# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00098.fasta.huge -Q ../query/FLJ00098.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00098, 780 aa vs ./tmplib.10216 library 2210214 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2566+/-0.00383; mu= 18.7808+/- 0.259 mean_var=87.2247+/-18.859, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.137327 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00105 ( 721 res) as00105 ( 721) 4789 959.5 0 KIAA1176 ( 1101 res) hg02851a (1101) 3452 694.8 1.4e-200 FLJ00100 ( 672 res) as00100 ( 672) 650 139.4 1.4e-33 FLJ00010 ( 772 res) as00010 ( 772) 650 139.5 1.5e-33 FLJ00379 ( 487 res) sj00523 ( 487) 415 92.6 1.2e-19 FLJ00009 ( 540 res) as00009 ( 540) 415 92.7 1.3e-19 FLJ00059 ( 477 res) as00059 ( 477) 328 75.4 1.8e-14 KIAA1613 ( 686 res) fj12845 ( 686) 123 35.0 0.038 KIAA1565 ( 1313 res) bf00184 (1313) 101 31.0 1.1 KIAA1164 ( 390 res) hk00541 ( 390) 89 27.9 2.9 FLJ00016 ( 349 res) as00016 ( 349) 88 27.7 3.1 KIAA1847 ( 564 res) bm00425 ( 564) 89 28.1 3.6 KIAA1166 ( 165 res) hk01743 ( 165) 80 25.6 6.1 KIAA1994 ( 1117 res) bh00052 (1117) 88 28.4 6.2 KIAA0707 ( 630 res) hh00286(revised) ( 630) 85 27.4 6.7 KIAA0803 ( 1708 res) hj03049(revised) (1708) 89 28.8 6.9 KIAA0287 ( 1523 res) fg06332 (1523) 87 28.3 8.5 KIAA1467 ( 432 res) fj01477 ( 432) 81 26.4 9.3 KIAA1664 ( 920 res) fj04751s1 ( 920) 84 27.5 9.6 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 84 27.5 10 KIAA1604 ( 937 res) fj10713 ( 937) 83 27.3 11 KIAA1671 ( 364 res) hh02164 ( 364) 78 25.7 13 FLJ00279 ( 563 res) sh01691 ( 563) 79 26.2 14 KIAA1105 ( 730 res) hh02687(revised) ( 730) 80 26.5 15 KIAA1187 ( 813 res) fk03027 ( 813) 80 26.6 15 KIAA0890 ( 1210 res) hk08057 (1210) 81 27.0 17 KIAA0578 ( 1542 res) bf00990 (1542) 82 27.4 17 KIAA0632 ( 727 res) hh01900 ( 727) 78 26.1 19 FLJ00153 ( 497 res) sh06127 ( 497) 76 25.5 20 KIAA1028 ( 501 res) fh00176s1 ( 501) 76 25.5 20 KIAA0153 ( 638 res) ha00521 ( 638) 77 25.8 20 KIAA1907 ( 1737 res) ah00504 (1737) 81 27.2 21 KIAA0085 ( 269 res) ha01520 ( 269) 73 24.5 21 KIAA1799 ( 610 res) fj20761 ( 610) 76 25.6 23 KIAA0655 ( 1083 res) hk01768 (1083) 78 26.4 24 KIAA0113 ( 636 res) ha01652s1 ( 636) 75 25.4 26 KIAA0605 ( 1031 res) hg03238a (1031) 77 26.1 27 KIAA0359 ( 760 res) hh00048 ( 760) 75 25.6 29 KIAA1783 ( 1560 res) fg01285 (1560) 78 26.6 30 KIAA1843 ( 1778 res) bf02364 (1778) 78 26.7 32 FLJ00255 ( 733 res) sj09579 ( 733) 74 25.3 33 KIAA0266 ( 766 res) ha02755 ( 766) 74 25.4 34 KIAA1589 ( 816 res) fj08951 ( 816) 74 25.4 35 KIAA1890 ( 1048 res) fk02692 (1048) 75 25.7 35 KIAA0641 ( 1326 res) hj03494s1 (1326) 76 26.1 35 FLJ00344 ( 1055 res) sf00013 (1055) 75 25.8 36 KIAA0033 ( 335 res) ha02009 ( 335) 70 24.1 36 KIAA0184 ( 863 res) ha02918 ( 863) 74 25.4 36 KIAA0958 ( 428 res) hj05707 ( 428) 71 24.4 36 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 75 25.8 38 >>FLJ00105 ( 721 res) as00105 (721 aa) initn: 4789 init1: 4789 opt: 4789 Z-score: 5127.6 bits: 959.