# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh06127.fasta.huge -Q ../query/FLJ00153.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00153, 497 aa vs ./tmplib.10216 library 2210497 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9119+/-0.00846; mu= -9.1871+/- 0.566 mean_var=500.2055+/-112.573, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.057346 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1308 ( 745 res) fh08652 ( 745) 994 96.4 9e-21 FLJ00371 ( 625 res) sh06716 ( 625) 974 94.6 2.5e-20 FLJ00185 ( 824 res) sj01856 ( 824) 974 94.8 3e-20 KIAA0959 ( 820 res) hj05718 ( 820) 598 63.6 6.9e-11 KIAA0351 ( 590 res) hg01609 ( 590) 307 39.4 0.001 KIAA0313 ( 1508 res) hg00186 (1508) 217 32.5 0.31 FLJ00084 ( 641 res) as00084 ( 641) 177 28.7 1.8 KIAA0277 ( 583 res) ha06833 ( 583) 174 28.4 2 KIAA1715 ( 429 res) hh02382 ( 429) 156 26.7 4.7 KIAA0505 ( 200 res) hh00043 ( 200) 143 25.2 6.2 KIAA1856 ( 1134 res) fh03203 (1134) 160 27.6 6.9 FLJ00037 ( 145 res) as00037 ( 145) 137 24.6 7.1 KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174) 159 27.5 7.4 KIAA1637 ( 479 res) fj00747s1 ( 479) 149 26.2 7.5 KIAA1375 ( 546 res) fj04426 ( 546) 150 26.4 7.7 KIAA1668 ( 791 res) fh11717 ( 791) 154 26.9 7.7 KIAA1030 ( 763 res) fh00432 ( 763) 148 26.4 11 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 159 27.9 11 KIAA0846 ( 691 res) hk05386 ( 691) 146 26.2 11 KIAA0666 ( 1085 res) hk02075 (1085) 150 26.7 12 KIAA1930 ( 664 res) fj11193 ( 664) 142 25.8 14 KIAA1902 ( 1112 res) hj04383 (1112) 147 26.5 14 FLJ00253 ( 349 res) sj09455 ( 349) 133 24.7 15 KIAA0595 ( 1666 res) hj02929s1 (1666) 147 26.7 18 KIAA0820 ( 892 res) bg00036 ( 892) 140 25.8 19 KIAA1217 ( 1339 res) fh03001s1 (1339) 144 26.4 19 FLJ00378 ( 855 res) sj00210 ( 855) 137 25.5 22 FLJ00070 ( 1382 res) as00070 (1382) 142 26.2 22 KIAA1779 ( 1233 res) hg04229 (1233) 140 26.0 23 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 137 25.6 24 KIAA0900 ( 503 res) hk09606s1 ( 503) 129 24.6 24 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 138 25.8 26 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 132 25.0 26 KIAA2025 ( 1109 res) fh08764 (1109) 136 25.6 27 KIAA0490 ( 135 res) hh00727 ( 135) 113 22.5 27 KIAA0612 ( 1810 res) hg00654s1 (1810) 141 26.3 27 KIAA2001 ( 689 res) bj00176 ( 689) 130 24.8 28 KIAA1292 ( 595 res) hk05468(revised) ( 595) 128 24.6 29 KIAA0575 ( 952 res) hj00216 ( 952) 133 25.3 29 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 131 25.0 30 KIAA1357 ( 836 res) fj01906 ( 836) 131 25.0 30 KIAA0029 ( 974 res) ha00566 ( 974) 132 25.2 31 KIAA1225 ( 1371 res) fh04221s1 (1371) 135 25.6 32 KIAA1983 ( 418 res) fk09737(revised) ( 418) 122 23.9 32 KIAA1076 ( 804 res) hj06779 ( 804) 129 24.8 33 KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315) 134 25.5 33 KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217) 133 25.4 34 FLJ00386 ( 811 res) sj04204 ( 811) 128 24.8 35 KIAA0947 ( 2330 res) ef03552 (2330) 139 26.2 36 KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800) 141 26.5 36 >>KIAA1308 ( 745 res) fh08652 (745 aa) initn: 967 init1: 617 opt: 994 Z-score: 466.3 bits: 96.4 E(): 9e-21 Smith-Waterman score: 1003; 44.028% identity (65.105% similar) in 427 aa overlap (8-403:150-570) 10 20 30 FLJ001 ARAGRGAASGPPRVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQG : .: : : :. : :.:: . 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KIAA13 TACPSPQYPFPS-PHSKSMHGARKPWILNTASRRFPIWQLAWGAPTGQWDLLILPSPSVL 540 550 560 570 580 590 430 440 450 460 470 480 FLJ001 RSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRGWEEMLISAIKSVGTFFG KIAA13 GISLTVIPGDLRHQLSLQQHLVLLSLHHARGCHTHPQALCLRALQLQLRAAALQPAGGRL 600 610 620 630 640 650 >>FLJ00371 ( 625 res) sh06716 (625 aa) initn: 1079 init1: 617 opt: 974 Z-score: 458.2 bits: 94.6 E(): 2.5e-20 Smith-Waterman score: 1049; 42.373% identity (63.559% similar) in 472 aa overlap (8-432:143-609) 10 20 30 FLJ001 ARAGRGAASGPPRVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQG : .: : : :. : :.:: . FLJ003 GLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVA----ENGLSEEK 120 130 140 150 160 40 50 60 70 80 90 FLJ001 PQLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNT :.:: : : ::::.::.: :::.:: :.::::.:::::. : .::.::::.:::. 