# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00088.fasta.huge -Q ../query/FLJ00088.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00088, 925 aa vs ./tmplib.10216 library 2210069 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.0503+/-0.00354; mu= 20.5734+/- 0.239 mean_var=79.1450+/-17.472, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.144166 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0088 ( 943 res) ha01225 ( 943) 2893 612.2 1.1e-175 KIAA1161 ( 680 res) hj01210s1 ( 680) 242 60.7 8.5e-10 KIAA1878 ( 453 res) pj01649 ( 453) 114 33.8 0.069 FLJ00286 ( 576 res) sh02369 ( 576) 101 31.2 0.52 FLJ00285 ( 829 res) sh02320 ( 829) 101 31.4 0.64 KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380) 102 32.0 0.75 KIAA0203 ( 1593 res) ha02320 (1593) 102 32.0 0.82 KIAA1864 ( 660 res) fj07836 ( 660) 85 28.0 5.7 KIAA1680 ( 902 res) fh23414 ( 902) 85 28.2 6.8 KIAA1899 ( 1032 res) fk06803s1 (1032) 84 28.0 8.5 KIAA0376 ( 885 res) hh00388 ( 885) 81 27.3 12 KIAA1892 ( 476 res) fk04164 ( 476) 78 26.3 13 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 82 27.9 14 KIAA1544 ( 1028 res) fh02556 (1028) 80 27.2 15 KIAA1725 ( 1042 res) pf00950 (1042) 80 27.2 15 KIAA0791 ( 1357 res) hk05655 (1357) 81 27.6 15 KIAA1343 ( 520 res) fj00420 ( 520) 77 26.2 16 KIAA0911 ( 1056 res) hj05129(revised) (1056) 79 27.0 18 KIAA1218 ( 864 res) fh03016 ( 864) 78 26.7 18 KIAA0752 ( 334 res) hk04439 ( 334) 74 25.3 19 KIAA1136 ( 596 res) hj01467 ( 596) 76 26.1 19 KIAA1575 ( 1010 res) fj01374s1 (1010) 78 26.8 20 KIAA0508 ( 253 res) hh00207 ( 253) 72 24.7 21 KIAA1421 ( 1463 res) hk08067(revised) (1463) 79 27.2 21 KIAA0463 ( 1963 res) hg00942 (1963) 80 27.6 22 KIAA1252 ( 580 res) hh09572 ( 580) 75 25.8 22 KIAA0531 ( 999 res) hg03072 ( 999) 77 26.6 23 FLJ00400 ( 782 res) sj07486 ( 782) 76 26.2 23 KIAA1943 ( 1054 res) fh10956 (1054) 77 26.6 24 KIAA0107 ( 397 res) ha00588 ( 397) 73 25.2 24 KIAA1283 ( 1884 res) hh05359(revised) (1884) 79 27.4 25 FLJ00120 ( 1171 res) as00120 (1171) 77 26.7 25 KIAA0974 ( 565 res) hj06874 ( 565) 74 25.6 25 KIAA1345 ( 1532 res) fj00488 (1532) 78 27.0 25 KIAA0769 ( 746 res) hk05035 ( 746) 75 26.0 26 KIAA0225 ( 2013 res) ha02515 (2013) 79 27.4 26 FLJ00357 ( 628 res) sh02980 ( 628) 74 25.7 27 FLJ00124 ( 118 res) sh00874 ( 118) 67 23.2 28 FLJ00188 ( 201 res) sj02282 ( 201) 68 23.7 33 KIAA0844 ( 438 res) hk05227 ( 438) 71 24.8 33 KIAA0517 ( 792 