# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/sf00010.fasta.huge -Q ../query/FLJ00411.ptfa ./tmplib.10216 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 FLJ00411, 437 aa
 vs ./tmplib.10216 library

2210557 residues in  2457 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.0521+/-0.00423; mu= 20.5839+/- 0.286
 mean_var=107.2258+/-23.190, 0's: 0 Z-trim: 12  B-trim: 22 in 2/38
 Lambda= 0.123858

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2457)
FLJ00055  ( 977 res)   as00055                     ( 977) 2501 457.8 1.6e-129
FLJ00051  ( 462 res)   as00051                     ( 462)  243 53.8 3.3e-08
FLJ00073  ( 462 res)   as00073                     ( 462)  243 53.8 3.3e-08
KIAA0756  ( 1222 res)   ff01911                    (1222)  200 46.8 1.1e-05
KIAA1496  ( 920 res)   fj09513                     ( 920)  169 41.0 0.00044
KIAA0230  ( 1496 res)   ha02538                    (1496)  170 41.6  0.0005
KIAA1867  ( 779 res)   fj18636                     ( 779)  158 38.9  0.0016
KIAA1355  ( 1189 res)   fj01564                    (1189)  156 38.9  0.0025
KIAA0343  ( 1187 res)   hg01457                    (1187)  139 35.9   0.021
KIAA0657  ( 1237 res)   hk01859s1                  (1237)  124 33.2    0.13
KIAA0806  ( 1073 res)   hk04165(revised)           (1073)  121 32.6    0.18
KIAA1568  ( 1380 res)   fh22308                    (1380)  121 32.7    0.21
KIAA1564  ( 2432 res)   fh20840s1                  (2432)  115 32.1    0.58
KIAA1639  ( 2584 res)   af14886                    (2584)  115 32.1    0.59
KIAA1556  ( 1595 res)   fh18619                    (1595)  112 31.2    0.68
KIAA1132  ( 2092 res)   hh01132s1                  (2092)  113 31.6    0.68
FLJ00259  ( 659 res)   sh04102                     ( 659)  107 29.7    0.81
KIAA1773  ( 3434 res)   hj00752s2                  (3434)  111 31.6     1.1
KIAA0627  ( 1324 res)   hh01026s2                  (1324)  105 29.9     1.5
KIAA1632  ( 1457 res)   fh19068(revised)           (1457)  105 29.9     1.5
KIAA1926  ( 412 res)   hh10052                     ( 412)   98 27.8     1.9
KIAA1777  ( 954 res)   fh19201x1                   ( 954)   97 28.2     3.3
KIAA1263  ( 850 res)   hj00608                     ( 850)   95 27.7       4
KIAA1522  ( 1044 res)   fh14706(revised)           (1044)   95 27.9     4.5
FLJ00376  ( 931 res)   sh07947                     ( 931)   94 27.6     4.8
FLJ00041  ( 330 res)   as00041                     ( 330)   89 26.0     5.3
KIAA1908  ( 445 res)   ah02604                     ( 445)   89 26.2     6.1
KIAA1977  ( 606 res)   fh18284(revised)            ( 606)   90 26.6     6.3
FLJ00121  ( 448 res)   sh00381                     ( 448)   88 26.0       7
FLJ00382  ( 482 res)   sj02645                     ( 482)   88 26.1     7.2
KIAA0023  ( 2111 res)   ha00512                    (2111)   93 28.0     8.2
KIAA1150  ( 499 res)   hg02066                     ( 499)   87 25.9     8.3
KIAA1957  ( 481 res)   fk12643                     ( 481)   86 25.7     9.3
KIAA1580  ( 640 res)   fj04979                     ( 640)   87 26.1     9.5
FLJ00385  ( 509 res)   sj03289                     ( 509)   85 25.6      11
KIAA1152  ( 354 res)   hh00415                     ( 354)   83 25.0      12
KIAA0467  ( 2687 res)   ff08895                    (2687)   90 27.7      13
KIAA1497  ( 730 res)   hg01608                     ( 730)   84 25.7      15
KIAA1233  ( 1023 res)   fh08611                    (1023)   85 26.1      15
KIAA0820  ( 892 res)   bg00036                     ( 892)   84 25.8      16
KIAA1739  ( 963 res)   pj00464                     ( 963)   84 25.9      17
KIAA0582  ( 760 res)   fh15957                     ( 760)   83 25.5      17
FLJ00133  ( 1282 res)   sh02303                    (1282)   85 26.3      17
FLJ00269  ( 1383 res)   sj06049                    (1383)   85 26.3      18
KIAA0200  ( 1042 res)   ha02508                    (1042)   83 25.8      20
FLJ00184  ( 580 res)   sj01836                     ( 580)   80 24.8      21
KIAA0344  ( 2066 res)   hg01568                    (2066)   84 26.4      25
FLJ00204  ( 573 res)   sj04432                     ( 573)   78 24.4      27
KIAA0909  ( 1234 res)   hk10471                    (1234)   81 25.5      27
KIAA1656  ( 136 res)   fg00806                     ( 136)   72 22.3      28


