# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj01648.fasta.huge -Q ../query/FLJ00264.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00264, 644 aa vs ./tmplib.10216 library 2210350 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3736+/-0.00379; mu= 18.0451+/- 0.256 mean_var=78.0813+/-16.726, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.145145 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0738 ( 941 res) hk03873 ( 941) 2839 604.5 1.6e-173 FLJ00190 ( 521 res) sj02368 ( 521) 102 31.0 0.37 KIAA0566 ( 1163 res) hh01910 (1163) 95 30.0 1.7 KIAA1266 ( 601 res) hj06235 ( 601) 89 28.4 2.7 KIAA0937 ( 653 res) hh04715 ( 653) 88 28.2 3.3 KIAA1166 ( 165 res) hk01743 ( 165) 81 26.0 3.8 KIAA1945 ( 420 res) fh14407 ( 420) 85 27.4 3.8 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 89 29.2 6.8 KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322) 86 28.2 6.9 KIAA1623 ( 1236 res) fj04650 (1236) 85 27.9 7.6 KIAA0168 ( 331 res) ha02316 ( 331) 78 25.8 9.1 FLJ00125 ( 156 res) sh01178 ( 156) 74 24.5 10 KIAA0257 ( 1805 res) ha07065 (1805) 84 27.9 11 KIAA0053 ( 666 res) ha01417 ( 666) 79 26.4 12 KIAA0443 ( 1404 res) pj00552 (1404) 82 27.4 13 KIAA1584 ( 995 res) fj06751 ( 995) 80 26.8 14 KIAA1343 ( 520 res) fj00420 ( 520) 77 25.8 14 FLJ00298 ( 527 res) sh04009 ( 527) 77 25.8 14 KIAA1994 ( 1117 res) bh00052 (1117) 80 26.8 15 KIAA1407 ( 744 res) fh00894(revised) ( 744) 78 26.2 15 FLJ00292 ( 194 res) sh03586 ( 194) 72 24.2 16 KIAA0863 ( 1181 res) hk06535 (1181) 79 26.7 18 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 78 26.4 19 KIAA1507 ( 872 res) hk04967 ( 872) 77 26.1 20 FLJ00060 ( 227 res) as00060 ( 227) 71 24.1 20 FLJ00248 ( 501 res) sj08681 ( 501) 74 25.2 21 KIAA0589 ( 687 res) hj02695 ( 687) 75 25.5 22 KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371) 78 26.5 22 KIAA1112 ( 694 res) hj05505s1 ( 694) 75 25.5 23 KIAA0547 ( 696 res) hh00544 ( 696) 75 25.5 23 KIAA1330 ( 945 res) fh15188 ( 945) 76 25.9 24 KIAA0535 ( 1047 res) hg03847 (1047) 76 26.0 25 KIAA1582 ( 1740 res) fj05982s1 (1740) 78 26.6 26 KIAA1138 ( 1239 res) hj05928 (1239) 76 26.1 28 KIAA1745 ( 893 res) pj01678 ( 893) 74 25.5 30 KIAA0298 ( 901 res) hf00341(revised) ( 901) 74 25.5 31 FLJ00367 ( 75 res) sh06256 ( 75) 63 21.9 31 FLJ00029 ( 240 res) as00029 ( 240) 68 23.5 32 KIAA1338 ( 1495 res) fh16948 (1495) 76 26.2 32 KIAA0133 ( 1527 res) ha03502s1 (1527) 76 26.2 32 KIAA1783 ( 1560 res) fg01285 (1560) 76 26.2 32 KIAA1115 ( 895 res) hk05464 ( 895) 73 25.3 35 KIAA0158 ( 367 res) ha03233 ( 367) 69 23.9 36 KIAA1029 ( 1015 res) fh00363 (1015) 73 25.3 38 KIAA1931 ( 514 res) fj14393 ( 514) 70 24.3 38 KIAA1326 ( 424 res) fh14376 ( 424) 69 24.0 39 KIAA0683 ( 844 res) fk02589 ( 844) 72 25.0 39 FLJ00235 ( 141 res) sj07209 ( 141) 64 22.4 40 KIAA1147 ( 451 res) pf02131 ( 451) 69 24.1 41 KIAA1110 ( 740 res) hh04831b(revised) ( 740) 71 24.7 42 >>KIAA0738 ( 941 res) hk03873 (941 aa) initn: 2839 init1: 2839 opt: 2839 Z-score: 3208.6 bits: 604.5 E(): 1.6e-173 Smith-Waterman score: 2839; 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KIAA05 LSSLFSLPTFSLLNWISSWSLVSRLGSVLQFSRTEQLADGQAGRGLPVQPHSGRSGLQGP 1090 1100 1110 1120 1130 1140 >>KIAA1266 ( 601 res) hj06235 (601 aa) initn: 35 init1: 35 opt: 89 Z-score: 98.6 bits: 28.4 E(): 2.7 Smith-Waterman score: 89; 20.408% identity (44.898% similar) in 196 aa overlap (360-544:264-453) 330 340 350 360 370 380 FLJ002 SVSCLWGGLLYVIVPKGSQLGPVPVTIRGAVPAPYYKLGKTSLEEWKRQ----MQENLAP :: : . .:::. . ..: : KIAA12 AAASRDITLFHAMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDEMEEWSASEASLFEEALEK 240 250 260 270 280 290 390 400 410 420 430 440 FLJ002 WGELATDNIILTVPTTNLQALKDPEPVLRLWDEMMQAVARLAAEPFPFRRPERIVADVQI .:. .: .: .: .. . . . :...: :: : . . . . KIAA12 YGKDFNDIRQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQ-KRLKAAEAESKLKQVYIPTYKP 300 310 320 330 340 350 450 460 470 480 490 500 FLJ002 SAGWMHS--GYPIMCHLESVKEIINEMDMRSRGVWGPIHELGHNQQRHGWEF--PPHTTE . . . . : : .:. .. . . . : : . : : : ::. KIAA12 NPNQISTSNGKP-----GAVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQSHQWYSWGPPNMQC 360 370 380 390 400 510 520 530 540 550 FLJ002 ATCNL-WSVYVHETVLGIPRAQAHEALSP-PERER-RIKAHLGKGAPLCDWNVWTALETY : . : . . : .: . .: ::: : : :...:... : KIAA12 RLCAICWLYWKKYGGLKMPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQAMQGMPVRNTGSPKS 410 420 430 440 450 460 560 570 580 590 600 610 FLJ002 LQLQEAFGWEPFTQLFAEYQTLSHLPKDNTGRMNLWVKKFSEKVKKNLVPFFEAWGWPIQ KIAA12 AVKTRQAFFLHTTYFTKFARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIRAEYADRHAELSGSP 470 480 490 500 510 520 >>KIAA0937 ( 653 res) hh04715 (653 aa) initn: 49 init1: 49 opt: 88 Z-score: 97.1 bits: 28.2 E(): 3.3 Smith-Waterman score: 88; 25.253% identity (55.556% similar) in 99 aa overlap (343-440:299-389) 320 330 340 350 360 370 FLJ002 SRAPMVTHQCWMDRTERSVSCLWGGLLYVIVPKGSQLGPVPVTIRGAVPAPYYKLGKTSL .: :. .: :.. :.: : :...: KIAA09 SGAKPLDSTGTIRGPLKTAPSQVIRRQASSMPTGTTMGS-PASP----PGPNSKTGRVAL 