# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh04009.fasta.huge -Q ../query/FLJ00298.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00298, 527 aa vs ./tmplib.10216 library 2210467 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4630+/-0.00445; mu= 11.7028+/- 0.299 mean_var=122.3823+/-29.428, 0's: 0 Z-trim: 23 B-trim: 159 in 1/39 Lambda= 0.115935 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0424 ( 567 res) hh01267 ( 567) 2173 374.7 1.2e-104 KIAA1112 ( 694 res) hj05505s1 ( 694) 2126 367.0 3.1e-102 FLJ00188 ( 201 res) sj02282 ( 201) 1375 240.7 9e-65 KIAA1415 ( 1621 res) hg04328s1 (1621) 602 112.5 2.8e-25 FLJ00018 ( 1430 res) as00018 (1430) 397 78.2 5.5e-15 KIAA0793 ( 1055 res) hk05692 (1055) 358 71.5 4.2e-13 KIAA0362 ( 1108 res) hh00083 (1108) 349 70.0 1.2e-12 FLJ00004 ( 698 res) as00004 ( 698) 304 62.2 1.7e-10 KIAA0142 ( 802 res) ha01169 ( 802) 291 60.1 8.3e-10 KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676) 270 57.0 1.5e-08 KIAA0337 ( 1609 res) hg01226 (1609) 264 56.0 2.9e-08 KIAA1362 ( 699 res) fj02381 ( 699) 244 52.2 1.8e-07 KIAA0861 ( 982 res) hk06521 ( 982) 244 52.4 2.2e-07 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 249 53.7 2.3e-07 KIAA1010 ( 1315 res) hj05262(revised) (1315) 238 51.5 5.3e-07 KIAA2016 ( 1715 res) pf04366 (1715) 208 46.6 2e-05 KIAA0294 ( 1405 res) hf00223s1 (1405) 195 44.4 8e-05 KIAA0382 ( 1443 res) ef00443 (1443) 193 44.0 0.0001 KIAA1909 ( 1287 res) ff10210 (1287) 160 38.5 0.0044 KIAA0771 ( 948 res) hk05113 ( 948) 156 37.6 0.0058 KIAA0418 ( 989 res) hh00988 ( 989) 150 36.7 0.012 KIAA1209 ( 1113 res) fg05970 (1113) 148 36.4 0.016 KIAA0777 ( 1171 res) hk05279 (1171) 135 34.2 0.075 KIAA1295 ( 550 res) fg01760 ( 550) 126 32.3 0.13 KIAA1296 ( 815 res) fg03576 ( 815) 127 32.7 0.15 KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051) 126 32.7 0.2 KIAA0131 ( 942 res) ha01235 ( 942) 124 32.3 0.23 KIAA0006 ( 773 res) ha01154 ( 773) 122 31.8 0.26 KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061) 123 32.2 0.28 KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095) 115 30.9 0.73 KIAA1249 ( 949 res) hh04184 ( 949) 111 30.1 1.1 KIAA0521 ( 1050 res) hg01387 (1050) 111 30.2 1.1 KIAA0400 ( 1022 res) hg01091 (1022) 110 30.0 1.2 KIAA1379 ( 457 res) fj05092s1 ( 457) 103 28.4 1.7 KIAA1971 ( 830 res) fk08985 ( 830) 106 29.2 1.7 KIAA0775 ( 639 res) hk05255 ( 639) 101 28.2 2.6 KIAA0336 ( 1635 res) hg01120 (1635) 106 29.6 2.7 KIAA0394 ( 417 res) hf00236 ( 417) 96 27.2 3.6 KIAA1232 ( 520 res) fh08445 ( 520) 96 27.3 4.1 KIAA1855 ( 1270 res) fg04654 (1270) 94 27.4 9.2 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 93 27.2 9.5 KIAA2012 ( 555 res) ah04096 ( 555) 89 26.1 9.7 FLJ00150 ( 1793 res) sh05613 (1793) 95 27.8 10 KIAA0665 ( 760 res) hk02064 ( 760) 87 26.0 15 KIAA1110 ( 740 res) hh04831b(revised) ( 740) 86 25.8 16 KIAA1275 ( 1140 res) hk10413 (1140) 88 26.4 17 KIAA0269 ( 567 res) ha06751 ( 567) 84 25.3 