>>FLJ00055  ( 977 res)   as00055                          (977 aa)
 initn: 2501 init1: 2501 opt: 2501  Z-score: 2418.4  bits: 457.8 E(): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 2501;  99.467% identity (99.733% similar) in 375 aa overlap (17-391:63-437)

                             10        20        30        40      
FLJ004               CGELGWVASAPSVPADPPDRPKLSALLDMGQGHMALFICTVDSRPL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ000 ARTDAALYACRILTEAGAQLSTPVLLSVLYPPDRPKLSALLDMGQGHMALFICTVDSRPL
             40        50        60        70        80        90  

         50        60        70        80        90       100      
FLJ004 ALLALFHGEHLLATSLGPQVPSHGRFQAKAEANSLKLEVRELGLGDSGSYRCEATNVLGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ000 ALLALFHGEHLLATSLGPQVPSHGRFQAKAEANSLKLEVRELGLGDSGSYRCEATNVLGS
            100       110       120       130       140       150  

        110       120       130       140       150       160      
FLJ004 SNTSLFFQVRGAWVQVSPSPELQEGQAVVLSCQVPTGVPEGTSYRWYRDGQPLQESTSAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
FLJ000 SNTSLFFQVRGAWVQVSPSPELQEGQAVVLSCQVHTGVPEGTSYRWYRDGQPLQESTSAT
            160       170       180       190       200       210  

        170       180       190       200       210       220      
FLJ004 LRFAAITLTQAGAYHCQAQAPGSATTSLAVPISLHVSYAPRHVTLTTLMDTGPGRLGLLL
       :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ000 LRFAAITLTQAGAYHCQAQAPGSATTSLAAPISLHVSYAPRHVTLTTLMDTGPGRLGLLL
            220       230       240       250       260       270  

        230       240       250       260       270       280      
FLJ004 CRVDSDPPAQLRLLHGDRLVASTLQGVGGPEGSSPRLHVAVAPNTLRLEIHGAMLEDEGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ000 CRVDSDPPAQLRLLHGDRLVASTLQGVGGPEGSSPRLHVAVAPNTLRLEIHGAMLEDEGV
            280       290       300       310       320       330  

        290       300       310       320       330       340      
FLJ004 YICEASNTLGQASASADFDAQAVNVQVWPGATVREGQLVNLTCLVWTTHPAQLTYTWYQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ000 YICEASNTLGQASASADFDAQAVNVQVWPGATVREGQLVNLTCLVWTTHPAQLTYTWYQD
            340       350       360       370       380       390  

        350       360       370       380       390       400      
FLJ004 GQQRLDAHSIPLPNVTVRDATSYRCGVGPPGRAPRLSRPITLDVLCESGWMQGGTHRNDR
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::               
FLJ000 GQQRLDAHSIPLPNVTVRDATSYRCGVGPPGRAPRLSRPITLDVLYAPRNLRLTYLLESH
            400       410       420       430       440       450  

        410       420       430                                    
FLJ004 SPQGSRHGRNPTGVQWGTRYPVASGALGKEH                             
                                                                   
FLJ000 GGQLALVLCTVDSRPPAQLALSHAGRLLASSTAASVPNTLRLELRGPQPRDEGFYSCSAR
            460       470       480       490       500       510  

>>FLJ00051  ( 462 res)   as00051                          (462 aa)
 initn: 670 init1: 236 opt: 243  Z-score: 240.8  bits: 53.8 E(): 3.3e-08
Smith-Waterman score: 649;  36.066% identity (64.481% similar) in 366 aa overlap (34-391:1-343)

            10        20        30        40        50        60   
FLJ004 LGWVASAPSVPADPPDRPKLSALLDMGQGHMALFICTVDSRPLALLALFHGEHLLATSLG
                                     .:: .::::::: : ::: :. .:::.: .
FLJ000                               LALVLCTVDSRPPAQLALSHAGRLLASSTA
                                             10        20        30

            70        80        90       100       110       120   
FLJ004 PQVPSHGRFQAKAEANSLKLEVRELGLGDSGSYRCEATNVLGSSNTSLFFQVRGAWVQVS
        .::           :.:.::.:     : : : : : . ::..:::: ....:. : ..
FLJ000 ASVP-----------NTLRLELRGPQPRDEGFYSCSARSPLGQANTSLELRLEGVRVILA
                          40        50        60        70         

