# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj00758.fasta.huge -Q ../query/FLJ00175.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00175, 1516 aa vs ./tmplib.10216 library 2209478 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5283+/-0.00438; mu= 22.5802+/- 0.297 mean_var=104.9115+/-22.557, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.125217 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1207 ( 2061 res) fg04512s1 (2061) 5115 936.1 0 KIAA0538 ( 816 res) hg03944(revised) ( 816) 148 38.2 0.0093 KIAA0528 ( 1003 res) fj15856 (1003) 145 37.8 0.015 KIAA1032 ( 1702 res) ff09715 (1702) 135 36.4 0.072 KIAA0985 ( 697 res) hj08038 ( 697) 130 34.9 0.081 KIAA0093 ( 927 res) ha00935 ( 927) 120 33.3 0.33 KIAA0636 ( 540 res) hj03289 ( 540) 115 32.0 0.46 KIAA0941 ( 533 res) hh04956 ( 533) 111 31.3 0.75 KIAA1599 ( 608 res) fj09928 ( 608) 108 30.8 1.2 KIAA0695 ( 781 res) hk04006s1 ( 781) 109 31.2 1.2 KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676) 106 31.1 2.7 KIAA1814 ( 1285 res) ph00952 (1285) 104 30.6 3 KIAA1358 ( 1123 res) fj02029 (1123) 103 30.3 3.1 FLJ00192 ( 1437 res) sj02564 (1437) 104 30.6 3.2 KIAA1342 ( 426 res) fj00418 ( 426) 96 28.4 4.3 FLJ00006 ( 401 res) as00006 ( 401) 95 28.2 4.8 KIAA0439 ( 995 res) hj00462 ( 995) 99 29.5 4.8 KIAA0747 ( 1072 res) hk04143 (1072) 99 29.6 5 KIAA1386 ( 1214 res) fj06274 (1214) 99 29.6 5.4 KIAA1228 ( 843 res) fh05620s1 ( 843) 97 29.1 5.6 FLJ00003 ( 235 res) as00003 ( 235) 90 27.0 6.6 FLJ00222 ( 656 res) sj06165 ( 656) 93 28.2 8.1 KIAA1191 ( 100 res) hh01795a ( 100) 83 25.2 9.7 KIAA0080 ( 486 res) hh13320 ( 486) 90 27.4 9.9 KIAA0559 ( 1212 res) hh01510 (1212) 94 28.7 10 KIAA1259 ( 1561 res) hh15706 (1561) 95 29.1 10 FLJ00414 ( 1129 res) sg00016 (1129) 93 28.5 11 FLJ00353 ( 1766 res) sh01144 (1766) 95 29.2 11 KIAA1410 ( 4293 res) pg00933y4 (4293) 99 30.4 11 KIAA0450 ( 1182 res) hj05822 (1182) 93 28.5 11 KIAA1832 ( 694 res) fg02852(revised) ( 694) 90 27.7 12 KIAA1096 ( 1919 res) pf00402 (1919) 93 28.8 15 FLJ00201 ( 705 res) sj04110 ( 705) 88 27.3 16 KIAA0997 ( 646 res) hk08613 ( 646) 87 27.1 17 KIAA1289 ( 2793 res) hh15326s2 (2793) 93 29.1 18 KIAA0734 ( 1190 res) hk03764s2 (1190) 89 27.8 19 FLJ00343 ( 2651 res) sf00012 (2651) 91 28.7 23 KIAA0195 ( 1410 res) ha02752 (1410) 88 27.7 23 KIAA1108 ( 763 res) hh03387s1 ( 763) 85 26.8 24 KIAA0230 ( 1496 res) ha02538 (1496) 88 27.8 24 KIAA0466 ( 1214 res) pg00625 (1214) 87 27.5 24 KIAA1842 ( 526 res) fj22905s1 ( 526) 83 26.2 25 KIAA1601 ( 690 res) fj10228 ( 690) 84 26.6 26 KIAA0023 ( 2111 res) ha00512 (2111) 88 28.0 29 KIAA1646 ( 481 res) hk01650 ( 481) 81 25.8 30 FLJ00417 ( 600 res) sj06336 ( 600) 82 26.1 30 KIAA0660 ( 490 res) hk01902 ( 490) 81 25.8 31 FLJ00238 ( 204 res) sj07412 ( 204) 77 24.6 31 KIAA0775 ( 639 res) hk05255 ( 639) 82 26.2 31 KIAA1271 ( 542 res) hk06527 ( 542) 81 25.9 32 >>KIAA1207 ( 2061 res) fg04512s1 (2061 aa) initn: 4916 init1: 1288 opt: 5115 Z-score: 4988.1 bits: 936.