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 FLJ002 EEWKRQMQENLA-PWGELATDNIILTVPTTNLQALKDPEPVLRLWDEMMQAVARLAAEPF .: . :: ... . . :::. ::.. . .:.: .....: : : KIAA09 ATLNRTNLQRLAIAQSRVLIASGVPTVPVKNLNGSSPVNPALAGITGILMSAAGL---PV 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 FLJ002 PFRRPERIVADVQISAGWMHSGYPIMCHLESVKEIINEMDMRSRGVWGPIHELGHNQQRH . :: ..: KIAA09 CLTRPPKLVLHPPPVSKSEIKSIPGVSNTSRKTTKKQAKKGKTPEEVLKKYLQKVRHPPD 390 400 410 420 430 440 >>KIAA1166 ( 165 res) hk01743 (165 aa) initn: 104 init1: 79 opt: 81 Z-score: 96.0 bits: 26.0 E(): 3.8 Smith-Waterman score: 81; 32.203% identity (64.407% similar) in 59 aa overlap (439-495:22-80) 410 420 430 440 450 460 FLJ002 PEPVLRLWDEMMQAVARLAAEPFPFRRPERIVADVQISAGWMHSGYPIMCHLESVKEIIN : ::.... : . :::.:::.::: : KIAA11 PQARRRWLHCVYCIPWLVYLYISRDVKLTVKSMADEQEIMCKLESIKEIRN 10 20 30 40 50 470 480 490 500 510 520 FLJ002 E-MDMRS-RGVWGPIHELGHNQQRHGWEFPPHTTEATCNLWSVYVHETVLGIPRAQAHEA . ..:.. .. : ....:: :. KIAA11 KTLQMEKIKARLKAEFEALESEERHLKEYKQEMDLLLQEKMAHVEELRLIHADINVMENT 60 70 80 90 100 110 >>KIAA1945 ( 420 res) fh14407 (420 aa) initn: 80 init1: 49 opt: 85 Z-score: 95.9 bits: 27.4 E(): 3.8 Smith-Waterman score: 85; 23.611% identity (47.917% similar) in 144 aa overlap (126-262:60-201) 100 110 120 130 140 150 FLJ002 PGHCPLAGFPGNIILNCFGLSILPQTLKAGCFPVPTPEMRSYHFRKALSQFQAILNHENG :: :..: .. : :. .. . KIAA19 GSHIHPLLVIQDEVAAFFVADLGAIVRKHFCFLKCLPRVRPFYAVKCNSSPGVLKVLAQL 30 40 50 60 70 80 160 170 180 190 200 FLJ002 NLEKSCLAKLRVDGAAFLQIPAEGVPAYISLHRLLR-KMLRGSGLPAVSRENP------V .: :: : ... . . ::: . ... . :. :. .: .: : KIAA19 GLGFSCANKAEMELVQHIGIPASKIICANPCKQIAQIKYAAKHGIQLLSFDNEMELAKVV 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 FLJ002 ASDSYEAAVLSLATGLAHSGTDCSQLAQGLGTWTCSSSLYPSKHPITVEINGINPGNNDC : :: .:: .:: .: .: :.. .: : .:. ::. :.. KIAA19 KSHPSAKMVLCIATDDSHS-LSCLSLKFGVSLKSCRHLLENAKKH-HVEVVGVSFHIGSG 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 FLJ002 WVSTGLYLLEGQNAEVSLSEAAASAGLRVQIGCHTDDLTKARKLSRAPMVTHQCWMDRTE KIAA19 CPDPQAYAQSIADARLVFEMGTELGHKMHVLDLGGGFPGTEGAKVRFEEIASVINSALDL 210 220 230 240 250 260 >>KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584 aa) initn: 119 init1: 70 opt: 89 Z-score: 91.4 bits: 29.2 E(): 6.8 Smith-Waterman score: 89; 25.581% identity (56.589% similar) in 129 aa overlap (172-295:6-122) 150 160 170 180 190 200 FLJ002 ALSQFQAILNHENGNLEKSCLAKLRVDGAAFLQIPAEGVPAYISLHRLLRKMLRGSGLPA :... .. :: ..: : .. :: . 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