           130       140        150       160       170       180  
FLJ004 PSPELQEGQAVVLSCQVPTG-VPEGTSYRWYRDGQPLQESTSATLRFAAITLTQAGAYHC
       :   . ::  ....:  :.. .:  : : ::..:. :::. .:.: : . : ..:::: :
FLJ000 PEAAVPEGAPITVTCADPAAHAP--TLYTWYHNGRWLQEGPAASLSFLVATRAHAGAYSC
      80        90       100         110       120       130       

             190       200       210       220       230       240 
FLJ004 QAQ-APGSATTSLAVPISLHVSYAPRHVTLTTLMDTGPGRLGLLLCRVDSDPPAQLRLLH
       ::: : :. ..    : .:.: :::. ..:... :.    .... : :::.:::.: : :
FLJ000 QAQDAQGTRSSR---PAALQVLYAPQDAVLSSFRDSRARSMAVIQCTVDSEPPAELALSH
       140          150       160       170       180       190    

             250       260       270       280       290       300 
FLJ004 GDRLVASTLQGVGGPEGSSPRLHVAVAPNTLRLEIHGAMLEDEGVYICEASNTLGQASAS
         ...:.. .:: .  ...   :: :: :.:::... .   :. .:.: :.: ::. :. 
FLJ000 DGKVLATS-SGVHSLASGTG--HVQVARNALRLQVQDVPAGDD-TYVCTAQNLLGSISTI
          200        210         220       230        240       250

             310       320        330        340       350         
FLJ004 ADFDAQAVNVQVWPGATVREGQLVNLTC-LVWTTHPA-QLTYTWYQDGQQRLDAHSIP--
       . ...... : . ::  : ::  .::.: :.    :. . :..:. . ..:: :. .:  
FLJ000 GRLQVEGARVVAEPGLDVPEGAALNLSCRLLGGPGPVGNSTFAWFWN-DRRLHAEPVPTL
              260       270       280       290        300         

        360       370        380       390       400       410     
FLJ004 -LPNVTVRDATSYRCGVG-PPGRAPRLSRPITLDVLCESGWMQGGTHRNDRSPQGSRHGR
        . .:.  .:  :.: .  : : :   : :. : ::                        
FLJ000 AFTHVARAQAGMYHCLAELPTGVAA--SAPVMLRVLYPPKTPTMMVFVEPEGGLRGILDC
     310       320       330         340       350       360       

         420       430                                             
FLJ004 NPTGVQWGTRYPVASGALGKEH                                      
                                                                   
FLJ000 RVDSEPLASLTLHLGSRLVASSQPQGAPAEPHIHVLASPNALRVDIEALRPSDQGEYICS
       370       380       390       400       410       420       

>>FLJ00073  ( 462 res)   as00073                          (462 aa)
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            10        20        30        40        50        60   
FLJ004 LGWVASAPSVPADPPDRPKLSALLDMGQGHMALFICTVDSRPLALLALFHGEHLLATSLG
                                     .:: .::::::: : ::: :. .:::.: .
FLJ000                               LALVLCTVDSRPPAQLALSHAGRLLASSTA
                                             10        20        30

            70        80        90       100       110       120   
FLJ004 PQVPSHGRFQAKAEANSLKLEVRELGLGDSGSYRCEATNVLGSSNTSLFFQVRGAWVQVS
        .::           :.:.::.:     : : : : : . ::..:::: ....:. : ..
FLJ000 ASVP-----------NTLRLELRGPQPRDEGFYSCSARSPLGQANTSLELRLEGVRVILA
                          40        50        60        70         

           130       140        150       160       170       180  
FLJ004 PSPELQEGQAVVLSCQVPTG-VPEGTSYRWYRDGQPLQESTSATLRFAAITLTQAGAYHC
       :   . ::  ....:  :.. .:  : : ::..:. :::. .:.: : . : ..:::: :
FLJ000 PEAAVPEGAPITVTCADPAAHAP--TLYTWYHNGRWLQEGPAASLSFLVATRAHAGAYSC
      80        90       100         110       120       130       

             190       200       210       220       230       240 
FLJ004 QAQ-APGSATTSLAVPISLHVSYAPRHVTLTTLMDTGPGRLGLLLCRVDSDPPAQLRLLH
       ::: : :. ..    : .:.: :::. ..:... :.    .... : :::.:::.: : :
FLJ000 QAQDAQGTRSSR---PAALQVLYAPQDAVLSSFRDSRARSMAVIQCTVDSEPPAELALSH
       140          150       160       170       180       190    

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FLJ004 GDRLVASTLQGVGGPEGSSPRLHVAVAPNTLRLEIHGAMLEDEGVYICEASNTLGQASAS
         ...:.. .:: .  ...   :: :: :.:::... .   :. .:.: :.: ::. :. 
FLJ000 DGKVLATS-SGVHSLASGTG--HVQVARNALRLQVQDVPAGDD-TYVCTAQNLLGSISTI
          200        210         220       230        240       250

