# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sj00753.fasta.huge -Q ../query/FLJ00380.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00380, 791 aa vs ./tmplib.10216 library 2210203 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2264+/-0.00577; mu= -4.8342+/- 0.385 mean_var=246.6670+/-56.667, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.081662 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800) 174 34.4 0.25 KIAA1491 ( 757 res) fj08187 ( 757) 154 31.5 0.47 KIAA0339 ( 1709 res) hg01304(revised) (1709) 154 31.8 0.88 KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759) 155 32.1 1.2 FLJ00261 ( 1651 res) sh06537 (1651) 149 31.2 1.3 KIAA1744 ( 855 res) pj01516 ( 855) 131 28.9 3.4 KIAA0482 ( 1332 res) hj01880 (1332) 133 29.3 4 KIAA0553 ( 1450 res) pf08859 (1450) 131 29.1 5.1 KIAA0670 ( 1286 res) hk02359s1 (1286) 129 28.8 5.4 KIAA2032 ( 952 res) eh00720 ( 952) 125 28.2 6 KIAA1538 ( 1029 res) fg06773 (1029) 124 28.1 6.9 KIAA1738 ( 1127 res) pj00192s1 (1127) 124 28.1 7.4 KIAA1604 ( 937 res) fj10713 ( 937) 122 27.8 7.6 KIAA1472 ( 601 res) fj03211 ( 601) 117 27.1 8.2 FLJ00169 ( 432 res) sh07709 ( 432) 113 26.5 8.8 KIAA0869 ( 888 res) hk06927 ( 888) 118 27.3 10 KIAA1663 ( 347 res) hk01115 ( 347) 109 26.0 10 KIAA0552 ( 709 res) hh00869 ( 709) 115 26.9 11 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 116 27.2 13 KIAA1041 ( 642 res) fh02801 ( 642) 111 26.4 14 KIAA1602 ( 1003 res) fj10252 (1003) 115 27.0 14 KIAA1728 ( 1644 res) pg00239 (1644) 119 27.7 15 KIAA0144 ( 983 res) ha03843 ( 983) 114 26.9 15 KIAA0257 ( 1805 res) ha07065 (1805) 118 27.6 17 KIAA0240 ( 1087 res) fg03390 (1087) 113 26.8 18 KIAA0235 ( 1064 res) ha04677s1 (1064) 112 26.7 19 KIAA0585 ( 416 res) hj00998 ( 416) 103 25.3 19 KIAA0445 ( 1919 res) hg00102s1 (1919) 117 27.5 20 FLJ00125 ( 156 res) sh01178 ( 156) 93 23.8 21 KIAA1673 ( 712 res) fg00690 ( 712) 107 26.0 21 KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 112 26.8 22 KIAA1113 ( 1131 res) hj06379(revised) (1131) 110 26.5 23 KIAA0347 ( 1281 res) hg01528(revised) (1281) 111 26.7 24 KIAA0773 ( 336 res) hk05140 ( 336) 98 24.6 25 KIAA1138 ( 1239 res) hj05928 (1239) 109 26.4 27 KIAA1791 ( 653 res) fh26241 ( 653) 103 25.5 27 KIAA0449 ( 1628 res) ff06247 (1628) 111 26.7 28 KIAA1307 ( 1678 res) fh08302 (1678) 111 26.7 29 FLJ00214 ( 322 res) sj05155 ( 322) 95 24.3 31 KIAA1464 ( 621 res) fh18679 ( 621) 101 25.2 31 KIAA1218 ( 864 res) fh03016 ( 864) 104 25.7 31 KIAA1671 ( 364 res) hh02164 ( 364) 96 24.4 31 KIAA1064 ( 1315 res) hj05008s1 (1315) 107 26.2 33 KIAA1832 ( 694 res) fg02852(revised) ( 694) 101 25.3 33 KIAA0595 ( 1666 res) hj02929s1 (1666) 109 26.5 34 FLJ00179 ( 194 res) sj01277 ( 194) 89 23.4 34 KIAA2026 ( 858 res) fk11517 ( 858) 102 25.4 36 KIAA0154 ( 692 res) ha03131 ( 692) 100 25.1 36 KIAA1474 ( 1079 res) fj03364 (1079) 104 25.8 36 KIAA2009 ( 501 res) fj05611 ( 501) 96 24.6 39 >>KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800 aa) initn: 882 init1: 140 opt: 174 Z-score: 117.2 bits: 34.4 E(): 0.25 Smith-Waterman score: 209; 30.159% identity (57.143% similar) in 252 aa overlap (292-541:2473-2703) 270 280 290 300 310 320 FLJ003 PSGEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLT :. : . .: ::.: : :.. ::. KIAA03 GRTSPPLLDRARSRTPPSAPSQSRMTSERAPSPSSRMGQA-PSQSLLPPAQDQPRSPV-- 2450 2460 2470 2480 2490 330 340 350 360 370 380 FLJ003 GTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVS : :. .:. . . . . . .:.. .. :: . ::..: ...:. KIAA03 --PSAFS-DQSRCLIAQTTPVAGSQSLSSGAVATTTSSAGDHNGMLSVPAPGVP-HSDVG 2500 2510 2520 2530 2540 2550 390 400 410 420 430 440 FLJ003 LHQASLGGCSQDFLL-FSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQ :: :. . . : ..: : .:::. . :.:.: .:. .:.. .: KIAA03 EPPASTGAQQPSALAALQPAKERRSSSSSSS----SSSSSSSSSSSSSSSSSSG------ 2560 2570 2580 2590 2600 450 460 470 480 490 FLJ003 LNGTANDTAGPELP-DPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLS ....:. : :: .: .: . . . :..:: : . ... .:.:. : KIAA03 --SSSSDSEGSSLPVQPEVAL--KRVPSPTPAPKEAVREGRPPEPTPAKRKRRSSSSSSS 2610 2620 2630 2640 2650 2660 500 510 520 530 540 550 FLJ003 LDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEG .:: : :: ::: .::::::::::::::.:::.: : .. : KIAA03 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSPSPAKPGPQALPKPASPKKPPPGER 2670 2680 2690 2700 2710 2720 560 570 580 590 600 610 FLJ003 AVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSK KIAA03 RSRSPRKPIDSLRDSRSLSYSPVERRRPSPQPSPRDQQSSSSERGSRRGQRGDSRSPSHK 2730 2740 2750 2760 2770 2780 >>KIAA1491 ( 757 res) fj08187 (757 aa) initn: 134 init1: 85 opt: 154 Z-score: 112.2 bits: 31.5 E(): 0.47 Smith-Waterman score: 154; 26.045% identity (48.875% similar) in 311 aa overlap (255-551:95-392) 230 240 250 260 270 280 FLJ003 ELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPSGEDQTALSLEECLRLLEATCP ::::.:. :. . : .::. KIAA14 SQPEPSPVLSQLSQRQQHQSQAVTVPPPGLESFPSQAKLRESTPGDSPSTVNKLLQLPST 70 80 90 100 110 120 290 300 310 320 330 FLJ003 FGENAEF------PADISSITEAVPSESEPPALQNNLL-SPLLTGTESPFDLEQQWQDLM :: : :. . .: :. :: .. : .:: . : .. . KIAA14 TIENISVSVHQPQPKHIKLAKRRIPPASKIPASAVEMPGSADVTGLNVQFG-ALEFGSEP 130 140 150 160 170 180 340 350 360 370 380 390 FLJ003 SIMEMQAMEVNTSASEI---LYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDF :. :. . . ....: ::: ..::.:. :. : :: . . . .:: KIAA14 SLSEFGSAPSSENSNQIPISLYSKSLSEPLNTSLSM---TSAVQNSTYTTSVITSCS--- 190 200 210 220 230 400 410 420 430 440 450 FLJ003 LLFSPEVESL-PVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGST-NLTGLFFPPQLNGTANDTAGPE : : ..: ::: ::. . : .: .:. . : . .:: .. . KIAA14 -LTSSSLNSASPVAMSSSYDQSSVHNRIPYQSPVSSSESAPGTI----MNGHGGGRSQQT 240 250 260 270 280 290 460 470 480 490 500 510 FLJ003 LPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSD--SGLSLDSSHSPSSLS : : :. . :: . . .. : ..:: .. :. : :: . : :::: KIAA14 LDTPKTTGPPSALPSVSSLPSTTSCTALLP-STSQHTGDLTSSPLSQLSSSLSSHQSSLS 300 310 320 330 340 350 520 530 540 550 560 570 FLJ003 SSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKF . . :::.: . .: :::: ::. .:.. ::.. . KIAA14 AHAALSSSTSHTHASVESASSHQSSATFSTAATSVSSSASSGVSLSSSMNTANSLCLGGT 360 370 380 390 400 410 580 590 600 610 620 630 FLJ003 CRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSKEKQADFLDKQM KIAA14 PASASSSSSRAAPLVTSGKAPPNLPQGVPPLLHNQYLVGPGGLLPAYPIYGYDELQMLQS 420 430 440 450 460 470 >>KIAA0339 ( 1709 res) hg01304(revised) (1709 aa) initn: 368 init1: 144 opt: 154 Z-score: 107.4 bits: 31.8 E(): 0.88 Smith-Waterman score: 154; 41.322% identity (58.678% similar) in 121 aa overlap (445-558:962-1071) 420 430 440 450 460 470 FLJ003 LAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDL : :. : : . .. :: :: . : KIAA03 EAGEPGRPGTKPPKRDEERGKTQGKHRKSFALDSEGEEASQESSSEKDEED-DEEDEEDE 940 950 960 970 980 990 480 490 500 510 520 FLJ003 AIEEGFNPVQ-----ASQLEEEFDSDSGLSL--DSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSS ::. . .. .. .:: ::.: :: ::. .: :.::.::::::::::::: KIAA03 DREEAVDTTKKETEVSDGEDEESDSSSKCSLYADSDGENDSTSDSESSSSSSSSSSSSSS 1000 1010 1020 1030 1040 1050 530 540 550 560 570 580 FLJ003 SASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYL :.:::.::: :.: . : :: : KIAA03 SSSSSSSSS----------SESSSEDEEEEERPAALPSASPPPREVPVPTPAPVEVPVPE 1060 1070 1080 1090 1100 590 600 610 620 630 640 FLJ003 EHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSKEKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTND KIAA03 RVAGSPVTPLPEQEASPARPAGPTEESPPSAPLRPPEPPAGPPAPAPRPDERPSSPIPLL 1110 1120 1130 1140 1150 1160 >>KIAA0308 ( 2759 res) ee00163 (2759 aa) initn: 371 init1: 142 opt: 155 Z-score: 105.2 bits: 32.1 E(): 1.2 Smith-Waterman score: 155; 51.899% identity (68.354% similar) in 79 aa overlap (484-558:2003-2081) 460 470 480 490 500 510 FLJ003 PDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSE ..:. . :::: : ::.: :: ::: KIAA03 GKCETDRRMVAARTEPLTPNPASKKPRVHKRGSESSSDSDSDSERSSCSSRSSSSSSSSS 1980 1990 2000 2010 2020 2030 520 530 540 550 560 FLJ003 GS---SSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSET-LDLEEAEGAVGYQPEYSK : :.:::::::: ::::::.::: : .. . ::. :. : :::. KIAA03 CSHSRSGSSSSSSSSCSSASSSSSSSTSSSSSSSSSSSEESDSDEEEAQKRAESTTHMKA 2040 2050 2060 2070 2080 2090 570 580 590 600 610 620 FLJ003 FCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSKEKQADFLDKQ KIAA03 YDEESVASLSTTQDETQDSFQMNNGTPESAYILQGGYMLAASYWPKDRVMINRLDSICQT 2100 2110 2120 2130 2140 2150 >>FLJ00261 ( 1651 res) sh06537 (1651 aa) initn: 67 init1: 43 opt: 149 Z-score: 104.4 bits: 31.2 E(): 1.3 Smith-Waterman score: 174; 22.677% identity (50.743% similar) in 538 aa overlap (152-647:347-850) 130 140 150 160 170 180 FLJ003 WLVHRDPEGSVSGSQPNSGLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLG-AVAP .:: .:. ..: :: ::.: . . . FLJ002 EQVNDEKGEQKQKQEQVQDVMLGRQGERMGLTGEPEGLNDGEWEQ---EDMERKAQGQGG 320 330 340 350 360 370 190 200 210 220 230 FLJ003 PVSGDLTKEDIDLIDILWRQDID------LGAGREVF--DYSHRQKEQDVEKELRDGGEQ : .:. :..... . .. : :: ..:: . .: ::. : ... : FLJ002 PEQGEERKRELQVPEENRADSQDEKSQTFLGKSEEVTGKQEDHGIKEKGVPVSGQEAKEP 380 390 400 410 420 430 240 250 260 270 280 FLJ003 DTWAGE--GAEALARNLLVDGET-GESFPAQVPSGEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENA ..: : :: . ::. ..: : :.:: . . ::. .: : . : : .. FLJ002 ESWDGGRLGAVGRARSREEENEHHGPSMPALI-APEDSPHCDLFPGASYLMTQIP-GTQT 440 450 460 470 480 490 290 300 310 320 330 340 FLJ003 EF------PADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQ : :: .: : . .: .: ...:. ::: : : . .. . ... FLJ002 ESRAEELSPAALSPSLEPIRCSHQPISLLGSFLTE-----ESP-DKEIDQNSQQEGSRLR 500 510 520 530 540 350 360 370 380 390 FLJ003 AMEVNTSASEILYSA----PPGDPLSTNYSLAPNTPINQ-NVSLHQ-ASLGGCSQDFLLF :.....:..... :: : :. : : ::. .:: . ... . FLJ002 KGTVSSQGTEVVFASASVTPPRTPDSAPPSPAEAYPITPASVSARPPVAFPRRETSCAAR 550 560 570 580 590 600 400 410 420 430 440 450 FLJ003 SPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNST----FGSTNLTGLFFPPQLNGTANDTAGPEL .::. : :.. .. : .: ... . .. : ::. . : . .::.. . . FLJ002 APETASAPLSMDD---P-SPCGTSEMCQAALYGFPSTGTSPPRPPANSTGTVQHLRSDSF 610 620 630 640 650 660 460 470 480 490 500 FLJ003 PDPLGGLLDEAMLDEISLM-----DLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDS-SHSPS : :. : : .... . .. .:. :.. . : :: . .. : ::. FLJ002 P---GSHRTEQTPDLVGMLLSYSHSELPQRPPKPAIYSSVTPRRDRRSGRDYSTVSASPT 670 680 690 700 710 510 520 530 540 550 560 FLJ003 SLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASS------SASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAV .::. . .:. : :. :: : . .:. :. . :.:. ...:... FLJ002 ALSTLKQDSQESISNLERPSSPPSIQPWVSPHNPAFATESPA-YGSSPSFVSMEDVR--- 720 730 740 750 760 770 570 580 590 600 610 620 FLJ003 GYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLP-YLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSKE ..: . : . . : .: :: .. ..:. : . . ::: :: .: . FLJ002 IHEP-------LPPPPPQRRDTHPSVVETDGHARV--VVPT-LKQHSHPPPLALGSGLHA 780 790 800 810 820 630 640 650 660 670 FLJ003 KQADFLDKQMSRDEHRARAMK-IPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRR . : . . : :: . .: : : FLJ002 PHKGPLPQ--ASDPAVARQHRPLPSTPDSSHHAQATPRWRYNKPLPPTPDLPQPHLPPIS 830 840 850 860 870 880 >>KIAA1744 ( 855 res) pj01516 (855 aa) initn: 99 init1: 72 opt: 131 Z-score: 96.8 bits: 28.9 E(): 3.4 Smith-Waterman score: 134; 20.771% identity (49.893% similar) in 467 aa overlap (157-586:276-711) 130 140 150 160 170 180 FLJ003 DPEGSVSGSQPNSGLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLG---AVAPPVS ::.: : ... : ..:.. . . . KIAA17 SLSSINKKKGKPQTEKEKIKKTDNRLNSRINGIRLSTPQHAHGGTVKDVNLDIGSGHDTC 250 260 270 280 290 300 190 200 210 220 230 240 FLJ003 GDLTKEDIDLIDILWRQDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEAL :. ..:. . . :.: ::: :. :...:..:.... .:.:. .: : .. KIAA17 GETSSESYSSPSSP-RHD-----GRESFE-SEEEKDRDTDSNSEDSGNPSTTRFTGYGSV 310 320 330 340 350 250 260 270 280 FLJ003 ARNLLVD---------GETGESF--PAQVPSGEDQTALSLEECL-----RLLEATCPFGE ... : .:.:. . : . :. . . . .:. . :.. : KIAA17 NQTVTVKPPVQIASLGNENGNLLEDPLNSPKYQHISFMPTLHCVMHNGAQKSEVVVP--- 360 370 380 390 400 410 290 300 310 320 330 340 FLJ003 NAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLS-P--LLTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQA : ::: ..: ::: :.... : : .: : . :.. . : : . . . KIAA17 -APKPADGKTIGMLVPSPVAISAIRESANSTPVGILGPTACTGESEKHLELLASPLPIPS 420 430 440 450 460 470 350 360 370 380 390 FLJ003 MEVNTSASEILY------SAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDFLLFS . :.. :. . :: : ... : . : : : :. : . : KIAA17 TFLPHSSTPALHLTVQRLKLPP--PQGSSESCTVNIP--------QQPPGSLS----IAS 480 490 500 510 520 400 410 420 430 440 450 FLJ003 PEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLF-FPPQLNGTANDTAGP---ELP :.. .:. . ... : .: .:. : ......:: . ::..:... . : .. KIAA17 PNTAFIPIHNPGSF-PGSPVATTD-PITKSASQVVGLNQMVPQIEGNTGTVPQPTNVKVV 530 540 550 560 570 460 470 480 490 500 FLJ003 DPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQL-----EEEFDSDSGLSLDSSHSPSSL : .:: : . : : : :.. ...:.: .. : .. KIAA17 LPAAGLSAAQPPASYPLPGSPLAAGVLPSQNSSVLSTAATSPQPASAGISQAQATVPPAV 580 590 600 610 620 630 510 520 530 540 550 560 FLJ003 SSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSK . . . : : . . :.:.:...: .: ::: .. . :. . :. : .. KIAA17 PTHTPGPAPSPSPALTHSTAQSDSTSYIS---AVGNTNANGTVVPPQQMGS-GPCGSCGR 640 650 660 670 680 690 570 580 590 600 610 620 FLJ003 FCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGSKEKQADFLDKQ : . . ::. : KIAA17 RCSCGTNGNLQLNSYYYPNPMPGPMYRVPSFFTLPSICNGSYLNQAHQSNGNQLPFFLPQ 700 710 720 730 740 750 >>KIAA0482 ( 1332 res) hj01880 (1332 aa) initn: 186 init1: 77 opt: 133 Z-score: 95.5 bits: 29.3 E(): 4 Smith-Waterman score: 136; 23.944% identity (47.183% similar) in 426 aa overlap (172-581:786-1174) 150 160 170 180 190 FLJ003 ALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAP-PVSGDLTKEDI--DLIDILW .::: ..:: :. . . . : . KIAA04 SVVSVTSQCSFSSTIVHVGDKKPPESDIIMMEDLPGLAPGPAPSPAPSPTVAPDPAPDAY 760 770 780 790 800 810 200 210 220 230 240 250 FLJ003 RQDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFP : .: . :.. ...:: ...:: :. : . . : . : :: : KIAA04 R---PVGLTKAVLSLHTQKEEQAFLSRFRDLGR---LRGLDSSSTAPSAL--GERGCHHG 820 830 840 850 860 260 270 280 290 300 310 FLJ003 AQVPSGEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSES--EPPALQN--N :: . . . . : . : :: : .: . . :: ::: KIAA04 PAPPSRRHHCRSKAK---RSRHHQNP---RAEAPCYVSHPSPVPPSTPWPTPPATTPFPA 870 880 890 900 910 920 320 330 340 350 360 370 FLJ003 LLSPLLTGTESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLST----NYSL ...: . :: : . ::. . :: :. . :: : KIAA04 