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 4789; 100.000% identity (100.000% similar) in 721 aa overlap (60-780:1-721) 30 40 50 60 70 80 FLJ000 SATSALWGLFCNGSQPSAACDEYFIQNNVTEIQGIPGAASGVFLENLWSTYAHAGAFVEK :::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 EIQGIPGAASGVFLENLWSTYAHAGAFVEK 10 20 30 90 100 110 120 130 140 FLJ000 KGVPSVPVAEESRASALPYVLTDIAASFTLLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 KGVPSVPVAEESRASALPYVLTDIAASFTLLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIP 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 FLJ000 TGTILAIVTTSFIYLSCIVLFGACIEGVVLRDKFGEALQGNLVIGMLAWPSPWVIVIGSF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 TGTILAIVTTSFIYLSCIVLFGACIEGVVLRDKFGEALQGNLVIGMLAWPSPWVIVIGSF 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 FLJ000 FSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIARDGIVPFLQVFGHGKANGEPTWALLLTVLICETGILIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 FSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIARDGIVPFLQVFGHGKANGEPTWALLLTVLICETGILIA 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 FLJ000 SLDSVAPILSMFFLMCYLFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFKFYHWTLSFLGMSLCLALMFI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 SLDSVAPILSMFFLMCYLFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFKFYHWTLSFLGMSLCLALMFI 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 FLJ000 CSWYYALSAMLIAGCIYKYIEYRGAEKEWGDGIRGLSLNAARYALLRVEHGPPHTKNWRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 CSWYYALSAMLIAGCIYKYIEYRGAEKEWGDGIRGLSLNAARYALLRVEHGPPHTKNWRP 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 FLJ000 QVLVMLNLDAEQAVKHPRLLSFTSQLKAGKGLTIVGSVLEGTYLDKHMEAQRAEENIRSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 QVLVMLNLDAEQAVKHPRLLSFTSQLKAGKGLTIVGSVLEGTYLDKHMEAQRAEENIRSL 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 FLJ000 MSTEKTKGFCQLVVSSSLRDGMSHLIQSAGLGGLKHNTVLMAWPASWKQEDNPFSWKNFV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 MSTEKTKGFCQLVVSSSLRDGMSHLIQSAGLGGLKHNTVLMAWPASWKQEDNPFSWKNFV 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 FLJ000 DTVRDTTAAHQALLVAKNVDSFPQNQERFGGGHIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRQHKVWR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 DTVRDTTAAHQALLVAKNVDSFPQNQERFGGGHIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRQHKVWR 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 FLJ000 KCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHLRISAEVEVVEMVENDISAFTYERTLMMEQR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 KCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHLRISAEVEVVEMVENDISAFTYERTLMMEQR 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 670 680 FLJ000 SQMLKQMQLSKNEQEREAQLIHDRNTASHTAAAARTQAPPTPDKVQMTWTREKLIAEKYR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 SQMLKQMQLSKNEQEREAQLIHDRNTASHTAAAARTQAPPTPDKVQMTWTREKLIAEKYR 580 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 FLJ000 SRDTSLSGFKDLFSMKPDQSNVRRMHTAVKLNGVVLNKSQDAQLVLLNMPGPPKNRQGDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 SRDTSLSGFKDLFSMKPDQSNVRRMHTAVKLNGVVLNKSQDAQLVLLNMPGPPKNRQGDE 640 650 660 670 680 690 750 760 770 780 FLJ000 NYMEFLEVLTEGLNRVLLVRGGGREVITIYS ::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ001 NYMEFLEVLTEGLNRVLLVRGGGREVITIYS 700 710 720 >>KIAA1176 ( 1101 res) hg02851a (1101 aa) initn: 3909 init1: 3076 opt: 3452 Z-score: 3694.1 bits: 694.8 E(): 1.4e-200 Smith-Waterman score: 3823; 