             310       320        330        340       350         
FLJ004 ADFDAQAVNVQVWPGATVREGQLVNLTC-LVWTTHPA-QLTYTWYQDGQQRLDAHSIP--
       . ...... : . ::  : ::  .::.: :.    :. . :..:. . ..:: :. .:  
FLJ000 GRLQVEGARVVAEPGLDVPEGAALNLSCRLLGGPGPVGNSTFAWFWN-DRRLHAEPVPTL
              260       270       280       290        300         

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FLJ004 -LPNVTVRDATSYRCGVG-PPGRAPRLSRPITLDVLCESGWMQGGTHRNDRSPQGSRHGR
        . .:.  .:  :.: .  : : :   : :. : ::                        
FLJ000 AFTHVARAQAGMYHCLAELPTGVAA--SAPVMLRVLYPPKTPTMMVFVEPEGGLRGILDC
     310       320       330         340       350       360       

         420       430                                             
FLJ004 NPTGVQWGTRYPVASGALGKEH                                      
                                                                   
FLJ000 RVDSEPLASLTLHLGSRLVASSQPQGAPAEPHIHVLASPNALRVDIEALRPSDQGEYICS
       370       380       390       400       410       420       

>>KIAA0756  ( 1222 res)   ff01911                         (1222 aa)
 initn: 198 init1:  86 opt: 200  Z-score: 195.4  bits: 46.8 E(): 1.1e-05
Smith-Waterman score: 256;  25.258% identity (50.773% similar) in 388 aa overlap (9-371:299-656)

                                     10          20        30      
FLJ004                       CGELGWVASAPSVPADPPD--RPKLSALLDMGQGHMAL
                                     :: .:    :.   :. .:  .:    : :
KIAA07 TIQQKNPFTLKVLTNHPYNDSSLRNHPDMYSARGVAERTPSFMYPQGTASSQMVLRGMDL
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FLJ004 FI-CTVDSRPLALLALFHGEHLLATSLGPQVPSHGRFQAKAEANSLKLEVRELGLGDSGS
       .. : ... :   .: ..         : ..::    .:: :  .  :.. ...  ::: 
KIAA07 LLECIASGVPTPDIAWYKK--------GGDLPSD---KAKFENFNKALRITNVSEEDSGE
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FLJ004 YRCEATNVLGSSNTSLFFQVRGA--WVQVSPSPELQEGQAVVLSCQVPTGVPEGTSYRWY
       : : :.: .::   ..  .:..:  :..   .  :  :.   : :.. .: :. :  .:.
KIAA07 YFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDEPKNLILAPGEDGRLVCRA-NGNPKPT-VQWM
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FLJ004 RDGQPLQ--------ESTSATLRFAAITLTQAGAYHCQAQAPGSATTSLAVPISLHVS--
        .:.:::        : .. :. :    ... ..:.:...   .   . :    : :   
KIAA07 VNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISSRAVYQCNTSNEHGYLLANAFVSVLDVPPR
         440       450       460       470       480       490     

            210       220       230       240       250       260  
FLJ004 -YAPRHVTLTTLMDTGPGRLGLLLCRVDSDPPAQLRLLHGDRLVASTLQGVGGPEGSSPR
         .::.  . ...  .  ::    :   ..:   :: ... .  .:.:.:     :.   
KIAA07 MLSPRNQLIRVIL-YNRTRLD---CPFFGSPIPTLRWFKNGQ--GSNLDG-----GN---
         500        510          520       530              540    

            270       280       290       300        310        320
FLJ004 LHVAVAPNTLRLEIHGAMLEDEGVYICEASNTLGQASASADFDAQ-AVNVQVWPGATV-R
        ::    .   :::.    ::.:.: : :.: ::.:  .. ....  . .   :   : :
KIAA07 YHVYENGS---LEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPTRIYRMPEDQVAR
                550       560       570       580       590        

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FLJ004 EGQLVNLTCLVWTTHPAQLTYTWYQDGQ-----QRL--DAHSIPLPNVTVRDATSYRCGV
       .:  :.: : :      .:: .: .: .     .:.  .  :. . .:. ::  :: :  
KIAA07 RGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLYIGNRMKKEDDSLTIFGVAERDQGSYTCVA
      600       610       620       630       640       650        

           380       390       400       410       420       430   
FLJ004 GPPGRAPRLSRPITLDVLCESGWMQGGTHRNDRSPQGSRHGRNPTGVQWGTRYPVASGAL
                                                                   
