# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj02030.fasta.huge -Q ../query/FLJ00266.ptfa ./tmplib.10216 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 FLJ00266, 1544 aa
 vs ./tmplib.10216 library

2209450 residues in  2457 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3038+/-0.00589; mu= 3.5142+/- 0.394
 mean_var=241.3322+/-55.891, 0's: 0 Z-trim: 9  B-trim: 0 in 0/40
 Lambda= 0.082559

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2457)
KIAA1564  ( 2432 res)   fh20840s1                  (2432) 10476 1262.3       0
KIAA1335  ( 2041 res)   bf00973                    (2041) 4244 520.0 2.3e-147
KIAA1416  ( 1966 res)   hh02957s1                  (1966) 4017 492.9 3.1e-139
KIAA0308  ( 2759 res)   ee00163                    (2759) 3636 447.7 1.8e-125
KIAA0444  ( 978 res)   hg00035                     ( 978)  718 99.6 3.7e-21
KIAA0309  ( 3053 res)   hg00096s1                  (3053)  527 77.4 5.7e-14
KIAA1259  ( 1561 res)   hh15706                    (1561)  508 74.8 1.7e-13
KIAA1122  ( 1048 res)   hj01698                    (1048)  439 66.5 3.9e-11
KIAA0809  ( 1385 res)   hk10195                    (1385)  302 50.3 3.9e-06
KIAA1994  ( 1117 res)   bh00052                    (1117)  153 32.4    0.74
KIAA0828  ( 619 res)   hh04230                     ( 619)  141 30.7     1.3
KIAA1673  ( 712 res)   fg00690                     ( 712)  136 30.2     2.2
KIAA0579  ( 910 res)   bg00015                     ( 910)  138 30.5     2.2
KIAA1016  ( 793 res)   hk03719s1                   ( 793)  135 30.1     2.6
KIAA1813  ( 673 res)   ph00819b                    ( 673)  133 29.8     2.7
KIAA0384  ( 967 res)   hh00733                     ( 967)  133 30.0     3.5
FLJ00169  ( 432 res)   sh07709                     ( 432)  126 28.8     3.6
KIAA0339  ( 1709 res)   hg01304(revised)           (1709)  136 30.6       4
KIAA0924  ( 617 res)   hh02883                     ( 617)  122 28.5     6.4
KIAA0142  ( 802 res)   ha01169                     ( 802)  124 28.8     6.5
KIAA1464  ( 621 res)   fh18679                     ( 621)  121 28.3       7
KIAA1321  ( 714 res)   fh13788                     ( 714)  120 28.3     8.3
KIAA1476  ( 2142 res)   fj04778s1                  (2142)  125 29.4      12
KIAA0164  ( 929 res)   ha02373                     ( 929)  117 28.0      13
FLJ00034  ( 1343 res)   as00034                    (1343)  120 28.6      13
KIAA0522  ( 1555 res)   hg01393                    (1555)  121 28.8      13
KIAA0855  ( 632 res)   hk06219                     ( 632)  113 27.4      14
KIAA1265  ( 835 res)   hj04493                     ( 835)  115 27.8      14
KIAA0378  ( 970 res)   hh00502s1                   ( 970)  116 27.9      14
KIAA0717  ( 751 res)   fh19258                     ( 751)  113 27.5      15
KIAA1938  ( 1376 res)   hg00912s1                  (1376)  118 28.3      15
KIAA0886  ( 1233 res)   hk07722                    (1233)  117 28.2      15
KIAA0467  ( 2687 res)   ff08895                    (2687)  122 29.1      17
KIAA0324  ( 2800 res)   ee08846s1                  (2800)  122 29.1      18
FLJ00355  ( 469 res)   sh02302                     ( 469)  107 26.5      18
KIAA0482  ( 1332 res)   hj01880                    (1332)  115 28.0      19
KIAA1238  ( 408 res)   fh09938                     ( 408)  105 26.2      20
KIAA1286  ( 1214 res)   hh11961(revised)           (1214)  114 27.8      20
KIAA1318  ( 1418 res)   fh13683                    (1418)  115 28.0      20
KIAA0570  ( 3412 res)   hk03615s2                  (3412)  122 29.2      21
KIAA0429  ( 666 res)   hk07754                     ( 666)  108 26.8      21
KIAA1223  ( 1089 res)   pg00513                    (1089)  112 27.5      21
KIAA1823  ( 377 res)   fj18328                     ( 377)  103 26.0      22
KIAA1855  ( 1270 res)   fg04654                    (1270)  113 27.7      22
KIAA1604  ( 937 res)   fj10713                     ( 937)  110 27.2      23
KIAA1298  ( 738 res)   fg04206                     ( 738)  108 26.9      23
KIAA1914  ( 460 res)   fk06306                     ( 460)  104 26.2      23
FLJ00294  ( 681 res)   sh03769                     ( 681)  107 26.7      24
KIAA0369  ( 794 res)   hh00177                     ( 794)  108 26.9      24
KIAA1235  ( 1485 res)   fh08704                    (1485)  112 27.7      26


>>KIAA1564  ( 2432 res)   fh20840s1                       (2432 aa)
 initn: 10476 init1: 10476 opt: 10476  Z-score: 6749.6  bits: 1262.3 E():    0
Smith-Waterman score: 10476;  100.000% identity (100.000% similar) in 1544 aa overlap (1-1544:889-2432)

                                             10        20        30
FLJ002                               EKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 DFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEK
      860       870       880       890       900       910        

               40        50        60        70        80        90
FLJ002 NFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 NFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQA
      920       930       940       950       960       970        

              100       110       120       130       140       150
FLJ002 MVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 MVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNL
      980       990      1000      1010      1020      1030        

