# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh06477.fasta.huge -Q ../query/FLJ00156.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00156, 1887 aa vs ./tmplib.10216 library 2209107 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8462+/-0.00422; mu= 20.3073+/- 0.285 mean_var=104.0715+/-23.078, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 7 in 1/39 Lambda= 0.125721 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1607 ( 1270 res) fj11118 (1270) 8157 1491.6 0 FLJ00111 ( 334 res) as00111 ( 334) 1889 353.9 4.4e-98 KIAA0993 ( 1556 res) bf03014 (1556) 1386 263.6 3.3e-70 KIAA0540 ( 2041 res) pg00116 (2041) 1149 220.7 3.4e-57 FLJ00341 ( 2760 res) sf00005 (2760) 1149 220.9 4.1e-57 KIAA1544 ( 1028 res) fh02556 (1028) 1140 218.7 6.9e-57 KIAA1242 ( 504 res) fh10406 ( 504) 153 39.3 0.0035 KIAA0413 ( 1237 res) hh00077s1 (1237) 152 39.6 0.0068 FLJ00182 ( 938 res) sj01566 ( 938) 142 37.6 0.02 KIAA1708 ( 1657 res) fj17878y1 (1657) 139 37.4 0.042 KIAA1449 ( 680 res) fk04105 ( 680) 126 34.6 0.12 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KIAA09 TVNRNLILGPGNHDQEFISCLAHCLINLHVGSNVDGFGLEAEARMTTWH--IMIPS-DIE 160 170 180 190 200 210 820 830 840 850 860 870 FLJ001 EKREDLPSLSDVQHNIQKTVQTLWQQLVAQRQQTLEDAFKIDLSVKPGER-EVKIEEVTP ..:. .. . :.:. .: .:. ...:.::. ::. : :. :: .: : . : KIAA09 PDGSYSQDISEGRQLLIKAVNRVWTELIHSKKQVLEELFKVTLPVN--ERGHVDIATARP 220 230 240 250 260 880 890 900 910 920 FLJ001 LWEETMLKAWQHYLASEKKSLASRSNVAHHSKVTLWSGSLSSAMKLMPGRQAKDPEC--- : ::. :: ::..:: ::: .. .: .. : : . ... . : . . : KIAA09 LIEEAALKCWQNHLAHEKKCISRGEALAPTTQSKLSRVSSGFGLSKLTGSRRNRKESGLN 270 280 290 300 310 320 930 940 950 960 970 980 FLJ001 ----KTEDFVSCIENYRRRGQELYASLYKDHVQRRKCGNIKAANAWARIQEQLFGELGLW .:... . . .. ..: . ::.. .:.. . ... : .:. .:. : ::: KIAA09 KHSLSTQEISQWMFTHIAVVRDLVDTQYKEYQERQQNALKYVTEEWCQIECELLRERGLW 330 340 350 360 370 380 990 1000 1010 1020 1030 FLJ001 SQGEETKPCSPWELDWREGPARMRKRIKR---------LSPLEALSSGRHKESQDKN--- . .. . : :. ::: ::::.. : : .. .: .:. KIAA09 GPPIGSH-LDKWMLEMTEGPCRMRKKMVRNDMFYNHYPYVPETEQETNVASEIPSKQPET 390 400 410 420 430 440 1040 1050 1060 1070 1080 FLJ001 -DHISQTN------AENQD--ELTLREAEGEP---DEVGVDCTQLTFFPALHESLHSEDF : : : . : . : : .: : :.: ... :. .. : .: :.:: KIAA09 PDDIPQKKPARYRRAVSYDSKEYYMRLASGNPAIVQDAIVESSEGE--AAQQEPEHGEDT 450 460 470 480 490 500 1090 1100 FLJ001 