# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh04092s1.fasta.huge -Q ../query/FLJ00141.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00141, 1326 aa vs ./tmplib.10216 library 2209668 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.8408+/-0.0095; mu= -22.4567+/- 0.630 mean_var=685.6562+/-161.439, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.048980 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0638 ( 1384 res) hj03347s1 (1384) 6021 441.6 5.2e-124 KIAA1590 ( 1393 res) fj09048y1 (1393) 330 39.5 0.0059 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 233 32.5 0.57 KIAA0042 ( 1652 res) ha00930 (1652) 236 32.9 0.67 KIAA0706 ( 1123 res) pj01355 (1123) 223 31.8 0.97 KIAA1030 ( 763 res) fh00432 ( 763) 217 31.2 1 KIAA1319 ( 1208 res) fh13717 (1208) 223 31.8 1 KIAA0691 ( 762 res) hk03735 ( 762) 210 30.7 1.4 FLJ00420 ( 613 res) sj09535 ( 613) 203 30.1 1.7 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 205 30.7 2.9 KIAA1222 ( 742 res) fh03567 ( 742) 192 29.4 3.3 KIAA0170 ( 2090 res) 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KIAA15 PPAPEEQDLSMADFPPPEEAFFSVASPEPAGPSGSPELVSSPAAS------SSSATALQI 730 740 750 760 770 450 460 470 480 490 500 FLJ001 QPPESPRLGRRGLDSMRELPPLSPSLSRRALSPLPTRTTP--DPKLNREVAESPRPRRWA ::: :: . :: :. . . .: . : .: . . :: . . KIAA15 QPPGSP-----------DPPPAPPAPAPASSAPGHVAKLPQKEPVGCSKGGGPPR-EDVG 780 790 800 810 820 510 520 530 540 550 FLJ001 AHGASPEDFSLT-LGARGRRTRSPSPTLGESLAPHKG---SFSGRLSPAYSLGSLTGASP : ..: .... : . : .:.:.:: : ::.: ..::: ::. . .: :. KIAA15 APLVTPSLLQMVRLRSVGAPGGAPTPALGPS-APQKPLRRALSGRASPVPAPSSGLHAAV 830 840 850 860 870 880 560 570 580 590 600 610 FLJ001 CQSPC---VQRKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQERLREQEMERL . : ... :::.. : : . . : . . :. . :: : . KIAA15 RLKACSLAASEGLSSAQPNGPPEAEPRPPQSPASTASFIFSKGSRKLQLERPVSPETQA- 890 900 910 920 930 940 620 630 640 650 660 670 FLJ001 ERQRLETILNLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGASGRS--SEE . :: :: :: :. . . . :. .. : ..:.:: :. .. : : KIAA15 DLQR-----NLVAEL-RSISEQRPPQAPK--KSPKAPPPVARKPSVGVPPPASPSYPRAE 950 960 970 980 990 680 690 700 710 720 730 FLJ001 PGVA--TQRLWESMERSDEENLKEECSSTEST-QQEHEDAPSTKLQGEVLALEEERAQVL : .: :. : ....:. .: : :. . . . .:. :.. : :. KIAA15 PLTAPPTNGLPHTQDRTKRE-LAENGGVLQLVGPEEKMGLPGSDSQKELA 1000 1010 1020 1030 1040 740 750 760 770 780 790 FLJ001 GHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKLVALE >>KIAA0042 ( 1652 res) ha00930 (1652 aa) initn: 197 init1: 108 opt: 236 Z-score: 109.5 bits: 32.9 E(): 0.67 Smith-Waterman score: 236; 33.835% identity (64.662% similar) in 133 aa overlap (39-161:795-925) 10 20 30 40 50 60 FLJ001 DALNRNQIGPGCQTQTMVQKGPLDLIEKGKGLKVQTDK--PHLVSLGSGRLSTAITLLPV :. : :. :.::.:. . . : . 