18 KIAA0228 ( 681 res) ha04738 ( 681) 84 25.4 20 KIAA0203 ( 1593 res) ha02320 (1593) 88 26.5 21 KIAA1494 ( 638 res) fj08673 ( 638) 83 25.2 21 >>KIAA0424 ( 567 res) hh01267 (567 aa) initn: 2153 init1: 1140 opt: 2173 Z-score: 1972.4 bits: 374.7 E(): 1.2e-104 Smith-Waterman score: 2173; 60.681% identity (83.176% similar) in 529 aa overlap (6-527:43-567) 10 20 30 FLJ002 ASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVT :: : . .. ::. ..: :::.::::: KIAA04 ATEKKKKSQTETGKERERTSFLTQGGKRFELQHGLAVICMTLLITGDSIVSAEAVWDHVT 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 FLJ002 MDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQE-ELSENSSSTPS : ..::.:::::::.::.:::::::::. .:.:.::::::::: :::: :. :. :.. . 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KIAA04 QDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILDRSSELIY 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 FLJ002 SGELTKITKQ-GKSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRD .::.. : . :..:::.:::::::.: :::::.:::.::::::.:::..:.::. :::: KIAA04 TGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVVDIEDGRD 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 FLJ002 KDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQ : :.:.:::::: .. :.:..:: ::: :.: :::.: .::. ::::...:.:::::: KIAA04 DDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIGFEISENQ 440 450 460 470 480 490 460 470 480 490 500 FLJ002 KKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRC----PVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEP :. : ....:. :.:: : : :: : :... . .: .. :.::: ..:: KIAA04 KRQAAMTVRKV--PKQKGVNSARSVPPSYPPPQ--DPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEFTEP 500 510 520 530 540 510 520 FLJ002 KRKSSLFWHTFNRLTPFRK ::..: ::..:.:::::.: KIAA04 KRSQSPFWQNFSRLTPFKK 550 560 >>KIAA1112 ( 694 res) hj05505s1 (694 aa) initn: 1600 init1: 1140 opt: 2126 Z-score: 1928.9 bits: 367.0 E(): 3.1e-102 Smith-Waterman score: 2126; 63.314% identity (82.446% similar) in 507 aa overlap (1-501:195-692) 10 20 FLJ002 ASPRYLQPGG--EQLAINELISDGNVVCAE .: .: .::: ::::::::::::.::::: KIAA11 GTAMPDGALDTAVCADEVGSEEDLYDDLHSSSHHYSHPGGGGEQLAINELISDGSVVCAE 170 180 190 200 210 220 30 40 50 60 70 80 FLJ002 ALWDHVTMDDQELGFKAGDVIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSEN :::::::::::::::::::::.:..:.:..::::: : :.:::::::::::::.: ... KIAA11 ALWDHVTMDDQELGFKAGDVIEVMDATNREWWWGRVADGEGWFPASFVRLRVNQDEPADD 230 240 250 260 270 280 90 100 110 120 130 140 FLJ002 SSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKH .. .. :... . .:.::::::: ::..::: ::::::::::::.:::::. KIAA11 DAPLAGNSGAEDGGAEAQ---SSKDQMRTNVINEILSTERDYIKHLRDICEGYVRQCRKR 290 300 310 320 330 340 150 160 170 180 190 200 FLJ002 TGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSE . ::. :: ::::::::::. :. :.: ::...:.:.:::::.:.:::..: : :::: KIAA11 ADMFSEEQLRTIFGNIEDIYRCQKAFVKALEQRFNRERPHLSELGACFLEHQADFQIYSE 350 360 370 380 390 400 210 220 230 240 250 260 FLJ002 YCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAEL ::::::.::.::. : : .:: .:::::::::.::::..::::::::::::::::::::: KIAA11 YCNNHPNACVELSRLTKLSKYVYFFEACRLLQKMIDISLDGFLLTPVQKICKYPLQLAEL 410 420 430 440 450 460 270 280 290 300 310 320 FLJ002 LKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRS :::: .: :.....:: .:::::: :::::::.::.:::::.:: :: ::: :.: :: KIAA11 LKYTHPQHRDFKDVEAALHAMKNVAQLINERKRRLENIDKIAQWQSSIEDWEGEDLLVRS 470 480 490 500 510 520 330 340 350 360 370 380 FLJ002 SELIHSGELTKITK-QGKSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDL ::::.:::::..:. :.::::: ::::::::. :::::::::.:::::::::: .:.::: KIAA11 SELIYSGELTRVTQPQAKSQQRMFFLFDHQLIYCKKDLLRRDVLYYKGRLDMDGLEVVDL 530 540 550 560 570 580 390 400 410 420 430 440 FLJ002 GDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGME ::.:.: ..:.::::.: .: . .:.:..: :.: :::.: : ::..:: :.: :. KIAA11 EDGKDRDLHVSIKNAFRLHRGATGDSHLLCTRKPEQKQRWLKAFAREREQVQLDQETGFS 590 600 610 620 630 640 450 460 470 480 490 500 FLJ002 ISENQKKLAMLNAQKAG-HGKSKGYNRCPVAPPHQ--GLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFG :.: :.: :::::.: :: :: : .::: . : .: .: : ::.: KIAA11 ITELQRKQAMLNASKQQVTGKPKG--RRTAAPPPRLPGPYPAD----IIPFSEPQSQAS 650 660 670 680 690 510 520 FLJ002 LAEPKRKSSLFWHTFNRLTPFRK >>FLJ00188 ( 201 res) sj02282 (201 aa) initn: 1375 init1: 1375 opt: 1375 Z-score: 1256.2 bits: 240.7 E(): 9e-65 Smith-Waterman score: 1375; 100.000% identity (100.000% similar) in 201 aa overlap (327-527:1-201) 300 310 320 330 340 350 FLJ002 NERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDH :::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 RSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDH 10 20 30 360 370 380 390 400 410 FLJ002 QLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 QLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLF 40 50 60 70 80 90 420 430 440 450 460 470 FLJ002 CAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 CAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPV 100 110 120 130 140 150 480 490 500 510 520 FLJ002 APPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFNRLTPFRK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 APPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFNRLTPFRK 160 170 180 190 200 >>KIAA1415 ( 1621 res) hg04328s1 (1621 aa) initn: 667 init1: 302 opt: 602 Z-score: 547.1 bits: 112.5 E(): 2.8e-25 Smith-Waterman score: 696; 34.026% identity (61.558% similar) in 385 aa overlap (107-462:3-385) 80 90 100 110 120 130 FLJ002 RLRVNQEELSENSSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRD :. : . ..: :. ::. ::: :. :: KIAA14 AARESERQLRLRLCVLNEILGTERDYVGTLRF 10 20 30 140 150 160 170 180 190 FLJ002 ICEGYIRQCRKHTG-----MFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSE . ..... :.... .: .. ..:.::::: . .. :: :: . : : KIAA14 LQSAFLHRIRQNVADSVEKGLTEENVKVLFSNIEDILEVHKDFLAALEYCLHPEPQSQHE 40 50 60 70 80 90 200 210 220 230 240 FLJ002 IGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLL--QQMIDIAIDG .:. ::. .. : .: :::.:: : :..: : : :. .: :: .. :: ..: KIAA14 LGNVFLKFKDKFCVYEEYCSNHEKALRLLVELNKIPTVRAFLLSCMLLGGRKTTDIPLEG 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 FLJ002 FLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKRKLESIDKI .::.:.:.:::::: : :: : : .: :. ...: .:::.: ::: ::..:... . KIAA14 YLLSPIQRICKYPLLLKELAKRTPGKHPDHPAVQSALQAMKTVCSNINETKRQMEKLEAL 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 FLJ002 ARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDHQLVSCK------- . : : :::: .. : ..:. .: : ::. :. :.:.:::::. :: :: KIAA14 EQLQSHIEGWEGSNLTDICTQLLLQGTLLKISA-GNIQERAFFLFDNLLVYCKRKSRVTG 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 FLJ002 -KDLLRR------DMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGR-DKDCN-LSVKNAFKLVSRTTDEV : .: .. ..::.. . ::. .. :: : : .: :..:. . . .. KIAA14 SKKSTKRTKSINGSLYIFRGRINTEVMEVENVEDGTADYHSNGYTVTNGWKIHNTAKNKW 280 290 300 310 320 330 420 430 440 450 460 FLJ002 YLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGME------ISENQKKLAMLNAQKAGHGK .. :: :.: .::.: ::.. .:. ..::: :.:. .:: . .: KIAA14 FVCMAKTAEEKQKWLDAIIREREQ-RESLKLGMERDAYVMIAEKGEKLYHMMMNKKVNLI 340 350 360 370 380 390 470 480 490 500 510 520 FLJ002 SKGYNRCPVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFNRLTPFRK KIAA14 KDRRRKLSTVPKCFLGNEFVAWLLEIGEISKTEEGVNLGQALLENGIIHHVSDKHQFKNE 400 410 420 430 440 450 >>FLJ00018 ( 1430 res) as00018 (1430 aa) initn: 379 init1: 104 opt: 397 Z-score: 362.4 bits: 78.2 E(): 5.5e-15 Smith-Waterman score: 425; 30.928% identity (56.186% similar) in 388 aa overlap (119-492:150-504) 90 100 110 120 130 140 FLJ002 SSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKH : :::..:::.:.. ::.: : :. FLJ000 RPEPLPGPPIRLHLSPVGIPGSARPSRLERVAREIVETERAYVRDLRSIVEDYLGPLLDG 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 FLJ002 TGM-FTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYS . ..: :..:.:.::::::.:. ..:.:::.. . . :. ::.: .: : ::. FLJ000 GVLGLSVEQVGTLFANIEDIYEFSSELLEDLENSSSA-----GGIAECFVQRSEDFDIYT 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 FLJ002 EYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAE :: :.:.. : : .. . .. : : .. ...::: :::.: :: : : : FLJ000 LYCMNYPSS-LALLRELSLSPPAALWLQERQAQLRHSLPLQSFLLKPVQRILKYHLLLQE 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 FLJ002 LLKYTTQEHGDYSN--IKAAYEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDIL : :. .. : . .. : .: :: ::. ::: : .. . : . :: : . : FLJ000 LGKHWAEGPGTGGREMVEEAIVSMTAVAWYINDMKRKQEHAARLQEVQRRLGGWTGPE-L 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 FLJ002 DRSSELIHSGELTKITKQG---KSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLY-YKGRLDMDE . .::. : . : .. .: .:::...:. : :: . : :::.. FLJ000 SAFGELVLEGAFRGGGGGGPRLRGGERLLFLFSRMLLVAK----RRGLEYTYKGHIFC-- 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 FLJ002 MELVDLGDGRDKDCNLSVKNA------FKLVSRTTDE-VYLFCAKKQEDKARWLQACADE :::::... ::. . : . .:. ::.::.: :.. : FLJ000 -------------CNLSVSESPRDPLGFKVSDLTIPKHRHLLQAKNQEEKRLWIH-CL-- 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 490 FLJ002 RRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQGLHPIHQRHITMP .: :.. . : . :.. . :. . . ::: . :..:: . .: : .: FLJ000 QRLFFENHPAS--IPAKAKQVLLENSLHCAP-KSKPVLE-PLTPPLGSPRPRDARSFTPG 460 470 480 490 500 500 510 520 FLJ002 TSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFNRLTPFRK FLJ000 RRNTAPSPGPSVIRRGRRQSEPVKDPYVMFPQNAKPGFKHAGSEGELYPPESQPPVSGSA 510 520 530 540 550 560 >>KIAA0793 ( 1055 res) hk05692 (1055 aa) initn: 341 init1: 170 opt: 358 Z-score: 328.7 bits: 71.5 E(): 4.2e-13 Smith-Waterman score: 373; 27.066% identity (57.835% similar) in 351 aa overlap (103-445:526-859) 80 90 100 110 120 130 FLJ002 ASFVRLRVNQEELSENSSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIK . ::.. . . ...::. :::.:.: KIAA07 QVPLGPAEQGSSPLLSPVLSDAGGAGMDCEEPRHKRVPADEAYF--IVKEILATERTYLK 500 510 520 530 540 550 140 150 160 170 180 FLJ002 HLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQYNKEE-P---H :. : . :. .: .. .. .:.::. ::.:.: ::...:.. : : : KIAA07 DLEVITVWFRSAVVKEDAM-PATLMTLLFSNIDPIYEFHRGFLREVEQRLALWEGPSKAH 560 570 580 590 600 610 190 200 210 220 230 240 FLJ002 LS----EIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHPGACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQMID . .::. .:.:.. . .. : . : . :: . :. : . ::.. KIAA07 TKGSHQRIGDILLRNMRQLKEFTSYFQRHDEVLTELEKATKRCKKLEAVYKEFELQKVCY 620 630 640 650 660 670 250 260 270 280 290 300 FLJ002 IAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKRKLE . .. ::: :.:.. .: : : .: . . : ::.. . : .:. .:. ... .:: KIAA07 LPLNTFLLKPIQRLLHYRLLLRRLCGHYSPGHHDYADCHDALKAITEVTTTLQHILIRLE 680 690 700 710 720 730 310 320 330 340 350 360 FLJ002 SIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKITKQGKSQQRTFFLFDHQLVSCKKD ...:... : ..:: :.: : :.:. : : :.::.: ::: ::::. .:. .: KIAA07 NLQKLTELQRDLVGIENLIAPGR--EFIREGCLHKLTKKGL-QQRMFFLFSDMLLYTSKG 740 750 760 770 780 370 380 390 400 410 420 FLJ002 LLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQEDK . . . .: : .. : ::. ..: . :: . : . . .... . :. . .: KIAA07 VAGTSHFRIRGLLPLQGM-LVE-----ESDNEWSVPHCFTIYA--AQKTIVVAASTRLEK 790 800 810 820 830 840 430 440 450 460 470 480 FLJ002 ARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLAMLNAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQGLH .:. : .: : : KIAA07 EKWM---LDLNSAIQAAKSGGDTAPALPGRTVCTRPPRSPNEVSLEQESEDDARGVRSSL 850 860 870 880 890 >>KIAA0362 ( 1108 res) hh00083 (1108 aa) initn: 327 init1: 92 opt: 349 Z-score: 320.3 bits: 70.0 E(): 1.2e-12 Smith-Waterman score: 402; 28.261% identity (54.565% similar) in 460 aa overlap (86-482:604-1028) 60 70 80 90 100 FLJ002 NKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSSST-------PSEEQDEEASQSRH-R :::::: : .. : :.::. : KIAA03 ARQTRPVQPVAPRPEALAKSPCPSPGIRRGSENSSSEGGALRRGPYRRAKSEMSESRQGR 580 590 600 610 620 630 110 120 130 140 