# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj04945.fasta.huge -Q ../query/FLJ00208.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00208, 333 aa vs ./tmplib.10216 library 2210661 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.9982+/-0.0032; mu= 16.3701+/- 0.217 mean_var=67.1076+/-15.060, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.156563 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00293 ( 812 res) sh03709 ( 812) 2093 481.9 5.8e-137 FLJ00121 ( 448 res) sh00381 ( 448) 1923 443.2 1.4e-125 KIAA0727 ( 1010 res) hk03490y1 (1010) 1099 257.5 2.6e-69 KIAA0389 ( 1296 res) hj00061 (1296) 535 130.2 6.7e-31 KIAA0866 ( 1984 res) hk00546s1 (1984) 496 121.6 3.9e-28 FLJ00395 ( 1105 res) sj06062 (1105) 489 119.7 8.1e-28 KIAA1512 ( 2010 res) fg04660y1 (2010) 461 113.7 9.4e-26 KIAA0865 ( 1900 res) hk06640y1 (1900) 434 107.6 6.2e-24 KIAA1119 ( 1854 res) hf00569y1 (1854) 413 102.9 1.6e-22 KIAA1000 ( 1956 res) hk09604y2 (1956) 411 102.4 2.3e-22 KIAA0799 ( 2111 res) fg01615y1 (2111) 389 97.5 7.7e-21 KIAA2034 ( 1571 res) ah04445 (1571) 361 91.0 5.1e-19 KIAA0216 ( 2067 res) hf00331s1 (2067) 115 35.6 0.032 KIAA0062 ( 531 res) ha01020 ( 531) 82 27.4 2.4 KIAA1783 ( 1560 res) fg01285 (1560) 85 28.7 3 FLJ00217 ( 547 res) sj05423 ( 547) 79 26.8 3.9 KIAA1552 ( 726 res) fh16875 ( 726) 79 26.9 4.7 KIAA0402 ( 3284 res) hg01127s1 (3284) 85 29.1 4.7 FLJ00177 ( 526 res) sj01081 ( 526) 76 26.1 6.1 KIAA1937 ( 704 res) fk04595 ( 704) 76 26.2 7.4 FLJ00090 ( 770 res) as00090 ( 770) 76 26.3 7.8 KIAA1650 ( 797 res) hk02174 ( 797) 76 26.3 8 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 74 25.6 8.1 KIAA1055 ( 868 res) hh09512 ( 868) 76 26.3 8.4 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 74 25.6 8.5 KIAA1688 ( 1094 res) fh26207 (1094) 76 26.5 9.7 KIAA1626 ( 1284 res) fg01925(revised) (1284) 76 26.5 11 KIAA1043 ( 2126 res) af02720 (2126) 78 27.3 11 KIAA0200 ( 1042 res) ha02508 (1042) 75 26.2 11 KIAA1369 ( 653 res) fj03222 ( 653) 72 25.3 13 KIAA0601 ( 886 res) hg00838a ( 886) 73 25.7 14 KIAA1027 ( 2550 res) fh00156s1 (2550) 77 27.1 14 KIAA1011 ( 3541 res) ff02850 (3541) 78 27.5 15 KIAA0291 ( 1024 res) fh25236 (1024) 73 25.7 15 KIAA0955 ( 485 res) hj05544 ( 485) 70 24.7 15 KIAA1831 ( 663 res) hk00543 ( 663) 71 25.1 16 FLJ00191 ( 523 res) sj02390 ( 523) 70 24.7 16 KIAA0626 ( 433 res) hh00753 ( 433) 69 24.4 16 KIAA0201 ( 949 res) ha03256 ( 949) 72 25.5 17 KIAA0156 ( 963 res) ha03253 ( 963) 72 25.5 17 KIAA1931 ( 514 res) fj14393 ( 514) 69 24.5 18 KIAA1745 ( 893 res) pj01678 ( 893) 71 25.2 19 FLJ00139 ( 585 res) sh03241 ( 585) 69 24.5 20 KIAA0023 ( 2111 res) ha00512 (2111) 74 26.4 20 KIAA0262 ( 811 res) ha07073s1 ( 811) 70 24.9 21 KIAA1971 ( 830 res) fk08985 ( 830) 70 25.0 21 KIAA0266 ( 766 res) ha02755 ( 766) 69 24.7 23 KIAA0536 ( 1028 res) hg03863 (1028) 70 25.1 24 KIAA1154 ( 476 res) hh03679s1 ( 476) 66 23.7 27 KIAA1830 ( 486 res) hj01608 ( 486) 66 