# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00084.fasta.huge -Q ../query/FLJ00084.ptfa ./tmplib.10216 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 FLJ00084, 641 aa
 vs ./tmplib.10216 library

2210353 residues in  2457 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.7057+/-0.00945; mu= -23.5013+/- 0.628
 mean_var=861.1592+/-195.650, 0's: 0 Z-trim: 6  B-trim: 0 in 0/40
 Lambda= 0.043705

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2457)
FLJ00201  ( 705 res)   sj04110                     ( 705)  282 33.2    0.11
KIAA1306  ( 1154 res)   fh05845                    (1154)  271 32.8    0.24
KIAA0845  ( 1034 res)   hk05234s1                  (1034)  264 32.3    0.31
KIAA1802  ( 821 res)   fj21631                     ( 821)  257 31.7    0.36
KIAA0754  ( 1174 res)   hh06485                    (1174)  261 32.2    0.38
KIAA0665  ( 760 res)   hk02064                     ( 760)  235 30.3    0.91
FLJ00252  ( 819 res)   sj09394                     ( 819)  233 30.2       1
FLJ00378  ( 855 res)   sj00210                     ( 855)  233 30.2     1.1
KIAA1768  ( 1207 res)   ph00672(revised)           (1207)  233 30.4     1.3
KIAA1205  ( 1217 res)   fg03511a                   (1217)  233 30.4     1.3
KIAA0613  ( 734 res)   hg01088b                    ( 734)  226 29.7     1.3
KIAA0458  ( 1552 res)   ef01252                    (1552)  236 30.8     1.3
KIAA1668  ( 791 res)   fh11717                     ( 791)  223 29.6     1.6
KIAA1471  ( 1421 res)   fj02383s1                  (1421)  231 30.4     1.6
KIAA0079  ( 1102 res)   ha03543                    (1102)  227 30.0     1.6
KIAA1139  ( 1124 res)   hk00330                    (1124)  226 30.0     1.7
KIAA0035  ( 707 res)   ha01976                     ( 707)  219 29.2     1.8
KIAA0434  ( 1571 res)   hh02165                    (1571)  228 30.3     1.9
KIAA1187  ( 813 res)   fk03027                     ( 813)  214 29.0     2.4
KIAA1522  ( 1044 res)   fh14706(revised)           (1044)  217 29.3     2.4
KIAA1883  ( 1480 res)   fh02249                    (1480)  218 29.6     2.8
KIAA0303  ( 2137 res)   hg00009                    (2137)  222 30.1       3
KIAA0985  ( 697 res)   hj08038                     ( 697)  206 28.4     3.1
KIAA1741  ( 1777 res)   fh23254                    (1777)  218 29.7     3.2
KIAA1587  ( 991 res)   fj08327                     ( 991)  208 28.7     3.5
FLJ00160  ( 1696 res)   sh06621                    (1696)  214 29.4     3.7
KIAA1870  ( 832 res)   hh05136b                    ( 832)  203 28.3     3.9
FLJ00253  ( 349 res)   sj09455                     ( 349)  191 27.1     3.9
KIAA1935  ( 441 res)   fk03135(revised)            ( 441)  194 27.4     3.9
KIAA1002  ( 962 res)   hk09859                     ( 962)  204 28.5     4.1
KIAA0339  ( 1709 res)   hg01304(revised)           (1709)  210 29.2     4.4
KIAA1623  ( 1236 res)   fj04650                    (1236)  205 28.7     4.5
KIAA1539  ( 543 res)   fg02356                     ( 543)  193 27.5     4.7
FLJ00198  ( 677 res)   sj03504                     ( 677)  196 27.8     4.7
FLJ00420  ( 613 res)   sj09535                     ( 613)  194 27.6     4.8
KIAA1357  ( 836 res)   fj01906                     ( 836)  198 28.0     4.9
KIAA1172  ( 929 res)   hj03919(revised)            ( 929)  197 28.0     5.4
KIAA0691  ( 762 res)   hk03735                     ( 762)  194 27.7     5.5
FLJ00090  ( 770 res)   as00090                     ( 770)  194 27.7     5.5
KIAA1650  ( 797 res)   hk02174                     ( 797)  194 27.7     5.6
KIAA0561  ( 1308 res)   hh01676                    (1308)  199 28.3     6.1
FLJ00139  ( 585 res)   sh03241                     ( 585)  187 27.1     6.3
KIAA0771  ( 948 res)   hk05113                     ( 948)  193 27.8     6.5
KIAA1217  ( 1339 res)   fh03001s1                  (1339)  194 28.0     7.7
KIAA0910  ( 1315 res)   hg02207s1                  (1315)  193 28.0     7.9
KIAA1224  ( 997 res)   fh02652                     ( 997)  187 27.4     8.7
FLJ00153  ( 497 res)   sh06127                     ( 497)  177 26.4     8.9
KIAA0886  ( 1233 res)   hk07722                    (1233)  189 27.7     9.1
KIAA1811  ( 715 res)   ha06731                     ( 715)  181 26.9     9.3
KIAA1681  ( 1236 res)   fh23697                    (1236)  187 27.5     9.9