KIAA07 STELDQDLAKAYLTVLGRPDRPRDLELTDLAERSVRLTWIPGDANNSPITDYVVQFEEDQ
      660       670       680       690       700       710        

>>KIAA1496  ( 920 res)   fj09513                          (920 aa)
 initn: 125 init1:  60 opt: 169  Z-score: 166.6  bits: 41.0 E(): 0.00044
Smith-Waterman score: 254;  23.559% identity (49.123% similar) in 399 aa overlap (83-437:174-550)

             60        70        80        90       100       110  
FLJ004 HGEHLLATSLGPQVPSHGRFQAKAEANSLKLEVRELGLGDSGSYRCEATNVLGSSNTS--
                                     ::. ..   :.:::.: : :  :.. .   
KIAA14 LGNPIPQINWRRSDGLPFSSKIKLRKFSGVLEIPNFQQEDAGSYECIAENSRGKNVARGR
           150       160       170       180       190       200   

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FLJ004 LFFQVRGAWVQVSPSPELQEGQAVVLSCQVPTGVPEGTSYRWYRDGQPL--QEST---SA
       : . ..  :::.  . :.   ...   :.. .: :.  :::: ..:  :  .: :   ..
KIAA14 LTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRA-SGKPK-PSYRWLKNGAALVLEERTQIENG
           210       220       230         240       250       260 

         170       180        190       200         210       220  
FLJ004 TLRFAAITLTQAGAYHCQAQAP-GSATTSLAVPISLHVSYAP--RHVTLTTLMDTGPGRL
       .: .. ...:..: ..: :.   : . .:  . .   :. ::   .  .  :...  : :
KIAA14 ALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKV---VASAPDFSKNPMKKLVQVQVGSL
             270       280       290          300       310        

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FLJ004 GLLLCRVDSDPPAQLRLLHGDRLVASTLQGVGGPEGSSPRLHVAVAPNTLRLEIHGAMLE
         : :.  ..: :     .::  :               :. .    :   :.: ..   
KIAA14 VSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQE-----------HERISLL---NDGGLKIANVTKA
      320       330       340                  350          360    

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FLJ004 DEGVYICEASNTLGQASASADFDA-QAVNVQVWPGAT-VREGQLVNLTCLVWTTHPAQLT
       : :.: : : : .:.:.... . . . . . . :.   :  :. : : : :      .. 
KIAA14 DAGTYTCMAENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDII
          370       380       390       400       410       420    

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FLJ004 YTWY---------QDGQ--QRLDAHS---IPLPNVTVRDATSYRC----GV---------
       .:::         .::.  ... . :   . . :. .. . .: :    ::         
KIAA14 FTWYFNGALADFKKDGSHFEKVGGSSSGDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDSVSSAADL
          430       440       450       460       470       480    

              380       390       400         410       420        
FLJ004 ---GPPGRAPRLSRPITLDVLCESGWMQGGTHRNDRSP--QGSRHGRNPTGVQWGTRYPV
          : ::    ..     :.  . .: .:   ....::  . : ..:.: .: : :   :
KIAA14 IVRGSPGPPENVKVDEITDTTAQLSWKEG---KDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQTVTTV
          490       500       510          520       530       540 

      430                                                          
FLJ004 ASGALGKEH                                                   
            :: :                                                   
KIAA14 PEVIDGKTHTATVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPSEVNG
             550       560       570       580       590       600 

>>KIAA0230  ( 1496 res)   ha02538                         (1496 aa)
 initn: 133 init1:  76 opt: 170  Z-score: 165.7  bits: 41.6 E(): 0.0005
Smith-Waterman score: 233;  24.289% identity (49.612% similar) in 387 aa overlap (11-371:263-611)

                                   10        20        30        40
FLJ004                     CGELGWVASAPSVPADPPDRPKLSALLDMGQGHMALFICT
                                     : . ..: :        :. .:. . : : 
KIAA02 AQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEELNCERPRITSEPQDA-------DVTSGNTVYFTCR
            240       250       260       270              280     

               50        60        70        80        90       100
FLJ004 VDSRPLALLALFHGEHLLATSLGPQVPSHGRFQAKAEANSLKLEVRELGLGDSGSYRCEA
       ... :   .  ..... :.      . . .:..   ... .  ...:    :.: :.: :
KIAA02 AEGNPKPEIIWLRNNNELS------MKTDSRLNLLDDGTLMIQNTQET---DQGIYQCMA
         290       300             310       320          330      

              110             120       130       140       150    
FLJ004 TNVLGSSNTSL----FF--QVRGAWVQVSPSPELQEGQAVVLSCQVPTGVPEGTSYRWYR
        :: :  .:.     .:   .: ..:    . :.  :..:.: :.. :: :      : :
KIAA02 KNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVTLECSA-TGHPP-PRISWTR
        340       350       360       370       380         390    