              160       170       180       190       200       210
FLJ002 RQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 RQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIG
     1040      1050      1060      1070      1080      1090        

              220       230       240       250       260       270
FLJ002 QSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 QSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLL
     1100      1110      1120      1130      1140      1150        

              280       290       300       310       320       330
FLJ002 RKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 RKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDIS
     1160      1170      1180      1190      1200      1210        

              340       350       360       370       380       390
FLJ002 LDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 LDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDD
     1220      1230      1240      1250      1260      1270        

              400       410       420       430       440       450
FLJ002 ERPRSRRHDRHHAYGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 ERPRSRRHDRHHAYGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAIL
     1280      1290      1300      1310      1320      1330        

              460       470       480       490       500       510
FLJ002 VYCLLHYRGDENIKGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTFDIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 VYCLLHYRGDENIKGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTFDIH
     1340      1350      1360      1370      1380      1390        

              520       530       540       550       560       570
FLJ002 KADWIRKYNPDTLFQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 KADWIRKYNPDTLFQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASE
     1400      1410      1420      1430      1440      1450        

              580       590       600       610       620       630
FLJ002 IDIWFPVVDQLEVPTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 IDIWFPVVDQLEVPTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKA
     1460      1470      1480      1490      1500      1510        

              640       650       660       670       680       690
FLJ002 IAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 IAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDE
     1520      1530      1540      1550      1560      1570        

              700       710       720       730       740       750
FLJ002 AQVTQQPGHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 AQVTQQPGHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLK
     1580      1590      1600      1610      1620      1630        

              760       770       780       790       800       810
FLJ002 EIARREKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 EIARREKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYF
     1640      1650      1660      1670      1680      1690        

              820       830       840       850       860       870
FLJ002 HGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 HGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLE
     1700      1710      1720      1730      1740      1750        

              880       890       900       910       920       930
FLJ002 DRLALCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 DRLALCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQN
     1760      1770      1780      1790      1800      1810        

              940       950       960       970       980       990
FLJ002 HQAGAPAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 HQAGAPAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLE
     1820      1830      1840      1850      1860      1870        

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
FLJ002 HEVVARSRPTPQDYEMRVSPSDTTPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLSKLSPSSSSSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 HEVVARSRPTPQDYEMRVSPSDTTPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLSKLSPSSSSSSS
     1880      1890      1900      1910      1920      1930        

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
FLJ002 SSSSSSSTDESEDEKEEKLTDQSRSKLYDEESLLSLTMSQDGFPNEDGEQMTPELLLLQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 SSSSSSSTDESEDEKEEKLTDQSRSKLYDEESLLSLTMSQDGFPNEDGEQMTPELLLLQE
     1940      1950      1960      1970      1980      1990        

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
FLJ002 RQRASEWPKDRVLINRIDLVCQAVLSGKWPSSRRSQEMVTGGILGPGNHLLDSPSLTPGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 RQRASEWPKDRVLINRIDLVCQAVLSGKWPSSRRSQEMVTGGILGPGNHLLDSPSLTPGE
     2000      2010      2020      2030      2040      2050        

             1180      1190      1200      1210      1220      1230
FLJ002 YGDSPVPTPRSSSAASMAEEEASAVSTAAAQFTKLRRGMDEKEFTVQIKDEEGLKLTFQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 YGDSPVPTPRSSSAASMAEEEASAVSTAAAQFTKLRRGMDEKEFTVQIKDEEGLKLTFQK
     2060      2070      2080      2090      2100      2110        

             1240      1250      1260      1270      1280      1290
FLJ002 HKLMANGVMGDGHPLFHKKKGNRKKLVELEVECMEEPNHLDVDLETRIPVINKVDGTLLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 HKLMANGVMGDGHPLFHKKKGNRKKLVELEVECMEEPNHLDVDLETRIPVINKVDGTLLV
     2120      2130      2140      2150      2160      2170        

             1300      1310      1320      1330      1340      1350
FLJ002 GEDAPRRAELEMWLQGHPEFAVDPRFLAYMEDRRKQKWQRCKKNNKAELNCLGMEPVQTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 GEDAPRRAELEMWLQGHPEFAVDPRFLAYMEDRRKQKWQRCKKNNKAELNCLGMEPVQTA
     2180      2190      2200      2210      2220      2230        

             1360      1370      1380      1390      1400      1410
FLJ002 NSRNGKKGHHTETVFNRVLPGPIAPESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 NSRNGKKGHHTETVFNRVLPGPIAPESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNTF
     2240      2250      2260      2270      2280      2290        

             1420      1430      1440      1450      1460      1470
FLJ002 QHSSSGLQSVSSLGHSSATSASLPFMPFVMGGAPSSPHVDSSTMLHHHHHHPHPHHHHHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 QHSSSGLQSVSSLGHSSATSASLPFMPFVMGGAPSSPHVDSSTMLHHHHHHPHPHHHHHH
     2300      2310      2320      2330      2340      2350        

             1480      1490      1500      1510      1520      1530
FLJ002 HPGLRAPGYPSSPVTTASGTTLRLPPLQPEEDDDEDEEDDDDLSQGYDSSERDFSLIDDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA15 HPGLRAPGYPSSPVTTASGTTLRLPPLQPEEDDDEDEEDDDDLSQGYDSSERDFSLIDDP
     2360      2370      2380      2390      2400      2410        

             1540    
FLJ002 MMPANSDSSEDADD
       ::::::::::::::
KIAA15 MMPANSDSSEDADD
     2420      2430  

>>KIAA1335  ( 2041 res)   bf00973                         (2041 aa)
 initn: 3285 init1: 1485 opt: 4244  Z-score: 2738.9  bits: 520.0 E(): 2.3e-147
Smith-Waterman score: 4244;  65.000% identity (83.367% similar) in 980 aa overlap (1-973:14-986)

