# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sh00469.fasta.huge -Q ../query/FLJ00274.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00274, 1386 aa vs ./tmplib.10216 library 2209608 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5023+/-0.00608; mu= 1.7422+/- 0.405 mean_var=244.1946+/-56.205, 0's: 0 Z-trim: 15 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.082074 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1362 ( 699 res) fj02381 ( 699) 1472 188.2 5.2e-48 FLJ00004 ( 698 res) as00004 ( 698) 488 71.7 6.2e-13 KIAA0793 ( 1055 res) hk05692 (1055) 461 68.7 7.6e-12 KIAA0305 ( 1547 res) hg00042 (1547) 245 43.3 0.0005 KIAA0321 ( 1542 res) hg00426 (1542) 204 38.4 0.014 KIAA1589 ( 816 res) fj08951 ( 816) 198 37.4 0.015 KIAA0647 ( 1195 res) hj03819s1 (1195) 199 37.7 0.018 KIAA1643 ( 993 res) hh10131(revised) ( 993) 197 37.4 0.019 KIAA0993 ( 1556 res) bf03014 (1556) 193 37.1 0.035 KIAA1537 ( 619 res) fj02581s1 ( 619) 183 35.5 0.042 KIAA1255 ( 1232 res) hh14633s1 (1232) 187 36.3 0.049 KIAA0424 ( 567 res) hh01267 ( 567) 179 35.0 0.055 KIAA1435 ( 415 res) hh13841 ( 415) 158 32.4 0.25 KIAA0969 ( 1091 res) hj06525 (1091) 164 33.5 0.3 KIAA0371 ( 1203 res) hh00252 (1203) 163 33.5 0.35 KIAA1909 ( 1287 res) ff10210 (1287) 155 32.5 0.7 KIAA0938 ( 1257 res) hh04777s1 (1257) 147 31.6 1.3 KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676) 145 31.5 1.9 KIAA0677 ( 1073 res) hk02635 (1073) 140 30.7 2.1 KIAA1115 ( 895 res) hk05464 ( 895) 138 30.4 2.2 KIAA0845 ( 1034 res) hk05234s1 (1034) 139 30.5 2.2 KIAA0902 ( 910 res) hk09777 ( 910) 137 30.3 2.4 KIAA2028 ( 1449 res) hg04183 (1449) 139 30.7 2.8 KIAA0915 ( 846 res) hk06275s1 ( 846) 134 29.9 2.9 FLJ00084 ( 641 res) as00084 ( 641) 131 29.4 3.1 KIAA1686 ( 1175 res) fh25862s1 (1175) 132 29.8 4.4 KIAA0084 ( 648 res) ha02022 ( 648) 124 28.6 5.5 KIAA0362 ( 1108 res) hh00083 (1108) 128 29.3 5.8 KIAA0142 ( 802 res) ha01169 ( 802) 125 28.8 5.9 FLJ00169 ( 432 res) sh07709 ( 432) 118 27.7 6.8 KIAA1893 ( 800 res) fk04261 ( 800) 122 28.4 7.6 KIAA1209 ( 1113 res) fg05970 (1113) 124 28.8 8.1 KIAA1330 ( 945 res) fh15188 ( 945) 122 28.5 8.5 KIAA1509 ( 1365 res) fh14721 (1365) 125 29.0 8.6 KIAA0835 ( 1167 res) hj05861 (1167) 123 28.7 9.1 KIAA0403 ( 416 res) hg01159 ( 416) 114 27.2 9.2 KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800) 129 29.8 10 KIAA1443 ( 573 res) hj01820b ( 573) 115 27.4 11 KIAA2016 ( 1715 res) pf04366 (1715) 124 29.0 11 KIAA0702 ( 988 res) hg01814(revised) ( 988) 119 28.2 11 KIAA1447 ( 1721 res) fh04686 (1721) 123 28.9 12 KIAA1200 ( 1403 res) fg02656 (1403) 120 28.4 13 FLJ00418 ( 200 res) sj09371 ( 200) 103 25.6 14 KIAA1444 ( 416 res) fg03469a ( 416) 109 26.6 14 KIAA1486 ( 677 res) fj07162 ( 677) 112 27.2 15 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 113 27.3 16 KIAA0664 ( 1134 res) hk02041 (1134) 115 27.7 17 KIAA1986 ( 334 res) pg00636 ( 334) 104 25.9 18 KIAA0440 ( 1817 res) ah05029 (1817) 118 28.3 19 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 116 28.0 20 >>KIAA1362 ( 699 res) fj02381 (699 aa) initn: 1437 init1: 829 opt: 1472 Z-score: 955.2 bits: 188.2 E(): 5.2e-48 Smith-Waterman score: 1473; 38.599% identity (65.797% similar) in 728 aa overlap (617-1318:2-696) 590 600 610 620 630 640 FLJ002 KKTENKLHVDVNVSSSRSSSESSYHGPSRILEVDRRSLSNSPQLKSRTGKLRASESPSSL .: : ..: . . .:. : ..:. : KIAA13 GIESDWQGLLVGEEKRSKPIKAYSTENYSLE 10 20 30 650 660 670 680 690 700 FLJ002 IFYRDGKRKGVPFSRTVSRVESFEDR--SRPPFLPLPLTKPRSISFPSADT-SDYENIPA . : .: . . :.::..:. :: : . :. : .. ::.:: KIAA13 SQKKRKKSRGQTSAANGLRAESLDDQMLSRESSSQAPYKSVTSLCAPEYENIRHYEEIP- 40 50 60 70 80 90 710 720 730 740 750 760 FLJ002 MNSDYENIQIPPRRPARAGAFTKLFEDQSRALSTANENDGYVDMSSFNAFESKQQSADQD .:::. . :. : : . . :. .. :. :..: .. : KIAA13 ---EYENLPF-------IMAIRKTQELEWQNSSSMEDADA-------NVYEVEEPYEAPD 100 110 120 130 770 780 790 800 FLJ002 AESAYTEPYKVCPISSAAPKE-------DLTSDEEQ--RSSEEEDSASR------DPSVT .. : . :.:. .: :: ::::. ::.:.: .:. :: KIAA13 GQLQLG-PRHQHSSSGASQEEQNDLGLGDLPSDEEEIINSSDEDDVSSESSKGEPDPLED 140 150 160 170 180 190 810 820 830 840 850 860 FLJ002 HKVEG---QSRALVIAQELLSSEKAYVEMLQHLNLDFHGAVMRALDDMDHEGRDTLAREE .. : .:.. ::.:..::::..:..:. :..::. :: .: .. :. .. . 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FLJ000 IVNPANELIKEGQIQKLSAKNGTPQDRHLFLFNSMILYCVPKLRLMGQKFSVREKMDISG 430 440 450 460 470 480 1090 1100 1110 1120 1130 1140 FLJ002 MKVSRPVMEKVPYALKIETSESCLMLSASSCAERDEWYGCLSRALPEDYK--AQALAAFH ..:. : .. ... : . : :.. . :. :: . .: : .: .... :: FLJ000 LQVQDIVKPNTAHTFIITGRKRSLELQTRTEEEKKEWIQII-QATIEKHKQNSETFKAFG 490 500 510 520 530 540 1150 1160 1170 FLJ002 HSVEIRERLGVSLGERPPTLVPVTHVMM---------------------------CMNCG . : ..: . :: :. : .:: FLJ000 GAFSQDEDPSLSPDMPITSTSPVEPVVTTEGSSGAAGLEPRKLSSKTRRDKEKQSCKSCG 550 560 570 580 590 600 1180 1190 1200 1210 1220 1230 FLJ002 CDF-SLTLRRHHCHACGKIVCRNCSRNKYPLKYLKDRMAKVCDGCFGELKKRGRAVPGLM : :.: :::::. :: ..: .::. .: ..:...:: :: FLJ000 ETFNSITKRRHHCKLCGAVICGKCSE----FKAENSRQSRVCRDCFLTQPVAPESTEVGA 610 620 630 640 650 660 1240 1250 1260 1270 1280 1290 FLJ002 RERPVSMSFPLSSPRFSGSAFSSVFQSINPSTFKKQKKVPSALTEVAASGEGSAISGYLS FLJ000 PSSCSPPGGAAEPPDTCSCAPAALAASAFGVSLGPG 670 680 690 >>KIAA0793 ( 1055 res) hk05692 (1055 aa) initn: 430 init1: 252 opt: 461 Z-score: 306.0 