# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00084.fasta.huge -Q ../query/FLJ00084.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00084, 641 aa vs ./tmplib.10216 library 2210353 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.7057+/-0.00945; mu= -23.5013+/- 0.628 mean_var=861.1592+/-195.650, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.043705 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00201 ( 705 res) sj04110 ( 705) 282 33.2 0.11 KIAA1306 ( 1154 res) fh05845 (1154) 271 32.8 0.24 KIAA0845 ( 1034 res) hk05234s1 (1034) 264 32.3 0.31 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 257 31.7 0.36 KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174) 261 32.2 0.38 KIAA0665 ( 760 res) hk02064 ( 760) 235 30.3 0.91 FLJ00252 ( 819 res) sj09394 ( 819) 233 30.2 1 FLJ00378 ( 855 res) sj00210 ( 855) 233 30.2 1.1 KIAA1768 ( 1207 res) ph00672(revised) (1207) 233 30.4 1.3 KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217) 233 30.4 1.3 KIAA0613 ( 734 res) hg01088b ( 734) 226 29.7 1.3 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 236 30.8 1.3 KIAA1668 ( 791 res) fh11717 ( 791) 223 29.6 1.6 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 231 30.4 1.6 KIAA0079 ( 1102 res) ha03543 (1102) 227 30.0 1.6 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 226 30.0 1.7 KIAA0035 ( 707 res) ha01976 ( 707) 219 29.2 1.8 KIAA0434 ( 1571 res) hh02165 (1571) 228 30.3 1.9 KIAA1187 ( 813 res) fk03027 ( 813) 214 29.0 2.4 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 217 29.3 2.4 KIAA1883 ( 1480 res) fh02249 (1480) 218 29.6 2.8 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 222 30.1 3 KIAA0985 ( 697 res) hj08038 ( 697) 206 28.4 3.1 KIAA1741 ( 1777 res) fh23254 (1777) 218 29.7 3.2 KIAA1587 ( 991 res) fj08327 ( 991) 208 28.7 3.5 FLJ00160 ( 1696 res) sh06621 (1696) 214 29.4 3.7 KIAA1870 ( 832 res) hh05136b ( 832) 203 28.3 3.9 FLJ00253 ( 349 res) sj09455 ( 349) 191 27.1 3.9 KIAA1935 ( 441 res) fk03135(revised) ( 441) 194 27.4 3.9 KIAA1002 ( 962 res) hk09859 ( 962) 204 28.5 4.1 KIAA0339 ( 1709 res) hg01304(revised) (1709) 210 29.2 4.4 KIAA1623 ( 1236 res) fj04650 (1236) 205 28.7 4.5 KIAA1539 ( 543 res) fg02356 ( 543) 193 27.5 4.7 FLJ00198 ( 677 res) sj03504 ( 677) 196 27.8 4.7 FLJ00420 ( 613 res) sj09535 ( 613) 194 27.6 4.8 KIAA1357 ( 836 res) fj01906 ( 836) 198 28.0 4.9 KIAA1172 ( 929 res) hj03919(revised) ( 929) 197 28.0 5.4 KIAA0691 ( 762 res) hk03735 ( 762) 194 27.7 5.5 FLJ00090 ( 770 res) as00090 ( 770) 194 27.7 