                            10        20        30        40       
FLJ002              EKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNL
                    :::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.. :::::
KIAA13 LKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLTKGANQHNMPNL
               10        20        30        40        50        60

        50        60        70        80        90       100       
FLJ002 LNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPK
       .:::::::::::::::::::::::: .::..      ::.::::...:::::::::::::
KIAA13 INTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPK
               70        80        90       100       110       120

       110       120       130       140       150       160       
FLJ002 LKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFV
       : :::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: ::::::::
KIAA13 LIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNLRQAAIDRFCKPDSDRFV
              130       140       150       160       170       180

       170       180       190       200       210       220       
FLJ002 FLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA13 FLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYE
              190       200       210       220       230       240

       230       240       250       260       270       280       
FLJ002 REMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSK
       :::::::::::::::::::... : :. .:.::.:: :.:::::::::.:.:.:.:::::
KIAA13 REMFDKASLKLGLDKAVLQDIN-RKGGTNGVQQLSKMEVEDLLRKGAYGALMDEEDEGSK
              250       260        270       280       290         

       290       300       310       320       330       340       
FLJ002 FCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLD
       :::::::::: ::: ::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::: :.::
KIAA13 FCEEDIDQILQRRTHTITIQSEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKIAELD
     300       310       320       330       340       350         

       350       360       370       380       390         400     
FLJ002 MDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDDERP-RSRR-HDRHHAYG
        .  : :..:::: :::::::.:......:.:.:::.:.:..:::: :::: .:. . : 
KIAA13 TEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEEDELMEFSELDSDSDERPTRSRRLNDKARRYL
     360       370       380       390       400       410         

         410       420       430       440       450       460     
FLJ002 RTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENIKG
       :..::::::.::..:::::.:::.::::: ...:.:.: ::::.::::. ::.:::.::.
KIAA13 RAECFRVEKNLLIFGWGRWKDILTHGRFKWHLNEKDMEMICRALLVYCVKHYKGDEKIKS
     420       430       440       450       460       470         

         470       480       490       500        510       520    
FLJ002 FIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTF-DIHKADWIRKYNPDTLF
       :::.::.:...:... :::::::: ::::::::::.:.:  . ... :::.   ::....
KIAA13 FIWELITPTKDGQAQTLQNHSGLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVL
     480       490       500       510       520       530         

          530       540       550       560       570       580    
FLJ002 QDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIASEIDIWFPVVDQLEVP
       .:..::::::..::::::::::::::. :..:. :::.. :. : :.:. .: .: .:.:
KIAA13 HDDGYKKHLKQHCNKVLLRVRMLYYLKAEILGEAAEKAFEGSPARELDVPLPDIDYMEIP
     540       550       560       570       580       590         

          590       600       610       620       630       640    
FLJ002 TTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDDKAIAAEHRVLDNFSDI
       . :::.::::::::::::::::.::.::::::::::::.: ::.:...::. : :. :::
KIAA13 VDWWDAEADKSLLIGVFKHGYERYNAMRADPALCFLEKVGMPDEKSLSAEQGVTDGTSDI
     600       610       620       630       640       650         

          650        660       670       680       690       700   
FLJ002 VEGVDFDK-DCEDPEYKPLQGPPKDQDDEGDPLMMMDEEISVIDGDEAQVTQQPGHLFWP
        :  . :: :  . .   ::   ....: :: ..   ..    :.  ::  ..: .  ::
KIAA13 PERGNTDKEDNAEDKVDGLQKQTESSSDGGDGVFSEKKD----DSRAAQDGSDPDKSPWP
     660       670       680       690           700       710     

           710       720       730       740       750          760
FLJ002 PGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRCEAAFKLK---EIARREKQQR
        .::::::::::::.:::  ..:  . :    :..     :  :.     ..  .: :.:
KIAA13 VSSALTARLRRLVTVYQRCNRKELCRPEILGPGNQGYWVQEEMFRRTSEMDLINKEAQKR
         720       730       740       750       760       770     

              770       780       790       800       810       820
FLJ002 WTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDKKTDESLTKYFHGFVAMCRQV
       ::::::.::::.::.::: :: .   : : .:: ..:::::.:::: .::..::::::.:
KIAA13 WTRREQADFYRTVSSFGVVYDQEKKTFDWTQFRIISRLDKKSDESLEQYFYSFVAMCRNV
         780       790       800       810       820       830     

              830       840       850       860       870       880
FLJ002 CRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLREQVLCHPLLEDRLALCQPPG
       ::::      ::: ....::::::::.::::::::::..:::::  : :..:: ::.: .
KIAA13 CRLPTWKDGGPPDTTIYVEPITEERAARTLYRIELLRKVREQVLKCPQLHERLQLCRP-S
         840       850       860       870       880       890     

              890       900       910       920       930       940
FLJ002 PELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSFLAARMNYMQNHQAGAPAPSL
         :: :::  .:: .:: :.:.::...::: ::.::..::: :  :: :....:. ::. 
KIAA13 LYLPVWWECGKHDRDLLIGTAKHGLNRTDCYIMNDPQLSFLDAYRNYAQHKRSGTQAPGN
          900       910       920       930       940       950    

              950       960       970       980       990      1000
FLJ002 SRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQVPSLESLTLKLEHEVVARSRPT
         :      . : : : : .  : .  .:. ::                           
KIAA13 LCCLYQTNSKLYESLTYSQMS-RTSESLENEPENLVRVESRDDHLSLPDVTCENFISKVQ
          960       970        980       990      1000      1010   

             1010      1020      1030      1040      1050      1060
FLJ002 PQDYEMRVSPSDTTPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLSKLSPSSSSSSSSSSSSSSTDE
                                                                   