bits: 68.7 E(): 7.6e-12 Smith-Waterman score: 554; 23.857% identity (52.658% similar) in 809 aa overlap (610-1384:317-1026) 580 590 600 610 620 630 FLJ002 FLALTFKKKTENKLHVDVNVSSSRSSSESSYHGPSRILEVDRRSLSNSPQLKSRTGKLRA :: :.: :. . . . . :: ...: KIAA07 PEVHGPYQDTLEFLLGSRDECKNFWKICVEYHTFFRLL--DQPKPKAKAVFFSRGSSFRY 290 300 310 320 330 340 640 650 660 670 680 690 FLJ002 S-ESPSSLI-FYRDGKRKGVPFSRTVSRVESFEDRSRPPFLPLPLTKPRSISFPSA--DT : .. ..:. ...:. : .:. : :.... : :: .::::: . KIAA07 SGRTQKQLVDYFKDSGMKRIPYERRHSKTHT---SVRALTADLP---KQSISFPEGLRTP 350 360 370 380 390 700 710 720 730 740 FLJ002 SDYENIPAMNSDYENIQIPPRRPARAGAFTKLFEDQ-SRALSTANEN-DGYV----DMSS .. . :. : . .: : . ..: . : : . : : : .: : : : KIAA07 ASPSSANAFYSLSPSTLVPSGLPEFKDSSSSLTDPQVSYVKSPAAERRSGAVAGGPDTPS 400 410 420 430 440 450 750 760 770 780 790 FLJ002 FNAF--------ESKQQSADQDAESAYTEPYKVCPISSA--APKEDLTSDEEQRSSEEED . . . . .. : . :. : .. : .. .: :. .: . . KIAA07 AQPLGPPALQPGPGLSTKSPQPSPSSRKSPLSLSPAFQVPLGPAEQGSSPLLSPVLSDAG 460 470 480 490 500 510 800 810 820 830 840 850 FLJ002 SASRD-PSVTHKVEGQSRALVIAQELLSSEKAYVEMLQHLNLDFHGAVMRALDDMDHEGR .:. : :: ..: :..:.:..:..:.. :. ... :..::.. . KIAA07 GAGMDCEEPRHKRVPADEAYFIVKEILATERTYLKDLEVITVWFRSAVVK---------E 520 530 540 550 560 860 870 880 890 900 FLJ002 DTLAREELRQGLSELPAIHDLHQGILEELEERLSNWE---------SQQKVADVFLAREQ :.. . .:.. :...:.:.:.:.:.::. :: :.:...:..: . KIAA07 DAMPATLMTLLFSNIDPIYEFHRGFLREVEQRLALWEGPSKAHTKGSHQRIGDILLRNMR 570 580 590 600 610 620 910 920 930 940 950 960 FLJ002 GFDHHATHILQFDRYLGLLSENCLHSPRLAAAVREFE-QSVQGGSQTAKHRLLRVVQRLF . . .... . :. : : . . .: :. .::: :.: . ::. .:::. KIAA07 QLKEFTSYFQRHDEVLTELEKATKRCKKLEAVYKEFELQKVC--YLPLNTFLLKPIQRLL 630 640 650 660 670 680 970 980 990 1000 1010 1020 FLJ002 QYQVLLTDYLNNLCPDSAEYDNTQGALSLISKVTDRANDSMEQGENLQKLVHIEHSVRGQ .:..:: .. : .: . . ::. :..:: . . . ::::::....... : KIAA07 HYRLLLRRLCGHYSPGHHDYADCHDALKAITEVTTTLQHILIRLENLQKLTELQRDLVGI 690 700 710 720 730 740 1030 1040 1050 1060 1070 1080 FLJ002 GDLLQPGREFLKEGTLMKVTGKNRRPRHLFLMNDVLLYTYPQKDG--KYRLKNTLAVANM .:. :::::..:: : :.: :. . : .::..:.:::: : ..:... : . .: KIAA07 ENLIAPGREFIREGCLHKLTKKGLQQRMFFLFSDMLLYTSKGVAGTSHFRIRGLLPLQGM 750 760 770 780 790 800 1090 1100 1110 1120 1130 1140 FLJ002 KVSRPVME-KVPYALKIETSESCLMLSASSCAERDEWYGCLSRALPEDYKAQALAAFHHS : . : .::. . : .... ....::. :...:. :. :. :: KIAA07 LVEESDNEWSVPHCFTIYAAQKTIVVAASTRLEKEKWMLDLNSAI------QAAK----- 810 820 830 840 850 1150 1160 1170 1180 1190 1200 FLJ002 VEIRERLGVSLGERPPTLVPVTHVMMCMNCGCDFSLTLRRHHCHACGKIVCRNCSRNKYP : :. :.: : :. :: :. 