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Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
FLJ00056, 1310 aa
vs ./tmplib.10216 library
2209684 residues in 2457 sequences
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Lambda= 0.077387
FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
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>>FLJ00128 ( 1546 res) sh01521 (1546 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ001 PRFVHKEGLMVGHQPSTLPPELPSGPPGLPSPPLPEEALGTRSPGDGHNAPVEGPEGEYV
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40 50 60 70 80 90
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
FLJ001 ELLEVTLPVRGSPTDAEGSPGLSRVRTVPTRKGAGGKGRHRRHRAWMHQKGLGPRGQDGA
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100 110 120 130 140 150
FLJ000 RPPGEGSSTGASPESPPGAEAVPEAAVLEVSEPPAEAVGEASGSCPLRPGELRGGGGGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ001 RPPGEGSSTGASPESPPGAEAVPEAAVLEVSEPPAEAVGEASGSCPLRPGELRGGGGGGQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ001 GAEGPPGTPRRTGKGNRRKKRAAGRGALSRGGDSAPLSPGDKEDASHQEALGNLPSPSEH
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220 230 240 250 260 270
FLJ000 KLPECHLVKEEYEGSGKPESEPKELKTAGEKEPQLSEACGPTEEGAGERELEGPGLLCMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ001 KLPECHLVKEEYEGSGKPESEPKELKTAGEKEPQLSEACGPTEEGAGERELEGPGLLCMA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ001 GHTGPEGPLSDTPTPPLETVQEGKGDNIPEEALAVSVSDHPDVAWDLMASGFLILTGGVD
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340 350 360 370 380 390
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ001 QSGRALLTITPPCPPEEPPPSRDTLNTTLHYLHSLLRPDLQTLGLSVLLDLRQAPPLPPA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ001 ADPRLTALQRDGGAILMRLRSTPSSKLEGQGPATLYQEVDEAIHQLVRLSNLHVQQQEQR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ001 LEENATSQKVLDIFEQRLEQVESGLHRALRLQRFFQQAHEWVDEGFARLAGAGPGREAVL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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FLJ000 LQQPLEQLTRYGRLLEELLREAGPELSSECRALGAAVQLLREQEARGRDLLAVEAVRGCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
FLJ001 MGLTENIGDSGLCFELWFRRRRAREAYTLQATSPEIKLKWTSSIAQLLWRQAAHNKELRV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:: :: . : . .. : . ::: .
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FLJ000 PLSP--GDKEDASHQEA--LGNLPSPSEHKLPECHLVKEEYEGSGKPESEPKELKTAGEK
: . :: . .. . . :.. :.:: . : . .. ..: ::. . .:.
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:. . : . :: . . : : :::. . ::.. :.: : .
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: .. :. :.:.:::. : : : .:::.: . : . : . : :
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::.:. ::..:.:::.::.: : : .:. .:::::... . : ::. . ..
FLJ000 YLRSIPRPEVQALGLTVLVDARICAP-SSSLFSGLSQLQEAAPGAVYQVLLVGSTLLKEV
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:. :.: .. :.. : .. : ::: . :....... : . ::..
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. .. ::: .... .: : :: . . .:.:: .: :. :: .:: : :..
FLJ000 ALLQGAIESVKAVPQPMEPGEVGQLLQQTEVLMQQVLDSPWLAWLQCQGGRELTWLKQEV
360 370 380 390 400 410
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.:. . . ::..:: .:::. :: ..: : : :. :.:. :
FLJ000 PEVTLSPDYRTAMDKADELYDRVDGLLHQLTLQSNQRIQALELVQTLEARESGLHQIEVW
420 430 440 450 460 470
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FLJ000 LSGPGEEQLASFAMPGDTLSALQETELRFRAFSAEVQERLAQAREAL-------ALEENA
:. : : . : .:. : ... :. . .::.. :... : : : .
FLJ000 LQQVGWPALEEAGEP--SLDMLLQAQGSFQELYQVAQEQVRQGEKFLQPLTGWEAAELDP
480 490 500 510 520
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. . : . : . : : . : : :: ..:..: :..:: .:.: ::
FLJ000 PGARFLALRAQLTEFSRALAQRCQRLADAERLFQLFREALTWAEEGQRVLAELEQERPG-
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FLJ000 EAVLAALALR--RAPEPSAGTFQEMRALALDLGSPAALREWGRCQARCQELERRIQQHLG
.:: : :. : :. . :..: ::: ::: : .: ::::. ..:.:
FLJ000 -VVLQQLQLHWTRHPDLPPAHFRKMWALATGLGSEAIRQECRWAWARCQDTWLALDQKL-
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::: . : : : .:: . . :. ::.: : .
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. : :. : :.. .: : : . :.. : :
FLJ000 NLGQSLSEPACHCHHAATIA-------------ACRRPEA---GGGALPQASPTVPPPGS
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FLJ000 ERKRSISAQQRLVSELIACEQDYVATLSEPVPPPGPEL----TPE-LRGTWAAALSARER
::.. : ...:..: :..:: .: . ::: .:. ::: : .. :.
FLJ000 SDPRSLNRLQLVLAEMVATEREYVRALEYTMENYFPELDRPDVPQGLRGQRAHLFGNLEK
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::.:: :::::..:. :: :.. :::: ::..:: : :.. . . ... . . :
FLJ000 LRDFHCHFFLRELEACTRHPPRVAYAFLRHRVQFGMYALYSKNKPRSDALMSSYGHTFFK
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...: : .: : : .:.... .:. ::.:: : : ..: :: : .:.. :
FLJ000 DKQQALGDHLDLASYLLKPIQRMGKYALLLQELARACGGP-TQELSALREAQSLVHFQLR
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.: ::::..:..::...:::::::...: :.: ::.: .:..::::.:::::: .
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