>>FLJ00201  ( 705 res)   sj04110                          (705 aa)
 initn: 127 init1: 127 opt: 282  Z-score: 123.5  bits: 33.2 E(): 0.11
Smith-Waterman score: 344;  29.650% identity (48.787% similar) in 371 aa overlap (294-624:24-383)

           270       280       290       300        310        320 
FLJ000 LPHPLEGSRKVEEEGSPGDPDHEASTQGRTCGPEHSKGGGRVDE-GPQP-RSVEPQDAGP
                                     :::. :.:::     :  : . ..:.. ::
FLJ002        DAMLGTLTPLSSLLLLLLVLVLGCGPRASSGGGAGGAAGYAPVKYIQPMQKGP
                      10        20        30        40        50   

             330       340       350         360       370         
FLJ000 LERSQGDEAGGHGEDRPEPLSPKESKKRKLELSRR--EQPPTEPGPQSASEVEKIALNLE
       .      :. :.  . : :: : . : .    ..   . ::  ::  .   . : .:. .
FLJ002 VG-PPFREGKGQYLEMPLPLLPMDLKGEPGPPGKPGPRGPPGPPGFPGKPGMGKPGLHGQ
             60        70        80        90       100       110  

      380       390       400       410       420             430  
FLJ000 -GCALSQGSLRTGTQEVGGQDPGEAVQPCRQPLGARVADKVRKRRKV--DEGA----GDS
        : :   :  : :     :  ::. : :  :: : :    .:  . .    :     : :
FLJ002 PGPAGPPGFSRMGKAGPPGL-PGK-VGPPGQP-GLRGEPGIRGDQGLRGPPGPPGLPGPS
            120       130         140        150       160         

              440           450       460       470       480      
FLJ000 AAVASG--GAQTL----ALAGSPAPSGHPKAGHSENGVEEDTEGRTGPKEGTPGSPSETP
       . .  :  ::: .    .. : :.:.:.: .  .. :.. :. :   :  : ::.:..  
FLJ002 GITIPGKPGAQGVPGPPGFQGEPGPQGEP-GPPGDRGLKGDN-GVGQP--GLPGAPGQGG
     170       180       190        200       210          220     

        490       500       510       520              530         
FLJ000 GPSPAGPAGDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEPAESPSETPGPR-------PAGPAGDEPA
       .:.: :  :     .:.    :   :  ::.   .:  .::::       : :: : . .
FLJ002 APGPPGLPGPAGLGKPGLDGLP---GAPGDKGESGPPGVPGPRGEPGAVGPKGPPGVDGV
         230       240          250       260       270       280  

     540       550          560           570          580         
FLJ000 KTPSETPGPSPAGPT--RDEPA-ESPSETPGPR----PA--GPAGDE-PAESPS---ETP
        .:. .  :.: ::.  . ::. ..:    ::     :.  :: ::. ::  :.   .  
FLJ002 GVPGAAGLPGPQGPSGAKGEPGTRGPPGLIGPTGYGMPGLPGPKGDRGPAGVPGLLGDRG
            290       300       310       320       330       340  

        590       600        610         620       630       640   
FLJ000 GPRPAGPAGDEPAESPSETPG-PSPAG-P-TRDEPAKAGEAAELQDAEVESSAKSGKP  
        :   :  :..  .. .  :: :. :: :  :  :.  :::                   
FLJ002 EPGEDGEPGEQGPQGLGGPPGLPGSAGLPGRRGPPGPKGEAGPGGPPGVPGIRGDQGPSG
            350       360       370       380       390       400  

FLJ002 LAGKPGVPGERGLPGAHGPPGPTGPKGEPGFTGRPGGPGVAGALGQKGDLGLPGQPGLRG
            410       420       430       440       450       460  