res) hg00752 ( 792) 73 25.6 35 KIAA0141 ( 536 res) ha03721 ( 536) 71 24.9 37 KIAA0459 ( 430 res) fg05396 ( 430) 70 24.6 38 KIAA2032 ( 952 res) eh00720 ( 952) 73 25.7 39 KIAA0049 ( 969 res) ha01035 ( 969) 73 25.7 40 KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 74 26.1 40 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 71 25.0 40 KIAA1089 ( 1033 res) ha02541 (1033) 73 25.8 41 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 73 25.8 42 KIAA0319 ( 1109 res) hg00378 (1109) 73 25.8 43 >>KIAA0088 ( 943 res) ha01225 (943 aa) initn: 3132 init1: 2772 opt: 2893 Z-score: 3247.6 bits: 612.2 E(): 1.1e-175 Smith-Waterman score: 3235; 50.656% identity (77.462% similar) in 914 aa overlap (26-924:31-942) 10 20 30 40 50 FLJ000 ELGAGRSDREAMEAAVKEEISVEDEAVDKNIFRDCNKIAFYRRQKQWLSKKSTYR :::.. :. :.. .: .::.. : :: KIAA00 AAVAAVAARRRRSWASLVLAFLGVCLGITLAVDRSNFKTCEESSFCKRQRSIRPGLSPYR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 FLJ000 ALLDSVTTDEDSTRFQIINEASKVPLLAEIYGIEGNIFRLKINEETPLKPRFEVPDVLTS :::::. :: ..:.:..:: :. :. :.. :. :..:.: : .::..:::::.. KIAA00 ALLDSLQLGPDSLTVHLIHEVTKVLLVLELQGLQKNMTRFRIDELEPRRPRYRVPDVLVA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 FLJ000 KPSTVRLISCSG-DTGSLILADGKGDLKCHITANPFKVDLVSEEEVVISINSLGQLYFEH : .:: : :: : .:. :. ..: : .:: ::..::. .. ...:.:. : : ::: KIAA00 DPPIARL-SVSGRDENSVELTMAEGPYKIILTARPFRLDLLEDRSLLLSVNARGLLEFEH 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 FLJ000 LQILHKQRAAKE-------NEEETSVDTSQ--ENQ-----EDLGLWEEKFGKFVDIKANG . . ....:. . ::: : .. :.: .. : ::: : : : : KIAA00 QRAPRVSQGSKDPAEGDGAQPEETPRDGDKPEETQGKAEKDEPGAWEETFKTHSDSKPYG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 FLJ000 PSSIGLDFSLHGFEHLYGIPQHAESHQLKNTGDGDAYRLYNLDVYGYQIYDKMGIYGSVP : :.:::::: :.::.::::.::.. .:: : :. ::::::::. :..:. :..::::: KIAA00 PMSVGLDFSLPGMEHVYGIPEHADNLRLKVTEGGEPYRLYNLDVFQYELYNPMALYGSVP 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 FLJ000 YLLAHKLGRTIGIFWLNASETLVEINTEPAVEYTLTQMGPVAAKQKVRSRTHVHWMSESG ::::. : .:::::::.:: :.:... : . . .: . .: :.::::.: KIAA00 VLLAHNPHRDLGIFWLNAAETWVDISSNTAGKTLFGKMMDYLQGSGETPQTDVRWMSETG 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 FLJ000 IIDVFLLTGPTPSDVFKQYSHLTGTQAMPPLFSLGYHQCRWNYEDEQDVKAVDAGFDEHD ::::::: ::. ::::.::. ::::::.:::::::::: ::::.:: :: :: :::.:. KIAA00 IIDVFLLLGPSISDVFRQYASLTGTQALPPLFSLGYHQSRWNYRDEADVLEVDQGFDDHN 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 