5.5 KIAA1650 ( 797 res) hk02174 ( 797) 194 27.7 5.6 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 199 28.3 6.1 FLJ00139 ( 585 res) sh03241 ( 585) 187 27.1 6.3 KIAA0771 ( 948 res) hk05113 ( 948) 193 27.8 6.5 KIAA1217 ( 1339 res) fh03001s1 (1339) 194 28.0 7.7 KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315) 193 28.0 7.9 KIAA1224 ( 997 res) fh02652 ( 997) 187 27.4 8.7 FLJ00153 ( 497 res) sh06127 ( 497) 177 26.4 8.9 KIAA0886 ( 1233 res) hk07722 (1233) 189 27.7 9.1 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 181 26.9 9.3 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 187 27.5 9.9 >>FLJ00201 ( 705 res) sj04110 (705 aa) initn: 127 init1: 127 opt: 282 Z-score: 123.5 bits: 33.2 E(): 0.11 Smith-Waterman score: 344; 29.650% identity (48.787% similar) in 371 aa overlap (294-624:24-383) 270 280 290 300 310 320 FLJ000 LPHPLEGSRKVEEEGSPGDPDHEASTQGRTCGPEHSKGGGRVDE-GPQP-RSVEPQDAGP :::. :.::: : : . ..:.. :: FLJ002 DAMLGTLTPLSSLLLLLLVLVLGCGPRASSGGGAGGAAGYAPVKYIQPMQKGP 10 20 30 40 50 330 340 350 360 370 FLJ000 LERSQGDEAGGHGEDRPEPLSPKESKKRKLELSRR--EQPPTEPGPQSASEVEKIALNLE . :. :. . : :: : . : . .. . :: :: . . : .:. . 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KIAA13 PP--PAEPPPTDLAHLPPLPPPEGEA-RKPAKPPV-SPKPVLTQPVPKLQGSPTPTSKKV 920 930 940 950 960 970 550 560 570 580 FLJ000 PGPSPAGPTRDE-----PAESPSETPGPR-----------PAGPAGDEPAESPSETPGPR : :.:..: . : ::. : : :.: :: :: ::.. : KIAA13 PLPGPGSPEVKRAHGTPPPVSPKPPPPPTAPKPVKAVAGLPSGSAGPSPAPSPARQPPAA 980 990 1000 1010 1020 1030 590 600 610 620 630 640 FLJ000 PAGPAGDEPAESPSETPGPSPAGPTRDEPAKAGEAAELQDAEVESSAKSGKP : : : :. . : . :::..:. ::: .:: KIAA13 LAKPPGTPPSLGASPAKPPSPGAPALHVPAKPPRAAAAAAAAAAAPPAPPEGASPGDSAR 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA13 QKLEETSACLAAALQAVEEKIRQEDAQGPRDSAAEKSTGSILDDIGSMFDDLADQLDAML 1100 1110 1120 1130 1140 1150 >>KIAA0845 ( 1034 res) hk05234s1 (1034 aa) initn: 242 init1: 181 opt: 264 Z-score: 115.6 bits: 32.3 E(): 0.31 Smith-Waterman score: 287; 27.273% identity (55.844% similar) in 308 aa overlap (345-641:449-739) 320 330 340 350 360 370 FLJ000 EPQDAGPLERSQGDEAGGHGEDRPEPLSPKESKKRKLELSRREQPPTEPGPQSASEVEKI : : . .: :..: .: . .. .:.. KIAA08 CRIGFGPIPFSLPEGLPKIPSVSTHIKVKSEEKIKVVEKSEKETVIVEEQTEETQVTEEV 420 430 440 450 460 470 380 390 400 410 420 FLJ000 ALNLEGCALSQGSLRTGTQEVGGQDP----GEAVQPCRQPLGARVADKVRKRRK-VDEGA . . : .... . : .: ::.. :: . ..: . ..:. .. .. : : : KIAA08 TEEEE----KEAKEEEGKEEEGGEEEEAEGGE--EETKSPPAEEAASPEKEAKSPVKEEA 480 490 500 510 520 530 430 440 450 460 