150 FLJ002 HCENKQQ-----MRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRK----H---TGMFTVA .... .: .:. :..::::.:...: . ::: . . : ::. . KIAA03 GSAGEEEESLAILRRHVMSELLDTERAYVEELLCVLEGYAAEMDNPLMAHLLSTGLHN-- 640 650 660 670 680 690 160 170 180 190 200 210 FLJ002 QLATIFGNIEDIYKFQ-RKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNHP . ..:::.:.::.:. : ::..::. :. . :.: .: :::. .: : :: .::.:.: KIAA03 KKDVLFGNMEEIYHFHNRIFLRELEN-YT-DCPEL--VGRCFLERMEDFQIYEKYCQNKP 700 710 720 730 740 220 230 240 250 260 270 FLJ002 GACLELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQMID--IAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYT . .: .: . ::. : :. .: ...:..:: :::.: :: : : :.:::. KIAA03 RS----ESLWRQCSDCPFFQEC---QRKLDHKLSLDSYLLKPVQRITKYQLLLKEMLKYS 750 760 770 780 790 800 280 290 300 310 320 330 FLJ002 TQEHGDYSNIKAAYEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELI . .: ... : .. .. .:. :. :: :.:..: : ..:. KIAA03 RNCEGA-EDLQEALSSILGILKAVND------SMHLIA-----ITGYDG--NLGDLGKLL 810 820 830 840 340 350 360 370 FLJ002 HSGELTKIT--KQG----------KSQQRTFFLFDHQLVSCKK-----DLLRRDMLY-YK .: .. : :.: : .:: .:: .. .. ::: . .. : :: KIAA03 MQGSFSVWTDHKRGHTKVKELARFKPMQRHLFLHEKAVLFCKKREENGEGYEKAPSYSYK 850 860 870 880 890 900 380 390 400 410 420 FLJ002 GRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARW------- :.: . ... : : :.. . .:::. : : :: : KIAA03 QSLNMAAVGITENVKGDAKK--------FEIWYNAREEVYIVQAPTPEIKAAWVNEIRKV 910 920 930 940 950 430 440 450 460 470 FLJ002 ----LQAC--ADERRRVQEDKEMGMEISE-------NQKKLAMLNAQKAGHGKSKGY-NR :::: :...: ..... . . :.... :. .:. . .:: . KIAA03 LTSQLQACREASQHRALEQSQSLPLPAPTSTSPSRGNSRNIKKLEERKTDPLSLEGYVSS 960 970 980 990 1000 1010 480 490 500 510 520 FLJ002 CPVA-PPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFWHTFNRLTPFRK :.. ::..: KIAA03 APLTKPPEKGKGWSKTSHSLEAPEDDGGWSSAEEQINSSDAEEDGGLGPKKLVPGKYTVV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 >>FLJ00004 ( 698 res) as00004 (698 aa) initn: 103 init1: 60 opt: 304 Z-score: 281.9 bits: 62.2 E(): 1.7e-10 Smith-Waterman score: 307; 23.316% identity (59.067% similar) in 386 aa overlap (80-452:194-553) 50 60 70 80 90 100 FLJ002 QVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSSSTPSEEQDEEASQSRHRHC :..: ::: :: .. :..:. ..: FLJ000 PSPTVLGAHAEMALDSQVPKVTPQEEADSDVGEEPDSEN---TP-QKADKDAGLAQH--- 170 180 190 200 210 110 120 130 140 150 160 FLJ002 ENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLAT-IFGNIEDIY . : .. .:.. ::..:.:.:. . . . : . : .. ::.:: .:. FLJ000 -SGPQKLLHIAQELLHTEETYVKRLHLLDQVF---CTRLTDAGIPPEVIMGIFSNISSIH 220 230 240 250 260 270 170 180 190 200 210 220 FLJ002 KFQRKFL-KDLEKQYNKE---EPHLSEIGSCFLQNQEGF-AIYSEYCNNHPGACLELANL .:. .:: .:. . ..: .:.:..: ::. : .:.:: .: : ... FLJ000 RFHGQFLLPELKTRITEEWDTNPRLGDI----LQKLAPFLKMYGEYVKNFDRAVGLVSTW 280 290 300 310 320 230 240 250 260 270 280 FLJ002 MKQGK-YRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNI ... .. ... . . ..... .: :::.. .: : : . :: :. : .. FLJ000 TQRSPLFKDVIHSIQKQEVCGNLTLQHHMLEPVQRVPRYELLLKDYLKRLPQDAPDRKDA 330 340 350 360 370 380 290 300 310 320 330 340 FLJ002 KAAYEAMKNVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGELTKIT- . . : ....: : ::.:.. :. . .. : : ::.. ..:::. :.. :.. FLJ000 ERSLELISTAANHSNAAIRKVEKMHKLLEVYEQLGGEE--DIVNPANELIKEGQIQKLSA 390 400 410 420 430 440 350 360 370 380 390 400 FLJ002 KQGKSQQRTFFLFDHQLVSCKKDL-LRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVK :.: :.: .:::. ... : : : . . . ..:.. ... :. . .. FLJ000 KNGTPQDRHLFLFNSMILYCVPKLRLMGQKFSVREKMDISGLQVQDI-------VKPNTA 450 460 470 480 490 410 420 430 440 450 FLJ002 NAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQ---ACADERRRVQED-KEMGMEISENQKKLA ..: ...: . . .. .:.: .:.: : ..... .: : .: .:... FLJ000 HTFIITGRKRS--LELQTRTEEEKKEWIQIIQATIEKHKQNSETFKAFGGAFSQDEDPSL 500 510 520 530 540 550 460 470 480 490 500 510 FLJ002 MLNAQKAGHGKSKGYNRCPVAPPHQGLHPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSLFW FLJ000 SPDMPITSTSPVEPVVTTEGSSGAAGLEPRKLSSKTRRDKEKQSCKSCGETFNSITKRRH 560 570 580 590 600 610 >>KIAA0142 ( 802 res) ha01169 (802 aa) initn: 321 init1: 132 opt: 291 Z-score: 269.4 bits: 60.1 E(): 8.3e-10 Smith-Waterman score: 462; 24.038% identity (57.692% similar) in 520 aa overlap (10-524:150-635) 10 20 30 FLJ002 ASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAEALWDHVTMDDQ :. ... ...: . ..: .. ... KIAA01 VCARPSSHRIKSFDSLGSQSLHTRTSKLFQGQYRSLDMTDNSNNQLVVRAKFNFQQTNED 120 130 140 150 160 170 40 50 60 70 80 90 FLJ002 ELGFKAGDVIQVLEASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVR-LRVNQEELSENSSSTPSEEQD ::.:. ::::.: .. . :: : . . .:::...:: ...... .: .:.. : . KIAA01 ELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTLNGRTGWFPSNYVREVKASEKPVSPKSGTLKSPPKG 180 190 200 210 220 230 100 110 120 130 140 150 FLJ002 EEASQSRHRHCENKQQMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLA ... ::. . . :...:..:: : :.:. . :.: . . . :... KIAA01 FDTTAI------NKSYYNV-VLQNILETENEYSKELQTVLSTYLRPLQTSEKL-SSANIS 240 250 260 270 280 290 160 170 180 190 200 210 FLJ002 TIFGNIEDIYKFQRKFLKDLEKQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGF-AIYSEYCNNHPGAC ..::.:.: .::. ....::. . : . ...:.:::. . . ..: :: :::.: KIAA01 YLMGNLEEICSFQQMLVQSLEECTKLPEAQ-QRVGGCFLNLMPQMKTLYLTYCANHPSAV 300 310 320 330 340 350 220 230 240 250 260 270 FLJ002 LELANLMKQGKYRHFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHG :.. .. . .:.:. . : . : : : ... ::: : :: .. . : KIAA01 NVLTE--HSEELGEFMETKGASSPGILVLTTG-LSKPFMRLDKYPTLLKELERHMEDYHT 360 370 380 390 400 280 290 300 310 320 330 FLJ002 DYSNIKAAYEAMKNVACLINE-RKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLDILDRSSELIHSGE : ..:. .. :.::.. .: :::: .. ... .: .::: :: .. : KIAA01 DRQDIQKSMAAFKNLSAQCQEVRKRKELELQILTE---AIRNWEGDDIKTLGNVTYMSQV 410 420 430 440 450 460 340 350 360 370 380 390 FLJ002 LTKITKQGKSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCN : . . . ....: ..:: . :. . . : . . :.:.: : .. : :.... KIAA01 LIQCAGSEEKNERYLLLFPNVLLMLSASP-RMSGFIYQGKLPTTGMTITKLEDSENH--- 470 480 490 500 510 520 400 410 420 430 440 450 FLJ002 LSVKNAFKLVSRTTDEVYLFCAKKQEDKARWLQACADERRRVQEDKEMGMEISENQKKLA .:::.. . ... . : ..:.: .:.. . . .. . : .. : KIAA01 ---RNAFEISGSMIERILVSC-NNQQDLQEWVEHLQKQTKVTSVGNPTIKPHSVPSHTLP 530 540 550 560 570 460 470 480 490 500 510 FLJ002 MLNAQKAG-HGKSKGYNRCPVAPPHQGL-HPIHQRHITMPTSVPQQQVFGLAEPKRKSSL . .. :. :: :..: .. : :: : : : :.. .: :: :. KIAA01 SHPVTPSSKHADSKP---APLTPAYHTLPHPSH--HGTPHTTIN----WGPLEPP-KTPK 580 590 600 610 620 520 FLJ002 FWHTFNRLTPFRK : ... : : KIAA01 PW-SLSCLRPAPPLRPSAALCYKEDLSKSPKTMKKLLPKRKPERKPSDEEFASRKSTAAL 630 640 650 660 670 680 >>KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676 aa) initn: 475 init1: 133 opt: 270 Z-score: 246.8 bits: 57.0 E(): 1.5e-08 Smith-Waterman score: 376; 26.149% identity (60.345% similar) in 348 aa overlap (25-359:1108-1439) 10 20 30 40 50 FLJ002 ASPRYLQPGGEQLAINELISDGNVVCAE-ALWDHVTMDDQELGFKAGDVIQVLE :: :..:... ...::.:. :..:.:.. KIAA12 GKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAANNEDELSFSKGQLINVMN 1080 1090 1100 1110 1120 1130 60 70 80 90 100 110 FLJ002 ASNKDWWWGRSEDKEAWFPASFVRLRVNQEELSENSSSTPSEEQDEEASQSRHRHCENKQ .. ::: :. . . ::...:.. .. :. :.. .. : .. : .:. KIAA12 KDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTD----SDPSQQWCADLQTLDTMQPIERK----- 1140 1150 1160 1170 1180 120 130 140 150 160 170 FLJ002 QMRTNVIREIMDTERVYIKHLRDICEGYIRQCRKHTGMFTVAQLATIFGNIEDIYKFQRK : . :.:...::. :. :. . : . .. ..:..: ...: :: : ... . : KIAA12 --RQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRM-AESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTK 1190 1200 1210 1220 1230 1240 180 190 200 210 220 230 FLJ002 FLKDLE--KQYNKEEPHLSEIGSCFLQNQEGFAIYSEYCNNH-PGACLELANLMKQGKYR .:: :. :. . :. .. ::. . . . : ..:. . :: : . .. .. KIAA12 LLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFK 1250 1260 1270 1280 1290 1300 240 250 260 270 280 290 FLJ002 HFFEACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLAELLKYTTQEHGDYSNIKAAYEAMK .:.. . . ...::: :.:.: .::: . .:. : . :.:.:..: : : . KIAA12 EFLKKLASDPRCKGMPLSSFLLKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKLALERAE 1310 1320 1330 1340 1350 1360 300 310 320 330 340 FLJ002 NVACLINERKRKLESIDKIARWQVSIVGWEGLD---ILDRSS------ELIHSGELTKIT .. .:: :. :. :.. .: . : ::: :.. . .:.:::.: : : KIAA12 ELCSQVNEGVREKENSDRL-EWIQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLYK-T 1370 1380 1390 1400 1410 1420 350 360 370 380 390 400 FLJ002 KQGKSQQRTFFLFDHQLVSCKKDLLRRDMLYYKGRLDMDEMELVDLGDGRDKDCNLSVKN :..: . :::. :. KIAA12 KSNKELHG--FLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKL 1430 1440 1450 1460 1470 1480 527 residues in 1 query sequences 2210467 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:51:16 2009 done: Fri Feb 27 10:51:16 2009 Total Scan time: 0.580 Total Display time: 0.160 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]