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KIAA07 NETWEEKLRKTEALRMEREALLAEMGVAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECL 480 490 500 510 520 530 70 80 90 100 110 FLJ001 LLPVEEGRTVIGSAARDISIQGPGLAPEHCYIENL---GG--TLTLYPCGNACT-IDGLP : ...: : .:.. ::.. : . .:: .... : ..:: :: .: : ..: KIAA07 LYHIKDGVTRVGQVDMDIKLTGQFIREQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKL 540 550 560 570 580 590 120 130 140 150 160 170 FLJ001 VRQPTRLTQGCMLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSM-IPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVN : .: : .: . .:.. .::::: .:. . .: :::: :: KIAA07 VTEPLVLKSGNRIVMGKNHVFRFNHPEQARLERERGVPP---PPGPPSEPVDWNFAQKEL 600 610 620 630 640 650 180 190 200 210 220 230 FLJ001 GNHTPQTATRGPSACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMANG KIAA07 LEQQGIDIKLEMEKRLQDLENQYRKEKEEADLLLEQQRLYADSDSGDDSDKRSCEESWRL 660 670 680 690 700 710 >>KIAA1030 ( 763 res) fh00432 (763 aa) initn: 181 init1: 71 opt: 217 Z-score: 106.4 bits: 31.2 E(): 1 Smith-Waterman score: 254; 28.912% identity (48.806% similar) in 377 aa overlap (213-563:351-699) 190 200 210 220 230 FLJ001 ATRGPSACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMA-----NGGR :: ::. . ::. : : .: KIAA10 ALKSQLTPLSSSQESYLPPPAYSPRFQPRGLEGPGGLEGRLQATGQARPPAPRPFHHGQY 330 340 350 360 370 380 240 250 260 270 280 290 FLJ001 YLLSPPTSPGAMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPARSS : .::: . : . . ::::: :: ...: :. :..: .: KIAA10 YGYLSSSSPGEVEPPPFY--VPEVGSPLSSVMSSPPLPTEGPFGH---PTIPEENGENAS 390 400 410 420 430 300 310 320 330 340 350 FLJ001 SYHLALQPPQSRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPGLRGLLTDSPAATVLAEARRATESP . : : . :.:.:: : :. . : ::. : .. .. . : KIAA10 NSTL---PLTQTPTGGRSPEPW-----GRPEFPFGGLETPAMMFPHQLPPCDVPESLQ-P 440 450 460 470 480 360 370 380 390 400 410 FLJ001 RLGGQ--LPVVAISL-SEYPASGALSQPTSIPGSPKFQPPVPAPRNKIGTLQDRPPSPFR . : :: ..... . ::. .: : . :. . ::::: . :::: .:. KIAA10 KAGLPRGLPPTSLQVPAAYPGILSLEAPKGWAGKSPGRGPVPAP--PAAKWQDRPMQPLV 490 500 510 520 530 540 420 430 440 450 FLJ001 EPPGSER---------VLT-TSPSRQLV-GRTFSDGLATRTLQP-PE---SPRLGRRGLD :. : :: :.. . : . :: :: .: :. ::: .::. KIAA10 SQ-GQLRHTSQGMGIPVLPYPEPAEPGAHGGPSTFGLDTRWYEPQPRPRPSPRQARRAEP 550 560 570 580 590 600 460 470 480 490 500 510 FLJ001 SMRELPPLSPS-LSRRALSPLPTRTTPDPKLNREVAESPRPRRWAAHGASPEDFSLTLGA :.... :.:: :: . ::: .:: .: :.: ::: . : ...: : KIAA10 SLHQVV-LQPSRLSPLTQSPLSSRTG-SP----ELAARARPRPGLLQQAEMSEITLQPPA 610 620 630 640 650 520 530 540 550 560 570 FLJ001 RGRRTRSPSPTLGESLAPHKGSFSGRLSPAY--SLGSLTGASPCQSPCVQRKLSSGDLRV .:. .:. : .: ..: :: ::.: ..: : :. :: KIAA10 AVSFSRKSTPSTG---SPSQSSRSG--SPSYRPAMGFTTLATGYPSPPPGPAPAGPGDSL 660 670 680 690 700 710 580 590 600 610 620 630 FLJ001 PVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQERLREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADG KIAA10 DVFGQTPSPRRTGEELLRPETPPPTLPTSGKLRRDRPAPATSPPERALSKL 