>>KIAA1306  ( 1154 res)   fh05845                         (1154 aa)
 initn: 407 init1: 189 opt: 271  Z-score: 117.4  bits: 32.8 E(): 0.24
Smith-Waterman score: 297;  26.761% identity (47.183% similar) in 426 aa overlap (243-625:662-1069)

            220       230       240       250       260       270  
FLJ000 VRQSALDYFMFAVRCRHQRRQLVHFAWEHFRPRCKFVWGPQDKLRRFKPSSLPHPLEGSR
                                     ::: :   ::     . . :.:     .: 
KIAA13 TVQRRVGRSHSVRAPAGADKNVNRSQSFAVRPRKK---GPPPPPPKRSSSAL-----ASA
             640       650       660          670       680        

            280       290        300       310       320           
FLJ000 KVEEEGSPGDPDHEASTQG-RTCGPEHSKGGGRVDEGPQPRSVEPQDAGPLERSQ---GD
       .. .:  : : . : .  : :.   . :  .: :: : .  ::. . :. :: :.   : 
KIAA13 NLADEPVP-DAEPEDGLLGVRAQCRRASDLAGSVDTG-SAGSVK-SIAAMLELSSIGGGG
           690        700       710        720        730       740

      330          340       350       360       370       380     
FLJ000 EAG---GHGEDRPEPLSPKESKKRKLELSRREQPPTEPGPQSASEVEKIALNLEGCALSQ
       .:.    .:.  :.: ::. ..   .  : ...    :: . ... . ..  . :     
KIAA13 RAARRPPEGHPTPRPASPEPGRVATVLASVKHKEAIGPGGEVVNRRRTLSGPVTGLL---
              750       760       770       780       790          

         390       400           410       420       430       440 
FLJ000 GSLRTGTQEVGGQDP----GEAVQPCRQPLGARVADKVRKRRKVDEGAGDSAAVASGGAQ
       .. : :  : .   :    : . :  : :  .... .     ::. .:  .  . .   :
KIAA13 ATARRGPGESADPGPFVEDGTGRQRPRGPSKGEAGVEGPPLAKVEASATLKRRIRAKQNQ
       800       810       820       830       840       850       

                 450       460            470       480            
FLJ000 T----LALAGSPAPSGHPKAGHSENGVEEDT-----EGRTGPKEGTPGS----PSETPGP
            . :. : . . .::: . : : :        .. ::  .  :.:    : : : :
KIAA13 QENVKFILTESDTVKRRPKAKEREAGPEPPPPLSVYHNGTGTVRRRPASEQAGPPELPPP
       860       870       880       890       900       910       

      490       500       510       520          530       540     
FLJ000 SPAGPAGDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEPAESPSETPGP---RPAGPAGDEPAKTPSET
        :  ::   :..     : : : : :  .::. :  .: :   .:.      :. : ...
KIAA13 PP--PAEPPPTDLAHLPPLPPPEGEA-RKPAKPPV-SPKPVLTQPVPKLQGSPTPTSKKV
         920       930       940         950       960       970   

         550            560                  570       580         
FLJ000 PGPSPAGPTRDE-----PAESPSETPGPR-----------PAGPAGDEPAESPSETPGPR
       : :.:..:   .     :  ::.  : :            :.: ::  :: ::.. :   
KIAA13 PLPGPGSPEVKRAHGTPPPVSPKPPPPPTAPKPVKAVAGLPSGSAGPSPAPSPARQPPAA
           980       990      1000      1010      1020      1030   

     590       600       610       620       630       640         
FLJ000 PAGPAGDEPAESPSETPGPSPAGPTRDEPAKAGEAAELQDAEVESSAKSGKP        
        : : :  :. . : .  :::..:.   :::  .::                        
KIAA13 LAKPPGTPPSLGASPAKPPSPGAPALHVPAKPPRAAAAAAAAAAAPPAPPEGASPGDSAR
          1040      1050      1060      1070      1080      1090   

KIAA13 QKLEETSACLAAALQAVEEKIRQEDAQGPRDSAAEKSTGSILDDIGSMFDDLADQLDAML
          1100      1110      1120      1130      1140      1150   

>>KIAA0845  ( 1034 res)   hk05234s1                       (1034 aa)
 initn: 242 init1: 181 opt: 264  Z-score: 115.6  bits: 32.3 E(): 0.31
Smith-Waterman score: 287;  27.273% identity (55.844% similar) in 308 aa overlap (345-641:449-739)