FLJ000 IPYDAMWLDIEHTEGKRYFTWDKNRFPNPKRMQELLRSKKRKLVVISDPHIKIDPDYSVY .: :..::::::..:::::::: .:::.:. : : : ::.::::.: :::::.: : :. KIAA00 LPCDVIWLDIEHADGKRYFTWDPSRFPQPRTMLERLASKRRKLVAIVDPHIKVDSGYRVH 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 FLJ000 VKAKDQGFFVKNQEGEDFEGVCWPGLSSYLDFTNPKVREWYSSLFAFPVYQGSTDILFLW . .. :..::...: :.:: :::: ..: ::::: .: :....:.. :.::. ::.: KIAA00 EELRNLGLYVKTRDGSDYEGWCWPGSAGYPDFTNPTMRAWWANMFSYDNYEGSAPNLFVW 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 FLJ000 NDMNEPSVFRGPEQTMQKNAIHHGNWEHRELHNIYGFYHQMATAEGLIKRSKGKERPFVL ::::::::: ::: :: :.: :.:.::::..:::::.: .::::.:: .:: : :::::: KIAA00 NDMNEPSVFNGPEVTMLKDAQHYGGWEHRDVHNIYGLYVHMATADGLRQRSGGMERPFVL 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 FLJ000 TRSFFAGSQKYGAVWTGDNTAEWSNLKISIPMLLTLSITGISFCGADIGGFIGNPETELL .:.::::::..::::::::::::..::::::: :.:...:.::::::.:::. ::: ::: KIAA00 ARAFFAGSQRFGAVWTGDNTAEWDHLKISIPMCLSLGLVGLSFCGADVGGFFKNPEPELL 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 FLJ000 VRWYQAGAYQPFFRGHATMNTKRREPWLFGEEHTRLIREAIRERYGLLPYWYSLFYHAHV ::::: ::::::::.:: ..: ::::::. .:. .::.:. .::.:::.::.:.:.:: KIAA00 VRWYQMGAYQPFFRAHAHLDTGRREPWLLPSQHNDIIRDALGQRYSLLPFWYTLLYQAHR 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 FLJ000 ASQPVMRPLWVEFPDELKTFDMEDEYMLGSALLVHPVTEPKATTVDVFLPGSNEVWYDYK . ::::::::..:... ::...:.:.::.:::::::.. : :.:.:::..::::: . KIAA00 EGIPVMRPLWVQYPQDVTTFNIDDQYLLGDALLVHPVSDSGAHGVQVYLPGQGEVWYDIQ 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 FLJ000 TFAHWEGGCTVKIPVALDTIPVFQRGGSVIPIKTTVGKSTGWMTESSYGLRVALSTKGSS .. . .: :. .::.:..::::::::...: : .:. : .. : :::: .:.. KIAA00 SYQKHHGPQTLYLPVTLSSIPVFQRGGTIVPRWMRVRRSSECMKDDPITLFVALSPQGTA 780 790 800 810 820 830 830 840 850 860 870 880 FLJ000 VGELYLDDGHSFQYLHQKQFLHRKFSFCSSVLINSFADQRGHYPSKCVVEKILVLGFRKE :::.::::..:.: ...:: :.::: ...:..: :: .::. . .:.....: : KIAA00 QGELFLDDGYTFNYQTRQEFLLRRFSFSGNTLVSSSADPEGHFETPIWIERVVIIGAGK- 840 850 860 870 880 890 890 900 910 920 FLJ000 PSSVTTHSSDGKDQPVAFTYCAKTSILSLEKLSLNIATDWEVRII :..:. ... . .. ..: . .::.: :.: ..:.:.:: ... KIAA00 PAAVVLQTKGSPESRLSFQHDPETSVLVLRKPGINVASDWSIHLR 900 910 920 930 940 >>KIAA1161 ( 680 res) hj01210s1 (680 aa) initn: 287 init1: 136 opt: 242 Z-score: 269.2 bits: 60.7 E(): 8.5e-10 Smith-Waterman score: 326; 24.433% identity (50.630% similar) in 397 aa overlap (399-782:309-668) 370 380 390 400 410 420 FLJ000 