720 730 740 750 760 >>KIAA1319 ( 1208 res) fh13717 (1208 aa) initn: 176 init1: 115 opt: 223 Z-score: 106.2 bits: 31.8 E(): 1 Smith-Waterman score: 256; 21.795% identity (51.775% similar) in 1014 aa overlap (265-1189:28-996) 240 250 260 270 280 290 FLJ001 GGRYLLSPPTSPGAMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPA .. :.:.. .. .:..:. . : KIAA13 GLLLFMEQAPNMAEPRGPVDHGVQIRFITEPVSGAEMGTLRRGGRRPAKD------A 10 20 30 40 50 300 310 320 330 340 350 FLJ001 RSSSYHLALQPPQSRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPG--LRGLLTDSPAATVLAEARR :.:.: .:. : .: .. : . ..:.. : : ..: .:. :. .:. . 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KIAA13 LPENPYSQVKGFPAPSQSSTSDEEPGAYWNGKLLRSHSQASLAGPGPVDPSNRSNSMLEL 110 120 130 140 150 160 410 420 430 440 450 460 FLJ001 PP---SPFRE----PPGSERVLTTSPSRQLVGRTFS-DGLATRTLQPPESPRLGRRGLDS : :: : .: : .. . :: :.. . : :: : :::. : ..::: KIAA13 APKVASPGSTIDTAPLSSVDSLINKFDSQLGGQARGRTGRRTRML-PPEQ-RKRSKSLDS 170 180 190 200 210 220 470 480 490 500 510 FLJ001 MRELPPLS-PSLSRRALSPLPTRTTPDPKL--NREVAESPR--PRRWAAHGASPEDFSLT .:: . :.. . . : : .. ... :.: : ... . .:. : KIAA13 --RLPRDTFEERERQSTNHWTSSTKYDNHVGTSKQPAQSQNLSPLSGFSRSRQTQDWVLQ 230 240 250 260 270 280 520 530 540 550 560 FLJ001 LGARGRRT-RSPS-------PTL--GESLAPHKGSFSGRLSPAYSLGSLTGASPCQSPCV . ::. ..:. : : .. : :: . . : : : .: . : KIAA13 SFEEPRRSAQDPTMLQFKSTPDLLRDQQEAAPPGSVDHMKATIY--GILREGSSESETSV 290 300 310 320 330 570 580 590 600 610 FLJ001 QRKLSSGDLRV-PVTRERKNSITEISDNED---DLLEYHRRQRQERLREQEMER----LE .::.: .. :.. ..: .. . . . : .:. .: ..:..: :: KIAA13 RRKVSLVLEKMQPLVMVSSGSTKAVAGQGELTRKVEELQRKLDEEVKKRQKLEPSQVGLE 340 350 360 370 380 390 620 630 640 650 660 FLJ001 RQRLETILNLCAEYS----RADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGA------ :: :: . :.. . : : :: . . . : :. .:: KIAA13 RQ-LEEKTEECSRLQELLERRKG--EAQQSNKELQNMKRLLDQGEDLRHGLETQVMELQN 400 410 420 430 440 450 670 680 690 700 710 720 FLJ001 SGRSSEEPGVATQRLWESMERSDE--ENLKEECSSTESTQQEHEDAPSTKLQGEVLALEE . . . : : . : ... .. : :.. : . .: : . .. : :.: ::.: KIAA13 KLKHVQGPEPAKEVLLKDLLETRELLEEVLEGKQRVEE-QLRLRERELTALKG---ALKE 460 470 480 490 500 510 730 740 750 760 770 780 FLJ001 ERAQVLGHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQE : :. .::... . .. .::..: ..: ...:.:..::. ::.. :. ... .: KIAA13 EVASRDQEVEHVRQQYQRDTEQLRRSMQDATQDHAVLEAERQKMSALVRGLQRELEETSE 520 530 540 550 560 570 790 800 810 820 830 840 FLJ001 KLVALETG-IQKERDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAEL ::: :. .:. : :.. . . .:.... : : .. :. :. . : ...: KIAA13 -----ETGHWQSMFQKNKEDLRATKQELLQLRMEKEEMEEELGEKIEVLQRELEQARASA 580 590 600 610 620 850 860 870 880 890 FLJ001 --LRSIAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLA---RDKNASLQL--LQKEKEKLTVL :.. :..: : .: . :: ..:...: ::.. :: :. : .. : KIAA13 GDTRQVEVLKKEL--LRTQEELKELQAERQSQEVAGRHRDRELEKQLAVLRVEADRGREL 