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FLJ003 IIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIA 350 360 370 380 390 400 280 290 300 310 320 330 FLJ001 PHPPILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSS : . : ..: ..:.: .:: :: .:::. : .. : .. ...:: : . : FLJ003 PDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTEL 410 420 430 440 450 460 340 350 360 FLJ001 SPSGS------------P----GDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRSRD--- : ::: : :: .. : : :: : :: ... FLJ003 STSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKF 470 480 490 500 510 520 370 380 390 400 410 FLJ001 --APAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQSSE . . : : . : .. :.. : .: : . : .: .:: :: .. FLJ003 WESASQSSPETSGISSASSNTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGD 530 540 550 560 570 580 420 430 440 450 460 470 FLJ001 ACVIRVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRGW :.::::.: :.::.:.:::.. FLJ003 CCIIRVSLDVDNGNMYKSILVSRRGWPGCLPPLAANAP 590 600 610 620 >>FLJ00185 ( 824 res) sj01856 (824 aa) initn: 1079 init1: 617 opt: 974 Z-score: 456.8 bits: 94.8 E(): 3e-20 Smith-Waterman score: 1049; 42.373% identity (63.559% similar) in 472 aa overlap (8-432:342-808) 10 20 30 FLJ001 ARAGRGAASGPPRVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQG : .: : : :. : :.:: . FLJ001 GLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVA----ENGLSEEK 320 330 340 350 360 40 50 60 70 80 90 FLJ001 PQLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNT :.:: : : ::::.::.: :::.:: :.::::.:::::. : .::.::::.:::. FLJ001 PHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNS 370 380 390 400 410 420 100 110 120 130 140 150 FLJ001 VTGCVLGSVLGAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKR :..::. . :: . ::.::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:::. FLJ001 VANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKK 430 440 450 460 470 480 160 170 180 190 200 210 FLJ001 SWGAVSREPLSTFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPP-- .: :::. . :.:::.:::::::. :::.:..: ... . : : : ..: FLJ001 TWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMN-PKRAQKRPKETG 490 500 510 520 530 540 220 230 240 250 260 270 FLJ001 ---GPVPYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLS : :::::::::::::::::. :.: : ::::::::::.:..:.:. :: :..:... FLJ001 IIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIA 550 560 570 580 590 600 280 290 300 310 320 330 FLJ001 PHPPILAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSS : . : ..: ..:.: .:: :: .:::. : .. : .. ...:: : . : FLJ001 PDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTEL 610 620 630 640 650 660 340 350 360 FLJ001 SPSGS------------P----GDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRSRD--- : ::: : :: .. : : :: : :: ... FLJ001 STSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKF 670 680 690 700 710 720 370 380 390 400 410 FLJ001 --APAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQSSE . . : : . : .. :.. : .: : . : .: .:: :: .. FLJ001 WESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGD 730 740 750 760 770 780 420 430 440 450 460 470 FLJ001 ACVIRVSIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRGW :.::::.: :.::.:.:::.. FLJ001 CCIIRVSLDVDNGNMYKSILVSRRGWPGCLPPLAANAP 790 800 810 820 >>KIAA0959 ( 820 res) hj05718 (820 aa) initn: 1148 init1: 596 opt: 598 Z-score: 288.8 bits: 63.6 E(): 6.9e-11 Smith-Waterman score: 1141; 41.843% identity (65.643% similar) in 521 aa overlap (20-487:259-772) 10 20 30 40 FLJ001 ARAGRGAASGPPRVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMP-QGPQLLDFSVDEV :.. :::: : .. .. :: : : KIAA09 RMMPGSDPERRAQNLLEQFQKQEVETDNGLPNTISFSLEEEEELEGGESAEFTCFSEDLV 230 240 250 260 270 280 50 60 70 80 90 100 FLJ001 AEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGCVLGSVLG ::::: .: .::.:: ..::: .::.::. .::.:::..::::.: ::....:: KIAA09 