          320       330       340       350       360       370    
FLJ000 EPQDAGPLERSQGDEAGGHGEDRPEPLSPKESKKRKLELSRREQPPTEPGPQSASEVEKI
                                     : : . .: :..:   .:   . .. .:..
KIAA08 CRIGFGPIPFSLPEGLPKIPSVSTHIKVKSEEKIKVVEKSEKETVIVEEQTEETQVTEEV
      420       430       440       450       460       470        

          380       390       400           410       420          
FLJ000 ALNLEGCALSQGSLRTGTQEVGGQDP----GEAVQPCRQPLGARVADKVRKRRK-VDEGA
       . . :    .... . : .: ::..     ::  .  ..: . ..:.  .. .. : : :
KIAA08 TEEEE----KEAKEEEGKEEEGGEEEEAEGGE--EETKSPPAEEAASPEKEAKSPVKEEA
      480           490       500         510       520       530  

     430       440       450       460       470        480        
FLJ000 GDSAAVASGGAQTLALAGSPAPSGHPKAGHSENGVEEDTEGRT-GPKEGTPGSPSETPGP
        . : . :   .    : :::    :. ..:    :  .  .. .:..    ::.:. .:
KIAA08 KSPAEAKSPEKEE---AKSPAEVKSPEKAKSPAKEEAKSPPEAKSPEKEEAKSPAEVKSP
            540          550       560       570       580         

      490       500       510       520       530       540        
FLJ000 SPAGPAGDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEPAKTPSETPGP
         :   . : :.::.:. .:. :     : :.::.:. .:        : ::.:.:. .:
KIAA08 EKAKSPAKEEAKSPAEAKSPEKAKSPVKEEAKSPAEAKSPVK------EEAKSPAEVKSP
     590       600       610       620       630             640   

      550        560       570       580       590       600       
FLJ000 SPA-GPTRDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEPAESPSETPG
         : .::..: :.:: .. .:. :     : :.:: .. .:  :   . : :.:: .. .
KIAA08 EKAKSPTKEE-AKSPEKAKSPEKAKSPEKEEAKSPEKAKSPVKAEAKSPEKAKSPVKAEA
           650        660       670       680       690       700  

       610          620        630       640                       
FLJ000 PSPA---GPTRDEPAKAGEAAELQ-DAEVESSAKSGKP                      
        ::    .:...: ::. : :.     :..:  :. .:                      
KIAA08 KSPEKAKSPVKEE-AKSPEKAKSPVKEEAKSPEKAKSPVKEEAKTPEKAKSPVKEEAKSP
            710        720       730       740       750       760 

KIAA08 EKAKSPEKAKTLDVKSPEAKTPAKEEARSPADKFPEKAKSPVKEEVKSPEKAKSPLKEDA
             770       780       790       800       810       820 

>>KIAA1802  ( 821 res)   fj21631                          (821 aa)
 initn: 129 init1: 129 opt: 257  Z-score: 114.2  bits: 31.7 E(): 0.36
Smith-Waterman score: 285;  29.598% identity (50.000% similar) in 348 aa overlap (296-623:121-447)

         270       280       290       300       310       320     
FLJ000 HPLEGSRKVEEEGSPGDPDHEASTQGRTCGPEHSKGGGRVDEGPQPRSVEPQDAGPLERS
                                     :::.:      :   :.:. :  :  .: .
KIAA18 TSKHASPDKWNDKPKNQLNKETDPVKSPPLPEHQKIPCNSAE---PKSI-P--ALSMETQ
              100       110       120       130             140    

         330       340       350       360           370       380 
FLJ000 QGDEAGGHGEDRPEPLSPKESKKRKLELSRREQPPT---EPG-PQSASEVEKIALNLEGC
       .   . .    .: ::.: : .:    .: . : :    ::. : :.:  :    ..  :
KIAA18 KLGSVLSPESPKPTPLTPLEPQKPGSVVSPELQTPLPSPEPSKPASVSSPEP-PKSVPVC
          150       160       170       180       190        200   

             390       400       410        420       430       440
FLJ000 ALSQGSLRTGTQEVGGQDPGEAVQPCRQPLGARVAD-KVRKRRKVDEGAGDSAAVASGGA
         ::    . . :   : :.  :.:  . . : ... : .:. .  :  :  .:   .. 
KIAA18 E-SQKLAPVPSPE--PQKPAP-VSP--ESVKATLSNPKPQKQSHFPETLGPPSA---SSP
            210         220          230       240       250       

