# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00080.fasta.huge -Q ../query/FLJ00080.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00080, 716 aa vs ./tmplib.10216 library 2210278 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9261+/-0.00432; mu= 18.5646+/- 0.292 mean_var=110.4662+/-24.837, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.122028 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1831 ( 663 res) hk00543 ( 663) 111 30.3 0.87 KIAA1332 ( 651 res) fh15405 ( 651) 108 29.8 1.2 KIAA0931 ( 1258 res) bf00159 (1258) 109 30.3 1.6 KIAA1726 ( 624 res) pf01109 ( 624) 95 27.5 5.9 FLJ00133 ( 1282 res) sh02303 (1282) 98 28.4 6.3 KIAA0442 ( 1266 res) hh03913 (1266) 97 28.2 7 KIAA1474 ( 1079 res) fj03364 (1079) 93 27.4 10 FLJ00260 ( 922 res) sh05833 ( 922) 92 27.2 11 KIAA1869 ( 935 res) hh01800 ( 935) 92 27.2 11 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 92 27.3 13 KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051) 91 27.1 13 KIAA0953 ( 789 res) hj05484 ( 789) 89 26.6 14 KIAA0011 ( 924 res) ha00409 ( 924) 89 26.6 15 KIAA1779 ( 1233 res) hg04229 (1233) 90 27.0 16 KIAA0915 ( 846 res) hk06275s1 ( 846) 88 26.4 17 FLJ00078 ( 103 res) as00078 ( 103) 77 23.3 18 FLJ00334 ( 645 res) sj04320 ( 645) 86 25.9 18 KIAA1737 ( 400 res) pj00125 ( 400) 83 25.1 19 KIAA1676 ( 735 res) fh07095 ( 735) 85 25.8 22 KIAA1249 ( 949 res) hh04184 ( 949) 86 26.1 23 KIAA0677 ( 1073 res) hk02635 (1073) 86 26.2 24 KIAA1868 ( 463 res) fj22550 ( 463) 81 24.8 27 KIAA1960 ( 871 res) hk03842 ( 871) 84 25.7 27 KIAA0954 ( 1183 res) hj05543s1 (1183) 85 26.1 29 KIAA0977 ( 1207 res) hj07018 (1207) 85 26.1 29 FLJ00324 ( 376 res) sj01157 ( 376) 79 24.4 30 KIAA0815 ( 1640 res) sh06087 (1640) 86 26.4 31 KIAA1440 ( 1377 res) hg02441b (1377) 85 26.2 32 KIAA0936 ( 640 res) hh04647 ( 640) 81 25.0 33 KIAA1083 ( 584 res) hj07423 ( 584) 80 24.8 35 KIAA1418 ( 889 res) hj05336(revised) ( 889) 82 25.4 35 KIAA2011 ( 1091 res) pj02017 (1091) 83 25.7 35 KIAA0298 ( 901 res) hf00341(revised) ( 901) 82 25.4 36 FLJ00345 ( 339 res) sf00014 ( 339) 77 24.0 36 FLJ00362 ( 638 res) sh04538 ( 638) 80 24.8 37 FLJ00150 ( 1793 res) sh05613 (1793) 85 26.3 37 KIAA1809 ( 800 res) fk01629 ( 800) 81 25.2 37 KIAA1076 ( 804 res) hj06779 ( 804) 81 25.2 37 FLJ00151 ( 302 res) sh05780 ( 302) 76 23.7 38 FLJ00235 ( 141 res) sj07209 ( 141) 72 22.6 39 KIAA0616 ( 634 res) hg03623 ( 634) 79 24.7 41 KIAA0497 ( 239 res) hg00150 ( 239) 74 23.2 42 FLJ00386 ( 811 res) sj04204 ( 811) 80 25.0 43 KIAA0322 ( 1614 res) hg00462s1 (1614) 83 25.9 45 KIAA1966 ( 480 res) fh23421 ( 480) 77 24.2 45 KIAA0176 ( 265 res) ha03941 ( 265) 74 23.3 45 FLJ00134 ( 341 res) sh02437 ( 341) 75 23.6 46 KIAA1356 ( 519 res) fj01605 ( 519) 77 24.2 47 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 78 24.5 49 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 76 24.0 50 >>KIAA1831 ( 663 res) hk00543 (663 aa) initn: 82 init1: 54 opt: 111 Z-score: 107.5 bits: 30.3 E(): 0.87 Smith-Waterman score: 111; 30.464% identity (46.358% similar) in 151 aa overlap (17-161:495-637) 10 20 30 40 FLJ000 PGSSRSRHPLLLLIWSLGSSQGPHRQIRPPPPCRH----AGTHVPS : :: . :: :: :: .: . : KIAA18 DSEGSDTEPLDEDSPGVYENGLTPSEGSPELPSSPASSRQPWRPPACRSPLPPGGDQGPF 470 480 490 500 510 520 50 60 70 80 90 100 FLJ000 PLPHTQVHRRRQAYAHLSLVCFRRGAAQWFGVSGDWEGQRQQWQRRSLHHCSMRYGRLKA :.. .. : :. . . : . :..: : :. : :: : :. 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KIAA04 TGIHPMNSISSLDRTRMMTPFMGISPLPGGER--FPYPSFHWDPIR-DPLRDP-YRELDI 1040 1050 1060 1070 1080 1090 120 130 140 150 160 FLJ000 PSQE--APSFQGTESP-KPCKMPKIVDPLARGRAFRHPEEMDRPHALHPPLTPGVLSLTS .. . .: ..: . . :.. . :.:: : : : : : ::. KIAA04 HRRDPLGRDFLLRNDPLHRLSTPRLYEA---DRSFRDREPHDYSHHHHHHHHP--LSVDP 1100 1110 1120 1130 1140 170 180 190 200 210 220 FLJ000 FTSVRSGYSHLPRRKRMSVAHMSLQAAAALLKGRSVLDAT--GQRCRVVKRSFAFPSFLE . : .:: .:.:. :: :. . .:: :. :. . . ..::. 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