# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00093.fasta.huge -Q ../query/FLJ00093.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00093, 977 aa vs ./tmplib.10216 library 2210017 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9840+/-0.0085; mu= -6.3183+/- 0.569 mean_var=520.9521+/-118.688, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.056192 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00020 ( 1142 res) as00020 (1142) 6227 520.0 8.1e-148 FLJ00281 ( 1495 res) sh01915 (1495) 5536 464.1 7e-131 KIAA1968 ( 860 res) fk04713 ( 860) 2055 181.6 4.4e-46 FLJ00356 ( 851 res) sh02495 ( 851) 1962 174.1 8.2e-44 KIAA2011 ( 1091 res) pj02017 (1091) 250 35.4 0.057 KIAA0339 ( 1709 res) hg01304(revised) (1709) 237 34.6 0.16 KIAA0929 ( 1663 res) hh03374 (1663) 222 33.4 0.36 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 216 32.6 0.38 KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217) 213 32.5 0.49 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 207 32.1 0.8 KIAA0845 ( 1034 res) hk05234s1 (1034) 200 31.3 0.92 KIAA1187 ( 813 res) fk03027 ( 813) 197 30.9 0.94 KIAA1866 ( 1783 res) pf09734 (1783) 199 31.5 1.4 KIAA0819 ( 989 res) hh01037 ( 989) 189 30.4 1.7 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 187 30.3 2 FLJ00248 ( 501 res) sj08681 ( 501) 175 28.9 2.4 KIAA0618 ( 1052 res) hg03971 (1052) 182 29.9 2.6 KIAA1375 ( 546 res) fj04426 ( 546) 169 28.5 3.6 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 178 30.0 5.1 FLJ00353 ( 1766 res) sh01144 (1766) 174 29.5 5.5 KIAA0346 ( 1682 res) hg01508s1 (1682) 173 29.4 5.7 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 169 29.0 6.4 KIAA0771 ( 948 res) hk05113 ( 948) 164 28.4 6.6 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 161 28.0 7.2 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 163 28.4 7.8 FLJ00253 ( 349 res) sj09455 ( 349) 150 26.7 7.8 KIAA1306 ( 1154 res) fh05845 (1154) 163 28.4 7.9 KIAA0495 ( 209 res) hg00106 ( 209) 142 25.7 9 KIAA1858 ( 2469 res) ae00147 (2469) 167 29.1 10 KIAA1887 ( 967 res) fk02232 ( 967) 156 27.7 10 KIAA1856 ( 1134 res) fh03203 (1134) 157 27.9 11 KIAA0900 ( 503 res) hk09606s1 ( 503) 148 26.7 11 KIAA1071 ( 675 res) hj05664s2 ( 675) 148 26.9 13 KIAA0268 ( 1193 res) ha07061 (1193) 154 27.7 13 KIAA0680 ( 635 res) hk02746 ( 635) 146 26.7 14 KIAA1509 ( 1365 res) fh14721 (1365) 154 27.7 15 KIAA0867 ( 568 res) hk06783 ( 568) 144 26.5 15 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 162 28.8 15 KIAA1883 ( 1480 res) fh02249 (1480) 154 27.8 15 KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174) 151 27.4 16 KIAA1662 ( 1653 res) fj03879s1 (1653) 154 27.9 16 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 146 26.8 17 KIAA1986 ( 334 res) pg00636 ( 334) 136 25.5 17 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 156 28.2 18 KIAA0079 ( 1102 res) ha03543 (1102) 148 27.1 18 KIAA1914 ( 460 res) fk06306 ( 460) 138 25.9 18 KIAA1855 ( 1270 res) fg04654 (1270) 149 27.3 18 KIAA1862 ( 1070 res) aj00563 (1070) 146 27.0 20 KIAA1543 ( 917 res) hh05613a ( 917) 144 26.7 20 FLJ00260 ( 922 res) sh05833 ( 922) 144 26.7 20 >>FLJ00020 ( 1142 res) as00020 (1142 aa) initn: 6227 init1: 6227 opt: 6227 Z-score: 2747.1 bits: 520.0 E(): 8.1e-148 Smith-Waterman