69.891% identity (85.127% similar) in 827 aa overlap (1-773:275-1101) 10 20 30 FLJ000 DIPVCLLGNRTLSRRSFDACVKAYGIHNNS ..:.::::::::::..::.:.: :.. KIAA11 NKFALVFLGCVILSILAIYAGVIKSAFDPPNFPICLLGNRTLSRHGFDVCAKLAWEGNET 250 260 270 280 290 300 40 50 60 70 80 90 FLJ000 ATSALWGLFCNGSQPSAACDEYFIQNNVTEIQGIPGAASGVFLENLWSTYAHAGAFVEKK .:. ::::::.. .:.::::: .:::::::::::::::.. :::::.: :..::.. KIAA11 VTTRLWGLFCSSRFLNATCDEYFTRNNVTEIQGIPGAASGLIKENLWSSYLTKGVIVERS 310 320 330 340 350 360 100 110 120 130 140 FLJ000 GVPSVPVAEESRASA-LPYVLTDIAASFTLLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGDLKDAQKSIP :. :: .:. . . :::..:... :::::::::::::::::::::::::.::::::: KIAA11 GMTSVGLADGTPIDMDHPYVFSDMTSYFTLLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGDLRDAQKSIP 370 380 390 400 410 420 150 160 170 180 190 200 FLJ000 TGTILAIVTTSFIYLSCIVLFGACIEGVVLRDKFGEALQGNLVIGMLAWPSPWVIVIGSF :::::::.::: .:.: .:::::::::::::::::::..::::.: :::::::::::::: KIAA11 TGTILAIATTSAVYISSVVLFGACIEGVVLRDKFGEAVNGNLVVGTLAWPSPWVIVIGSF 430 440 450 460 470 480 210 220 230 240 250 260 FLJ000 FSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIARDGIVPFLQVFGHGKANGEPTWALLLTVLICETGILIA :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::. ::: ::::: KIAA11 FSTCGAGLQSLTGAPRLLQAISRDGIVPFLQVFGHGKANGEPTWALLLTACICEIGILIA 490 500 510 520 530 540 270 280 290 300 310 320 FLJ000 SLDSVAPILSMFFLMCYLFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFKFYHWTLSFLGMSLCLALMFI ::: :::::::::::::.:::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::: KIAA11 SLDEVAPILSMFFLMCYMFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFRYYHWTLSFLGMSLCLALMFI 550 560 570 580 590 600 330 340 350 360 370 380 FLJ000 CSWYYALSAMLIAGCIYKYIEYRGAEKEWGDGIRGLSLNAARYALLRVEHGPPHTKNWRP ::::::: :::::: :::::::::::::::::::::::.::::::::.:.:::::::::: KIAA11 CSWYYALVAMLIAGLIYKYIEYRGAEKEWGDGIRGLSLSAARYALLRLEEGPPHTKNWRP 610 620 630 640 650 660 390 400 410 420 430 440 FLJ000 QVLVMLNLDAEQAVKHPRLLSFTSQLKAGKGLTIVGSVLEGTYLDKHMEAQRAEENIRSL :.::.. .: .: : ::.:::.::::::::::::::::::::.:..: .::::::.:: : KIAA11 QLLVLVRVDQDQNVVHPQLLSLTSQLKAGKGLTIVGSVLEGTFLENHPQAQRAEESIRRL 670 680 690 700 710 720 450 460 470 480 490 500 FLJ000 MSTEKTKGFCQLVVSSSLRDGMSHLIQSAGLGGLKHNTVLMAWPASWKQEDNPFSWKNFV : .::.:::::.:.::.::::.::::::.:::::.:::::..:: .:.:... .:.::. KIAA11 MEAEKVKGFCQVVISSNLRDGVSHLIQSGGLGGLQHNTVLVGWPRNWRQKEDHQTWRNFI 730 740 750 760 770 780 510 520 530 540 550 560 FLJ000 DTVRDTTAAHQALLVAKNVDSFPQNQERFGGGHIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRQHKVWR . ::.:::.: ::::.:::. :: : :::. : :::::::::::::::::::::.::::: KIAA11 ELVRETTAGHLALLVTKNVSMFPGNPERFSEGSIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRHHKVWR 790 800 810 820 830 840 570 580 590 600 610 620 FLJ000 KCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHLRISAEVEVVEMVENDISAFTYERTLMMEQR ::.::::::::.::::::::::: :::::::.:::::::: :.::::.:::.::.:::: KIAA11 KCKMRIFTVAQMDDNSIQMKKDLTTFLYHLRITAEVEVVEMHESDISAYTYEKTLVMEQR 850 860 870 880 890 900 630 640 FLJ000 SQMLKQMQLSKNEQERE-----------------------------------------AQ ::.::::.:.:::.::: .: KIAA11 SQILKQMHLTKNEREREIQSITDESRGSIRRKNPANTRLRLNVPEETAGDSEEKPEEEVQ 910 920 930 940 950 960 650 660 670 680 690 700 FLJ000 LIHDRNTASHTAAAARTQAPPT------PDKVQMTWTREKLIAEKYRS-RDTSLSGFKDL ::::... : ... : :.::..:::..: .::: .. .: :.::. KIAA11 LIHDQSAPSCPSSSPSPGEEPEGEGETDPEKVHLTWTKDKSVAEKNKGPSPVSSEGIKDF 970 980 990 1000 1010 1020 710 720 730 740 750 FLJ000 FSMKPD-----QSNVRRMHTAVKLNGVVLNKSQDAQLVLLNMPGPPKNRQGDENYMEFLE :::::. :::::::::::.:: :...::.::.:::::::: :.::.:::::::::: KIAA11 FSMKPEWENLNQSNVRRMHTAVRLNEVIVKKSRDAKLVLLNMPGLPRNRNGDENYMEFLE 1030 1040 1050 1060 1070 1080 760 770 780 FLJ000 VLTEGLNRVLLVRGGGREVITIYS :::: :.::.::::::: KIAA11 VLTEHLDRVMLVRGGGR 1090 1100 >>FLJ00100 ( 672 res) as00100 (672 aa) initn: 660 init1: 220 opt: 650 Z-score: 696.2 bits: 139.4 E(): 1.4e-33 Smith-Waterman score: 685; 28.366% identity (58.169% similar) in 557 aa overlap (111-608:19-559) 90 100 110 120 130 140 FLJ000 AHAGAFVEKKGVPSVPVAEESRASALPYVLTDIAASFTLLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGD : . .:. . .. : . ::::::.: ::. FLJ001 CTLLPGRILLAGYAEDYTTGAVMNFASVFAVLFNGCTGIMAGANMSGE 10 20 30 40 150 160 170 180 190 200 FLJ000 LKDAQKSIPTGTILAIVTTSFIYLSCIVLFGACIEGVVLRDKFGEALQGNLVIGMLAWPS ::: ...:: :::.:.. : :.:. . : . . ..:.. .: . .. :: FLJ001 LKDPSRAIPLGTIVAVAYTFFVYVLLFFLSSFTCDRTLLQEDYG------FFRAISLWP- 50 60 70 80 90 100 210 220 230 240 250 FLJ000 PWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIARDGIVPFLQVFGHGKA---NGEPTWALLL : ...:: . .. .:...:: :: :.:.:.::: . : ... .:. .:.: :.: FLJ001 P-LVLIGIYATALSASMSSLIGASRILHALARDDL--FGVILAPAKVVSRGGNPWAAVLY 110 120 130 140 150 260 270 280 290 300 310 FLJ000 TVLICETGILIASLDSVAPILSMFFLMCYLFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFKFYHWTLSF . . . .: ..:...: ....:.:. : :.:.: .::.:: :... : . FLJ001 SWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLSLEWASAPNFRPTFSLFSWHTCL 160 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 FLJ000 LGMSLCLALMFICSWYYALSAMLIAGCIYKYIEYRGAEKEWGDGIRGLSLNAARYALLRV ::.. :: .::. : : ...:. : . . ::. . :: ..: .. .: :::. FLJ001 LGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGPSSWGYVSQALLFHQVRKYLLRL 220 230 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 FLJ000 EHGPPHTKNWRPQVLVMLNLDAEQAVKHPRLLSFTSQLKAGKGLTIVGSVLEGTYLDK-- . :.: ::::.:.... . . :. : :: ...::: : :: ..: : : ::. FLJ001 DVRKDHVKFWRPQLLLLVG-NPRGAL--P-LLRLANQLKKG-GLYVLGHVTLGD-LDSLP 280 290 300 310 320 330 440 450 460 470 480 490 FLJ000 HMEAQRAEENIRSLMSTEKTKGFCQLVVSSSLRDGMSHLIQSAGLGGLKHNTVLMAW--- .: ::.. ..:.: .:..: :.:.: .::.. .::::.: ::..... FLJ001 SDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQHLLRISGLGGMKPNTLVLGFYDD 340 350 360 370 380 390 500 510 FLJ000 ----------PA------SWKQEDNP-----------------FSWKNFVDTVRDTTAAH :: : .. ..: .. ...: :: :. . FLJ001 APPQDHFLTDPAFSEPADSTREGSSPALSTLFPPPRAPGSPRALNPQDYVATVADALKMN 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 FLJ000 QALLVAKNVDSFPQNQERFGGG------HIDVW---WIVHDGG---------MLMLLPFL . ...:. ..: .. :.: :.::: . :: .:. . . FLJ001 KNVVLARASGALPPERLSRGSGGTSQLHHVDVWPLNLLRPRGGPGYVDVCGLFLLQMATI 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 FLJ000 LRQHKVWRKCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHLRISAEVEVVEMVENDISAFTYE : . .:.. :.::: . . :. .: .::: :::. : FLJ001 LGMVPAWHSARLRIFLCLGPREAPGAAEGRLRALLSQLRIRAEVQEVVWGEGAGAGEPEA 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 670 680 FLJ000 