PPLFSLGYHQCRWNYEDEQDVKAVDAGFDEHDIPYDAMWLDIEHTEGKRYFTWDKNRFPN : . . . .: .: . : .:. .::: KIAA11 FRDPIWSTWALYGRAVDQDKVLRFAQQIRLHHFNSSHLEIDDMYTPAYGDFDFDEVKFPN 280 290 300 310 320 330 430 440 450 460 470 480 FLJ000 PKRMQELLRSKKRKLVVISDPHIKIDPDYSVYVKAKDQGFFVKNQEGEDFEGVCW-PGLS . : . ::. .... : .. . : . .. .. .::.. :. : : :.. KIAA11 ASDMFRRLRDAGFRVTLWVHPFVNYNS--SRFGEGVERELFVREPTGRLPALVRWWNGIG 340 350 360 370 380 390 490 500 510 520 530 540 FLJ000 SYLDFTNPKVREWYSS-LFAFPVYQGSTDILFLWNDMNEPSVFRGPEQ-TMQKNAIHHGN . ::::.::.:.:... : . . ... : : .: : . :.. . . . KIAA11 AVLDFTHPKARDWFQGHLRRLRSRYSVASFKF---DAGEVSYL--PRDFSTYRPLPDPSV 400 410 420 430 440 450 550 560 570 580 590 600 FLJ000 WEHRELHNIYGFYHQMATAEGLIKRSKGKERPFVLTRSFFAGSQKYGAVWTGDNTAEWSN : .: . :. . : ... :: .. .:: : . KIAA11 WSRRYTEMALPFFSLAEVRVGYQSQN---------ISCFFRLVDR-DSVWGYD-----LG 460 470 480 490 610 620 630 640 650 FLJ000 LKISIPMLLTLSITGISFCGAD-IGGFI-------GN-PETELLVRWYQAGAYQPFFRGH :. :: .::.:. : : : .:: :. :: :: .:: ...:..: .. KIAA11 LRSLIPAVLTVSMLGYPFILPDMVGGNAVPQRTAGGDVPERELYIRWLEVAAFMPAMQFS 500 510 520 530 540 550 660 670 680 690 700 710 FLJ000 ATMNTKRREPWLFGEEHTRLIREAIRERYGLL-PYWYSLFYHAHVASQPVMRPLWVEFPD :: . : . . .. : .:. : : .. ...:..:::: : KIAA11 IP-------PWRYDAEVVAIAQKFAALRASLVAPLLLELAGEVTDTGDPIVRPLWWIAPG 560 570 580 590 600 720 730 740 750 760 770 FLJ000 ELKTFDMEDEYMLGSALLVHPVTEPKATTVDVFLPGSNEVWYDYKTFAHWEGGCTVKIPV . . .......:..::: :: :: ::.::... : .:: : : :: KIAA11 DETAHRIDSQFLIGDTLLVAPVLEPGKQERDVYLPAGK--WRSYK------GELFDKTPV 610 620 630 640 650 660 780 790 800 810 820 830 FLJ000 ALDTIPVFQRGGSVIPIKTTVGKSTGWMTESSYGLRVALSTKGSSVGELYLDDGHSFQYL : :: KIAA11 LLTDYPVDLDEIAYFTWAS 670 680 >>KIAA1878 ( 453 res) pj01649 (453 aa) initn: 62 init1: 62 opt: 114 Z-score: 127.2 bits: 33.8 E(): 0.069 Smith-Waterman score: 114; 28.205% identity (52.137% similar) in 117 aa overlap (1-117:288-398) 10 20 30 FLJ000 ELGAGRSDREAMEAAVKEEISVEDEAVDKN : : ::. .:.. ..::.. . .: KIAA18 PAWMVRRAEGLGHEQTPLPAAQAQVQATGPEAGRGRAAADALNRQIREEVASAVSSSYRN 260 270 280 290 300 310 40 50 60 70 80 90 FLJ000 IFRDCNKIAFYRRQKQWLSKKSTYRALLDSVTTDEDSTRFQIINEASKVPLLAEIYGIEG :: . : . . .. : :. :... : : :. .:::: : :. :. KIAA18 EFRAWTDI----KPVKPIKAKPQYKPPDDKMV-HETSYSAQFKGEASK-PTTADNKVIDR 320 330 340 350 360 370 100 110 120 130 140 150 FLJ000 NIFRLKINEETPLKPRFEVPDVLTSKPSTVRLISCSGDTGSLILADGKGDLKCHITANPF .: .: :. : :.: .::: KIAA18 RRIRSLYSEPFKEPPKVEKPSVQSSKPKKTSASHKPTRKAKDKQAVSGQAAKKKSAEGPS 