KIAA13 DVISINHDESLLPESLESMMYGKKVLSQEPSSFQESPSTNTESRKDVITISISKDGNCQS
          1020      1030      1040      1050      1060      1070   

>>KIAA1416  ( 1966 res)   hh02957s1                       (1966 aa)
 initn: 4866 init1: 2276 opt: 4017  Z-score: 2593.0  bits: 492.9 E(): 3.1e-139
Smith-Waterman score: 5023;  56.545% identity (74.022% similar) in 1482 aa overlap (1-1357:433-1895)

                                             10        20        30
FLJ002                               EKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEK
                                     :::::::.::::::::::::::::::::::
KIAA14 EFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEK
            410       420       430       440       450       460  

               40        50        60        70        80        90
FLJ002 NFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQA
       ::.:::::.:..:.:::::::::::::::::::::::::::: ::.:. .    ::.:::
KIAA14 NFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFKETHNAESPDFQLQA
            470       480       490       500       510       520  

              100       110       120       130       140       150
FLJ002 MVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNL
       :...:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
KIAA14 MIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYERIDGRVRGNL
            530       540       550       560       570       580  

              160       170       180       190       200       210
FLJ002 RQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
KIAA14 RQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIG
            590       600       610       620       630       640  

              220       230       240       250       260       270
FLJ002 QSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLL
       :::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::..  .:.::.:::::::::
KIAA14 QSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLL
            650       660       670       680       690       700  

              280       290       300       310       320       330
FLJ002 RKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDIS
       :::::.:.:.:.::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::: ::::::
KIAA14 RKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTITIESEGKGSTFAKASFVASGNRTDIS
            710       720       730       740       750       760  

              340       350       360       370       380       390
FLJ002 LDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLESEDD
       ::::::::::::::.::.: ::..::::::::::::::: .:..:.:.:.:::::::...
KIAA14 LDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSE
            770       780       790       800       810       820  