           160             170       180       190       200       
FLJ004 -DGQPLQE------STSATLRFAAITLTQAGAYHCQAQAPGSATTSLAVPISLHVSYAPR
        :  ::        . :. : .  ..  ..: : :.:    ... . :  :   :.  :.
KIAA02 GDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNIDSVHATAFII---VQALPQ
          400       410       420       430       440          450 

       210       220       230       240       250       260       
FLJ004 HVTLTTLMDTGPGRLGLLLCRVDSDPPAQLRLLHGDRLVASTLQGVGGPEGSSPRLHVAV
        ..      .  :.   . :.. ..::          ..: :    :: . :  : :...
KIAA02 FTVTPQDRVVIEGQTVDFQCEAKGNPPP---------VIAWTK---GGSQLSVDRRHLVL
             460       470                480          490         

       270       280       290       300       310           320   
FLJ004 APNTLRLEIHGAMLEDEGVYICEASNTLGQASASADFDAQAVNVQVW---PG-ATVREGQ
       . .:::  : :. :.:.: : :.: : .:. .. : . .:   . :.   :. .::. : 
KIAA02 SSGTLR--ISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVFASIPSDTTVEVGA
     500         510       520       530       540       550       

           330        340       350          360            370    
FLJ004 LVNLTCLVW-TTHPAQLTYTWYQDGQQRLDA---HSIPLPNVTVRD-----ATSYRCGVG
        :.: :      .::    :: .:: :  ..   :  :   .:. :     :  :.:   
KIAA02 NVQLPCSSQGEPEPA---ITWNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRYECVAR
       560       570          580       590       600       610    

          380       390       400       410       420       430    
FLJ004 PPGRAPRLSRPITLDVLCESGWMQGGTHRNDRSPQGSRHGRNPTGVQWGTRYPVASGALG
                                                                   
KIAA02 NTIGSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSRPRSPNDL
          620       630       640       650       660       670    

>>KIAA1867  ( 779 res)   fj18636                          (779 aa)
 initn:  96 init1:  69 opt: 158  Z-score: 156.7  bits: 38.9 E(): 0.0016
Smith-Waterman score: 186;  24.444% identity (52.444% similar) in 225 aa overlap (98-316:315-527)

        70        80        90       100       110        120      
FLJ004 SHGRFQAKAEANSLKLEVRELGLGDSGSYRCEATNVLGSSNTSLFFQVR-GAWVQVSPSP
                                     ::.::.:::.: :   .:  :  . . :. 
KIAA18 WAKRGQIIKEASGEVYRTTVDYTYFSEPVSCEVTNALGSTNLSRTVDVYFGPRMTTEPQS
          290       300       310       320       330       340    

        130        140       150       160       170       180     
FLJ004 ELQE-GQAVVLSCQVPTGVPEGTSYRWYRDGQPLQESTSATLRFAAITLTQAGAYHCQAQ
        : . :. ...::   :: : . .  :.. :. .  :.  :: . ..   .:: : :.: 
KIAA18 LLVDLGSDAIFSCAW-TGNP-SLTIVWMKRGSGVVLSNEKTLTLKSVRQEDAGKYVCRAV
          350        360        370       380       390       400  

         190       200       210       220       230       240     
FLJ004 APGSATTSLAVPISLHVSYAPRHVTLTTLMDTGPGRLGLLLCRVDSDPPAQLRLLHGDRL
       .:  ..    : ....   .:  .. :  . .  :. : . : . : ::        ::.
KIAA18 VPRVGAGEREVTLTVN---GPPIISSTQTQHALHGEKGQIKCFIRSTPPP-------DRI
            410          420       430       440              450  

         250         260       270        280        290       300 
FLJ004 VASTLQGV--GGPEGSSPRLHVAVAPNTLR-LEIHGAMLED-EGVYICEASNTLGQASAS
       . :  ..:  .:  :      ...  ...  : : . .  : . .: : : :..:. .  
KIAA18 AWSWKENVLESGTSGRYTVETISTEEGVISTLTISNIVRADFQTIYNCTAWNSFGSDTEI
            460       470       480       490       500       510  

             310       320       330       340       350       360 
FLJ004 ADFDAQAVNVQVWPGATVREGQLVNLTCLVWTTHPAQLTYTWYQDGQQRLDAHSIPLPNV
         .  :. ...   :                                             
KIAA18 IRLKEQGSEMKSGAGLEAESVPMAVIIGVAVGAGVAFLVLMATIVAFCCARSQRNLKGVV
            520       530       540       550       560       570  

