# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj04565.fasta.huge -Q ../query/FLJ00205.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00205, 359 aa vs ./tmplib.10216 library 2210635 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.0222+/-0.00402; mu= 18.9852+/- 0.273 mean_var=84.0531+/-17.208, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.139893 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1918 ( 516 res) hj01313 ( 516) 937 198.5 7.8e-52 KIAA1130 ( 575 res) hh00715 ( 575) 847 180.4 2.4e-46 FLJ00166 ( 454 res) sh07301 ( 454) 94 28.3 1.2 KIAA0808 ( 530 res) hk04477s1 ( 530) 93 28.2 1.5 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 93 28.7 2.2 KIAA0752 ( 334 res) hk04439 ( 334) 88 26.9 2.3 KIAA0794 ( 490 res) hk06006 ( 490) 86 26.8 3.8 KIAA0058 ( 181 res) ha01532 ( 181) 78 24.5 6.7 KIAA0545 ( 1368 res) hh00165s1 (1368) 86 27.4 6.8 KIAA1481 ( 1380 res) fj05724 (1380) 86 27.4 6.8 KIAA1642 ( 1997 res) hh02864(revised) (1997) 87 27.8 7.3 KIAA0812 ( 1364 res) hg01044 (1364) 83 26.8 10 KIAA1980 ( 660 res) fj10323s1 ( 660) 80 25.7 10 KIAA0731 ( 1096 res) hk03714 (1096) 81 26.3 12 FLJ00188 ( 201 res) sj02282 ( 201) 74 23.8 12 KIAA0773 ( 336 res) hk05140 ( 336) 75 24.3 14 FLJ00099 ( 217 res) as00099 ( 217) 73 23.6 15 FLJ00008 ( 217 res) as00008 ( 217) 73 23.6 15 FLJ00358 ( 217 res) sh03894 ( 217) 73 23.6 15 KIAA0257 ( 1805 res) ha07065 (1805) 81 26.6 16 KIAA1898 ( 1013 res) fk06427 (1013) 78 25.6 18 KIAA0789 ( 620 res) pj01253 ( 620) 76 24.9 18 KIAA0162 ( 1730 res) ha03982 (1730) 80 26.3 18 KIAA1580 ( 640 res) fj04979 ( 640) 76 24.9 18 FLJ00352 ( 289 res) sh00608 ( 289) 72 23.6 20 KIAA0390 ( 1312 res) hj00075 (1312) 78 25.8 20 KIAA1425 ( 495 res) hj01333(revised) ( 495) 74 24.3 21 FLJ00298 ( 527 res) sh04009 ( 527) 74 24.4 21 KIAA0878 ( 687 res) hk07361 ( 687) 75 24.7 22 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 78 25.9 22 KIAA0284 ( 1573 res) pf09542 (1573) 78 25.9 23 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 75 24.9 24 FLJ00248 ( 501 res) sj08681 ( 501) 72 23.9 27 KIAA0432 ( 827 res) hh01859s1 ( 827) 74 24.7 27 KIAA1051 ( 402 res) hh04271 ( 402) 71 23.6 28 KIAA0746 ( 1029 res) hk04140 (1029) 74 24.8 31 KIAA0510 ( 95 res) hh00345 ( 95) 64 21.3 33 FLJ00117 ( 331 res) as00117 ( 331) 69 23.1 33 KIAA1597 ( 913 res) fj09819 ( 913) 73 24.5 33 KIAA1302 ( 2016 res) ff04539 (2016) 76 25.6 34 FLJ00324 ( 376 res) sj01157 ( 376) 69 23.2 35 KIAA1635 ( 1435 res) fh23184(revised) (1435) 74 25.0 37 KIAA0375 ( 1540 