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FLJ002 ERP--RSRR-HDRHHAYGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICR
       :.:  . :: .:. ..:.:..::::::.::::::::: :::::::.::..::.:::::::
KIAA14 EKPCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGRWTDILSHGRYKRQLTEQDVETICR
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FLJ002 AILVYCLLHYRGDENIKGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQSTF
       .:::::: ::.::::::.::::::.:. .:.:. : :::::: ::::::::::::.::: 
KIAA14 TILVYCLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALVNHSGLSAPVPRGRKGKKVKAQSTQ
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FLJ002 DI-HKADWIRKYNPDTLFQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGA
        . . :::. . :::.:::..::::::::.:::::::::::::::::::::::.:.: ::
KIAA14 PVVQDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQADKILEGA
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FLJ002 IASEIDIWFPVVDQLEVPTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRP
        .:: :.:.:   . :::. :::.:::::::::::::::::::.:::::::::::..: :
KIAA14 DSSEADVWIPEPFHAEVPADWWDKEADKSLLIGVFKHGYEKYNSMRADPALCFLERVGMP
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FLJ002 DDKAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKDQDDE--GDPLMMMDEEIS
       : ::::::.:  : ..:  .: .::.. ::::::: . : ::. ::  ..:    .: . 
KIAA14 DAKAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDREDEDPEYKPTRTPFKDEIDEFANSPSEDKEESME
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FLJ002 V-IDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMKIEAAERGDRRRRRC
       .   : ... . . :.:.::  :.::.:::::.:::::::::.::. ::  . :::::: 
KIAA14 IHATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITAYQRSYKRQQMRQEALMKTDRRRRRP
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FLJ002 EAAFKLKEIARR----EKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLD
       .   .  :  :.    ::.:.:::::..::::::::::: .::  .:: :..::.:::::
KIAA14 REEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVSTFGVIFDPVKQQFDWNQFRAFARLD
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FLJ002 KKTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRL
       ::.:::: :::  ::::::.:::.:    ::::: . .::::::::::::::::::::..
KIAA14 KKSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDLSSIIEPITEERASRTLYRIELLRKI
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FLJ002 REQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFS
       ::::: :: : .:: :::: . .::.:::  ::: .:: :::.::::.:: .:..::..:
KIAA14 REQVLHHPQLGERLKLCQP-SLDLPEWWECGRHDRDLLVGAAKHGVSRTDYHILNDPELS
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FLJ002 FLAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRPDAPVEKSPEETATQV
       :: :. :. ::. ::  . ::.  .. ...   .  .:     :    .: . ::  . .
KIAA14 FLDAHKNFAQNRGAGNTS-SLNPLAVGFVQTPPVISSAHIQDERVLEQAEGKVEEPENPA
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FLJ002 PSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQDYEMRVSPSDTTPLVSRSVPPVKLEDEDDSDSELDLS
        . .    . :.:. . .. . :. : ..:       :.  .  :..  .  : :   .:
KIAA14 AKEKCEGKEEEEETDGSGKESKQECEAEASS------VKNELKGVEVGADTGSKS---IS
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FLJ002 KLSPSSSSSSSSSSSSSSTDESEDEKEEKLTDQSRSKLYDEESLLSLTM----SQDGFPN
       .    ..:  .   .  . :.::. .. .    ::.: .::::  :..     ..:::  
KIAA14 E----KGSEEDEEEKLEDDDKSEESSQPEAGAVSRGKNFDEESNASMSTARDETRDGFYM
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FLJ002 EDGEQMTPELLLLQERQRA-SEWPKDRVLINRIDLVCQAVLSGKWPSSRRSQEMVTGGIL
       :::.  . .:  :.::  : : ::::::.:::.: .:.:::.:::: .::..    : : 
KIAA14 EDGDPSVAQL--LHERTFAFSFWPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMFDFQGLIP
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FLJ002 GPGNHLLDSP---------------SLTPGE-YGDSP-----------VPTPR-------
       :     .:::               :.. .:    ::           ::  :       
KIAA14 GYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASISGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQRRRRRRKI
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FLJ002 ---SSSAA---SMAE-----EEASAVS------------------TAAAQFTKLRRGMDE
          .  ::   .. :     .:...::                  .....:..:   .  
KIAA14 EIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQEKVVDLSKASREATSSTSNFSSLSSKFIL
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FLJ002 KEFTVQIKD---------EEGLKLTFQKHKLMANGVMGDGHPLFHKKKGNRKKLVELEVE
        . .. ..:         . ::. :  .: :  :: . ::.: .....: ::..  :.. 
KIAA14 PNVSTPVSDAFKTQMELLQAGLSRTPTRHLL--NGSLVDGEPPMKRRRGRRKNVEGLDLL
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FLJ002 CM------------------EE----------PNHLDVDLETRIPVINKVDGTLLVGEDA
        :                  ::          :.  ..: .:::::::  ::: ::::::
KIAA14 FMSHKRTSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRNIPSPGQLDPDTRIPVINLEDGTRLVGEDA
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FLJ002 PRRAELEMWLQGHPEFAVD-PRFLAYMED-------RRKQKWQRCKKNNKAELNCL-GME
       :.  .:  ::. :: ..:: : ..    :       . ::: .::.. :: ..: : : :
KIAA14 PKNKDLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPNKLDINTLTGEE
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        : ..:.:::::                                                
KIAA14 RVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESMFDRLLT
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       :..::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :.::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::..:. ::::.:::::::::
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       :.:::.:::::.::::::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::: ::::::
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       ::::::::::::::..:.. ....:.:::::::.::::: ::. ::. :.:.:. ::: :
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FLJ002 ERPRSRRH-DRHHAYGRTDCFRVEKHLLVYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAI
       :.:. ::  :: ..::::.::::::.::::::::::.:::::::::...:.::: ::::.
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FLJ002 LVYCLLHYRGDENIKGFIWDLISPAENGKTKELQNHSGLSIPVPRGRKGKKVKSQ-STFD
       :.:::.::::::.:::::::::.:.:.:.:.::::: ::: ::::::::::::.: :.::
KIAA03 LAYCLVHYRGDEKIKGFIWDLITPTEDGQTRELQNHLGLSAPVPRGRKGKKVKTQTSSFD
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FLJ002 IHKADWIRKYNPDTLFQDESYKKHLKHQCNKVLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKVLGGAIA
       :.::.:.:::::. :.:::.::::.::.::::::::::::::.:::::.. .::. :. :
KIAA03 IQKAEWLRKYNPEQLLQDEGYKKHIKHHCNKVLLRVRMLYYLKQEVIGNECQKVFDGVDA
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FLJ002 SEIDIWFPVVDQLEVPTTWWDSEADKSLLIGVFKHGYEKYNTMRADPALCFLEKAGRPDD
       :.::.: :  :. :::. ::: .:::::::::::::::::::.::::::::::..:.::.
KIAA03 SDIDVWVPEPDHSEVPAEWWDFDADKSLLIGVFKHGYEKYNTIRADPALCFLERVGKPDE
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FLJ002 KAIAAEHRVLDNFSDIVEGVDFDKDCEDPEYKPLQGPPKD--QDDEGDP--LMMMDEEIS
       ::.:::.:.    .: ..:     : :::::::  .  ::  .:: ..:  :.. : . .
KIAA03 KAVAAEQRA----NDYMDG-----DVEDPEYKPAPAIFKDDIEDDVSSPGDLVIADGDGQ
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          690       700       710       720        730          740
FLJ002 VIDGDEAQVTQQPGHLFWPPGSALTARLRRLVTAYQRSYKREQMK-IE---AAERGDRRR
       ...::.         ..::  ::::.:::::.:::::. : .:.. :.   ..  .  . 
KIAA03 LMEGDK---------VYWPTQSALTTRLRRLITAYQRTNKNRQIQQIQPTFSVPTSVMQP
                   1650      1660      1670      1680      1690    

              750       760       770       780       790       800
FLJ002 RRCEAAFKLKEIARREKQQRWTRREQTDFYRVVSTFGVEYDPDTMQFHWDRFRTFARLDK
          ::... :  :. :.::::::::..::::::::::: .:::  :: : .::..::: :
KIAA03 IYEEATLNPKMAAKIERQQRWTRREEADFYRVVSTFGVVFDPDRGQFDWTKFRAMARLHK
         1700      1710      1720      1730      1740      1750    

              810       820       830       840       850       860
FLJ002 KTDESLTKYFHGFVAMCRQVCRLPPAAGDEPPDPNLFIEPITEERASRTLYRIELLRRLR
       :::.:: ::...:..:::.:::::  . .:  :::.::.::::::::::::::::::..:
KIAA03 KTDDSLEKYLYAFMSMCRRVCRLP--SKEELVDPNIFIQPITEERASRTLYRIELLRKVR
         1760      1770        1780      1790      1800      1810  

              870       880       890       900       910       920
FLJ002 EQVLCHPLLEDRLALCQPPGPELPKWWEPVRHDGELLRGAARHGVSQTDCNIMQDPDFSF
       ::.: :: : .:: ::.: .:.:: :::   :: .:: :::.::::.:: .:..::..::
KIAA03 EQALRHPQLFERLKLCHP-NPDLPVWWECGPHDRDLLIGAAKHGVSRTDYHILRDPELSF
           1820      1830       1840      1850      1860      1870 