>>KIAA1355  ( 1189 res)   fj01564                         (1189 aa)
 initn: 145 init1:  71 opt: 156  Z-score: 153.1  bits: 38.9 E(): 0.0025
Smith-Waterman score: 208;  24.679% identity (50.641% similar) in 312 aa overlap (7-301:142-417)

                                       10        20        30      
FLJ004                         CGELGWVASAPSVPADPPDRPKLSALLDMGQGHMAL
                                     : : :.    ::      :.:.. . . . 
KIAA13 DQGWYECRVFFLDQHIPEDDFANGSWVHLTVNSPPQFQETPP------AVLEVQELEPVT
             120       130       140       150             160     

         40        50        60        70        80        90      
FLJ004 FICTVDSRPLALLALFHGEHLLATSLGPQVPSHGRFQAKAEANSLKLEVRELGLGDSGSY
       . :.. . ::  ..     .: . .::     .:. :.... ..:.  .:..  :.:: :
KIAA13 LRCVARGSPLPHVTW----KLRGKDLG-----QGQGQVQVQNGTLR--IRRVERGSSGVY
         170       180                190       200         210    

        100       110       120         130       140       150    
FLJ004 RCEATNVLGSSNTSLFFQVRGAWVQVSP--SPELQEGQAVVLSCQVPTGVPEGTSYRWYR
        :.:... ::.. .  . : :  : : :  .  .. .: : :.:.. .  : . .: :..
KIAA13 TCQASSTEGSATHATQLLVLGPPVIVVPPKNSTVNASQDVSLACHAEA-YPANLTYSWFQ
          220       230       240       250       260        270   

                    160       170       180           190       200
FLJ004 DG---------QP-LQESTSATLRFAAITLTQAGAYHCQAQA----PGSATTSLAVPISL
       :.         :: ..  ....::. :    .:: : :  .     : ::.. :.:    
KIAA13 DNINVFHISRLQPRVRILVDGSLRLLATQPDDAGCYTCVPSNGLLHPPSASAYLTVLYPA
           280       290       300       310       320       330   

              210       220       230       240       250       260
FLJ004 HVSYAPRHVTLTTLMDTGPGRLGLLLCRVDSDPPAQLRLLHGDRLVASTLQGVGGPEGSS
       .:.  : .. :   :   :   :.. : : ..::  .     :  . .  .  :  .:. 
KIAA13 QVTAMPPETPLPIGM---P---GVIRCPVRANPPLLFVSWTKDGKALQLDKFPGWSQGTE
           340             350       360       370       380       

              270       280        290       300       310         
FLJ004 PRLHVAVAPNTLRLEIHGAMLEDE-GVYICEASNTLGQASASADFDAQAVNVQVWPGATV
         : .:..             ::  : : :   :.:: :. :                  
KIAA13 GSLIIALGN------------EDALGEYSCTPYNSLGTAGPSPVTRVLLKAPPAFIERPK
       390                   400       410       420       430     

     320       330       340       350       360       370         
FLJ004 REGQLVNLTCLVWTTHPAQLTYTWYQDGQQRLDAHSIPLPNVTVRDATSYRCGVGPPGRA
                                                                   
KIAA13 EEYFQEVGRELLIPCSAQGDPPPVVSWTKVGRGLQGQAQVDSNSSLILRPLTKEAHGHWE
         440       450       460       470       480       490     

>>KIAA0343  ( 1187 res)   hg01457                         (1187 aa)
 initn: 174 init1:  89 opt: 139  Z-score: 136.7  bits: 35.9 E(): 0.021
Smith-Waterman score: 253;  23.871% identity (54.194% similar) in 310 aa overlap (83-371:313-604)

             60        70        80        90       100       110  
FLJ004 HGEHLLATSLGPQVPSHGRFQAKAEANSLKLEVRELGLGDSGSYRCEATNVLGSSNTSLF
                                     :.. ... .:::.:.: : :.::. . .. 
KIAA03 EGLPTPIIYWAKEDGMLPKNRTVYKNFEKTLQIIHVSEADSGNYQCIAKNALGAIHHTIS
            290       300       310       320       330       340  

              120       130       140       150       160          
FLJ004 FQVRGA--WVQVSPSPELQEGQAVVLSCQVPTGVPEGTSYRWYRDGQPLQ--------ES
        .:..:  :. .  .  :. :.  .: :.. .: :.     :  .: :..        . 
KIAA03 VRVKAAPYWITAPQNLVLSPGEDGTLICRA-NGNPK-PRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKI
            350       360       370         380       390       400

            170       180        190       200       210        220
FLJ004 TSATLRFAAITLTQAGAYHCQAQAP-GSATTSLAVPISLHVSYAPRHVT-LTTLMDTGPG
        . :. :. .   ....:.:.:.   :   ..  : .   ..  :: .:  .::...  .
KIAA03 DGDTIIFSNVQERSSAVYQCNASNEYGYLLANAFVNV---LAEPPRILTPANTLYQVIAN
              410       420       430          440       450       