res) hh00360s1 (1540) 74 25.1 39 KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202) 73 24.7 39 KIAA1208 ( 950 res) fj07955 ( 950) 72 24.3 39 KIAA1987 ( 357 res) fk04103 ( 357) 68 22.9 39 FLJ00388 ( 103 res) sj04429 ( 103) 63 21.1 39 FLJ00261 ( 1651 res) sh06537 (1651) 74 25.1 40 KIAA0828 ( 619 res) hh04230 ( 619) 70 23.7 41 KIAA1740 ( 1119 res) pj00674 (1119) 72 24.4 43 >>KIAA1918 ( 516 res) hj01313 (516 aa) initn: 811 init1: 390 opt: 937 Z-score: 1023.9 bits: 198.5 E(): 7.8e-52 Smith-Waterman score: 937; 48.951% identity (76.923% similar) in 286 aa overlap (70-348:7-288) 40 50 60 70 80 90 FLJ002 VAPAAGQGSHSRQKKTFFLGDGQKLKDWHDKEAIRRDAQRVGNGEQGRPY--PMTDAERV . .: :. . : ::.:. : : :.. 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KIAA19 MTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRNYFEEIGTYDAGM 220 230 240 250 260 270 340 350 FLJ002 EIWGGEQYEISFKVSQLSRRPVLGTAS .:::::. :.::.. : KIAA19 DIWGGENLEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGHVINKNNRRLAEVW 280 290 300 310 320 330 >>KIAA1130 ( 575 res) hh00715 (575 aa) initn: 840 init1: 294 opt: 847 Z-score: 925.3 bits: 180.4 E(): 2.4e-46 Smith-Waterman score: 865; 42.120% identity (69.628% similar) in 349 aa overlap (4-346:41-361) 10 20 30 FLJ002 LLQAVALVLAALVLLPNVGLWALYRERQPDGTP :.:.. .: .: :: .: .. KIAA11 ERPRPGPESTPAQSPTWGARLPTMRKIRANAIAILTVAWILGTFYYLWQ--DNRAHAASS 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 FLJ002 GGSGAAVAPAAGQGSHS-RQKKTF-FLGDGQKLKDWHDKEAIRRDAQRVGNGEQGRPYPM :: :: ::. :.. :. .:. .. : : . .: . .:... ::. :: KIAA11 GGRGAQ---RAGRRSEQLREDRTIPLIVTGTPSKGFDEKAYL--SAKQLKAGED--PY-- 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 FLJ002 TDAERVDQAYRENGFNIYVSDKISLNRSLPDIRHPNCNSKRYLETLPNTSIIIPFHNEGW :...:: :::.: .: . : :: .: : : :: ::.:: ::::. KIAA11 ----------RQHAFNQLESDKLSPDRPIRDTRHYSCPSVSYSSDLPATSVIITFHNEAR 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 FLJ002 SSLLRTVHSVLNRSPPELVAEIVLVDDFSDREHLKKPLEDYMAL--FPSVRILRTKKREG :.:::::.:::::.: .:. ::.::::::. : :: . : .:.:. ::. .::: KIAA11 STLLRTVKSVLNRTPANLIQEIILVDDFSS-----DP-EDCLLLTRIPKVKCLRNDRREG 170 180 190 200 210 220 210 220 230 240 250 260 FLJ002 LIRTRMLGASVATGDVITFLDSHCEANVNWLPPLLDRIARNRKTIVCPMIDVIDHDDFRY :::.:. ::.::.. :.::::::::.:..::::.:.:. ... .: :.::::. :.: : KIAA11 LIRSRVRGADVAAATVLTFLDSHCEVNTEWLPPMLQRVKEDHTRVVSPIIDVISLDNFAY 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 FLJ002 ETQAGDAMRGAFDWEMYYK--RIPIPPELQKADPSDPFESPVMAGGLFAVDRKWFWELGG . ..: .::.::: ...: .::. .. ..::. :...::.:::.:..:..:: .:: KIAA11 