470 480 FLJ000 GDSAAVASGGAQTLALAGSPAPSGHPKAGHSENGVEEDTEGRT-GPKEGTPGSPSETPGP . : . : . : ::: :. ..: : . .. .:.. ::.:. .: KIAA08 KSPAEAKSPEKEE---AKSPAEVKSPEKAKSPAKEEAKSPPEAKSPEKEEAKSPAEVKSP 540 550 560 570 580 490 500 510 520 530 540 FLJ000 SPAGPAGDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEPAKTPSETPGP : . : :.::.:. .:. : : :.::.:. .: : ::.:.:. .: KIAA08 EKAKSPAKEEAKSPAEAKSPEKAKSPVKEEAKSPAEAKSPVK------EEAKSPAEVKSP 590 600 610 620 630 640 550 560 570 580 590 600 FLJ000 SPA-GPTRDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEPAESPSETPG : .::..: :.:: .. .:. : : :.:: .. .: : . : :.:: .. . KIAA08 EKAKSPTKEE-AKSPEKAKSPEKAKSPEKEEAKSPEKAKSPVKAEAKSPEKAKSPVKAEA 650 660 670 680 690 700 610 620 630 640 FLJ000 PSPA---GPTRDEPAKAGEAAELQ-DAEVESSAKSGKP :: .:...: ::. : :. :..: :. .: KIAA08 KSPEKAKSPVKEE-AKSPEKAKSPVKEEAKSPEKAKSPVKEEAKTPEKAKSPVKEEAKSP 710 720 730 740 750 760 KIAA08 EKAKSPEKAKTLDVKSPEAKTPAKEEARSPADKFPEKAKSPVKEEVKSPEKAKSPLKEDA 770 780 790 800 810 820 >>KIAA1802 ( 821 res) fj21631 (821 aa) initn: 129 init1: 129 opt: 257 Z-score: 114.2 bits: 31.7 E(): 0.36 Smith-Waterman score: 285; 29.598% identity (50.000% similar) in 348 aa overlap (296-623:121-447) 270 280 290 300 310 320 FLJ000 HPLEGSRKVEEEGSPGDPDHEASTQGRTCGPEHSKGGGRVDEGPQPRSVEPQDAGPLERS :::.: : :.:. : : .: . 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KIAA18 TPSVSSASWKSSSVSPSSWKSPPASPESWKSGPPELRKTAPTLSPEHWKAVPPVSPELRK 380 390 400 410 420 430 610 620 630 640 FLJ000 PGPSPAGPTRDEPAKAGEAAELQDAEVESSAKSGKP ::: : .: :: . : KIAA18 PGP-PLSPEIRSPAGSPELRKPSGSPDLWKLSPDQRKTSPASLDFPESQKSSRGGSPDLW 440 450 460 470 480 >>KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174 aa) initn: 536 init1: 100 opt: 261 Z-score: 113.9 bits: 32.2 E(): 0.38 Smith-Waterman score: 296; 32.057% identity (55.981% similar) in 209 aa overlap (448-641:723-926) 420 430 440 450 460 470 FLJ000 KVRKRRKVDEGAGDSAAVASGGAQTLALAGSPAPSGHPKAGHSENGVEEDT-EGRTGPKE .:: . : . .:. .: : ..: KIAA07 SAVAGFSPEWAALAITVPITEEDGTPEGPVTPATTVHAPEEPDTAAVRVSTPEEPASPAA 700 710 720 730 740 750 480 490 500 510 520 FLJ000 GTPGSPSETPGPSPAGPAGDEP-----AESPSETP-GPRPAGPAGDEPAESPSETPGPR- ..: .: : .:. : :. .:: : : : : .: : :. .::. . .: :. KIAA07 AVP-TPEEPTSPAAAVPTPEEPTSPAAAVPPPEEPTSPAAAVPTPEEPTSPAAAVPTPEE 760 770 780 790 800 810 530 540 550 560 570 580 FLJ000 PAGPAGDEPAKTPSETPGPSPAGPTRDEPAESPSETPGPR-PAGPAG-----DEPAESPS :..::. : :: : .:. : :: .::. . .: :. :..::. .::: . KIAA07 PTSPAAAVP--TPEEPTSPAAAVPTPEEPTSPAAAVPTPEEPTSPAAAVPTPEEPASPAA 820 830 840 850 860 590 600 