# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj02149.fasta.huge -Q ../query/FLJ00187.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00187, 563 aa vs ./tmplib.10216 library 2210431 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2421+/-0.00536; mu= 10.3212+/- 0.359 mean_var=183.5857+/-42.318, 0's: 0 Z-trim: 84 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.094657 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 899 135.0 1.6e-32 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 892 134.1 3.3e-32 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 886 133.2 5.2e-32 FLJ00032 ( 705 res) as00032 ( 705) 873 131.6 2.3e-31 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 873 131.7 2.5e-31 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 870 131.1 2.7e-31 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 869 131.0 2.9e-31 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 862 130.0 5.5e-31 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 858 129.5 8.2e-31 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 854 129.1 1.4e-30 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 852 128.7 1.5e-30 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 850 128.6 2.2e-30 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 846 128.0 3.1e-30 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 845 127.9 3.5e-30 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 845 128.0 3.9e-30 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 835 126.3 7.2e-30 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 832 126.0 1e-29 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 833 126.3 1.2e-29 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 825 125.1 2.1e-29 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 826 125.4 2.2e-29 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 823 124.8 2.6e-29 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 812 123.2 6.8e-29 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 808 122.6 8.6e-29 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 809 122.8 8.9e-29 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 809 123.0 1e-28 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 804 122.0 1.3e-28 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 806 122.5 1.3e-28 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 797 121.0 2.4e-28 FLJ00309 ( 564 res) sh05969 ( 564) 796 121.0 2.9e-28 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 793 120.6 3.8e-28 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 785 119.5 8e-28 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 783 119.3 1.1e-27 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 778 118.5 1.5e-27 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 776 118.3 2e-27 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 757 115.6 1.1e-26 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 746 114.5 4.4e-26 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 725 111.3 2.4e-25 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 712 109.2 5.8e-25 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 715 110.2 7.9e-25 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 706 108.8 1.5e-24 FLJ00284 ( 366 res) sh02281 ( 366) 701 107.8 1.8e-24 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 675 104.6 3.1e-23 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 632 98.5 1.5e-21 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 592 93.0 5.9e-20 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 500 80.6 4.5e-16 KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 493 80.1 1.4e-15 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 476 77.4 4.4e-15 FLJ00306 ( 278 res) sh05582 ( 278) 464 75.2 8.6e-15 KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 433 71.9 3.8e-13 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 424 70.7 9.2e-13 >>KIAA1710 ( 515 res) fj18457 (515 aa) initn: 4993 init1: 869 opt: 899 Z-score: 677.1 bits: 135.0 E(): 1.6e-32 Smith-Waterman score: 1022; 47.075% identity (70.195% similar) in 359 aa overlap (191-543:24-377) 170 180 190 200 210 220 FLJ001 DPVQESSSFDLHHEATQSHFKHSSRKPRLLQSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAMASALFT : : : :: .:: ::..:. 