RTLMMEQRSQMLKQMQLSKNEQEREAQLIHDRNTASHTAAAARTQAPPTPDKVQMTWTRE FLJ001 EEEGDFVNSGRGDAEAEALARSANALVRAQQGRGTGGGPGGPEGGDAEGPITALTFLYLP 580 590 600 610 620 630 >>FLJ00010 ( 772 res) as00010 (772 aa) initn: 689 init1: 220 opt: 650 Z-score: 695.6 bits: 139.5 E(): 1.5e-33 Smith-Waterman score: 685; 28.366% identity (58.169% similar) in 557 aa overlap (111-608:119-659) 90 100 110 120 130 140 FLJ000 AHAGAFVEKKGVPSVPVAEESRASALPYVLTDIAASFTLLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGD : . .:. . .. : . ::::::.: ::. FLJ000 SLPPRFGHFTGFNSSTLKDNLGAGYAEDYTTGAVMNFASVFAVLFNGCTGIMAGANMSGE 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 FLJ000 LKDAQKSIPTGTILAIVTTSFIYLSCIVLFGACIEGVVLRDKFGEALQGNLVIGMLAWPS ::: ...:: :::.:.. : :.:. . : . . ..:.. .: . .. :: FLJ000 LKDPSRAIPLGTIVAVAYTFFVYVLLFFLSSFTCDRTLLQEDYG------FFRAISLWP- 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 FLJ000 PWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIARDGIVPFLQVFGHGKA---NGEPTWALLL : ...:: . .. .:...:: :: :.:.:.::: . : ... .:. .:.: :.: FLJ000 P-LVLIGIYATALSASMSSLIGASRILHALARDDL--FGVILAPAKVVSRGGNPWAAVLY 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 FLJ000 TVLICETGILIASLDSVAPILSMFFLMCYLFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFKFYHWTLSF . . . .: ..:...: ....:.:. : :.:.: .::.:: :... : . FLJ000 SWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLSLEWASAPNFRPTFSLFSWHTCL 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 FLJ000 LGMSLCLALMFICSWYYALSAMLIAGCIYKYIEYRGAEKEWGDGIRGLSLNAARYALLRV ::.. :: .::. : : ...:. : . . ::. . :: ..: .. .: :::. FLJ000 LGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGPSSWGYVSQALLFHQVRKYLLRL 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 FLJ000 EHGPPHTKNWRPQVLVMLNLDAEQAVKHPRLLSFTSQLKAGKGLTIVGSVLEGTYLDK-- . :.: ::::.:.... . . :. : :: ...::: : :: ..: : : ::. FLJ000 DVRKDHVKFWRPQLLLLVG-NPRGAL--P-LLRLANQLKKG-GLYVLGHVTLGD-LDSLP 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 FLJ000 HMEAQRAEENIRSLMSTEKTKGFCQLVVSSSLRDGMSHLIQSAGLGGLKHNTVLMAW--- .: ::.. ..:.: .:..: :.:.: .::.. .::::.: ::..... FLJ000 SDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQHLLRISGLGGMKPNTLVLGFYDD 440 450 460 470 480 490 500 510 FLJ000 ----------PA------SWKQEDNP-----------------FSWKNFVDTVRDTTAAH :: : .. ..: .. ...: :: :. . FLJ000 APPQDHFLTDPAFSEPADSTREGSSPALSTLFPPPRAPGSPRALNPQDYVATVADALKMN 500 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 FLJ000 QALLVAKNVDSFPQNQERFGGG------HIDVW---WIVHDGG---------MLMLLPFL . ...:. ..: .. :.: :.::: . :: .:. . . FLJ000 KNVVLARASGALPPERLSRGSGGTSQLHHVDVWPLNLLRPRGGPGYVDVCGLFLLQMATI 560 570 580 590 600 610 570 580 590 600 610 620 FLJ000 LRQHKVWRKCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHLRISAEVEVVEMVENDISAFTYE : . .:.. :.::: . . :. .: .::: :::. : FLJ000 LGMVPAWHSARLRIFLCLGPREAPGAAEGRLRALLSQLRIRAEVQEVVWGEGAGAGEPEA 620 630 640 650 660 670 630 640 650 660 670 680 FLJ000 RTLMMEQRSQMLKQMQLSKNEQEREAQLIHDRNTASHTAAAARTQAPPTPDKVQMTWTRE FLJ000 EEEGDFVNSGRGDAEAEALARSANALVRAQQGRGTGGGPGGPEGGDAEGPITALTFLYLP 680 690 700 710 720 730 >>FLJ00379 ( 487 res) sj00523 (487 aa) initn: 358 init1: 220 opt: 415 Z-score: 446.0 bits: 92.6 E(): 1.2e-19 Smith-Waterman score: 446; 27.068% identity (55.890% similar) in 399 aa overlap (266-608:35-427) 