LE---------LCRER----------QVILQE---------------------LLDK-EK . : : : : ::. ::.. :: KIAA09 IAKVKGLVKPPLKRSRSAPDGGDEENQEQLQDQIAEGSSIEEEEKTDNATLLRLLEEGEK 510 520 530 540 550 560 1110 1120 1130 1140 1150 1160 FLJ001 VTQKFSLVIVQGHLVSEGVLLFGHQHFYICENFTLSPTGDVYCTRHCLSNISDPFIFNLC . . . . ::: .:::.::::..:::. ..::.. : .. . :. .:.: KIAA09 IQHMYRCARVQGLDTSEGLLLFGKEHFYVIDGFTMTATREIRDIETLPPNMHEPIIPRGA 570 580 590 600 610 620 1170 1180 1190 1200 1210 1220 FLJ001 SKDRSTDHYSCQCHSYADMRELRQARFLLQDIALEIFFHNGYSKFLVFYNNDRSKAFKSF . : . .:. .: :..:... :.::: ::.:.: .: . .:.: .. :.:... : KIAA09 RQGPSQLKRTCSIFAYEDIKEVHKRRYLLQPIAVEVFSGDGRNYLLAFQKGIRNKVYQRF 630 640 650 660 670 680 1230 1240 1250 1260 1270 FLJ001 CSFQPSL--KGKATSEDTLNLRRYPGS--------DRIMLQKWQKRDISNFEYLMYLNTA . ::: .....: . : :: .. . :.:.. .::::.:::.::: KIAA09 LAVVPSLTDSSESVSGQRPNTSVEQGSGLLSTLVGEKSVTQRWERGEISNFQYLMHLNTL 690 700 710 720 730 740 1280 1290 1300 1310 1320 1330 FLJ001 AGRTCNDYMQYPVFPWVLADYTSETLNLANPKIFRDLSKPMGAQTKERKLKFIQRFKEVE :::. :: ::::::::.:::: :: ..:.::: ::.:.::::::: :: .. .:.:. : KIAA09 AGRSYNDLMQYPVFPWILADYDSEEVDLTNPKTFRNLAKPMGAQTDERLAQYKKRYKDWE 750 760 770 780 790 800 1340 1350 1360 1370 1380 1390 FLJ001 KTEGDMTVQCHYYTHYSSAIIVASYLVRMPPFTQAFCALQGGSFDVADRMFHSVKSTWES .:. : :: ::::::.::::::::: :::: : :::: ::.::::::::. .: : KIAA09 DPNGE-TPAYHYGTHYSSAMIVASYLVRMEPFTQIFLRLQGGHFDLADRMFHSVREAWYS 810 820 830 840 850 860 1400 1410 1420 1430 1440 1450 FLJ001 ASRENMSDVRELTPEFFYLPEFLTNCNGVEFGCMQDGTVLGDVQLPPWADGDPRKFISLH ::..::.::.:: :::::::::: : :. ..:: :.:: :::: ::::: ::::.:: .: KIAA09 ASKHNMADVKELIPEFFYLPEFLFNSNNFDLGCKQNGTKLGDVILPPWAKGDPREFIRVH 870 880 890 900 910 920 1460 1470 1480 1490 1500 1510 FLJ001 RKALESDFVSANLHHWIDLIFGYKQQGPAAVDAVNIFHPYFYGDRMDLSSITDPLIKSTI :.::: :.:::.::.::::::::::::::::.:::.:: :: ..:. .:.::: ... KIAA09 REALECDYVSAHLHEWIDLIFGYKQQGPAAVEAVNVFHHLFYEGQVDIYNINDPLKETAT 930 940 950 960 970 980 1520 1530 1540 1550 1560 FLJ001 LGFVSNFGQVPKQLFTKPHPARTAAGKPLPGKDVSTPVSLPGHPQP--FFYSLQSLRPSQ .::..::::.::::: :::: . . .. : : ... : ::: . ::. :..:::: KIAA09 IGFINNFGQIPKQLFKKPHPPKRVRSR-LNGDNAGISV-LPGSTSDKIFFHHLDNLRPSL 990 1000 1010 1020 1030 1040 1570 1580 1590 1600 1610 1620 FLJ001 VTVKDMYLFSLGSESPKGAIGHIVSTEKTILAVERNKVLLPPLWNRTFSWGFDDFSCCLG . ::.. : .:.:: :.: :::::.::::.:: ::.::.::. :.:: :: KIAA09 TPVKEL----------KEPVGQIVCTDKGILAVEQNKVLIPPTWNKTFAWGYADLSCRLG 