79 24.4 35 FLJ00248 ( 501 res) sj08681 ( 501) 75 23.1 36 FLJ00176 ( 403 res) sj00934 ( 403) 74 22.8 36 KIAA0936 ( 640 res) hh04647 ( 640) 76 23.5 36 KIAA0141 ( 536 res) ha03721 ( 536) 75 23.2 37 KIAA0958 ( 428 res) hj05707 ( 428) 74 22.8 37 FLJ00018 ( 1430 res) as00018 (1430) 79 24.5 39 KIAA1555 ( 2414 res) fh17482s2 (2414) 81 25.2 40 KIAA1967 ( 818 res) fj04244 ( 818) 76 23.6 41 FLJ00404 ( 261 res) sj07851 ( 261) 71 22.0 41 KIAA1831 ( 663 res) hk00543 ( 663) 75 23.3 42 KIAA1986 ( 334 res) pg00636 ( 334) 72 22.3 42 KIAA0607 ( 731 res) hh00181a ( 731) 75 23.4 44 FLJ00332 ( 201 res) sj03652 ( 201) 69 21.5 46 KIAA1513 ( 649 res) fh00168(revised) ( 649) 74 23.1 47 KIAA0039 ( 491 res) ha02030 ( 491) 72 22.6 51 KIAA1335 ( 2041 res) bf00973 (2041) 78 24.6 53 KIAA0811 ( 1123 res) hj04806 (1123) 75 23.7 55 KIAA0765 ( 952 res) hk04803s1 ( 952) 74 23.4 57 FLJ00193 ( 491 res) sj02629 ( 491) 71 22.4 58 FLJ00390 ( 322 res) sj04630 ( 322) 69 21.8 59 >>KIAA0909 ( 1234 res) hk10471 (1234 aa) initn: 86 init1: 50 opt: 102 Z-score: 100.5 bits: 28.5 E(): 2.1 Smith-Waterman score: 102; 29.371% identity (44.755% similar) in 143 aa overlap (117-241:393-524) 90 100 110 120 130 FLJ002 KWLLGLGHPWRLRSKNTQYLRGLLPRLAAHGTRPSLCHWKPGPA------LTCPDQGLC- ::.:: :.:: :. :..: KIAA09 LEQRAGGLTPTRHLAPQADPRPSMSLAVVVGTEPSAPPAPPSPAFDPDRFLNSPQRGQTY 370 380 390 400 410 420 140 150 160 170 180 190 FLJ002 -AGTWVTSPFPTRNFAALEVLREEEFSPLKNAEPADRDSPRTARQALLTQHYRWALRAGA .: :. :: : .: . ::: :..: .. : . :.. 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