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 6108; 57.208% identity (78.930% similar) in 1533 aa overlap (1-1493:418-1922) 10 20 30 FLJ001 NPQWNQNITLPAMFPSMCEKMRIRIIDWDR ::.::: ..: :::.:::... : :::: KIAA12 NADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDR 390 400 410 420 430 440 40 50 60 70 FLJ001 LTHNDIVATTYLSMSKISAPGGEIE--------VDDY--------LGFLPTFGPCYINLY ::.::.:.:::: .:::.: :::.: . .: .::.:::::::.::: KIAA12 LTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTGAASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLY 450 460 470 480 490 500 80 90 100 110 120 130 FLJ001 GSPREFTGFPDPYTELNTGKGEGVAYRGRLLLSLETKLVEHS--EQKVEDLPADDILRVE :::::.::::::: :::::::::::::::.:. : : ..:.. ..:.: . ::.: :: KIAA12 GSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVELAT-FLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVE 510 520 530 540 550 560 140 150 160 170 180 190 FLJ001 KYLRRRKYSLFAAFYSATMLQDVDDAIQFEVSIGNYGNKFDMTCLPLASTTQYSRAVFDG :: ::::::: :.:.:::::::: .:::::::::::::::: :: ::::::::::::::: KIAA12 KYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIGNYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDG 570 580 590 600 610 620 200 210 220 230 240 250 FLJ001 CHYYYLPWGNVKPVVVLSSYWEDISHRIETQNQLLGIADRLEAGLEQVHLALKAQCSTED .::::::...::::.:.:::::::::... : ::..:.::....: .. ..... ... KIAA12 NYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQ 630 640 650 660 670 680 260 270 280 290 300 310 FLJ001 VDSLVAQLTDELIAGCSQPLGDIHETPSATHLDQYLYQLRTHHLSQITEAALALKLGHSE . : .: ::.: : . ..: :: . .::.. :::: :::. .. .. KIAA12 LAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDTQIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATD 690 700 710 720 730 740 320 330 340 350 360 370 FLJ001 LPAALEQAEDWLLRLRALAEEPQNSLPDIVIWMLQGDKRVAYQRVPAHQVLFSRRGANYC . ..: . :::: .: :.::::::.:::.:::..:.::.:: :.::::::.: : : KIAA12 VKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENAS 750 760 770 780 790 800 380 390 400 410 420 430 FLJ001 GKNCGKLQTIFLKYPMEKVPGARMPVQIRVKLWFGLSVDEKEFNQFAEGKLSVFAETYEN :: ::: ::::::::.:: : ..::..::..:.:::. ::.::.:::: ..:::: ::: KIAA12 GKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYEN 810 820 830 840 850 860 440 450 460 470 480 490 FLJ001 ETKLALVGNWGTTGLT-YPKFSDVTGKIKLPKDSFRPSAGWTWAGDWFVCPEKTLLHDMD .. . :.:::.::. ::::::::::: .. : : :: : :.:.: ::..:: . : KIAA12 QA--LMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFLPPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEAD 870 880 890 900 910 920 500 510 520 530 540 550 FLJ001 AGHLSFVEEVFENQTRLPGGQWIYMSDNYTDVNGEKVLPKDDIECPLGWKWEDEEWSTDL ::: :..::..:..: :::.: :.:::.::.:. ... :: ::.:::. :: :. KIAA12 AGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDKAASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDI 930 940 950 960 970 980 560 570 580 590 600 610 FLJ001 NRAVDEQGWEYSITIPPERKPKHWVPAEKMYYTHRRRRWVRLRRRDLSQMEA-LKRHRQA ::::::.::::.:::::..::: :: :::::.:::::: :: :..::.: . : . KIAA12 NRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEE 990 1000 1010 1020 1030 1040 620 630 640 650 660 FLJ001 EAEGEGWEYASLFGWKFHLEYRKTDAFRRRRWRRRMEPLEKTGPAAVFALEGALGG-VMD . ::::::::.::::: . :..:.::::::::.: : : : ::.: ::::::. . . KIAA12 LQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTE 1050 1060 1070 1080 1090 1100 670 680 690 700 710 720 FLJ001 DKSEDSMS----VSTLSFGVNRPTISCIFDYGNRYHLRCYMYQARDLAAMDKDSFSDPYA : .: :. .: ::.: : .:: :: ::::::.::::.: :.:::::::::: KIAA12 DGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYA 1110 1120 1130 1140 1150 1160 730 740 750 760 770 780 FLJ001 IVSFLHQSQKTVVVKNTLNPTWDQTLIFYEIEIFGEPATVAEQPPSIVVELYDHDTYGAD . :::.:. : ....:::::::::.:: :.::.::: :: ..::....::.:.: : : KIAA12 HICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGEPQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKD 1170 1180 1190 1200 1210 1220 790 800 810 820 830 FLJ001 EFMGRCICQP------SLERMPRLAWFPLTRGSQPSGELLASFELIQREKPAIHHIPGFE ::.:: : .: .. :.: : :. :.. :..:.. ::: : : KIAA12 EFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKACGDVLVTAELILRGK---------- 1230 1240 1250 1260 1270 840 850 860 870 880 890 FLJ001 VQETSRILDESEDTDLPYPPPQREANIYMVPQNIKPALQRTAIEILAWGLRNMKSYQLAN . ..:: :::: :.:::::.:.:..: ::::::::::::::..:.:. KIAA12 -----------DGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQMAS 1280 1290 1300 1310 1320 900 910 920 930 940 950 FLJ001 ISSPSLVVECGGQTVQSCVIRNLRKNPNFDICTLFMEVMLPREELYCPPITVKVIDNRQF :.::::::::::. :.: ::.::.:.::: .:::.:.::.:::: ::...::::.::: KIAA12 ITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDHRQF 1330 1340 1350 1360 1370 1380 960 970 980 990 1000 1010 FLJ001 GRRPVVGQCTIRSLESFLCDPYSA-ESPSPQGGPDDVSLLS--PGEDVLIDIDDKEPLIP ::.::::::::. :. : ::::.. :. :: .:::: : .:..:...: .::. KIAA12 GRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQ---LKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLA 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1020 1030 1040 1050 1060 1070 FLJ001 IQ----EEEFIDWWSKFFASIGEREKCGSYLEKDFDTLKVYDTQLENVEAFEGLSDFCNT . :::..::::::.:: ::.::::.:..: .. ::.:. .:::: ::::.:: .: KIAA12 SKLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIYNCELENVAEFEGLTDFSDT 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1080 1090 1100 1110 1120 1130 FLJ001 FKLYRGKTQEETEDPSVIGEFKGLFKIYPLPEDPAIPMPPRQFHQLAAQGPQECLVRIYI :::::::. .:.:::::.::::: :.:::::.::..: :::::..: . :::: ::::: KIAA12 FKLYRGKS-DENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQFRELPDSVPQECTVRIYI 1510 1520 1530 1540 1550 1140 1150 1160 1170 1180 1190 FLJ001 VRAFGLQPKDPNGKCDPYIKISIGKKSVSDQDNYIPCTLEPVFGKMFELTCTLPLEKDLK ::.. :::.: :: :::::::..::: . :.:.::: ::.::::.:.::.: :: ::::: KIAA12 VRGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLK 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1200 1210 1220 1230 1240 1250 FLJ001 ITLYDYDLLSKDEKIGETVVDLENRLLSKFGARCGLPQTYCVSGPNQWRDQLRPSQLLHL :..:::: ...:::.:::..:::::.::.::..::.:. ::::: : :::::::.:::. KIAA12 ISVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQN 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1260 1270 1280 1290 1300 1310 FLJ001 FCQQHRVKAPVYRTD--RVMFQDKEYSIEEIEAGRIPNPHLGPVEERLALHVLQQQGLVP . . :. : :. . ..::..:.::..: . ::: :::::::.:. ::::: KIAA12 VARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVP 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1320 1330 1340 1350 1360 1370 FLJ001 EHVESRPLYSPLQPDIEQGKLQMWVDLFPKALGRPGPPFNITPRRARRFFLRCIIWNTRD ::::.: :.: .::.: :::::::::.:::.:: ::::::::::.:....:: :::::.: KIAA12 EHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKD 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1380 1390 1400 1410 1420 1430 FLJ001 VILDDLSLTGEKMSDIYVKGWMIGFEEHKQKTDVHYRSLGGEGNFNWRFIFPFDYLPAEQ ::::. :.:::.:::::::::. : ::.::::::::::: :::::::::.:::::::::: KIAA12 VILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVFPFDYLPAEQ 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1440 1450 1460 1470 1480 1490 FLJ001 VCTIAKKDAFWRLDKTESKIPARVVFQIWDNDKFSFDDFLGSLQLDLNRMPSSASSSRPP .: .:::. :: .:.:: .:: :...:::::::::.::.:: :.::: . :.: . KIAA12 LCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKC 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1500 1510 FLJ001 RPDCPARVGRQTDGPAHTPRVANMEL : : KIAA12 RLDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEAD 1920 1930 1940 1950 1960 1970 >>KIAA0538 ( 816 res) hg03944(revised) (816 aa) initn: 209 init1: 148 opt: 148 Z-score: 142.8 bits: 38.2 E(): 0.0093 Smith-Waterman score: 175; 31.193% identity (61.468% similar) in 109 aa overlap (702-808:148-247) 680 690 700 710 720 730 FLJ001 SEDSMSVSTLSFGVNRPTISCIFDYGNRYHLRCYMYQARDLAAMDKDSFSDPYAIVSFLH ::: . .::::: :... :::.. : . KIAA05 AHLTEVDPDEEVQGEIHLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKG 120 130 140 150 160 170 740 750 760 770 780 790 FLJ001 QSQKTVVVKNTLNPTWDQTLIFYEIEIFGEPATVAEQPPSIVVELYDHDTYGADEFMGRC ....: .::.. : :..: .:.:. : : : . :: .: : . ..:.:. KIAA05 RTRETSIVKKSCYPRWNET---FEFEL-QEGAMEA-----LCVEAWDWDLVSRNDFLGKV 180 190 200 210 220 800 810 820 830 840 FLJ001 ICQPSLERMPRL--AWFPLTRGSQPSGELLASFELIQREKPAIHHIPGFEVQETSRILDE . . . :. . .:: : KIAA05 VIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSKSRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHL 230 240 250 260 270 280 >>KIAA0528 ( 1003 res) fj15856 (1003 aa) initn: 123 init1: 58 opt: 145 Z-score: 139.0 bits: 37.8 E(): 0.015 Smith-Waterman score: 145; 29.204% identity (59.292% similar) in 113 aa overlap (702-808:8-114) 680 690 700 710 720 730 FLJ001 SEDSMSVSTLSFGVNRPTISCIFDYGNRYHLRCYMYQARDLAAMDKDS-FSDPYAIVSFL :. . .: : .::. : ..: .. :.: KIAA05 TETMPGKLKVKIVAGRHLPVMDRASDLTDAFVEVKFG 10 20 30 740 750 760 770 780 790 FLJ001 HQSQKTVVVKNTLNPTWDQTLIFYEIEIFGEPATVAEQPPSIVVELYDHDTYGADEFMGR . . :: : ..::: :.. . .:. . . ..: .:.: :::::.:.. .:. KIAA05 NTTFKTDVYLKSLNPQWNSEWFKFEV----DDEDLQDEPLQITV--LDHDTYSANDAIGK 40 50 60 70 80 90 800 810 820 830 840 FLJ001 CICQ--PSL--ERMPRLA-WFPLTRGSQPSGELLASFELIQREKPAIHHIPGFEVQETSR . : : : .. :::. KIAA05 VYIDIDPLLYSEAATVISGWFPIYDTIHGIRGEINVVVKVDLFNDLNRFRQSSCGVKFFC 100 110 120 130 140 150 >>KIAA1032 ( 1702 res) ff09715 (1702 aa) initn: 209 init1: 102 opt: 135 Z-score: 126.9 bits: 36.4 E(): 0.072 Smith-Waterman score: 135; 28.846% identity (58.654% similar) in 104 aa overlap (1128-1220:677-775) 1100 1110 1120 1130 1140 1150 FLJ001 KIYPLPEDPAIPMPPRQFHQLAAQGPQECLVRIYIVRAFGLQPKDPNGKCDPYIKISIGK . : .: : ::: :: .:. :::. ...:: KIAA10 IFAVTKTAHTQQMKAVKQSVLDGTSKWSAKISITVVCAQGLQAKDKTGSSDPYVTVQVGK 650 660 670 680 690 700 1160 1170 1180 1190 1200 FLJ001 KSVSDQDNYIPCTLEPVFGKMFELTCTLPLEKDLKITLYDYD--LLSK---------DEK . . : .:.::. . :.. : .. .:. ..: : . :. :. KIAA10 TKKRTKTIY--GNLNPVWEENFHFECHNSSDR-IKVRVWDEDDDIKSRVKQRFKRESDDF 710 720 730 740 750 760 1210 1220 1230 1240 1250 1260 FLJ001 IGETVVDLENRLLSKFGARCGLPQTYCVSGPNQWRDQLRPSQLLHLFCQQHRVKAPVYRT .:.:.... : :: KIAA10 LGQTIIEV--RTLSGEMDVWYNLDKRTDKSAVSGAIRLHISVEIKGEEKVAPYHVQYTCL 770 780 790 800 810 820 >>KIAA0985 ( 697 res) hj08038 (697 aa) initn: 112 init1: 80 opt: 130 Z-score: 125.9 bits: 34.9 E(): 0.081 Smith-Waterman score: 167; 28.846% identity (60.577% similar) in 104 aa overlap (691-789:402-498) 670 680 690 700 710 720 FLJ001 EGALGGVMDDKSEDSMSVSTLSFGVNRPTISCIFDYGNRYHLRCYMYQARDLAAMDKDSF : ..: : :.: . .:. : ::.... KIAA09 ARQPPPPEEEEEEANSYDSDEATTLGALEFSLLYDQDNS-SLQCTIIKAKGLKPMDSNGL 380 390 400 410 420 430 730 740 750 760 770 FLJ001 SDPYAIVSFLHQSQK-----TVVVKNTLNPTWDQTLIFYEIEIFGEPATVAEQPPSIVVE .:::. . .: ..: : ...:: :: :..::... : . : .. . 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