LAASAD-LRGGFDWSLHFKWEQIPLEQKMTRTDPTRPIRTPVIAGGIFVIDKSWFNHLGK 290 300 310 320 330 340 330 340 350 FLJ002 YDPGLEIWGGEQYEISFKVSQLSRRPVLGTAS :: ..:::::..:.::.: KIAA11 YDAQMDIWGGENFELSFRVWMCGGSLEIVPCSRVGHVFRKRHPYNFPEGNALTYIRNTKR 350 360 370 380 390 400 >>FLJ00166 ( 454 res) sh07301 (454 aa) initn: 52 init1: 52 opt: 94 Z-score: 105.0 bits: 28.3 E(): 1.2 Smith-Waterman score: 95; 24.812% identity (52.632% similar) in 133 aa overlap (177-296:107-231) 150 160 170 180 190 200 FLJ002 HNEGWSSLLRTVHSVLNRSPPELVAEIVLVDDFSDREHLKKPLEDYMALFPSVRILRTKK .: :. . :::..: . ::. . FLJ001 IEIQKFISKKADLLFALSWKSDAPATSEINEDSEDHYAIMPPLEQFMEI-PSM-----DR 80 90 100 110 120 130 210 220 230 240 250 260 FLJ002 REGLIRTRMLGASVATGDVITFLD-SHCEANVNWLPPLLDRIARNRKTIVCPMIDVIDH- :: ..: : ... : . .. . . . . .. ::. . : .::. :: .: FLJ001 RELFFRDIERG-DIVIGRISSIREFGFFMVLICLGSGIMRDIAHLEITALCPLRDVPSHS 140 150 160 170 180 270 280 290 300 310 FLJ002 ---DDFRYETQAGDAMR-GAFDWEMYYKRIPI-------PPELQKADPSDPFESPVMAGG : . : :.:: .: : : . :.... . ::.: FLJ001 NHGDPLSYY-QTGDIIRAGIKDIDRYHEKLAVSLYSSSLPPHLSGIKLGVISSEELPLYY 190 200 210 220 230 240 320 330 340 350 FLJ002 LFAVDRKWFWELGGYDPGLEIWGGEQYEISFKVSQLSRRPVLGTAS FLJ001 RRSVELNSNSLESYENVMQSSLGFVNPGVVEFLLEKLGIDESNPPSLMRGLQSKNFSEDD 250 260 270 280 290 300 >>KIAA0808 ( 530 res) hk04477s1 (530 aa) initn: 78 init1: 50 opt: 93 Z-score: 103.2 bits: 28.2 E(): 1.5 Smith-Waterman score: 93; 21.756% identity (47.710% similar) in 262 aa overlap (119-355:81-326) 90 100 110 120 130 140 FLJ002 YPMTDAERVDQAYRENGFNIYVSDKISLNRSLPD--IRHPN-CNSKRYLETLP-NTSIII :::: . : : .: . : : . .. KIAA08 PSQDYVPASQSYPGPSLESEDFNIPPITPPSLPDHSLVHLNEVESGYHSLCHPMNHNGLL 60 70 80 90 100 110 150 160 170 180 190 200 FLJ002 PFHNEGWSSLLRTVHSVLNRSPPELVAEIVLVDDFSDREHLKKPLEDYMALFPSVRILRT ::: .. . :: ..:... : : .. : ...: .. :.. .: KIAA08 PFHPQNMDLPEITVSNMLGQDGTLLSNSISVMPD------IRNPEGTQYSSHPQMAAMRP 120 130 140 150 160 210 220 230 240 250 FLJ002 KKREGLIRTRMLGASVATGDVITFLDSHCEANVNW------LPPLLDRIARNRKTIVCPM . . . :: . . . :.. :. .:. :... .: .... : KIAA08 RGQPADIRQQ--PGMMPHGQLTTINQSQLSAQLGLNMGGSNVPHNSPSPPGSKSATPSPS 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 FLJ002 IDVIDHDDFRYETQA--GDAMRGAFDWEMYYKRIPIPPELQKADPSDPFESPVMAGGLFA .: :.: .:. : : : : . :. : . .: ::..: ..:: : .:: KIAA08 SSV--HEDEGDDTSKINGGEKRPASD---MGKKPKTPKKKKKKDPNEP-QKPVSAYALFF 230 240 250 260 270 320 330 340 350 FLJ002 VDRKWFWELGGYDPGLE----------IWGG---EQYEISFKVSQLSRRPVLGTAS : . . : .:. .: : :: .. : .. ... : KIAA08 RDTQA--AIKGQNPNATFGEVSKIVASMWDGLGEEQKQVYKKKTEAAKKEYLKQLAAYRA 