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KIAA07 VSLEQE----------SEDDARG------VR----------SSLEGHGQHRANTTMHV-- 890 900 910 1270 1280 1290 1300 1310 1320 FLJ002 STFKKQKKVPSALTEVAASGEGSAISGYLSRCKRGKRHWKKLWFVIKGKVLYTYMASEDK . .. .: : .:. .. .:::: : .... :.::: :. . :. : . .: KIAA07 -CWYRNTSVSRADHSAAVENQ---LSGYLLRKFKNSHGWQKLWVVFTNFCLFFYKTHQDD 920 930 940 950 960 1330 1340 1350 1360 1370 1380 FLJ002 VALESMPLLGFTIAPEKEEGSSEVGPIFHLYHKKTLFYSFKAEDTNSAQRWIEAMEDASV : :.::::.... .: . . .:.: :. ... :.::. . .::.:... :: KIAA07 YPLASLPLLGYSVSIPREADGIHKDYVFKLQFKSHVYF-FRAESKYTFERWMEVIQGASS 970 980 990 1000 1010 1020 FLJ002 L KIAA07 SAGRAPSIVQDGPQPSSGLEGMVRGKEE 1030 1040 1050 >>KIAA0305 ( 1547 res) hg00042 (1547 aa) initn: 257 init1: 216 opt: 245 Z-score: 165.7 bits: 43.3 E(): 0.0005 Smith-Waterman score: 295; 20.824% identity (52.706% similar) in 850 aa overlap (525-1333:158-910) 500 510 520 530 540 550 FLJ002 LDDHRIKRKEDNLSLSCVIGSSGSFSQRNHLPSSGTSTPSSMVDIPPPFDLACITKKPIT ::.. :. .:.. . ::. .. : . 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KIAA03 KIFNQLESIVDFNMSSALTRQSSKMFHAKDKLQHKSQPCGLL--KDVGLVKEEVDVAVIT 240 250 260 270 280 290 670 680 690 700 710 720 FLJ002 RVESFEDRSRPPFLPLPLTKPRSISFPSADTSDYENIPAMNSDYENIQIPPRRPARAGAF .: ...... : : : ... . .... : ::...: : KIAA03 AAECLKEEGKTSALTCSLPKNEDLCLNDSNSRD-----------ENFKLPD--------F 300 310 320 330 730 740 750 760 770 FLJ002 TKLFEDQSRALSTANENDGYVDMSSFNAFESKQQS---ADQDAESAYTE-PYK--VCP-- . . ::.. ..:.:.. .:... ......... ...:. :. . : . .: KIAA03 S-FQEDKTVIKQSAQEDSKSLDLKDNDVIQDSSSALHVSSKDVPSSLSCLPASGSMCGSL 340 350 360 370 380 390 780 790 800 810 820 830 FLJ002 ISSAAPKEDLTSDEEQRSSEEEDSASRDPSVTHKVEGQSRALVIAQELLSSEKAYVEMLQ : : : . :. ..:.... . :... . ..: .. . ..::..:: .:: KIAA03 IESKA-RGDFLPQHEHKDNIQ-DAVTIHEEIQNSVVLGGEPFK-ENDLLKQEKCKSILLQ 400 410 420 430 440 450 840 850 860 870 880 FLJ002 HL-------NLDFHGAVMRALDDMDHEGRDTLARE-ELRQGLS--ELPAIHDLHQGILEE : ..: .:.:: ...: : :: . : ..::: ..: : .:... KIAA03 SLIEGMEDRKIDPDQTVIRA-ESLD--GGDTSSTVVESQEGLSGTHVPESSDCCEGFINT 460 470 480 490 500 510 890 900 910 920 930 940 FLJ002 LEERLSNWESQQKVADVFLAREQGFDHHATHILQFDRYLGLLSENCLHSPRLAAAVREFE . :: . : . : : : . . ..: .: .:. :.. . .. :: KIAA03 FS---SNDMDGQDL-DYFNIDEGAKSGPLISDAELDAFL---TEQYLQT----TNIKSFE 520 530 540 550 950 960 970 980 990 1000 FLJ002 QSVQGGSQTAKHRLLRVVQRLFQYQVLLTDYLNNLCPDSAEYDNTQGALSLISKVTDRAN ..: . .: .. .. .. .. . . :.: ... ...: ...: ...:. : KIAA03 ENV----NDSKSQMNQIDMKGLDDGNINNIYFNA---EAGAIGESHG-INIICETVDKQN 560 570 580 590 600 610 1010 1020 1030 1040 1050 1060 FLJ002 DSMEQGENLQKLVHIEHSVRGQGDLLQPGREFLKEGTLMKVTGKN---RRPRHLFLMNDV ..:.: .: . . .. : : :. .. .. ..... ::..:: . . 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