              930       940       950       960                    
FLJ002 LAARMNYMQNHQAGAPAPSLSRCSTPLLHQQYTSRTASPLPLRP---DAP----------
       .::. :: :...:       :: :::::.:  .. .::::   :   ::           
KIAA03 MAAQRNYSQSKMAH------SRTSTPLLQQYQVALSASPLTSLPRLLDAKGIILEEMKVK
            1880            1890      1900      1910      1920     

          970        980       990      1000                 1010  
FLJ002 ---VEKSPEETATQ-VPSLESLTLKLEHEVVARSRPTPQ-----------DYEMRVSPSD
          ... :. .  . . :.:. ::   . :  ..   ::           . . :.  . 
KIAA03 SENLKEEPQSSEEESMSSVETRTLIKSEPVSPKNGVLPQATGDQKSGGKCETDRRMVAAR
        1930      1940      1950      1960      1970      1980     

           1020            1030      1040                          
FLJ002 TTPLVSRSV---PPVKL---EDEDDSDSELDLSKLSP-----------------------
       : ::.   .   : :.    :. .::::. . :. :                        
KIAA03 TEPLTPNPASKKPRVHKRGSESSSDSDSDSERSSCSSRSSSSSSSSSCSHSRSGSSSSSS
        1990      2000      2010      2020      2030      2040     

                    1050      1060       1070        1080      1090
FLJ002 ----------SSSSSSSSSSSSSSTDESE-DEKEEKLTDQSRS--KLYDEESLLSLTMSQ
                 :::.::::::::::..::. ::.: .   .: .  : :::::. ::. .:
KIAA03 SSCSSASSSSSSSTSSSSSSSSSSSEESDSDEEEAQKRAESTTHMKAYDEESVASLSTTQ
        2050      2060      2070      2080      2090      2100     

             1100            1110      1120      1130      1140    
FLJ002 DGFPNEDGEQM---TPE-LLLLQ--ERQRASEWPKDRVLINRIDLVCQAVLSGKWPSSRR
       :   ..:. ::   :::   .::      :: ::::::.:::.: .::.::.:::::.::
KIAA03 D--ETQDSFQMNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQTVLKGKWPSARR
          2110      2120      2130      2140      2150      2160   

         1150      1160      1170      1180      1190      1200    
FLJ002 SQEMVTGGILGPGNHLLDSPSLTPGEYGDSPVPTPRSSSAASMAEEEASAVSTAAAQFTK
       : .  : . .   ..:::::. .  ::..  :::: ....    .. ..  . .. ..: 
KIAA03 SYDANTVASFYT-TKLLDSPG-AATEYSEPSVPTPPGAGVKEEHDQSTQMSKEGGLKLTF
          2170       2180       2190      2200      2210      2220 

         1210                   1220          1230                 
FLJ002 LRRGMDEK-------------EFTVQIKDEEGLKLT----FQKH----------KLMANG
        ..:. .:             .. ..... .. . :    : :            : :::
KIAA03 QKQGLAQKRPFDGEDGALGQQQYLTRLRELQSASETSLVNFPKSIPVSGTSIQPTLGANG
            2230      2240      2250      2260      2270      2280 

      1240      1250      1260         1270                        
FLJ002 VMGDGHPLFHKKKGNRKKLVELEVECMEE---PNHLDV----------------------
       :. :..:. .:..: ::..  ...  ...   :::...                      
KIAA03 VILDNQPIVKKRRGRRKNVEGVDIFFFNRNKPPNHVSLGLTSSQISTGINPALSYTQPQG
            2290      2300      2310      2320      2330      2340 

             1280      1290      1300      1310           1320     
FLJ002 --DLETRIPVINKVDGTLLVGEDAPRRAELEMWLQGHPEFAVD-----PRFLAYMEDRRK
         : :. .::::  ::: :.:.:::.: .:: ::. :: .. :     :: .   : : :
KIAA03 IPDTESPVPVINLKDGTRLAGDDAPKRKDLEKWLKEHPGYVEDLGAFIPR-MQLHEGRPK
            2350      2360      2370      2380      2390       2400

        1330      1340       1350                                  
FLJ002 QKWQRCKKNNKAELNCL-GMEPVQTANSRNGKK---------------------------
       :: .::.. :: ..: : : : ::  : ::..:                           
KIAA03 QKRHRCRNPNKLDVNSLTGEERVQLINRRNARKVGGAFAPPLKDLCRFLKENSEYGVAPE
             2410      2420      2430      2440      2450      2460

              1360      1370      1380      1390      1400         
FLJ002 --------GHHTETVFNRVLPGPIAPESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNT
               :   :....:.: ::.. :  ..:.:: .  ..:  :   ..:. :.: .  
KIAA03 WGDVVKQSGFLPESMYERILTGPVVREEVSRRGRRPKSGIAKATAAAAAASATSVSGNPL
             2470      2480      2490      2500      2510      2520

    1410         1420      1430      1440         1450      1460   
FLJ002 FQHS---SSGLQSVSSLGHSSATSASLPFMPFVMG---GAPSSPHVDSSTMLHHHHHHPH
       . ..   .  : ....: ..  .  ::     .::   : ::                  
KIAA03 LANGLLPGVDLTTLQALQQNLQNLQSLQVTAGLMGMPTGLPSGGEAKNMAAMFPMLLSGM
             2530      2540      2550      2560      2570      2580

          1470      1480      1490      1500      1510      1520   
FLJ002 PHHHHHHHPGLRAPGYPSSPVTTASGTTLRLPPLQPEEDDDEDEEDDDDLSQGYDSSERD
                                                                   
KIAA03 AGLPNLLGMGGLLTKPTESGTEDKKGSDSKESEGKTERTESQSSENGGENSVSSSPSASS
             2590      2600      2610      2620      2630      2640