              450       460       470       480       490          
FLJ000 QTLALAGSPAPSGHPKAGHSENGVEEDTEGRTGPKEGTPGSPSETPGPSPAGPA-GDEPA
       .. .::.:: : :   :.  :.   . .   :.:.   : ::::.: :    :: . :: 
KIAA18 ESPVLAASPEPWGPSPAASPES---RKSARTTSPEPRKP-SPSESPEPWKPFPAVSPEPR
          260       270          280       290        300       310

     500        510        520         530          540         550
FLJ000 E-SPSETPGPRPAGPAGD-EPAES-PSETPGP-RPAGPA---GDEPAKT-PSETPGP-SP
       . .:. .::    :: :. .: .: :: . :: .:: ::   .  : :  :: .::: .:
KIAA18 RPAPAVSPGSWKPGPPGSPRPWKSNPSASSGPWKPAKPAPSVSPGPWKPIPSVSPGPWKP
              320       330       340       350       360       370

              560       570            580       590       600     
FLJ000 AGPTRDEPAESPSETPGPRPAGPAGDE-----PAESPSETPGPRPAGPAGDEPAESPSET
       .  . .   .: : .:.   . ::. :     : :  . .:   :    .  :.    . 
KIAA18 TPSVSSASWKSSSVSPSSWKSPPASPESWKSGPPELRKTAPTLSPEHWKAVPPVSPELRK
              380       390       400       410       420       430

         610       620       630       640                         
FLJ000 PGPSPAGPTRDEPAKAGEAAELQDAEVESSAKSGKP                        
       ::: : .:    :: . :                                          
KIAA18 PGP-PLSPEIRSPAGSPELRKPSGSPDLWKLSPDQRKTSPASLDFPESQKSSRGGSPDLW
               440       450       460       470       480         

>>KIAA0754  ( 1174 res)   hh06485                         (1174 aa)
 initn: 536 init1: 100 opt: 261  Z-score: 113.9  bits: 32.2 E(): 0.38
Smith-Waterman score: 296;  32.057% identity (55.981% similar) in 209 aa overlap (448-641:723-926)

       420       430       440       450       460        470      
FLJ000 KVRKRRKVDEGAGDSAAVASGGAQTLALAGSPAPSGHPKAGHSENGVEEDT-EGRTGPKE
                                     .:: . :     .  .:. .: :  ..:  
KIAA07 SAVAGFSPEWAALAITVPITEEDGTPEGPVTPATTVHAPEEPDTAAVRVSTPEEPASPAA
            700       710       720       730       740       750  

        480       490            500        510       520          
FLJ000 GTPGSPSETPGPSPAGPAGDEP-----AESPSETP-GPRPAGPAGDEPAESPSETPGPR-
       ..: .: :  .:. : :. .::     :  : : : .:  : :. .::.   . .: :. 
KIAA07 AVP-TPEEPTSPAAAVPTPEEPTSPAAAVPPPEEPTSPAAAVPTPEEPTSPAAAVPTPEE
             760       770       780       790       800       810 

     530       540       550       560        570            580   
FLJ000 PAGPAGDEPAKTPSETPGPSPAGPTRDEPAESPSETPGPR-PAGPAG-----DEPAESPS
       :..::.  :  :: :  .:. : :: .::.   . .: :. :..::.     .:::   .
KIAA07 PTSPAAAVP--TPEEPTSPAAAVPTPEEPTSPAAAVPTPEEPTSPAAAVPTPEEPASPAA
             820         830       840       850       860         

            590       600       610       620       630       640  
FLJ000 ETPGPR-PAGPAGDEPAESPSETPGPSPAGPTRDEPAKAGEAAELQDAEVESSAKSGKP 
        .: :. ::.::.  :  .: :   :.:: :: .: :.:. :.   .  .  .:    : 
KIAA07 AVPTPEEPASPAAAVP--TPEEPAFPAPAVPTPEESASAAVAVPTPEESASPAAAVPTPA
     870       880         890       900       910       920       

KIAA07 ESASFAAVVATLEEPTSPAASVPTPAAMVATLEEFTSPAASVPTSEEPASLAAAVSNPEE
       930       940       950       960       970       980       

>>KIAA0665  ( 760 res)   hk02064                          (760 aa)
 initn: 232 init1: 112 opt: 235  Z-score: 107.1  bits: 30.3 E(): 0.91
Smith-Waterman score: 238;  34.286% identity (50.286% similar) in 175 aa overlap (472-627:7-176)

