# /usr/local/bin/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/sf00005.fasta.nr -Q ../query/FLJ00341.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00341, 2760 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7817370 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3518+/-0.000199; mu= 12.6767+/- 0.011 mean_var=120.9835+/-23.142, 0's: 30 Z-trim: 53 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.116603 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 45, opt: 33, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|34526553|dbj|BAC85154.1| FLJ00341 protein [Homo (2760) 18525 3129.4 0 gi|194221387|ref|XP_001916603.1| PREDICTED: neurob (2748) 16955 2865.3 0 gi|187957482|gb|AAI57957.1| Nbeal2 protein [Mus mu (2750) 16140 2728.2 0 gi|219521767|gb|AAI72118.1| Unknown (protein for M (2723) 14046 2376.0 0 gi|119585205|gb|EAW64801.1| hCG15426, isoform CRA_ (1554) 10426 1766.8 0 gi|194677363|ref|XP_001255343.2| PREDICTED: simila (2720) 10142 1719.2 0 gi|109483998|ref|XP_236649.4| PREDICTED: similar t (2745) 9708 1646.2 0 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sap ( 974) 3188 549.0 1.1e-152 gi|34536111|dbj|BAC87543.1| unnamed protein produc (1042) 3188 549.0 1.2e-152 gi|149944613|ref|NP_001092743.1| neurobeachin-like (1404) 3187 549.0 1.7e-152 gi|148667728|gb|EDL00145.1| mCG116543 [Mus musculu (1942) 3174 546.9 9.7e-152 gi|153791557|ref|NP_775620.2| neurobeachin like 1 (2688) 3174 547.0 1.2e-151 gi|149046043|gb|EDL98936.1| rCG22325 [Rattus norve (2645) 3173 546.9 1.4e-151 gi|118093506|ref|XP_421964.2| PREDICTED: hypotheti (2298) 3138 540.9 7.3e-150 gi|47216728|emb|CAG01002.1| unnamed protein produc (2221) 3136 540.6 9e-150 gi|109100697|ref|XP_001094456.1| PREDICTED: simila (2295) 3076 530.5 1e-146 gi|33417009|gb|AAH55813.1| Nbeal1 protein [Mus mus ( 707) 2845 491.2 2.1e-135 gi|148677062|gb|EDL09009.1| mCG146094 [Mus musculu ( 448) 2769 478.2 1.1e-131 gi|115681472|ref|XP_785921.2| PREDICTED: hypotheti (3355) 2614 452.9 3.3e-123 gi|198437793|ref|XP_002124159.1| PREDICTED: ALS2CR (2609) 2486 431.3 8.4e-117 gi|156212913|gb|EDO33951.1| predicted protein [Nem ( 988) 2465 427.4 4.7e-116 gi|119585204|gb|EAW64800.1| hCG15435 [Homo sapiens ( 406) 2378 412.4 6.2e-112 gi|215493323|gb|EEC02964.1| nbeal1, putative [Ixod (1960) 2292 398.5 4.5e-107 gi|190586905|gb|EDV26958.1| hypothetical protein T ( 887) 2285 397.1 5.7e-107 gi|26334213|dbj|BAC30824.1| unnamed protein produc ( 550) 2228 387.3 3.1e-104 gi|21751572|dbj|BAC03994.1| unnamed protein produc ( 614) 2176 378.6 1.4e-101 gi|167878726|gb|EDS42109.1| beach protein [Culex q ( 879) 2138 372.3 1.6e-99 gi|190625025|gb|EDV40549.1| GF10565 [Drosophila an ( 879) 2135 371.8 2.2e-99 gi|194164285|gb|EDW79186.1| GK12734 [Drosophila wi ( 878) 2122 369.6 1e-98 gi|194128403|gb|EDW50446.1| GM14636 [Drosophila se ( 878) 2118 369.0 1.6e-98 gi|194179768|gb|EDW93379.1| GE21425 [Drosophila ya ( 905) 2115 368.5 2.3e-98 gi|10727297|gb|AAF47865.2| CG1332 [Drosophila mela ( 878) 2113 368.1 2.9e-98 gi|194153486|gb|EDW68670.1| GJ12835 [Drosophila vi ( 879) 2111 367.8 3.7e-98 gi|54641798|gb|EAL30548.1| GA12201 [Drosophila pse ( 880) 2111 367.8 3.7e-98 gi|193918426|gb|EDW17293.1| GI16583 [Drosophila mo ( 878) 2098 365.6 1.7e-97 gi|190653646|gb|EDV50889.1| GG15207 [Drosophila er ( 878) 2098 365.6 1.7e-97 gi|55242555|gb|EAL40970.1| AGAP003389-PA [Anophele ( 885) 2094 364.9 2.7e-97 >>gi|34526553|dbj|BAC85154.1| FLJ00341 protein [Homo sap (2760 aa) initn: 18525 init1: 18525 opt: 18525 Z-score: 16834.8 bits: 3129.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 18525; 100.000% identity (100.000% similar) in 2760 aa overlap (1-2760:1-2760) 10 20 30 40 50 60 FLJ003 PEPGRAMAASERLYELWLLYYAQKDLGYLQQWLKAFVGAFKKSISLSSLEPRRPEEAGAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|345 PEPGRAMAASERLYELWLLYYAQKDLGYLQQWLKAFVGAFKKSISLSSLEPRRPEEAGAE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 FLJ003 VPLLPLDELHVLAEQLHQADLEQALLLLKLFIILCRNLENIEAGRGQVLVPRVLALLTKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|345 VPLLPLDELHVLAEQLHQADLEQALLLLKLFIILCRNLENIEAGRGQVLVPRVLALLTKL 70 80 90 100 110 120 130 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