280 290 300 310 320 330 KIAA08 SLVSKSYSEPVDVKTSQPPQLINSKPSVFHGPSQAHSALYLSSHYHQQPGMNPHLTAMHP 340 350 360 370 380 390 >>KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064 aa) initn: 80 init1: 55 opt: 93 Z-score: 100.2 bits: 28.7 E(): 2.2 Smith-Waterman score: 93; 25.362% identity (49.275% similar) in 138 aa overlap (29-159:3-134) 10 20 30 40 50 FLJ002 LLQAVALVLAALVLLPNVGLWALYRERQPDGTP-GGSGAAVAPAAGQGSHSRQKKTFFLG : .: .: .:. ::.:... .. . : KIAA08 PLPGQAPLSGPPGATMPAGGRAGSLKDPDVAELF 10 20 30 60 70 80 90 100 110 FLJ002 DGQKLKDWHDKEAIRRDAQRVGNGEQGRPYPMTDAERVD------QAYRENGFNIYVSDK .:: : : . : ...:.: : : :.. . ..: . : .: KIAA08 ----FKD--DPEKLFSDLREIGHGSFGAVYFARDVRNSEVVAIKKMSYSGKQSNEKWQDI 40 50 60 70 80 120 130 140 150 160 170 FLJ002 ISLNRSLPDIRHPNCNSKRYLETLPNTSIIIPFHNEGWSSLLRTVHSVLNRSPPELVAEI :. : : .:::: . : .:. .. . : .: : :: KIAA08 IKEVRFLQKLRHPNTIQYRGCYLREHTAWLVMEYCLGSASDLLEVHKKPLQEVEIAAVTH 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 FLJ002 VLVDDFSDREHLKKPLEDYMALFPSVRILRTKKREGLIRTRMLGASVATGDVITFLDSHC KIAA08 GALQGLAYLHSHNMIHRDVKAGNILLSEPGLVKLGDFGSASIMAPANSFVGTPYWMAPEV 150 160 170 180 190 200 >>KIAA0752 ( 334 res) hk04439 (334 aa) initn: 36 init1: 36 opt: 88 Z-score: 99.8 bits: 26.9 E(): 2.3 Smith-Waterman score: 88; 22.378% identity (58.741% similar) in 143 aa overlap (90-225:5-137) 60 70 80 90 100 110 FLJ002 DGQKLKDWHDKEAIRRDAQRVGNGEQGRPYPMTDAERVDQAYRENGFNIYVSDK-----I : : . :..: :. ..... :: : KIAA07 KTYNPDYDEDLVQEASSEDVLGVHMVDKDTERDI 10 20 30 120 130 140 150 160 170 FLJ002 SLNRSLPDIR--HPNCNSKRYLETLPNTSIIIPFHNEGWSSLLRTVHSVLNRSPPELVAE ..:.: .: : . :.: :.. .::. .: ... .:: . . :::...: KIAA07 EMKRQLRRLRELHLYSTWKKYQEAM-KTSLGVPQRERDEGSLGKPL------CPPEILSE 40 50 60 70 80 180 190 200 210 220 230 FLJ002 IVLVDDFSDREHLKKPLEDYMALFPSVRILRTKKREGLIRTRMLGASVATGDVITFLDSH . : .... : ::.. : . .. ..... : .. ... ..::. KIAA07 TL---PGSVKKRVCFPSEDHLEEFIAEHLPEASNQSLLTVAHADAGTQTNGDLEDLEEHG 90 100 110 120 130 140 240 250 260 270 280 290 FLJ002 CEANVNWLPPLLDRIARNRKTIVCPMIDVIDHDDFRYETQAGDAMRGAFDWEMYYKRIPI KIAA07 PGQTVSEEATEVHMMEGDPDTLAELLIRDVLQELSSYNGEEEDPEEVKTSLGVPQRGDLE 150 160 170 180 190 200 >>KIAA0794 ( 490 res) hk06006 (490 aa) initn: 93 init1: 57 opt: 86 Z-score: 95.9 bits: 26.8 E(): 3.8 Smith-Waterman score: 86; 22.751% identity (55.026% similar) in 189 aa overlap (74-254:102-283) 50 60 70 80 90 100 FLJ002 AGQGSHSRQKKTFFLGDGQKLKDWHDKEAIRRDAQRVGNGEQGRPYPMTDAERVDQAYRE :: :. . .: : . .:.. : .: :. 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