240 250 260 270 280 290 FLJ000 VPFLQVFGHGKANGEPTWALLLTVLICETGILIASLDSVAPILSMFFLMCYLFVNLACAV .: ..:...: ....:.:. : :.:.: FLJ003 HWHSLVFTGILGVHWHFGTTARLLALAQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLS 10 20 30 40 50 60 300 310 320 330 340 350 FLJ000 QTLLRTPNWRPRFKFYHWTLSFLGMSLCLALMFICSWYYALSAMLIAGCIYKYIEYRGAE .::.:: :... : .::.. :: .::. : : ...:. : . . ::. FLJ003 LEWASAPNFRPTFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGP 70 80 90 100 110 120 360 370 380 390 400 410 FLJ000 KEWGDGIRGLSLNAARYALLRVEHGPPHTKNWRPQVLVMLNLDAEQAVKHPRLLSFTSQL . :: ..: .. .: :::.. :.: ::::.:.... . . :. : :: ...:: FLJ003 SSWGYVSQALLFHQVRKYLLRLDVRKDHVKFWRPQLLLLVG-NPRGAL--P-LLRLANQL 130 140 150 160 170 180 420 430 440 450 460 470 FLJ000 KAGKGLTIVGSVLEGTYLDK--HMEAQRAEENIRSLMSTEKTKGFCQLVVSSSLRDGMSH : : :: ..: : : ::. .: ::.. ..:.: .:..: :.:.: .: FLJ003 KKG-GLYVLGHVTLGD-LDSLPSDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQH 190 200 210 220 230 480 490 500 FLJ000 LIQSAGLGGLKHNTVLMAW-------------PA------SWKQEDNP------------ :.. .::::.: ::..... :: : .. ..: FLJ003 LLRISGLGGMKPNTLVLGFYDDAPPQDHFLTDPAFSEPADSTREGSSPALSTLFPPPRAP 240 250 260 270 280 290 510 520 530 540 FLJ000 -----FSWKNFVDTVRDTTAAHQALLVAKNVDSFPQNQERFGGG------HIDVWWI--- .. ...: :: :. .. ...:. ..: .. :.: :.::: . FLJ003 GSPRALNPQDYVATVADALKMNKNVVLARASGALPPERLSRGSGGTSQLHHVDVWPLNLL 300 310 320 330 340 350 550 560 570 580 590 FLJ000 --------VHDGGMLML-LPFLLRQHKVWRKCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHL : :...: . .: . .:.. :.::: . . :. .. .: FLJ003 RPRGGPGYVDVCGLFLLQMATILGMVPAWHSARLRIFLCLGPREAPGAAEGRLRALVSQL 360 370 380 390 400 410 600 610 620 630 640 650 FLJ000 RISAEVEVVEMVENDISAFTYERTLMMEQRSQMLKQMQLSKNEQEREAQLIHDRNTASHT :: :::. : FLJ003 RIRAEVQEVVWGEGAGAGEPEAEEEGDFVNSGRGDAEAEALARSANALVRAQQGARHRRR 420 430 440 450 460 470 >>FLJ00009 ( 540 res) as00009 (540 aa) initn: 413 init1: 220 opt: 415 Z-score: 445.6 bits: 92.7 E(): 1.3e-19 Smith-Waterman score: 450; 27.318% identity (55.890% similar) in 399 aa overlap (266-608:35-427) 240 250 260 270 280 290 FLJ000 VPFLQVFGHGKANGEPTWALLLTVLICETGILIASLDSVAPILSMFFLMCYLFVNLACAV .: ..:...: ....:.:. : :.:.: FLJ000 HWHSLVFTGILGVHWHFGTTARLLALAQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAYAAVDLSCLS 10 20 30 40 50 60 300 310 320 330 340 350 FLJ000 QTLLRTPNWRPRFKFYHWTLSFLGMSLCLALMFICSWYYALSAMLIAGCIYKYIEYRGAE .::.:: :... : .::.. :: .::. : : ...:. : . . ::. FLJ000 LEWASAPNFRPTFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLAALLTARGGP 70 80 90 100 110 120 360 370 380 390 400 410 FLJ000 KEWGDGIRGLSLNAARYALLRVEHGPPHTKNWRPQVLVMLNLDAEQAVKHPRLLSFTSQL . :: ..: .. .: :::.. :.: ::::.:.... . . :. : :: ...:: FLJ000 SSWGYVSQALLFHQVRKYLLRLDVRKDHVKFWRPQLLLLVG-NPRGAL--P-LLRLANQL 130 140 150 160 170 180 420 430 440 450 460 470 FLJ000 KAGKGLTIVGSVLEGTYLDK--HMEAQRAEENIRSLMSTEKTKGFCQLVVSSSLRDGMSH : : :: ..: : : ::. .: ::.. ..:.: .:..: :.:.: .: FLJ000 KKG-GLYVLGHVTLGD-LDSLPSDPVQPQYGAWLSLVDRAQVKAFVDLTLSPSVRQGAQH 190 200 210 220 230 480 490 500 FLJ000 LIQSAGLGGLKHNTVLMAW-------------PA------SWKQEDNP------------ :.. .::::.: ::..... :: : .. ..: FLJ000 LLRISGLGGMKPNTLVLGFYDDAPPQDHFLTDPAFSEPADSTREGSSPALSTLFPPPRAP 240 250 260 270 280 290 510 520 530 540 FLJ000 -----FSWKNFVDTVRDTTAAHQALLVAKNVDSFPQNQERFGGG------HIDVWWI--- .. ...: :: :. .. ...:. ..: .. :.: :.::: . FLJ000 GSPRALNPQDYVATVADALKMNKNVVLARASGALPPERLSRGSGGTSQLHHVDVWPLNLL 300 310 320 330 340 350 550 560 570 580 590 FLJ000 --------VHDGGMLML-LPFLLRQHKVWRKCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHL : :...: . .: . .:.. :.::: . . :. .: .: FLJ000 RPRGGPGYVDVCGLFLLQMATILGMVPAWHSARLRIFLCLGPREAPGAAEGRLRALLSQL 360 370 380 390 400 410 600 610 620 630 640 650 FLJ000 RISAEVEVVEMVENDISAFTYERTLMMEQRSQMLKQMQLSKNEQEREAQLIHDRNTASHT :: :::. : FLJ000 RIRAEVQEVVWGEGAGAGEPEAEEEGDFVNSGRGDAEAEALARSANALVRAQQGRGTGGG 420 430 440 450 460 470 >>FLJ00059 ( 477 res) as00059 (477 aa) initn: 388 init1: 195 opt: 328 Z-score: 353.0 bits: 75.4 E(): 1.8e-14 Smith-Waterman score: 363; 27.019% identity (54.039% similar) in 359 aa overlap (306-608:12-364) 280 290 300 310 320 330 FLJ000 PILSMFFLMCYLFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFKFYHWTLSFLGMSLCLALMFICSWYYA : :... : .::.. :: .::. : : FLJ000 VSVPPPLHARSPTFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAA 10 20 30 40 340 350 360 370 380 390 FLJ000 LSAMLIAGCIYKYIEYRGAEKEWGDGIRGLSLNAARYALLRVEHGPPHTKNWRPQVLVML ...:. : . . ::. . :: ..: .. .: :::.. :.: ::::.:... FLJ000 GGSLLLMGLLAALLTARGGPSSWGYVSQALLFHQVRKYLLRLDVRKDHVKFWRPQLLLLV 50 60 70 80 90 100 400 410 420 430 440 450 FLJ000 NLDAEQAVKHPRLLSFTSQLKAGKGLTIVGSVLEGTYLDK--HMEAQRAEENIRSLMSTE . . . :. : :: ...::: : :: ..: : : ::. .: ::.. FLJ000 G-NPRGAL--P-LLRLANQLKKG-GLYVLGHVTLGD-LDSLPSDPVQPQYGAWLSLVDRA 110 120 130 140 150 460 470 480 490 FLJ000 KTKGFCQLVVSSSLRDGMSHLIQSAGLGGLKHNTVLMAW-------------PA------ ..:.: .:..: :.:.: .::.. .::::.: ::..... :: FLJ000 QVKAFVDLTLSPSVRQGAQHLLRISGLGGMKPNTLVLGFYDDAPPQDHFLTDPAFSEPAD 160 170 180 190 200 210 500 510 520 530 FLJ000 SWKQEDNP-----------------FSWKNFVDTVRDTTAAHQALLVAKNVDSFPQNQER : .. ..: .. ...: :: :. .. ...:. ..: .. FLJ000 STREGSSPALSTLFPPPRAPGSPRALNPQDYVATVADALKMNKNVVLARASGALPPERLS 220 230 240 250 260 270 540 550 560 570 FLJ000 FGGG------HIDVW---WIVHDGG---------MLMLLPFLLRQHKVWRKCRMRIFTVA :.: :.::: . :: .:. . .: . .:.. :.::: FLJ000 RGSGGTSQLHHVDVWPLNLLRPRGGPGYVDVCGLFLLQMATILGMVPAWHSARLRIFLCL 280 290 300 310 320 330 580 590 600 610 620 630 FLJ000 QVDDNSIQMKKDLQMFLYHLRISAEVEVVEMVENDISAFTYERTLMMEQRSQMLKQMQLS . . :. .: .::: :::. : FLJ000 GPREAPGAAEGRLRALLSQLRIRAEVQEVVWGEGAGAGEPEAEEEGDFVNSGRGDAEAEA 340 350 360 370 380 390 >>KIAA1613 ( 686 res) fj12845 (686 aa) initn: 97 init1: 60 opt: 123 Z-score: 131.8 bits: 35.0 E(): 0.038 Smith-Waterman score: 132; 24.352% identity (55.440% similar) in 193 aa overlap (109-300:176-352) 80 90 100 110 120 130 FLJ000 TYAHAGAFVEKKGVPSVPVAEESRASALPYVLTDIAASFTLLVGIYFPSVTGIMAGSNRS :: :. : ..:. . ..:: : KIAA16 VWVFIMIAGLFFINGKYWAEGQFLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEA----- 150 160 170 180 190 200 140 150 160 170 180 190 FLJ000 GDLKDAQKSIPTGTILAIVTTSFIYLSCIVLFGACIEGVVLRDKFGEALQGNLVIGMLAW :. . ::: . ..: :.: :.. . .. : . .. .. :. : KIAA16 ---KNPNTSIPYAITASLVICLTAYVSVSVILTLMVPYYTI-DTESPLMEMFVAHGFYA- 210 220 230 240 250 200 210 220 230 240 250 FLJ000 PSPWVIVIGSFFSTCGAGLQSLTGAPRLLQAIARDGIVPFLQVFGHGKANGE-PTWALLL . .:..::: . . : :: ::.. :.: ::. ... ..: .. : :. : .. KIAA16 -AKFVVAIGSVAGLTVSLLGSLFPMPRVIYAMAGDGL--LFRFLAHVSSYTETPVVACIV 