             450       460       470       480       490       500 
FLJ000 TLALAGSPAPSGHPKAGHSENGVEEDTEGRTGPKEGTPGSPSETPGPSPAGPAGDEPAE-
                                     ..:  . :::    : : :.:: :   :. 
KIAA06                         PLGSMASAPPASPPGSEPPGPDPEPGGPDGPGAAQL
                                       10        20        30      

                      510       520        530         540         
FLJ000 --SPSE----TP--GPRPAGPAGDEPAESPSETPGPR-PAGPA-GDEPA-KTPSETPGPS
         .:.:    .:  :: : .:. :::: . .   : :  :::: : : . . :. .  : 
KIAA06 APGPAELRLGAPVGGPDPQSPGLDEPAPGAAADGGARWSAGPAPGLEGGPRDPGPSAPPP
         40        50        60        70        80        90      

     550       560       570       580         590       600       
FLJ000 PAGPTRDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEPAESP--SETPGPRPAGPAGDEPAESPSETPG
        .:: : . :   .  ::::  .:    :  .:  : :  :.  :::.  :  .: .  :
KIAA06 RSGP-RGQLASPDAPGPGPRSEAPL---PELDPLFSWTEEPEECGPAS-CPESAPFRLQG
        100        110       120          130       140        150 

       610            620       630       640                      
FLJ000 PSPAGPTRDE-----PAKAGEAAELQDAEVESSAKSGKP                     
        : .  .: :     :  :  :.::                                   
KIAA06 SSSSHRARGEVDVFSPFPAPTAGELALEQGPGSPPQPSDLSQTHPLPSEPVGSQEDGPRL
             160       170       180       190       200       210 

>>FLJ00252  ( 819 res)   sj09394                          (819 aa)
 initn: 131 init1: 100 opt: 233  Z-score: 106.1  bits: 30.2 E():    1
Smith-Waterman score: 251;  29.545% identity (52.273% similar) in 220 aa overlap (409-620:114-320)

      380       390       400       410       420       430        
FLJ000 EGCALSQGSLRTGTQEVGGQDPGEAVQPCRQPLGARVADKVRKRRKVDEGAGDSAAVASG
                                     ::  :.  .. :  ..  ::    .  : .
FLJ002 EATQLPAAFTSEATHFKPIVLAQNASVARDQPALAQEESEERGGQREGEGEEKLSLEAHA
            90       100       110       120       130       140   

      440       450       460       470       480       490        
FLJ000 GAQTLALAGSPAPSGHPKAGHSENGVEEDTEGRTGPKEGTPGSPSETPGPSPAGPAGDEP
       :. .:    .:.:.  :.      :.  .  : .  .... : :     : : .:: ..:
FLJ002 GSPSLKTPDGPVPGPGPQ------GAAPEPLGASVQRDSAQGRPC----PPPQAPA-NQP
           150       160             170       180            190  

      500        510         520       530        540         550  
FLJ000 AESPSETPG-PRPAGP--AGDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEP-AKTPSETP-GPS-PAG
         . : .:: : :: :  :.  :.:.    : :  .. .: .: :  :. .  ::  :  
FLJ002 EGASSAAPGSPVPAPPTKASALPVEQGPAEPIPPGVASGGLRPDALGPTTAHHGPRHPPK
            200       210       220       230       240       250  

            560        570       580        590       600       610
FLJ000 PTRDEPAESPSETP-GPRPAGPAGDEPAESPSETPG-PRPAGPAGDEPAESPSETPGPSP
       : :.. .: :.. : ::  : :::..  .::. .:  ::::      :  . :  :: . 
FLJ002 PPRSKATERPGQEPEGP-GATPAGERDDQSPDSVPERPRPADRRLCLPCVDASPLPGRT-
            260        270       280       290       300       310 

              620       630       640                              
FLJ000 AGPTRDEPAKAGEAAELQDAEVESSAKSGKP                             
       : :. .: ..                                                  
FLJ002 ACPSLQEATRLIQEEFAFDGYLDNGLEALIMGEYIFALKDLTFATFCGAISEKFCDLYWD
              320       330       340       350       360       370

>>FLJ00378  ( 855 res)   sj00210                          (855 aa)
 initn: 100 init1: 100 opt: 233  Z-score: 105.9  bits: 30.2 E():  1.1
Smith-Waterman score: 251;  29.545% identity (52.273% similar) in 220 aa overlap (409-620:351-557)