>>KIAA0444  ( 978 res)   hg00035                          (978 aa)
 initn: 784 init1: 593 opt: 718  Z-score: 473.1  bits: 99.6 E(): 3.7e-21
Smith-Waterman score: 718;  48.163% identity (76.327% similar) in 245 aa overlap (43-285:2-231)

             20        30        40        50        60        70  
FLJ002 EVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKIL
                                     :. .::: ::.:.::::::::.  :     
KIAA04                              GNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAV---
                                            10        20           

             80         90       100       110       120       130 
FLJ002 TEFREACHIIPH-DFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDY
           ::  ..:. ..  ...:.:.:::.:..:.: ::.  ::.:::::::.. ::.:::.
KIAA04 ----EA-PVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLEDF
           30         40        50        60        70        80   

             140       150       160       170       180       190 
FLJ002 LIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFD
       :  . : :::::: . :.::: :::::. : ...: ::: ::::::::::..::: ::.:
KIAA04 LEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYD
            90       100       110       120       130       140   

             200       210       220       230       240        250
FLJ002 SDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQ-SMSG
       :::::.::.:: .: :::::.: : .::..:: : :... . :. :. : . :.. ....
KIAA04 SDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGS
           150       160       170       180       190       200   

              260       270       280       290       300       310
FLJ002 RDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEG
       ..:..:      :.:..:.:. :.   ....: ::                         
KIAA04 KSGSMT------KQELDDILKFGT-EELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAA
                 210       220        230       240       250      

              320       330       340       350       360       370
FLJ002 KGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRH
                                                                   
KIAA04 SAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQ
        260       270       280       290       300       310      

>>KIAA0309  ( 3053 res)   hg00096s1                       (3053 aa)
 initn: 550 init1: 277 opt: 527  Z-score: 344.1  bits: 77.4 E(): 5.7e-14
Smith-Waterman score: 530;  30.233% identity (59.948% similar) in 387 aa overlap (44-414:1803-2181)

            20        30        40        50        60           70
FLJ002 VELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLI---NGAEEK
                                     :: .      :. :   :.:     . .:.
KIAA03 TYTEAAHRAVLFPQQRLDQLSEIIERFIFVMPPVEAPPPSLHACHPPPWLAPRQAAFQEQ
           1780      1790      1800      1810      1820      1830  

                       80        90       100       110       120  
FLJ002 ILTEF--------REACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMV
       . .:.        : .:..  .   :. .  . :::  .  :: .::: ::.::::.::.
KIAA03 LASELWPRARPLHRIVCNMRTQFPDLRLIQYDCGKLQTLAVLLRQLKAEGHRVLIFTQMT
           1840      1850      1860      1870      1880      1890  

            130       140       150       160       170       180  
FLJ002 RCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLT
       : ::.::..:  . .:: :.:: .: . ::: ..::.  :.  : :.: ::.::.:.:::
KIAA03 RMLDVLEQFLTYHGHLYLRLDGSTRVEQRQALMERFNA-DKRIFCFILSTRSGGVGVNLT
           1900      1910      1920      1930       1940      1950 

            190       200       210       220       230       240  
FLJ002 AADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDK
       .::: ...::::::  : ::: :::::::.. :..::::.. . :.... ::.     .:
KIAA03 GADTVVFYDSDWNPTMDAQAQDRCHRIGQTRDVHIYRLISERTVEENILKKAN-----QK
            1960      1970      1980      1990      2000           

            250         260        270       280       290         
FLJ002 AVLQSMSGRDGNITG--IQQFSKKEIEDL-LRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLR
        .: .:. . ::.:   ..: . .:. :. :.. . ...    .:  .       .:: .
KIAA03 RMLGDMAIEGGNFTTAYFKQQTIRELFDMPLEEPSSSSVPSAPEEEEETVASKQTHILEQ
       2010      2020      2030      2040      2050      2060      

     300       310       320       330        340       350        
FLJ002 RTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDP-NFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLV
              : . ...: :::  ::   . . .   : .  .. .. .  : ..  ......
KIAA03 ALCRAEDEEDIRAATQAKAEQVAELAEFNENDGFPAGEGEEAGRPGAEDEEMSRAEQEIA
       2070      2080      2090      2100      2110      2120      

      360       370       380        390       400       410       
FLJ002 IDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLE-SEDDERPRSRRHDRHHAYGRTDCFRVEKHLL
         . ..    :.   . . .: : :  : .. .:. .. :.:  .:  . . ::. .   
KIAA03 ALVEQLTPIERYAMKFLEASLEEVSREELKQAEEQVEAARKDLDQA--KEEVFRLPQEEE
       2130      2140      2150      2160      2170        2180    

       420       430       440       450       460       470       
FLJ002 VYGWGRWRDILSHGRFKRRMTERDVETICRAILVYCLLHYRGDENIKGFIWDLISPAENG
                                                                   
KIAA03 EGPGAGDESSCGTGGGTHRRSKKAKAPERPGTRVSERLRGARAETQGANHTPVISAHQTR
         2190      2200      2210      2220      2230      2240    

>>KIAA1259  ( 1561 res)   hh15706                         (1561 aa)
 initn: 534 init1: 298 opt: 508  Z-score: 335.4  bits: 74.8 E(): 1.7e-13
Smith-Waterman score: 508;  45.055% identity (72.527% similar) in 182 aa overlap (89-270:1099-1273)

       60        70        80        90       100       110        
FLJ002 NHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIF
                                     .... ..:::  .: :: .::. ::.:::.
KIAA12 RRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALDVLLTRLKSQGHRVLIY
     1070      1080      1090      1100      1110      1120        

      120       130       140       150       160       170        
FLJ002 SQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLG
       :::.: .:.::.:.. :.. : :.::  . . :.  .  : .  .: ::::: :::::::
KIAA12 SQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADF-QNRNDIFVFLLSTRAGGLG
     1130      1140      1150      1160       1170      1180       