              230       240       250       260       270       280
FLJ004 RLGLLLCRVDSDPPAQLRLLHGDRLVASTLQGVGGPEGSSPRLHVAVAPNTLRLEIHGAM
       : .:: :   ..:               :..   : .::. .  . :  ..  :::  :.
KIAA03 RPALLDCAFFGSP-------------LPTIEWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQ
       460       470                    480       490       500    

              290       300        310        320       330        
FLJ004 LEDEGVYICEASNTLGQASASADFDAQ-AVNVQVWPG-ATVREGQLVNLTCLVWTTHPAQ
        .. :.: : : : ::.:.  . .. . :. .   :  :.:..:..:.. : :   :  .
KIAA03 KDSTGTYTCVARNKLGMAKNEVHLEIKDATWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLS
          510       520       530       540       550       560    

      340              350       360       370       380       390 
FLJ004 LTYTWYQDGQQ-------RLDAHSIPLPNVTVRDATSYRCGVGPPGRAPRLSRPITLDVL
       ::  : .:...        .:   . . .:.  :. .: :                    
KIAA03 LTVLWLKDNRELPSDERFTVDKDHLVVADVSDDDSGTYTCVANTTLDSVSASAVLSVVAP
          570       580       590       600       610       620    

             400       410       420       430                     
FLJ004 CESGWMQGGTHRNDRSPQGSRHGRNPTGVQWGTRYPVASGALGKEH              
                                                                   
KIAA03 TPTPAPVYDVPNPPFDLELTDQLDKSVQLSWTPGDDNNSPITKFIIEYEDAMHKPGLWHH
          630       640       650       660       670       680    

>>KIAA0657  ( 1237 res)   hk01859s1                       (1237 aa)
 initn: 264 init1:  70 opt: 124  Z-score: 122.0  bits: 33.2 E(): 0.13
Smith-Waterman score: 192;  26.573% identity (51.049% similar) in 286 aa overlap (92-347:891-1140)

              70        80        90       100       110           
FLJ004 LGPQVPSHGRFQAKAEANSLKLEVRELGLGDSGSYRCEATNVLGSSNTSLFFQVRGAW--
                                     :.: . :.:      .. : :: :  .   
KIAA06 DGLEVEESEALVLERDGPRCRLVLPAAQPEDGGEFVCDA------GDDSAFFTVTVTEPP
              870       880       890             900       910    

          120        130       140       150       160             
FLJ004 -----VQVSPSPE-LQEGQAVVLSCQVPTGVPEGTSYRWYRDGQPLQESTSATLR-----
            ....:::  .  :. :::::..  .   :.   : ..:.:.::. .  :.     
KIAA06 VQFLALETTPSPLCVAPGEPVVLSCELSRA---GAPVVWSHNGRPVQEGEGLELHAEGPR
          920       930       940          950       960       970 

          170       180        190       200       210       220   
FLJ004 ----FAAITLTQAGAYHCQA-QAPGSATTSLAVPISLHVSYAPRHVTLTTLMDTGPGRLG
           . :   ..:: : ::.  :::. . :..:    .:.  : .:.     .:      
KIAA06 RVLCIQAAGPAHAGLYTCQSGAAPGAPSLSFTV----QVAEPPVRVVAPEAAQT------
             980       990      1000          1010      1020       

           230       240        250                260       270   
FLJ004 LLLCRVDSDPPAQLRLL-HGDRLVASTLQGVGGP-----EG----SSPRLHVAVAPNTLR
           :: : : ..:.:. :        :.: :::     .:    :. :...  :     
KIAA06 ----RVRSTPGGDLELVVH--------LSGPGGPVRWYKDGERLASQGRVQLEQAGARQV
                1030              1040      1050      1060         

           280       290         300       310       320       330 
FLJ004 LEIHGAMLEDEGVYICEA--SNTLGQASASADFDAQAVNVQVWPGATVREGQLVNLTCLV
       :...::   : : :.:.:  .. .  .:.   . .. :. .. :  ::.::. ... : :
KIAA06 LRVQGARSGDAGEYLCDAPQDSRIFLVSVEEPLLVKLVS-DLTP-LTVHEGDDATFRCEV
    1070      1080      1090      1100       1110       1120       

             340       350       360       370       380       390 
FLJ004 WTTHPAQLTYTWYQDGQQRLDAHSIPLPNVTVRDATSYRCGVGPPGRAPRLSRPITLDVL
           : .   :: ..:                                            
KIAA06 ---SPPDADVTWLRNGAVVTPGPQRQSCCSYGGCRMCGQRKARTCVSKWRQAEWVQRGPC
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