      380       390       400       410       420       430        
FLJ000 EGCALSQGSLRTGTQEVGGQDPGEAVQPCRQPLGARVADKVRKRRKVDEGAGDSAAVASG
                                     ::  :.  .. :  ..  ::    .  : .
FLJ003 EATQLPAAFTSEATHFKPIVLAQNASVARDQPALAQEESEERGGQREGEGEEKLSLEAHA
              330       340       350       360       370       380

      440       450       460       470       480       490        
FLJ000 GAQTLALAGSPAPSGHPKAGHSENGVEEDTEGRTGPKEGTPGSPSETPGPSPAGPAGDEP
       :. .:    .:.:.  :.      :.  .  : .  .... : :     : : .:: ..:
FLJ003 GSPSLKTPDGPVPGPGPQ------GAAPEPLGASVQRDSAQGRPC----PPPQAPA-NQP
              390             400       410           420          

      500        510         520       530        540         550  
FLJ000 AESPSETPG-PRPAGP--AGDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEP-AKTPSETP-GPS-PAG
         . : .:: : :: :  :.  :.:.    : :  .. .: .: :  :. .  ::  :  
FLJ003 EGASSAAPGSPVPAPPTKASALPVEQGPAEPIPPGVASGGLRPDALGPTTAHHGPRHPPK
     430       440       450       460       470       480         

            560        570       580        590       600       610
FLJ000 PTRDEPAESPSETP-GPRPAGPAGDEPAESPSETPG-PRPAGPAGDEPAESPSETPGPSP
       : :.. .: :.. : ::  : :::..  .::. .:  ::::      :  . :  :: . 
FLJ003 PPRSKATERPGQEPEGP-GATPAGERDDQSPDSVPERPRPADRRLCLPCVDASPLPGRT-
     490       500        510       520       530       540        

              620       630       640                              
FLJ000 AGPTRDEPAKAGEAAELQDAEVESSAKSGKP                             
       : :. .: ..                                                  
FLJ003 ACPSLQEATRLIQEEFAFDGYLDNGLEALIMGEYIFALKDLTFATFCGAISEKFCDLYWD
       550       560       570       580       590       600       

>>KIAA1768  ( 1207 res)   ph00672(revised)                (1207 aa)
 initn: 156 init1: 100 opt: 233  Z-score: 104.3  bits: 30.4 E():  1.3
Smith-Waterman score: 251;  29.545% identity (52.273% similar) in 220 aa overlap (409-620:693-899)

      380       390       400       410       420       430        
FLJ000 EGCALSQGSLRTGTQEVGGQDPGEAVQPCRQPLGARVADKVRKRRKVDEGAGDSAAVASG
                                     ::  :.  .. :  ..  ::    .  : .
KIAA17 EATQLPAAFTSEATHFKPIVLAQNASVARDQPALAQEESEERGGQREGEGEEKLSLEAHA
            670       680       690       700       710       720  

      440       450       460       470       480       490        
FLJ000 GAQTLALAGSPAPSGHPKAGHSENGVEEDTEGRTGPKEGTPGSPSETPGPSPAGPAGDEP
       :. .:    .:.:.  :.      :.  .  : .  .... : :     : : .:: ..:
KIAA17 GSPSLKTPDGPVPGPGPQ------GAAPEPLGASVQRDSAQGRPC----PPPQAPA-NQP
            730       740             750       760            770 

      500        510         520       530        540         550  
FLJ000 AESPSETPG-PRPAGP--AGDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEP-AKTPSETP-GPS-PAG
         . : .:: : :: :  :.  :.:.    : :  .. .: .: :  :. .  ::  :  
KIAA17 EGASSAAPGSPVPAPPTKASALPVEQGPAEPIPPGVASGGLRPDALGPTTAHHGPRHPPK
             780       790       800       810       820       830 

            560        570       580        590       600       610
FLJ000 PTRDEPAESPSETP-GPRPAGPAGDEPAESPSETPG-PRPAGPAGDEPAESPSETPGPSP
       : :.. .: :.. : ::  : :::..  .::. .:  ::::      :  . :  :: . 
KIAA17 PPRSKATERPGQEPEGP-GATPAGERDDQSPDSVPERPRPADRRLCLPCVDASPLPGRT-
             840        850       860       870       880          