23.8 28 >>FLJ00293 ( 812 res) sh03709 (812 aa) initn: 2093 init1: 2093 opt: 2093 Z-score: 2552.3 bits: 481.9 E(): 5.8e-137 Smith-Waterman score: 2093; 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KIAA03 FRYLNRGCTRYFANKETDKQILQNRKSPEYLKAGSMKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLD 290 300 310 320 330 340 80 90 100 110 120 130 FLJ002 PEEVESVHRILAAILHLGNIEFVETEEGGLQKEGLAVAEEAL--VDHVAELTATPRDLVL :: .. :..:..::::::.: ::.: . : . ... ... ::: . .: . KIAA03 DEEKLDLFRVVAGVLHLGNIDF---EEAGSTSGGCNLKNKSAQSLEYCAELLGLDQDDLR 350 360 370 380 390 140 150 160 170 180 FLJ002 RSLLAR---TVASGGRELIEKGHTAAE-ASYARDACAKAVYQRLFEWVVKRINSVMEPRG :: .: :.:.: . . : .: :. :::: ::.::..::. ::.:.:. . : KIAA03 VSLTTRVMLTTAGGTKGTVIKVPLKVEQANNARDALAKTVYSHLFDHVVNRVNQCF-PF- 400 410 420 430 440 450 190 200 210 220 230 240 FLJ002 RDPRRDGKDTVIGVLDIYGFEVFPVNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLILKQEQEEYEREG . .. :::::: ::: : :::::::::::::::::.: . :::.::: :..:: KIAA03 -----ETSSYFIGVLDIAGFEYFEHNSFEQFCINYCNEKLQQFFNERILKEEQELYQKEG 460 470 480 490 500 510 250 260 270 280 290 300 FLJ002 ITWQSVEYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACSSAGTITDRIFLQTLDTHHRHHLHYTS . . :.: .: .::.: ::: .::: . .:. : : .:..:. :. KIAA03 LGVNEVHYVDNQDCIDLIEAKLVGILDILDEE-NRLPQPSDQHF--TSAVHQKHKDHF-- 520 530 540 550 560 310 320 330 FLJ002 RQLCPTDKTMEFGRDFR------IKHYAGDVT : : . . :..: :.:.:: : KIAA03 RLTIPRKSKLAVHRNIRDDEGFIIRHFAGAVCYETTQFVEKNNDALHMSLESLICESRDK 570 580 590 600 610 620 KIAA03 FIRELFESSTNNNKDTKQKAGKLSFISVGNKFKTQLNLLLDKLRSTGASFIRCIKPNLKM 630 640 650 660 670 680 >>KIAA0866 ( 1984 res) hk00546s1 (1984 aa) initn: 545 init1: 263 opt: 496 Z-score: 598.4 bits: 121.6 E(): 3.9e-28 Smith-Waterman score: 654; 36.905% identity (66.667% similar) in 336 aa overlap (1-332:285-596) 10 20 30 FLJ002 KQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHLE .: ::.:: :: .. :...:. .: :: KIAA08 GKFIRINFDVTGYIVGANIETYLLEKSRAIRQARDERTFHIFYYMIAGAKEKMRSDLLLE 260 270 280 290 300 310 40 50 60 70 80 90 FLJ002 RNPAVYNFTHQGAGLNMTVHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEEVESVHRILAAILHL . :.: . :. . . .: .:.. : ..::: ..::: :: :. ......:.: KIAA08 ---GFNNYTFLSNGF-VPIPAA--QDDEMFQETVEAMAIMGFSEEEQLSILKVVSSVLQL 320 330 340 350 360 100 110 120 130 140 150 FLJ002 GNIEFVETEEGGLQKEGLAVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVASGGRELIEKG ::: : . :.. : .. ... ...: .: . ::.:. . : :....:. KIAA08 GNIVF-KKERNTDQA---SMPDNTAAQKVCHLMGINVTDFTRSILTPRIKVG-RDVVQKA 370 380 390 400 410 420 160 170 180 190 200 210 FLJ002 HTAAEASYARDACAKAVYQRLFEWVVKRINSVMEPRGRDPRRDGKDTVIGVLDIYGFEVF .: .:..: .: :::.:.:::.:.. :.:.... .:.: . .:.::: :::.: KIAA08 QTKEQADFAVEALAKATYERLFRWILTRVNKALDKT----HRQGA-SFLGILDIAGFEIF 430 440 450 460 470 220 230 240 250 260 FLJ002 PVNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEY-FNNATIVDLVERPH ::::::.:::: :::::::: . .. :::::.:::: :. ... .. ..:.:::. KIAA08 EVNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIELIERPN 480 490 500 510 520 530 270 280 290 300 310 320 FLJ002 R--GILAVLDEACSSAGTITDRIFLQTLDTHHRHHLHYTS-RQLCPTDKTMEFGRDFRIK :.::.::: : ::. :.. : :.. : .. . .:: ::: .: : KIAA08 NPPGVLALLDEECWFP-KATDKSFVEKLCTEQGSHPKFQKPKQL--KDKT-----EFSII 540 550 560 570 580 590 330 FLJ002 HYAGDVT :::: : KIAA08 HYAGKVDYNASAWLTKNMDPLNDNVTSLLNASSDKFVADLWKDVDRIVGLDQMAKMTESS 600 610 620 630 640 650 >>FLJ00395 ( 1105 res) sj06062 (1105 aa) initn: 638 init1: 330 opt: 489 Z-score: 592.7 bits: 119.7 E(): 8.1e-28 Smith-Waterman score: 645; 39.003% identity (63.930% similar) in 341 aa overlap (2-333:245-555) 10 20 30 FLJ002 KQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHLER :. .::::: .::::.:. ..: ..: : FLJ003 KYFEIQFSRGGEPDGGKISNFLLEKSRVVMQNENERNFHIYYQLLEGASQEQRQNLGLM- 220 230 240 250 260 270 40 50 60 70 80 90 FLJ002 NPAVYNFTHQGAGLNMTVHSALDSDEQSHQAVT-EAMRVIGFSPEEVESVHRILAAILHL .: : . .:. .... .:..: . : ::.:::. : . : ...:.:::: FLJ003 TPDYYYYLNQS-----DTYQVDGTDDRSDFGETLSAMQVIGIPPSIQQLVLQLVAGILHL 280 290 300 310 320 100 110 120 130 140 FLJ002 GNIEFVETEEGGLQKEGLAVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVAS--GGR-ELI ::: : : .:. . : :. : : . . ..: .: . : ::: : : FLJ003 GNISFCE--DGNYAR----VESVDLLAFPAYLLGIDSGRLQEKLTSRKMDSRWGGRSESI 330 340 350 360 370 380 150 160 170 180 190 200 FLJ002 EKGHTAAEASYARDACAKAVYQRLFEWVVKRINSVMEPRGRDPRRDGKDTVIGVLDIYGF . .. .:.:.::: ::..: :::...:. :: .:. :... . ::::::::: FLJ003 NVTLNVEQAAYTRDALAKGLYARLFDFLVEAINRAMQK----PQEEYS---IGVLDIYGF 390 400 410 420 430 210 220 230 240 250 260 FLJ002 EVFPVNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEYFNNATIVDLVER :.: :.:::::::. ::::::.::.: :: ::::: .::: : ..:::: .. ::.: FLJ003 EIFQKNGFEQFCINFVNEKLQQIFIELTLKAEQEEYVQEGIRWTPIQYFNNKVVCDLIEN 440 450 460 470 480 490 270 280 290 300 310 320 FLJ002 PHR--GILAVLDEACSS---AGTITDRIFLQTLDTHHRHHLHYTSRQLCPTDKTMEFGRD ::..:::..:.. .: .:. .:: :.. : :..: .. FLJ003 KLSPPGIMSVLDDVCATMHATGGGADQTLLQKLQAAVGTHEHFNS-----------WSAG 500 510 520 530 540 330 FLJ002 FRIKHYAGDVT : :.:::: :. FLJ003 FVIHHYAGKVSYDVSGFCERNRDVLFSDLIELMQTSEQAFLRMLFPEKLDGDKKGRPSTA 550 560 570 580 590 600 >>KIAA1512 ( 2010 res) fg04660y1 (2010 aa) initn: 566 init1: 252 opt: 461 Z-score: 555.6 bits: 113.7 E(): 9.4e-26 Smith-Waterman score: 635; 38.024% identity (63.473% similar) in 334 aa overlap (2-332:348-659) 10 20 30 FLJ002 KQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHLER : :::..:..::.: : . . : : KIAA15 KFIRIHFGPSGKLASADIDSYLLEKSRVIFQLPGERSYHVYYQILSGRKPELQDMLLLSM 320 330 340 350 360 370 40 50 60 70 80 90 FLJ002 NPAVYNFTHQGAGLNMTVHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEEVESVHRILAAILHLG :: :.: ::. .:: . :..: :. .:: ..::: .: . ..:..:.::.: KIAA15 NPYDYHFCSQGV---ITVDNMNDGEELI--ATDHAMDILGFSVDEKCACYKIVGALLHFG 380 390 400 410 420 430 100 110 120 130 140 150 FLJ002 NIEFVETEEGGLQKEGLAVAE-EALVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVASGGRELIEKG :..: . :.: : :. .:..: : .. .:..:: : :. : . :: KIAA15 NMKFKQK-----QREEQAEADGTESADKAAYLMGVSSGDLLKGLLHPRVRVGN-EYVTKG 440 450 460 470 480 160 170 180 190 200 210 FLJ002 HTAAEASYARDACAKAVYQRLFEWVVKRINSVMEPRGRDPRRDGKDTVIGVLDIYGFEVF ... .. .: : :::.:.:::.:.:.:::.... . ::. :::::: :::.: KIAA15 QSVEQVVFAVGALAKATYDRLFRWLVSRINQTLDTK--LPRQ----FFIGVLDIAGFEIF 490 500 510 520 530 540 220 230 240 250 260 FLJ002 PVNSFEQFCINYCNEKLQQLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEY-FNNATIVDLVERPH :::::.:::. ::::::.: : .. :::::.:::: : ... .. .::.:.: KIAA15 EFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNQHMFVLEQEEYKREGIDWVFIDFGLDLQPCIDLIEKPL 550 560 570 580 590 600 270 280 290 300 310 320 FLJ002 RGILAVLDEACSSAGTITDRIFLQTL-DTHHRHHLHYTSRQLCPTDKTMEFGRDFRIKHY :::..:.: : .: : : :.: . .. .: : :: .. :.. :: KIAA15 -GILSILEEECMFP-KASDASFRAKLYDNHAGKSPNF--QQPRP-DKKRKYQAHFEVVHY 610 620 630 640 650 330 FLJ002 AGDVT :: : KIAA15 AGVVPYSIVGWLEKNKDPLNETVVPIFQKSQNRLLATLYENYAGSCSTEPPKSGVKEKRK 660 670 680 690 700 710 >>KIAA0865 ( 1900 res) hk06640y1 (1900 aa) initn: 414 init1: 174 opt: 434 Z-score: 523.0 bits: 107.6 E(): 6.2e-24 Smith-Waterman score: 474; 31.176% identity (60.882% similar) in 340 aa overlap (2-332:628-953) 10 20 30 FLJ002 KQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHLER : .:. :: :: :. : .. . :::. 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KIAA11 IQAERDG---DSCSISPQDVYLSNFCRLLGVEHSQMEHWLCHRKLVTTSETYV-KTMSLQ 350 360 370 380 390 400 160 170 180 190 200 210 FLJ002 EASYARDACAKAVYQRLFEWVVKRINSVMEPRGRDPRRDGKDTVIGVLDIYGFEVFPVNS .. ::.: :: .: .:: :.:..::.... . . . ::::::::::.: ::: KIAA11 QVINARNALAKHIYAQLFGWIVEHINKALHTSLK------QHSFIGVLDIYGFETFEVNS 410 420 430 440 450 220 230 240 250 260 270 FLJ002 FEQFCINYCNEKLQQLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEYFNNATIVDLVERPHRGILA :::::::: :::::: : . ..: ::::: .: : : .....: .::.: . ::: KIAA11 FEQFCINYANEKLQQQFNSHVFKLEQEEYMKEQIPWTLIDFYDNQPCIDLIE-AKLGILD 460 470 480 490 500 510 280 290 300 310 320 330 FLJ002 VLDEACSSAGTITDRIFLQTLDTHHRHHLHYTSRQLCPTDKTMEFGRDFRIKHYAGDVT .::: :. . ::. . : : .: :. . .. : KIAA11 LLDEECK-VPKGTDQNWAQKLYDRHSSSQHFQKPRMSNTAFIIVHFADKVEYLSDGFLEK 520 530 540 550 560 570 KIAA11 NRDTVYEEQINILKASKFPLVADLFHDDKDPVPATTPGKGSSSKISVRSARPPMKVSNKE 580 590 600 610 620 630 >>KIAA1000 ( 1956 res) hk09604y2 (1956 aa) initn: 372 init1: 222 opt: 411 Z-score: 494.7 bits: 102.4 E(): 2.3e-22 Smith-Waterman score: 615; 35.224% identity (63.881% similar) in 335 aa overlap (2-332:299-608) 10 20 30 FLJ002 KQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHL-E :..::::.: :::.: :. :.::.: : KIAA10 KFIRMHFGARGMLSSVDIDIYLLEKSRVIFQQAGERNYHIFYQILSGQ--KELHDLLLVS 270 280 290 300 310 320 40 50 60 70 80 90 FLJ002 RNPAVYNFTHQGAGLNMTVHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEEVESVHRILAAILHL ::. ..: :: .::.: :..: :. .:: ..:: :.: . ... .::.:. 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