AEQLTYMDAQLFKKVVPHHCLGCIWSRRDKKENKHLAPTIRATISQFNTLTKCVVSTILG 290 300 310 320 330 340 110 120 130 140 150 160 FLJ001 APGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGAVSREPLS . : . :::. .:::: ::..:: :.::::::::.:::::: :::::..:.:: :. . KIAA09 GKELKTQQRAKIIEKWINIAHECRLLKNFSSLRAIVSALQSNSIYRLKKTWAAVPRDRML 350 360 370 380 390 400 170 180 190 200 210 FLJ001 TFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEAT-----EGSQEEDN--TPGSLPSKPP----PGP :..::.::::.::::.:::.:..: .. ..: .:.. : : . : KIAA09 MFEELSDIFSDHNNHLTSRELLMKEGTSKFANLDSSVKENQKRTQRRLQLQKDMGVMQGT 410 420 430 440 450 460 220 230 240 250 260 270 FLJ001 VPYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPI :::::::::::.:::::: :..:: ::::::::.:.:..:.:. :: :.:: ..: . KIAA09 VPYLGTFLTDLTMLDTALQDYIEGGLINFEKRRREFEVIAQIKLLQSACNSYCMTPDQKF 470 480 490 500 510 520 280 290 300 310 320 330 FLJ001 LAALHAQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAK-LAREKSSSPSG . .. :. ::::.:: :: :: : . .::. :. :..:::: :. . .::. KIAA09 IQWFQRQQLLTEEESYALSCEIEAAADASTTSPKPRK--SMVKRLSLLFLGSDMITSPTP 530 540 550 560 570 580 340 350 360 370 380 FLJ001 SPGDPSSPTSSVSPGSPPSSPRSR------DAPAGSPPASPGPQGPSTKLPLS------- . .:.: .:. : : : : .: :: :. :. :: : KIAA09 TKEQPKSTASGSSGESMDSVSVSSCESNHSEAEEGSITPMDTPDEPQKKLSESSSSCSSI 590 600 610 620 630 640 390 400 410 FLJ001 --LDLPSPRPFAL--PLGSP-------RI----------------PLPAQQSSEACVIRV .: : .: ::.:: .: :. ::. ..:.::. KIAA09 HSMDTNSSGMSSLINPLSSPPSCNNNPKIHKRSVSVTSITSTVLPPVYNQQNEDTCIIRI 650 660 670 680 690 700 420 430 440 450 460 470 FLJ001 SIDNDHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRGWEEMLIS :.....::.:.::.::::::.:.:..::. :::. . : .:.: ::. :. :..: KIAA09 SVEDNNGNMYKSIMLTSQDKTPAVIQRAMLKHNLDSDPAEEYELVQVISEDK---ELVIP 710 720 730 740 750 760 480 490 FLJ001 AIKSVGTFFGMFAMCQARFYR :...:..: KIAA09 --DSANVFYAMNSQVNFDFILRKKNSMEEQVKLRSRTSLTLPRTAKRGCWSNRHSKITL 770 780 790 800 810 820 >>KIAA0351 ( 590 res) hg01609 (590 aa) initn: 270 init1: 203 opt: 307 Z-score: 160.2 bits: 39.4 E(): 0.001 Smith-Waterman score: 441; 29.444% identity (57.222% similar) in 360 aa overlap (9-360:48-371) 10 20 30 FLJ001 ARAGRGAASGPPRVAQTSDPDSSEACAEEEEGLMPQGP :. :. ...:: ...: .. KIAA03 YVTCRGCPEAPCGLETMYKRNGLMASVLVTSATPQGSSSSDSLEGQSCDYASKSYDAVVF 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 FLJ001 QLLDFSVDEVAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTV ..: . .: : :.::.:. .:. .. : . ::.... . : :.: : . .:: : KIAA03 DVLKVTPEEFASQITLMDIPVFKAIQPEELASCGWSKKEKHSLA---PNVVAFTRRFNQV 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 FLJ001 TGCVLGSVLGAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRS . :. .: : : ::. : ....::.. :: :. :: ...::::: ::.:: .. KIAA03 SFWVVREILTAQTLKI--RAEILSHFVKIAKKLLELNNLHSLMSVVSALQSAPIFRLTKT 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 FLJ001 WGAVSREPLSTFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPPGPV :. ..:. .::.::. ..: :.:. .:: . :: : . KIAA03 WALLNRKDKTTFEKLDYLMSKEDNYKRTREYI----------------RSLKMVPS---I 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 FLJ001 PYLGTFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARI-QQLQRRCQSYTLSPHPPI :::: .: ::...:.: : :.... :.: .. . . :: .:: :. :. : . KIAA03 PYLGIYLLDLIYIDSAYPA--SGSIMENEQRSNQMNNILRIIADLQVSCSYDHLTTLPHV 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 FLJ001 LAALHA------QNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKS :.. ....:...:.:: ::: . ::::. .: . :.. : : KIAA03 QKYLKSVRYIEELQKFVEDDNYKLSLRIEPGS----SSPRL---VSSKEDLAGPSAGSGS 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 FLJ001 SSPSGSPGDPSSPTSSVSPGSP-PSSPRSRDAPAGSPPASPGPQGPSTKLPLSLDLPSPR . : : . : .::. . : : :: : KIAA03 ARFSRRP---TCPDTSVAGSLPTPPVPRHRKSHSLGNNMMCQLSVVESKSATFPSEKARH 350 360 370 380 390 400 >>KIAA0313 ( 1508 res) hg00186 (1508 aa) initn: 258 init1: 117 opt: 217 Z-score: 115.4 bits: 32.5 E(): 0.31 Smith-Waterman score: 260; 22.938% identity (51.509% similar) in 497 aa overlap (3-465:685-1142) 10 20 30 FLJ001 ARAGRGAASGPPRVAQTSDPDSSEACAEEE-- : : :: : .. .. :..:. 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