1050 1060 1070 1080 1090 1630 1640 1650 1660 1670 1680 FLJ001 SYGSDKVLMTFENLAAWGRCLCAVCPSPTTIVTSGTSTVVCVWELSMTKGRPRGLRLRQA .: :::.. ..: :. ::. :::.::.: ..:.::::::::::.. .: . . . :.:: KIAA09 TYESDKAMTVYECLSEWGQILCAICPNPKLVITGGTSTVVCVWEMGTSKEKAKTVTLKQA 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1690 1700 1710 1720 1730 1740 FLJ001 LYGHTQAVTCLAASVTFSLLVSGSQDCTCILWDLDHLTHVTRLPAHREGISAITISDVSG : :::..::: .::... ..::::.: :::.:::..:. .:.: .:: .::. :....: KIAA09 LLGHTDTVTCATASLAYHIIVSGSRDRTCIIWDLNKLSFLTQLRGHRAPVSALCINELTG 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1750 1760 1770 1780 1790 1800 FLJ001 TIVSCAGAHLSLWNVNGQPLASITTAWGPEGAITCCCLMEGPAWDTSQIIITGSQDGMVR ::::::... .:..::.:..:..: : : :::. : :::...:.:: .::.:: KIAA09 DIVSCAGTYIHVWSINGNPIVSVNTFTGRSQQIICCCMSEMNEWDTQNVIVTGHSDGVVR 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1810 1820 1830 1840 1850 1860 FLJ001 VWKTEDVKMSVPGLQMGRKREAAEALAQQC-QAEGGRGDWGLSSAYRRNPQGLLPHSSQG :. : ..:: . :. : . ..: .:. :. .:. . . . .. . KIAA09 FWRME--FLQVPETPAPEPAEVLE-MQEDCPEAQIGQEAQDEDSSDSEADEQSISQDPKD 1280 1290 1300 1310 1320 1870 1880 FLJ001 RASGNHSSAAQPSPWPMGLL : :.. .: KIAA09 TPSQPSSTSHRPRAASCRATAAWCTDSGSDDSRRWSDQLSLDEKDGFIFVNYSEGQTRAH 1330 1340 1350 1360 1370 1380 >>KIAA0540 ( 2041 res) pg00116 (2041 aa) initn: 1260 init1: 471 opt: 1149 Z-score: 1120.2 bits: 220.7 E(): 3.4e-57 Smith-Waterman score: 1188; 31.078% identity (55.603% similar) in 946 aa overlap (871-1771:994-1864) 850 860 870 880 890 900 FLJ001 VAQRQQTLEDAFKIDLSVKPGEREVKIEEVTPLWEETMLKAWQHYLASEKKSLASRSNVA :: :.. . : : ... . . ..: KIAA05 EPLGLQWGLPSLPPTNGSPTFFEDFQAFCATPEWRHFIDKQVQPTMSQFEMDTYAKS--- 970 980 990 1000 1010 1020 910 920 930 940 950 960 FLJ001 HHSKVTLWSGSLSSAMKLMPGRQAKDPECKTEDFVSCIENYRRRGQELYASLYKDHVQRR : .:.. . :. :: . . . .: .::.. : . : .... 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FLJ003 STELDMAVSGSEDGTVIIHTVRRGQFVAALRPLGATFPGPIFHLALGSEGQIVVQSSAWE 2570 2580 2590 2600 2610 2620 >>KIAA1544 ( 1028 res) fh02556 (1028 aa) initn: 910 init1: 359 opt: 1140 Z-score: 1114.6 bits: 218.7 E(): 6.9e-57 Smith-Waterman score: 1140; 38.302% identity (63.085% similar) in 577 aa overlap (1176-1728:291-841) 1150 1160 1170 1180 1190 1200 FLJ001 HCLSNISDPFIFNLCSKDRSTDHYSCQCHSYADMRELRQARFLLQDIALEIFFHNGYSKF ....: . . :.:::. :::.:. : : KIAA15 YFEVDEDDSAFKKIDTKVLAYTEGLHGKWMFSEIRAVFSRRYLLQNTALEVFMANRTS-- 