score: 6232; 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KIAA20 ATLFGGPADTGFLNQGDTWSSPREVSSHAQRIARAKWEFFYGSLDPPSSGAKPPEQAPPS 280 290 300 310 320 330 690 700 710 720 730 740 FLJ000 PPGRQRARSSSVPREVLRLSLSSESELPSLPLFSEKSKTTKDSPQAARDGKRGV-----G ::: ..:.: : : . ::..: ..:: . .: : : :. .. . KIAA20 PPGVGSRQGSGV--AVGRAAKYSETDLDTVPLRCYR-ETDIDEVLAEREEADSAIESQPS 340 350 360 370 380 750 760 770 780 790 800 FLJ000 SAGWPDRVTFRGQYTGHEYHVLSPKAVPK-GNGTVSCPHCRPIRTQDAGGAVTGDPLGPP : : : . . : : :. :.:. . . .:. : : KIAA20 SEGPPGTAYPPAPRPGPL-----PGPHPSLGSGNEDEDDDEAGGEEDVDDEVFEASEGAR 390 400 410 420 430 440 810 820 830 840 850 860 FLJ000 PADT--LQCPLCGQVGSPPEADGPGSATSGAEKATTRRKAPSTPSPKQRSKQAGSSPRPP :.. :. :. :. : :::: : . : ..: .: . : .: .:: : KIAA20 PGSRMPLKSPVPFLPGTSPSADGPDSFSCVFEAILESHRAKGTSYTSLASLEALASPGPT 450 460 470 480 490 500 870 880 890 900 910 FLJ000 PGLWYLATAPPAPAPPAFAYISSVPIMPYPP-AAVYYAPAGPTS-------AQPAAKWPP . .. :: : : . .:. : : ... : :: . :. :: : KIAA20 QSPFFTFELPPQPPAPRPDPPAPAPLAPLEPDSGTSSAADGPWTQRGEEEEAEARAKLAP 510 520 530 540 550 560 920 930 940 950 960 FLJ000 TASPPPARRHRHSIQLD---LGDLEELNKALSRAVQAAESVR----STTRQMRSSLSADL :: . . :. : ::. :.. .: . . .:.. ..: . .. .::: KIAA20 GREPPSPCHSEDSLGLGAAPLGSEPPLSQLVSDSDSELDSTERLALGSTDTLSNGQKADL 570 580 590 600 610 620 970 FLJ000 RQAHSLRGSCLF . :. : KIAA20 EAAQRLAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNNDFSKLVAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKE 630 640 650 660 670 680 >>KIAA0339 ( 1709 res) hg01304(revised) (1709 aa) initn: 171 init1: 104 opt: 237 Z-score: 120.8 bits: 34.6 E(): 0.16 Smith-Waterman score: 243; 25.106% identity (47.447% similar) in 470 aa overlap (461-918:248-656) 440 450 460 470 480 FLJ000 SGISERLPQKPLHRGGGPHLEETWMASPETDSGFVGSETSRVSPLTQ-TPEHRLSHISTA :..: .:. . : . : ::. :. KIAA03 SRRRSSSDTAAYPAGTTAVGTPGNGTPCSQDTSFSSSRQDTPSSFGQFTPQ------SSQ 220 230 240 250 260 270 490 500 510 520 530 540 FLJ000 GTLAQPFAA--SVP--RDGA-SYPKARGSLIPRRATEPSTPRSQAQRYLSSPSGPLRQRA :: :... :.: .:.: : . :. ::: .: : . ..:..:. :. . . KIAA03 GT---PYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTSFKPRR-SENSYQDAFSRRHFSASSA---STT 280 290 300 310 320 550 560 570 580 590 600 FLJ000 PNFSLERTLAAEMAVPGSEFE-GHKRISEQPLPNKTISPPPAPAPAAAPLPCGPTETIPS . .. : :: . .: . . : . .. . : :: . . : KIAA03 ASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFRSSDANYPAYYE-SWNRYQRHTS 330 340 350 360 370 380 610 620 630 640 650 660 FLJ000 FLLTRAGRDQAI-CELQEEVSRLRLRLEDSLHQPLQGSPTRPASAFDRPARTRGRPADSP . :: :.. . :.... :. : . : :.::.. :: ... : . : KIAA03 YPPRRATREEPPGAPFAENTAE---RFPPSYTSYLPPEPSRPTDQDYRPPASEAPPPEPP 390 400 410 420 430 440 670 680 690 700 710 720 FLJ000 ATWGSHYGSKSTERLPGEPRGEEQIVPPGRQRARSSSVPREVLRLSL--SSESELPSLPL :. :. :. : : . : . :::.: :. :. ...: : : KIAA03 EPGGGGGGGG-----PSPEREEVRTSPRPASPARSGSPAPETTNESVPFAQHSSLDSRIE 450 460 470 480 490 730 740 750 760 770 FLJ000 FSEKSKTTKDSPQAARDGKRGVGSAGWPDRVTFRGQYTGHEYHVLSPKAVPKGNGTVSC- . : . .: : :. .. .:. ... .. :: : ::.:.: : KIAA03 MLLKEQRSKFSFLASDTEEEEENSS-----MVLGARDTGSE--------VPSGSGHGPCT 500 510 520 530 540 780 790 800 810 820 830 FLJ000 PHCRPIRTQDAGGAVTGDPLGPPPADTLQCPLCGQVGSPPEADGPGSATSGAEKATTRRK : : .:. : ::. : : : . :: . : ..: : ... . 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