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KIAA16 FHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKV 610 620 630 640 650 660 430 440 450 460 470 480 FLJ001 IHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTG :::::::..::.:::.:...:.: ::: :.:::::.::::::::: :.:: :: :::: KIAA16 IHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTG 670 680 690 700 710 720 490 500 510 520 530 540 FLJ001 EKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERAS .:::.:.::::.:..:..: :::::: ::::.::.::::: :.:: : ::. :. KIAA16 KKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRY 730 740 750 760 770 780 550 560 FLJ001 EYSPASLDAFGAFLKSCV KIAA16 KCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK 790 800 810 >>KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 (579 aa) initn: 3509 init1: 858 opt: 870 Z-score: 655.2 bits: 131.1 E(): 2.7e-31 Smith-Waterman score: 880; 38.724% identity (65.376% similar) in 439 aa overlap (125-539:100-518) 100 110 120 130 140 150 FLJ001 ILELLVLEQFLSILPKELQVWLQEYRPDSGEEAVTLLEDLELDLSGQQVPGQVHGPEMLA .:.::. .:. .:.. .. :.. : : KIAA18 GALSSQDSPHFQEKSTEEGEVAALRLTARSQETVTF-KDVAMDFTPEEW-GKLD-P---A 70 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 FLJ001 RGMVPLDPVQESSSFDLHHEATQSHFKHSSRKPRLLQSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAM . : :. .. :. : .:: .....: :. .: : . . . .:.. KIAA18 QRDVMLENYRNLVSLWLPVSKPESHNLENGKEPLKLERKA-PKSSYSDMETRPQSKDSTS 130 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 270 FLJ001 ASALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEEWGCQNLARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNEN .. . :.: .. :. .. . . . .:: . : .: :: ::...:. KIAA18 VQDFSKAESCKVAIIDRLTRNSVYD----SNL-EAALECENWLENQ-----QGNQERHLR 190 200 210 220 230 280 290 300 310 320 FLJ001 EESTSKAETSEDSASRGETTGRS--QKE--FGEKRDQEGK----TGER--QQKN---PEE : : ::.. . .. .: :: . : : .:. : :. .::. .. KIAA18 EMFTHMNSLSEETDHKHDVYWKSFNQKSVLITEDRVPKGSYAFHTLEKSLKQKSNLMKKQ 240 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 FLJ001 KTRKEKR-----DSGP------AIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEV .: :::. : : .. . ... :::. : .. :.::: .:.: ... 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KIAA15 HRKAHGRTRTHECSECGKSFSRKTHLTQHQRVHTGERPYDCSECGKSFRQVSVLIQHQRV 240 250 260 270 280 290 430 440 450 460 470 480 FLJ001 HTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGE ::::.:.::.::::.::::.:: :. :.. .::::.::::.::.:..: .: :.::: KIAA15 HTGERPYECSECGKSFSHSTNLYRHRSAHTSTRPYECSECGKSFSHSTNLFRHWRVHTGV 300 310 320 330 340 350 490 500 510 520 530 540 FLJ001 KPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASE .:::::::::::. : ::: :.:.:: :.:: :..:::.: ..:.: :.:.:. :: : KIAA15 RPYECSECGKAFSCNIYLIHHQRFHTGERPYVCSECGKSFGQKSVLIQHQRVHTGERPYE 360 370 380 390 400 410 550 560 FLJ001 YSPASLDAFGAFLKSCV : KIAA15 CSECGKVFSQSSGLFRHRRAHTKTKPYECSECEKSFSCKTDLIRHQTVHTGERPYECSVC 420 430 440 450 460 470 >>KIAA0628 ( 540 res) hh01433 (540 aa) initn: 4698 init1: 841 opt: 862 Z-score: 649.6 bits: 130.0 E(): 5.5e-31 Smith-Waterman score: 862; 53.360% identity (72.727% similar) in 253 aa overlap (313-561:200-447) 290 300 310 320 330 340 FLJ001 TSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTIT :.:. . :: : . : :. ... : KIAA06 LMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQ-CGKAFCHSSDLIR 170 180 190 200 210 220 350 360 370 380 390 FLJ001 GER-GPREKG---KGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKII .: ::. : :..:: :: . ... :: . ..:.:::: : :::::::: : KIAA06 HQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQI 230 240 250 260 270 280 400 410 420 430 440 450 FLJ001 HTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGE :: : :::.:::::: :.:. ::::::::.: ::::::::: .::.:: :::::.:: KIAA06 HTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGE 290 300 310 320 330 340 460 470 480 490 500 510 FLJ001 KPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYK .:: :::::: :::.:..:.::::::::: :::.:::::: .:::: :..::: :. :. 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KIAA19 LDKIIER--CLRDDDHGLMEESQQYCGSSEEDHGNQGNSKGRVAQNK---TLGSGSRGKK 250 260 270 280 290 300 300 310 320 FLJ001 TGRSQKEFGE--------------------KRDQEGKTG---------ERQQKNPEEKTR ... ::. .: .:.: .:..:. ::.: KIAA19 FDPDKSPFGHNFKETSDLIKHLRVYLRKKSRRYNESKKPFSFHSDLVLNRKEKTAGEKSR 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 FLJ001 KEKRDSGPAIG---------KDKKTITGERGPREKGKGLG--RSFSLS------------ : . :.: ... : .: :.:. . . :. : .:: KIAA19 KSN-DGGKVLSHSSALTEHQKRQKIHLGDRSQKCSKCGIIFIRRSTLSRRKTPMCEKCRK 370 380 390 400 410 420 370 380 390 400 410 FLJ001 -----SNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSL . .. : .: :.:.:..::: : :.:: .:. :::::::: :.::::::: KIAA19 DSCQEAALNKDEGNESGKKTHKCSKCGKAFGYSASLTKHRRIHTGEKPYMCNECGKAFSD 430 440 450 460 470 480 420 430 440 450 460 470 FLJ001 NSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDL .:.:. :.: :.:::: .:..:::.:. :..:: :::::.:::::.:..::. ::.::.: KIAA19 SSSLTPHHRTHSGEKPFKCDDCGKGFTLSAHLIKHQRIHTGEKPYKCKDCGRPFSDSSSL 490 500 510 520 530 540 480 490 500 510 520 530 FLJ001 TKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHH .::::::::::: ::.:::.:...: : :.:::: :::::: .::::: ..: :: :. KIAA19 IQHQRIHTGEKPYTCSNCGKSFSHSSSLSKHQRIHTGEKPYKCGECGKAFRQNSCLTRHQ 550 560 570 580 590 600 540 550 560 FLJ001 RIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSCV :::. :. KIAA19 RIHTGEKPYLCNDCGMTFSHFTSVIYHQRLHSGEKPYKCNQCEKAFPTHSLLSRHQRIHT 610 620 630 640 650 660 563 residues in 1 query sequences 2210431 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:44:18 2009 done: Fri Feb 27 10:44:19 2009 Total Scan time: 0.610 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]