270 280 290 300 310 1210 1220 1230 1240 1250 FLJ001 LVFYNNDRSKAFKSFCSFQPSLKGKATSEDTLNLRR---------YPGSDRIMLQKWQKR :..: . . :. : . : .:: . :: : .:. : :.::.: KIAA15 -VMFNFPDQATVKKVVYSLPRV-GVGTSYGLPQARRISLATPRQLYKSSN--MTQRWQRR 320 330 340 350 360 370 1260 1270 1280 1290 1300 1310 FLJ001 DISNFEYLMYLNTAAGRTCNDYMQYPVFPWVLADYTSETLNLANPKIFRDLSKPMGAQTK .::::::::.::: :::: :: :::::::::..: :: :.:. : :::::::.:: . KIAA15 EISNFEYLMFLNTIAGRTYNDLNQYPVFPWVLTNYESEELDLTLPGNFRDLSKPIGALNP 380 390 400 410 420 430 1320 1330 1340 1350 1360 1370 FLJ001 ERKLKFIQRFKEVEKTEGDMTVQCHYYTHYSSAIIVASYLVRMPPFTQAFCALQGGSFDV .: . . .:. : : :.. :: ::::.: . :.:::. ::: : . :.:: KIAA15 KRAVFYAERY---ETWEDDQSPPYHYNTHYSTATSTLSWLVRIEPFTTFFLNANDGKFDH 440 450 460 470 480 490 1380 1390 1400 1410 1420 1430 FLJ001 ADRMFHSVKSTWESASRENMSDVRELTPEFFYLPEFLTNCNGVEFGCMQDGTVLGDVQLP :: : :: .:....:.. :::.:: :::.::::...: :: ..: .: .:..::.:: KIAA15 PDRTFSSVARSWRTSQRDT-SDVKELIPEFYYLPEMFVNSNGYNLGVREDEVVVNDVDLP 500 510 520 530 540 550 1440 1450 1460 1470 1480 1490 FLJ001 PWADGDPRKFISLHRKALESDFVSANLHHWIDLIFGYKQQGPAAVDAVNIFHPYFYGDRM ::: :. :. ..: ::::.::: .::.::::::::::.:: :: :.:.:: : . KIAA15 PWAK-KPEDFVRINRMALESEFVSCQLHQWIDLIFGYKQRGPEAVRALNVFHYLTYEGSV 560 570 580 590 600 1500 1510 1520 1530 1540 1550 FLJ001 DLSSITDPLIKSTILGFVSNFGQVPKQLFTKPHPARTAAGKP--LPGKDVSTPVSLPGHP .:.:::::... .. . ..::::.:.::. .::: :..: . :: ..:. . . KIAA15 NLDSITDPVLREAMEAQIQNFGQTPSQLLIEPHPPRSSAMHLCFLP----QSPLMFKDQM 610 620 630 640 650 660 1560 1570 1580 1590 1600 FLJ001 QPFFYSLQSLRPSQVTVKDMYLFSLGSESPKGAIGHIVS-TEKTILAVER--NKVLL--P : . .. ::. : . .: :. .: .:. : . ..::.: : : : KIAA15 QQDVIMVLKF-PSNSPVTHVAANTL----PHLTIPAVVTVTCSRLFAVNRWHNTVGLRGA 670 680 690 700 710 720 1610 1620 1630 1640 1650 1660 FLJ001 PLW--NRTFSWGFDDFSCCLGSYGSDKVLMTFENLAAWGRCLCAVCPSPTTIVTSGTSTV : . ... .. .. : .: .: .:. . . : : .::. . . KIAA15 PGYSLDQAHHLPIEMDPLIANNSGVNKRQIT--DLVDQSIQINAHC----FVVTADNRYI 730 740 750 760 770 1670 1680 1690 1700 1710 1720 FLJ001 -VC-VWELSMTKGRPRGLRLRQALYGHTQAVTCLAASVTF----SLLVSGSQDCTCILWD .: :. :. . .: : ..:: ..::::: : .. .::::.: : .:: KIAA15 LICGFWDKSFRVYSTETGKLTQIVFGHWDVVTCLARSESYIGGDCYIVSGSRDATLLLWY 780 790 800 810 820 830 1730 1740 1750 1760 1770 1780 FLJ001 LDHLTHVTRLPAHREGISAITISDVSGTIVSCAGAHLSLWNVNGQPLASITTAWGPEGAI . :. 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