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FLJ002 INLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKL
       :::::::: :..::::::  : ::. : ::.::.: : ::::: ... :......:.   
KIAA12 INLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAK---
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FLJ002 GLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILL
         .:. .: :    ::.   . .. ::. .::                            
KIAA12 --EKSEIQRMVISGGNFKP-DTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKE
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FLJ002 RRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLV
                                                                   
KIAA12 RKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPFVPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSP
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>>KIAA1122  ( 1048 res)   hj01698                         (1048 aa)
 initn: 436 init1: 265 opt: 439  Z-score: 293.2  bits: 66.5 E(): 3.9e-11
Smith-Waterman score: 447;  33.333% identity (61.111% similar) in 288 aa overlap (2-255:749-1034)

                                            10        20        30 
FLJ002                              EKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKN
                                     :.: ::.. :    ... :.. : ..... 
KIAA11 EQSIYEKERIAHAKQIIKPFILRRVKEEVLKQLPPKKDRIELCAMSEKQEQLYLGLFNRL
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FLJ002 FSFLSKGAGHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYL---INGAEE-KILTEF--REA--CHIIP
        . ... . . :  .. :.::.:::  ::: :      ::. : ....  .:   :.  :
KIAA11 KKSINNLVTEKNT-EMCNVMMQLRKMANHPLLHRQYYTAEKLKEMSQLMLKEPTHCEANP
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FLJ002 H----------DFHLQAMVRS----------------AGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLI
                  ::.:... ..                .::. ..  .: .::  : .:..
KIAA11 DLIFEDMEVMTDFELHVLCKQYRHINNFQLDMDLILDSGKFRVLGCILSELKQKGDRVVL
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FLJ002 FSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGL
       :::..  :::::  : .... : :.::... . :   ::.:.  : : ::::: :.::::
KIAA11 FSQFTMMLDILEVLLKHHQHRYLRLDGKTQISERIHLIDEFNT-DMDIFVFLLSTKAGGL
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FLJ002 GINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLK
       :::::.:.. :. : : :: :: ::. ::::.::.: : : .::.... :. :.   . :
KIAA11 GINLTSANVVILHDIDCNPYNDKQAEDRCHRVGQTKEVLVIKLISQGTIEESMLKINQQK
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FLJ002 LGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQIL
       : :.. .     : .:..                                          
KIAA11 LKLEQDMTTVDEGDEGSMPADIATLLKTSMGL                            
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>>KIAA0809  ( 1385 res)   hk10195                         (1385 aa)
 initn: 341 init1: 241 opt: 302  Z-score: 203.5  bits: 50.3 E(): 3.9e-06
Smith-Waterman score: 336;  31.156% identity (62.312% similar) in 199 aa overlap (91-270:634-825)

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FLJ002 PYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLVLIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQ
                                     ..... :.::. .:. .    : :.:.:::
KIAA08 GVGFNPFQERGNNIVTYEWAKDLLTNYQTGVLENSPKMVLLFHLIEESVKLGDKILVFSQ
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FLJ002 MVRCLDILEDYLIQR-----------------RYL-YERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPD
        .  : ..:..: .:                 : . : :.:: . .  :.  :..:. :.
KIAA08 SLSTLALIEEFLGKREVPCPPGTEGQGAQKWVRNISYFRLDGSTPAFERERLINQFNDPS
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FLJ002 S-DRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKAVKVYRLI
       .   ..::: :::: ::.:: .:.  ..::..::: .: ::  : .: ::.:   .:::.
KIAA08 NLTTWLFLLSTRAGCLGVNLIGANRVVVFDASWNPCHDAQAVCRVYRYGQKKPCYIYRLV
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FLJ002 TRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIEDLLRKGAYAAIMEE
       .  . :....:.   : :..  :.....        . .:..::.:.::           
KIAA08 ADYTLEKKIYDRQISKQGMSDRVVDDLNP-------MLNFTRKEVENLLHFVEKEPAPQV
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FLJ002 DDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRTDISLDDPNFWQKWA
                                                                   
KIAA08 SLNVKGIKESVLQLACLKYPHLITKEPFEHESLLLNRKDHKLTKAEKKAAKKSYEEDKRT
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>>KIAA1994  ( 1117 res)   bh00052                         (1117 aa)
 initn: 382 init1: 104 opt: 153  Z-score: 108.7  bits: 32.4 E(): 0.74
Smith-Waterman score: 153;  30.159% identity (51.587% similar) in 126 aa overlap (1389-1499:203-320)

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FLJ002 HHTETVFNRVLPGPIAPESSKKRARRMRPDLSKMMALMQGGSTGSLSLHNTFQHSSSGLQ
                                     ::.   : .   ..:    :.::.. .   
KIAA19 NSIAEDTESYDDLDESHTEDLSSSEILDVSLSRATDLGEPERSSSEETLNNFQEAET--P
            180       190       200       210       220         230

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FLJ002 SVSSLGHSSATSASLPFMP---FVMGGAPSSPHVDSSTMLHHHH--HHPHPHHHHHHHPG
       .. : ..    .  :: .:    :..:  . ::      :::::  :: :  .: ::::.
KIAA19 GAVSPNQPHLPQPHLPHLPQQNVVINGN-AHPH-----HLHHHHQIHHGHHLQHGHHHPS
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FLJ002 LRA-------PGYPSSPVT---TASGTTLRLPPLQPEEDDDEDEEDDDDLSQGYDSSERD
         :        : :::::.   ...:..  . :. :                        
KIAA19 HVAVASASITGGPPSSPVSRKLSTTGSSDSITPVAPTSAVSSSGSPASVMTNMRAPSTTG
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Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]