630 640 650 660 670 680 900 910 920 930 940 950 FLJ001 ERRYHSLTGGRPFPKTTSTLKEVYRSKMDGEATSP-LPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSV :.. .: . . . . .:. ..:: .:: . : . :.. . .. .... KIAA13 EEQ--NLQLQKTLQQLRQDCEEASKAKMVAEAEATVLGQRRAAVETTLRETQEENDEFRR 690 700 710 720 730 740 960 970 980 990 1000 FLJ001 ATLGRSPSPKSALLTQNGTGSLPRNLAATLQDIETKRQ---------------LALQQKG :: . : . .: .. : :: .:...: :: ... KIAA13 RILGLEQQLKETRGLVDGGEAVEARLRDKLQRLEAEKQQLEEALNASQEEEGSLAAAKRA 750 760 770 780 790 800 1010 1020 1030 1040 1050 FLJ001 QQV-IEEQRRRLAELKQ------KAAAEAQCQWDALH-GAAPFPAGPSGFPPLMHHSILH .. .:: .: ::.: : .: : : ..:. : : . :. ... KIAA13 LEARLEEAQRGLARLGQEQQTLNRALEEEGKQREVLRRGKAELEEQKR----LLDRTV-D 810 820 830 840 850 1060 1070 1080 1090 1100 FLJ001 HLPAGRER-GEEGEHAYDTLSLESSDSMETS---ISTGGNSAC--SPDNMSSASGLD--M .: :. ::....: . :. . : : . .. . .: . . ....::. . KIAA13 RLNKELEKIGEDSKQALQQLQAQLEDYKEKARREVADAQRQAKDWASEAEKTSGGLSRLQ 860 870 880 890 900 910 1110 1120 1130 1140 1150 1160 FLJ001 GKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESARRQQLV .:..... :. ..::.. ..: . : :.::.: . . .: :.. ::. . . KIAA13 DEIQRLRQALQASQAERDTARLDKEL-LAQRLQGLEQEAENK----KRSQDDRARQLKGL 920 930 940 950 960 970 1170 1180 1190 1200 1210 1220 FLJ001 EKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCRGYLVK :..:. : .... . .. : : KIAA13 EEKVSRLETELDEEKNTVELLTDRVNRGRDQVDQLRTELMQERSARQDLECDKISLERQN 980 990 1000 1010 1020 1030 >>KIAA0691 ( 762 res) hk03735 (762 aa) initn: 140 init1: 73 opt: 210 Z-score: 103.7 bits: 30.7 E(): 1.4 Smith-Waterman score: 227; 25.503% identity (48.993% similar) in 447 aa overlap (152-546:243-676) 130 140 150 160 170 180 FLJ001 RLTQGCMLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSMIPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVNGNHTPQ :: . : .:: : :.: . ... :: KIAA06 KDDVEYYVDSSQDPDFEENEFLYDDLDLEDIPQALVATSPP-SHSHMEDEIFNQSSSTPT 220 230 240 250 260 270 190 200 210 220 230 FLJ001 TATRG---PSACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATS--PLSPMANGG ..: . : . :. .. : .: . :: : . :. :.::. .. : :: : KIAA06 STTSSSPIPPSPANCTTENSEDDKKRGRSTDSEVSQSPAKNGSKPVHSNQHPQSP-AVPP 280 290 300 310 320 330 240 250 260 270 280 290 FLJ001 RYLLSPPTSPGAMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQE--PGPSVPPLVP- : .:: . .:.:. . .: :: : . :.. : :: .:: . :.: . ..: KIAA06 TYPSGPPPAASALST-TPGNNGVPA--PAAPPSALGPKASPAPSHNSGTPAPYAQAVAPP 340 350 360 370 380 300 310 320 330 340 FLJ001 ARSSSYHLALQPPQSRPSGA---------RSESPRLSRKGGH-ERPPSPGLRGLLTDSPA : :. .::. .:::. : : : :: .. . . ....:::: KIAA06 APSGPSTTQPRPPSVQPSGGGGGGSGGGGSSSSSNSSAGGGAGKQNGATSYSSVVADSPA 390 400 410 420 430 440 350 360 370 380 390 FLJ001 ATVLA-----EARRATESPRLGGQLPVVAISLSEYPASGALSQPTSI-PGS------PKF ..:. .: . .: : . : : :. :...: . .. ::: :.. 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