# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh06511.fasta.huge -Q ../query/FLJ00369.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00369, 700 aa vs ./tmplib.10216 library 2210294 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0622+/-0.00745; mu= 12.4147+/- 0.500 mean_var=345.1372+/-76.745, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.069036 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0382 ( 1443 res) ef00443 (1443) 636 77.8 9.6e-15 KIAA0380 ( 1539 res) hh00518 (1539) 292 43.6 0.0002 KIAA1076 ( 804 res) hj06779 ( 804) 194 33.3 0.13 KIAA0269 ( 567 res) ha06751 ( 567) 189 32.6 0.15 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 193 33.5 0.17 KIAA0765 ( 952 res) hk04803s1 ( 952) 190 33.0 0.19 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 180 32.3 0.45 KIAA1029 ( 1015 res) fh00363 (1015) 176 31.7 0.5 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 176 32.0 0.61 KIAA0505 ( 200 res) hh00043 ( 200) 157 28.6 0.84 KIAA1810 ( 579 res) fk03376 ( 579) 161 29.8 1.1 FLJ00353 ( 1766 res) sh01144 (1766) 167 31.2 1.2 KIAA1249 ( 949 res) hh04184 ( 949) 161 30.2 1.4 KIAA0865 ( 1900 res) hk06640y1 (1900) 163 30.9 1.7 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 159 30.3 2 KIAA1172 ( 929 res) hj03919(revised) ( 929) 150 29.0 2.9 KIAA0347 ( 1281 res) hg01528(revised) (1281) 151 29.4 3.2 KIAA0595 ( 1666 res) hj02929s1 (1666) 152 29.7 3.4 KIAA1375 ( 546 res) fj04426 ( 546) 140 27.7 4.5 FLJ00280 ( 440 res) sh01728 ( 440) 138 27.3 4.6 KIAA0945 ( 797 res) hj04760 ( 797) 141 28.0 5 KIAA1100 ( 444 res) hk07907 ( 444) 135 27.0 5.7 FLJ00221 ( 298 res) sj06160 ( 298) 131 26.3 6.2 KIAA1862 ( 1070 res) aj00563 (1070) 140 28.1 6.2 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 138 27.8 6.2 KIAA0900 ( 503 res) hk09606s1 ( 503) 134 27.0 6.5 KIAA1762 ( 1460 res) fh27937(revised) (1460) 141 28.5 6.7 KIAA0268 ( 1193 res) ha07061 (1193) 137 27.9 8 KIAA1887 ( 967 res) fk02232 ( 967) 135 27.6 8.3 KIAA1856 ( 1134 res) fh03203 (1134) 134 27.6 9.6 KIAA0867 ( 568 res) hk06783 ( 568) 129 26.6 9.7 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 134 27.7 10 FLJ00318 ( 127 res) sh07374 ( 127) 117 24.3 11 KIAA0820 ( 892 res) bg00036 ( 892) 129 26.9 12 KIAA0775 ( 639 res) hk05255 ( 639) 126 26.4 13 KIAA0304 ( 2415 res) af07172 (2415) 133 28.1 15 KIAA0992 ( 772 res) hk07554 ( 772) 124 26.3 16 KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217) 127 26.9 16 KIAA0142 ( 802 res) ha01169 ( 802) 123 26.2 17 KIAA1539 ( 543 res) fg02356 ( 543) 120 25.7 18 KIAA1357 ( 836 res) fj01906 ( 836) 123 26.3 18 KIAA0940 ( 699 res) hh04894 ( 699) 121 25.9 19 KIAA0649 ( 1253 res) hj04122 (1253) 125 26.8 19 KIAA0771 ( 948 res) hk05113 ( 948) 123 26.4 19 KIAA0915 ( 846 res) hk06275s1 ( 846) 122 26.2 19 KIAA1657 ( 127 res) hg00527 ( 127) 108 23.4 20 FLJ00201 ( 705 res) sj04110 ( 705) 120 25.8 20 KIAA1499 ( 660 res) hh04716 ( 660) 119 25.7 21 KIAA1343 ( 520 res) fj00420 ( 520) 117 25.3 21 KIAA1683 ( 832 res) fh24307 ( 832) 120 26.0 22 >>KIAA0382 ( 1443 res) ef00443 (1443 aa) initn: 581 init1: 469 opt: 636 Z-score: 358.0 bits: 77.8 E(): 9.6e-15 Smith-Waterman score: 638; 32.280% identity (60.271% similar) in 443 aa overlap (9-427:173-600) 10 20 30 FLJ003 GGAEARRKDTLSSSFSR-----VIGMDVTEPGSGSRDP :::. : .. :.: :..:: KIAA03 KHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDASRPS 150 160 170 180 190 200 40 50 60 70 80 90 FLJ003 GPGIAEPDLGRPAGHLRADTSPAEPREMEDFARGAASPGPSRPGLVPVSIIGAEDEDFEN . . : : : .. . .: . . ..: . .:: ..: ::::::.:: . 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