610 620 630 640 FLJ000 ETPGPR-PAGPAGDEPAESPSETPGPSPAGPTRDEPAKAGEAAELQDAEVESSAKSGKP .: :. ::.::. : .: : :.:: :: .: :.:. :. . . .: : KIAA07 AVPTPEEPASPAAAVP--TPEEPAFPAPAVPTPEESASAAVAVPTPEESASPAAAVPTPA 870 880 890 900 910 920 KIAA07 ESASFAAVVATLEEPTSPAASVPTPAAMVATLEEFTSPAASVPTSEEPASLAAAVSNPEE 930 940 950 960 970 980 >>KIAA0665 ( 760 res) hk02064 (760 aa) initn: 232 init1: 112 opt: 235 Z-score: 107.1 bits: 30.3 E(): 0.91 Smith-Waterman score: 238; 34.286% identity (50.286% similar) in 175 aa overlap (472-627:7-176) 450 460 470 480 490 500 FLJ000 TLALAGSPAPSGHPKAGHSENGVEEDTEGRTGPKEGTPGSPSETPGPSPAGPAGDEPAE- ..: . ::: : : :.:: : :. 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KIAA17 EATQLPAAFTSEATHFKPIVLAQNASVARDQPALAQEESEERGGQREGEGEEKLSLEAHA 670 680 690 700 710 720 440 450 460 470 480 490 FLJ000 GAQTLALAGSPAPSGHPKAGHSENGVEEDTEGRTGPKEGTPGSPSETPGPSPAGPAGDEP :. .: .:.:. :. :. . : . .... : : : : .:: ..: KIAA17 GSPSLKTPDGPVPGPGPQ------GAAPEPLGASVQRDSAQGRPC----PPPQAPA-NQP 730 740 750 760 770 500 510 520 530 540 550 FLJ000 AESPSETPG-PRPAGP--AGDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEP-AKTPSETP-GPS-PAG . : .:: : :: : :. :.:. : : .. .: .: : :. . :: : KIAA17 EGASSAAPGSPVPAPPTKASALPVEQGPAEPIPPGVASGGLRPDALGPTTAHHGPRHPPK 780 790 800 810 820 830 560 570 580 590 600 610 FLJ000 PTRDEPAESPSETP-GPRPAGPAGDEPAESPSETPG-PRPAGPAGDEPAESPSETPGPSP : :.. .: :.. : :: : :::.. .::. .: :::: : . : :: . KIAA17 PPRSKATERPGQEPEGP-GATPAGERDDQSPDSVPERPRPADRRLCLPCVDASPLPGRT- 840 850 860 870 880 620 630 640 FLJ000 AGPTRDEPAKAGEAAELQDAEVESSAKSGKP : :. .: .. KIAA17 ACPSLQEATRLIQEEFAFDGYLDNGLEALIMGEYIFALKDLTFATFCGAISEKFCDLYWD 890 900 910 920 930 940 >>KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217 aa) initn: 335 init1: 209 opt: 233 Z-score: 104.2 bits: 30.4 E(): 1.3 Smith-Waterman score: 290; 24.515% identity (47.087% similar) in 412 aa overlap (258-639:352-750) 230 240 250 260 270 280 FLJ000 RHQRRQLVHFAWEHFRPRCKFVWGPQDKLRRFKPSSLPHPLEGSRKVEEEGSPGDPDHEA : .: : . . ..: : .. KIAA12 DFCPPNPGPDGPRRRGRKPTKAKRDGPPRPRGRPRIRPLEVPTTAGPASASTPTDGAKKP 330 340 350 360 370 380 290 300 310 320 330 340 FLJ000 STQGRTCGPEHSKGGGRVDEGPQPRSVE---PQDAGPLERSQGDEAGGHGEDRPEPLSPK .:: : . ..:: : .: ... :. . : :.:: .: .. . . KIAA12 RGRGRGRGRKAEEAGGTRLEPLKPLKIKLSVPKAGEGLGTSSGDAISGTDHNSLDSSLTR 390 400 410 420 430 440 350 360 370 380 390 400 FLJ000 ESKKRKLELSRREQPPTEPGPQSASEVEKIALNLEGCALSQGSLR---TGTQEVGGQDPG :. . :.. ...:: . : . :: .. . . . : :..: . . : . :. 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