260 270 280 290 300 310 260 270 280 290 300 310 FLJ000 TVLICETGILIASLDSVAPILSMFFLMCYLFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFKFYHWTLSF . .. :..:: .. ..:. :. : .:.. :.. ::: KIAA16 SGFLAALLALLVSLRDLIEMMSIGTLLAYTLVSV-CVL--LLRYQPESDIDGFVKFLSEE 320 330 340 350 360 320 330 340 350 360 370 FLJ000 LGMSLCLALMFICSWYYALSAMLIAGCIYKYIEYRGAEKEWGDGIRGLSLNAARYALLRV KIAA16 HTKKKEGILADCEKEACSPVSEGDEFSGPATNTCGAKNLPSLGDNEMLIGKSDKSTYNVN 370 380 390 400 410 420 >>KIAA1565 ( 1313 res) bf00184 (1313 aa) initn: 41 init1: 41 opt: 101 Z-score: 105.3 bits: 31.0 E(): 1.1 Smith-Waterman score: 108; 20.690% identity (50.958% similar) in 261 aa overlap (393-653:265-510) 370 380 390 400 410 420 FLJ000 RGLSLNAARYALLRVEHGPPHTKNWRPQVLVMLNLDAEQAVKHPRLLSFTSQLKAGKGLT :. ::: . ... . : . .: ::.:: KIAA15 TRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVDGEMLEEVFHNLDPDGTMSVEDF--FYGLFKNGKSLT 240 250 260 270 280 290 430 440 450 460 470 480 FLJ000 IVGSVLEGTYLDKHMEAQRAEENIRSLMSTEKTKGFCQLVVSSSLRDGMSHLIQSAGLGG .:. : .:. : .:. : .. . . : : : :::.: : KIAA15 PSAST-PYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTSSAMTSTIGFRVFSCLDDGMGHASVERILDT 300 310 320 330 340 350 490 500 510 520 530 540 FLJ000 LKHNTVLMAWPASWKQEDNPFSWKNFVDTVRDTTAAHQALLVAKNVDSFPQNQERFGGGH ... . . : : :: . .. .. : : .. :::.:: .: ... . KIAA15 WQEEGIENSQEI-LKALD--FSLDGNINLTELTLALENELLVTKN----SIHQAALASFK 360 370 380 390 400 550 560 570 580 590 600 FLJ000 IDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRQHKVWRKCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHLRIS .. ... ... ::. . . ... . ...:::. ... . :.:: KIAA15 AEIRHLLERVDQVVREKEKLRSD-LDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNE---YNLRKL 410 420 430 440 450 460 610 620 630 640 650 660 FLJ000 AEVEVVEMVENDISAFTYERTLMMEQRSQMLKQMQLSKNEQEREAQLIHDRNTASHTAAA : : : . . . :: ...: ... ... .. . : . :.:: KIAA15 DE-EYKERIAALKNELRKEREQILQQAGKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLALSLKENS 470 480 490 500 510 670 680 690 700 710 720 FLJ000 ARTQAPPTPDKVQMTWTREKLIAEKYRSRDTSLSGFKDLFSMKPDQSNVRRMHTAVKLNG KIAA15 RLENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLTQMRNEYE 520 530 540 550 560 570 >>KIAA1164 ( 390 res) hk00541 (390 aa) initn: 80 init1: 52 opt: 89 Z-score: 98.0 bits: 27.9 E(): 2.9 Smith-Waterman score: 100; 26.852% identity (60.185% similar) in 108 aa overlap (597-689:263-370) 570 580 590 600 610 620 FLJ000 VWRKCRMRIFTVAQVDDNSIQMKKDLQMFLYHLRISAEVEVVEMVENDI--SAFTYERTL .::: .. :.: ..: . . . .: KIAA11 VTDQGFLTEEKVVWESLHNVDGDGNFCDSEFHLRPPSDPETVYKGQQDQIDQDYLMALSL 240 250 260 270 280 290 630 640 650 660 670 FLJ000 MMEQRSQMLK---------QMQLSKNEQERE----AQLIHDRNTASHTAAAARTQAPPTP ..::.:: .. ...:.:. ::.: .: .... :. .:::: ::: : KIAA11 QQEQQSQEINWEQIPEGISDLELAKKLQEEEDRRASQYYQEQEQAAAAAAAASTQAQGQP 300 310 320 330 340 350 680 690 700 710 720 730 FLJ000 DKVQMTWTREKLIAEKYRSRDTSLSGFKDLFSMKPDQSNVRRMHTAVKLNGVVLNKSQDA ... . :.. .:. : KIAA11 AQASPSSGRQSGNSERKRKEPREKDKEKEKEKNSCVIL 360 370 380 390 780 residues in 1 query sequences 2210214 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:33:54 2009 done: Fri Feb 27 10:33:55 2009 Total Scan time: 0.710 Total Display time: 0.200 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]