380 390 400 410 420 430 >>FLJ00286 ( 576 res) sh02369 (576 aa) initn: 41 init1: 41 opt: 101 Z-score: 111.5 bits: 31.2 E(): 0.52 Smith-Waterman score: 101; 28.205% identity (58.120% similar) in 117 aa overlap (747-860:223-331) 720 730 740 750 760 770 FLJ000 LKTFDMEDEYMLGSALLVHPVTEPKATTVDVFLPGSNEVWYDYKTFAHWEGGCTVKI-PV .:: :.: ::: . . : . .. :. FLJ002 KHIWLSIWDRPPRSCFTRIQRATCCVLLICLFL-GANAVWYGAVGDSAYSTGHVSRLSPL 200 210 220 230 240 250 780 790 800 810 820 830 FLJ000 ALDTIPVFQRGGSVI-PIKTTVGKSTGWMTESSYGLRVALSTKGSSVGELYLD-DGHSFQ ..::. : .. :. :. .. ::..: .:: : . . .:. :: :. . FLJ002 SVDTVAVGLVSSVVVYPVYLAI-LFLFWMSRS----KVAGSPSPTPAGQQVLDIDSCLDS 260 270 280 290 300 840 850 860 870 880 890 FLJ000 YLHQKQFLHRKFSFCSSVLINSFADQRGHYPSKCVVEKILVLGFRKEPSSVTTHSSDGKD . ...:: :: . .::..::.: FLJ002 SVLDSSFL--TFSGLHAEVINTLADHRHRGTDFGGSPWLLIITVFLRSYKFAISLCTTYL 310 320 330 340 350 360 >>FLJ00285 ( 829 res) sh02320 (829 aa) initn: 41 init1: 41 opt: 101 Z-score: 109.8 bits: 31.4 E(): 0.64 Smith-Waterman score: 101; 28.205% identity (58.120% similar) in 117 aa overlap (747-860:476-584) 720 730 740 750 760 770 FLJ000 LKTFDMEDEYMLGSALLVHPVTEPKATTVDVFLPGSNEVWYDYKTFAHWEGGCTVKI-PV .:: :.: ::: . . : . .. :. FLJ002 KHIWLSIWDRPPRSCFTRIQRATCCVLLICLFL-GANAVWYGAVGDSAYSTGHVSRLSPL 450 460 470 480 490 500 780 790 800 810 820 830 FLJ000 ALDTIPVFQRGGSVI-PIKTTVGKSTGWMTESSYGLRVALSTKGSSVGELYLD-DGHSFQ ..::. : .. :. :. .. ::..: .:: : . . .:. :: :. . FLJ002 SVDTVAVGLVSSVVVYPVYLAI-LFLFWMSRS----KVAGSPSPTPAGQQVLDIDSCLDS 510 520 530 540 550 840 850 860 870 880 890 FLJ000 YLHQKQFLHRKFSFCSSVLINSFADQRGHYPSKCVVEKILVLGFRKEPSSVTTHSSDGKD . ...:: :: . .::..::.: FLJ002 SVLDSSFL--TFSGLHAEVINTLADHRHRGTDFGGSPWLLIITVFLRSYKFAISLCTTYL 560 570 580 590 600 610 >>KIAA1568 ( 1380 res) fh22308 (1380 aa) initn: 120 init1: 56 opt: 102 Z-score: 108.6 bits: 32.0 E(): 0.75 Smith-Waterman score: 102; 36.735% identity (69.388% similar) in 49 aa overlap (104-152:405-450) 80 90 100 110 120 130 FLJ000 NEASKVPLLAEIYGIEGNIFRLKINEETPLKPRFEVPDVLTSKPSTVRLISCSGDTGSLI : ..:: ::::..: . : .: ... . 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KIAA02 IKKLKGELVCLEEVLQNKDNEFALVKHEKEAVICLQNEKDQKLLEMENIMHSQNCEIKEL 900 910 920 930 940 950 130 140 150 160 170 180 FLJ000 SCSGDTGSLILADGKGDLKCHITANPFKVDLVSEEEVVISINSLGQLYFEHLQILHKQRA . : . ..: : : : :. : :..:. : . . : .: . ::. : :. 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