              620       630       640                              
FLJ000 AGPTRDEPAKAGEAAELQDAEVESSAKSGKP                             
       : :. .: ..                                                  
KIAA17 ACPSLQEATRLIQEEFAFDGYLDNGLEALIMGEYIFALKDLTFATFCGAISEKFCDLYWD
     890       900       910       920       930       940         

>>KIAA1205  ( 1217 res)   fg03511a                        (1217 aa)
 initn: 335 init1: 209 opt: 233  Z-score: 104.2  bits: 30.4 E():  1.3
Smith-Waterman score: 290;  24.515% identity (47.087% similar) in 412 aa overlap (258-639:352-750)

       230       240       250       260       270       280       
FLJ000 RHQRRQLVHFAWEHFRPRCKFVWGPQDKLRRFKPSSLPHPLEGSRKVEEEGSPGDPDHEA
                                     : .:   :  .  .      ..: :  .. 
KIAA12 DFCPPNPGPDGPRRRGRKPTKAKRDGPPRPRGRPRIRPLEVPTTAGPASASTPTDGAKKP
             330       340       350       360       370       380 

       290       300       310          320       330       340    
FLJ000 STQGRTCGPEHSKGGGRVDEGPQPRSVE---PQDAGPLERSQGDEAGGHGEDRPEPLSPK
         .::  : .  ..::   :  .: ...   :. .  :  :.::  .:  ..  .    .
KIAA12 RGRGRGRGRKAEEAGGTRLEPLKPLKIKLSVPKAGEGLGTSSGDAISGTDHNSLDSSLTR
             390       400       410       420       430       440 

          350       360       370       380          390       400 
FLJ000 ESKKRKLELSRREQPPTEPGPQSASEVEKIALNLEGCALSQGSLR---TGTQEVGGQDPG
       :. . :..  ...::  . : . :: .. .  . .   : :..:    .  . :  . :.
KIAA12 EKIEAKIKEVEEKQPEMKSGFM-ASFLDFLKSGKRHPPLYQAGLTPPLSPPKSVPPSVPA
             450       460        470       480       490       500

             410       420        430       440       450       460
FLJ000 EAVQPCRQPLGARVADKVRKRRKVDEGA-GDSAAVASGGAQTLALAGSPAPSGHPKAGHS
       ...::  :: .. .. .         :: : ..:. .. .. :.: : :.:  .     .
KIAA12 RGLQP--QPPATPAVPH-----PPPSGAFGLGGALEAAESEGLGL-GCPSPCKRLDEELK
                510            520       530        540       550  

                      470        480       490           500       
FLJ000 EN--------GVEEDTEGRTGP-KEGTPGSPSETPGPSPAGPAG----DEPAESPSET-P
       .:        . :::. ...   .:.  .. :    :  :::      : :  .:. . :
KIAA12 RNLETLPSFSSDEEDSVAKNRDLQESISSAISALDDPPLAGPKDTSTPDGPPLAPAAAVP
            560       570       580       590       600       610  

        510       520          530       540       550       560   
FLJ000 GPRPAGPAGDEPAESPSETPGP---RPAGPAGDEPAKTPSETPGPSPAGPTRDEPAESPS
       :: :  :    :. . . :: :   .   :    :: ::.  : : :  :    :.  : 
KIAA12 GP-P--PLPGLPSANSNGTPEPPLLEEKPPPTPPPAPTPQPQPPPPPPPPQPALPSPPPL
               620       630       640       650       660         

           570       580       590       600        610            
FLJ000 ETPGPRPAGPAGDEPAESPSETPGPRPAGPAGDEPAESPSETPG-PSPAGPTRDE--P--
        .: :  . :    :   :   :.: :  : .  :  .: : :. :::  :   .  :  
KIAA12 VAPTPS-SPPPPPLPPPPPPAMPSPPPPPPPAAAPLAAPPEEPAAPSPEDPELPDTRPLH
     670        680       690       700       710       720        

       620       630       640                                     
FLJ000 -AKAGEAAELQDAEVESSAKSGKP                                    
        ::  :.: .     : ...::                                      
KIAA12 LAKKQETAAVCGETDEEAGESGGEGIFRERDEFVIRAEDIPSLKLALQTGREPPPIWRVQ
      730       740       750       760       770       780        




641 residues in 1 query   sequences
2210353 residues in 2457 library sequences
 Tcomplib [34.26] (2 proc)
 start: Fri Feb 27 10:32:51 2009 done: Fri Feb 27 10:32:52 2009
 Total Scan time:  0.650 Total Display time:  0.160

Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]