VVQPYPLPVFSPRGGPQPLPP-----------APTSVPPAAFPAPLVTPMVALVLPNY-L 930 940 950 960 380 390 400 410 420 430 FLJ003 APNTPINQNVSLHQASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGST :. .:. . : . :: . .:: : : .: .. .: . . KIAA04 FPTPSSYPYGALQTPAEGPPTPASHSPSPSLPALP--PSPPHRPDSPLFNSRCSSPL-QL 970 980 990 1000 1010 1020 440 450 460 470 480 FLJ003 NLTGLFFPPQLNGTA-----NDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQA :: : :. .:.: ...::: :. .. :: : :.. . . ..... . KIAA04 NLLQLEELPRAEGAAVAGGPGSSAGPPPPSAEAAE-PEARLAEVT--ESSNQDALSG--S 1030 1040 1050 1060 1070 1080 490 500 510 520 530 540 FLJ003 SQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGY :.: : . .... : .: . .::.:. ::.:.:.: ..:.::: . ::. :. . KIAA04 SDLLELLLQEDSRSGTGSAASGSLGSGLGSGSGSGSHEGGSTSASITRSSQSSHTSKYFG 1090 1100 1110 1120 1130 1140 550 560 570 580 590 600 FLJ003 SSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDS : :: . :.: : .: .. .. ::: : KIAA04 SIDSSEAEAGAARG--GAEPG-DQVIKYVLQDPIWLLMANADQRVMMTYQVPSRDMTSVL 1150 1160 1170 1180 1190 610 620 630 640 650 660 FLJ003 ADLPPPSALKKGSKEKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQ KIAA04 KQDRERLRAMQKQQPRFSEDQRRELGAVHSWVRKGQLPRALDVMACVDCGSSTQDPGHPD 1200 1210 1220 1230 1240 1250 >>KIAA0553 ( 1450 res) pf08859 (1450 aa) initn: 235 init1: 98 opt: 131 Z-score: 93.7 bits: 29.1 E(): 5.1 Smith-Waterman score: 131; 28.655% identity (54.971% similar) in 171 aa overlap (481-643:780-947) 460 470 480 490 500 510 FLJ003 PELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLS .: : :. ::: :: : : . :.: : KIAA05 KRSSRSSHRSQPSSGDEDSDDASSHRLHQKSPSQYSEEEEEEDSGSEHSRSRSRSGRRHS 750 760 770 780 790 800 520 530 540 550 560 FLJ003 SSEGSSSSSSSSSSSSSSASS-SASSSFSEEGAVGYSSDSE-----TLDLEEAEGAVG-Y : ..: : ::::..::. : : . :.:... ::. :. . : .... : . . KIAA05 SHRSSRRSYSSSSDASSDQSCYSRQRSYSDDSYSDYSDRSRRHSKRSHDSDDSDYASSKH 810 820 830 840 850 860 570 580 590 600 610 620 FLJ003 QPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLP-PPSALKKGSKEKQ . . :. : .: .::: . ...:: . . : : . : :. :. KIAA05 RSKRHKYS--SSDDDYSLSC-SQSRSRSRSHTRERSRSRGRSRSSSCSRSRSKRRSRSTT 870 880 890 900 910 920 630 640 650 660 670 680 FLJ003 ADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGK : ... : .. :.:. . : KIAA05 AHSWQRSRSYSRDRSRSTRSPSQRSGSRKRSWGHESPEERHSGRRDFIRSKIYRSQSPHY 930 940 950 960 970 980 >>KIAA0670 ( 1286 res) hk02359s1 (1286 aa) initn: 220 init1: 89 opt: 129 Z-score: 93.2 bits: 28.8 E(): 5.4 Smith-Waterman score: 129; 25.121% identity (48.068% similar) in 414 aa overlap (134-538:187-550) 110 120 130 140 150 160 FLJ003 SQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNSGLALESSSGLQDVTGPDNGVRESE :::: . . . . . : ... : KIAA06 EKGDSDDEKPRKGERRSSRVRQARAAKLSEGSQPAEEEEDQETPSRNLRVRADRNLKTEE 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 FLJ003 TEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWR-QDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDV :. :. :: :. ..: : .. . ..: .:..: .: : .. KIAA06 EEEEEEEEEEDDEEEEGDDEGQKSREAPILKEFKEEGEEIPRVKPEEMMD--ERPKTRSQ 220 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 FLJ003 EKELRDGGEQDTWAGEGAEA--LARNLLVDGETGESFPAQVPSGEDQTALSLEECLRLLE :.:. . : . : . : :. :::. . : . : . : ... .:.: . KIAA06 EQEVLERGGRFTRSQEEARKSHLARQQQ-EKEMKTTSPLEEEEREIKSSQGLKEKSK--S 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 FLJ003 ATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGTESPFDLEQQWQDLMSIM . : . . :.. .. : . :: : : :::: : . : : : KIAA06 PSPPRLTEDRKKASLVALPEQTASEEETPP-------PLLTKEASSPPPHPQ---LHSEE 340 350 360 370 380 350 360 370 380 390 FLJ003 EMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASL-GGCS-----QDF :.. :: . . .. .::. .: : :: : ..: :: : .: KIAA06 EIEPME-GPAPPVLIQLSPPNTDADTRELL---------VSQHTVQLVGGLSPLSSPSDT 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 FLJ003 LLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTANDTAGPELP :: .:..: : .:::. ....: . .. .: :. . .:. : KIAA06 KAESP-AEKVPEES---VLPLV--QKSTLADYSAQKDLE-----PESDRSAQ-------P 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 FLJ003 DPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEG :: ..:..: :: .. . : : . : . : .. .. :::.. KIAA06 LPLK-------IEELALAKGITEECLKQPSLEQKEGRRASHTLLPSHRLKQSADSSSSRS 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 FLJ003 SSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMS :::::::: : : : .::.: : : KIAA06 SSSSSSSSRSRSRSPDSSGSRSHSPLRSKQRDVAQARTHANPRGRPKMGSRSTSESRSRS 530 540 550 560 570 580 >>KIAA2032 ( 952 res) eh00720 (952 aa) initn: 132 init1: 69 opt: 125 Z-score: 92.4 bits: 28.2 E(): 6 Smith-Waterman score: 125; 27.922% identity (53.896% similar) in 154 aa overlap (389-536:399-540) 360 370 380 390 400 410 FLJ003 PPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPS : :. : : ::: ..::. . KIAA20 IFSGLVSLPGPSATPTAATPTPGPTPRSTLGSSEAFASTSAPFTSLPFSTSSSAASTSNP 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 FLJ003 NSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTANDT---AG---PELPDPLGGLLDEAMLDEISLM ::.::.:.:.. : .:: .: .: : :: : . ::: .. .:. .: KIAA20 NSASLSSVFAGLPLP---LPPTSQGLSNPTPVIAGGSTPSVAGPLG--VNSPLLS--ALK 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 FLJ003 DLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSS . . : ...: : : ::. : : .:..:..:.:. .. . :. . . KIAA20 GFLTSNDTNLINSSALSSAVTS--GLA---SLSSLTLQNSDSSASAPNKCYAPSAIPTPQ 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 FLJ003 ASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGH .:. KIAA20 RTSTPGLALFPGLPSPVANSTSTPLTLPVQSPLATAASASTSVPVSCGSSASLLRGPHPG 540 550 560 570 580 590 791 residues in 1 query sequences 2210203 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 11:02:30 2009 done: Fri Feb 27 11:02:31 2009 Total Scan time: 0.750 Total Display time: 0.270 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]