# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00055.fasta.huge -Q ../query/FLJ00055.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. 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KIAA07 GTASSQMVLRGMDLLLECIASGVPTPDIAWYKKGGDLPSDKAKFENFNKALRITNVSEED 320 330 340 350 360 370 690 700 710 720 730 740 FLJ000 AGDDTYVCTAQNLLGSISTIGRLQVEGARV-VAEP-GLDVPEGAALNLSCRLLGGPGPVG .:. : : :.: .::: ..:..: . :: .: . : : :: :.: : KIAA07 SGE--YFCLASNKMGSIRHTISVRVKAAPYWLDEPKNLILAPGEDGRLVCRANGNPKP-- 380 390 400 410 420 430 750 760 770 780 790 FLJ000 NSTFAWFWNDRRLH-AEPVP-------TLAFTHVARAQAGMYHCLAELPTGAAASAPVML : :. : . :. : : : :. : . .. ..:.: . : . . KIAA07 --TVQWMVNGEPLQSAPPNPNREVAGDTIIFRDTQISSRAVYQCNTSNEHGYLLANAFVS 440 450 460 470 480 800 810 820 830 840 850 FLJ000 RVLYPPK--TP-TMMVFVEPEGGLRGILDCRVDSEPLASLTLHLGSRLVASSQPQGAPAE . ::. .: .... : . : ::: . :. .: : ..: .. . KIAA07 VLDVPPRMLSPRNQLIRVILYNRTR--LDCPFFGSPIPTL------RWFKNGQGSNLDG- 490 500 510 520 530 860 870 880 890 900 910 FLJ000 PHIHVLASPNALRVDIEALRPSDQGEYICSASNVLGSASTSTYFGVRALHRLHQFQQLLW . :: . . ..:. .: ::: : : :.:.::.: ... . :. :.... . KIAA07 GNYHVYENGS---LEIKMIRKEDQGIYTCVATNILGKAENQVRLEVKDPTRIYRMPEDQV 540 550 560 570 580 590 920 930 940 950 960 970 FLJ000 VLGLLVGLLLLLLGLGACYTWRRRRVCKQSMGENSVEMAFQKETTQLIDPDAATCETSTC KIAA07 ARRGTTVQLECRVKHDPSLKLTVSWLKDDEPLYIGNRMKKEDDSLTIFGVAERDQGSYTC 600 610 620 630 640 650 >>KIAA1867 ( 779 res) fj18636 (779 aa) initn: 161 init1: 75 opt: 186 Z-score: 177.4 bits: 44.0 E(): 0.00011 Smith-Waterman score: 224; 22.678% identity (49.676% similar) in 463 aa overlap (298-722:89-529) 270 280 290 300 310 320 FLJ000 LGLLLCRVDSDPPAQLRLLHGDRLVASTLQGVGGPEGSSPRLHVAVAPNTL----RLEIH ::: .: :. :. : : .:.: KIAA18 VVVSGQPVTLLCAIPEYDGFVLWIKDGLALGVGRDLSSYPQ--YLVVGNHLSGEHHLKIL 60 70 80 90 100 110 330 340 350 360 370 FLJ000 GAMLEDEGVYICEASNTLGQ---ASASADFDAQAVNVQVWPGATVREGQLVNLTC----- : :.:..:: :.: .. . : .. . . : ..: :. .:::: KIAA18 RAELQDDAVYECQAIQAAIRSRPARLTVLVPPDDPVILGGPVISLRAGDPLNLTCHADNA 120 130 140 150 160 170 380 390 400 410 420 FLJ000 -----LVW-----TTHPAQLTYTWYQDGQQRLDAHSIPLPNVTVRDATSYRCGVGPPGRA ..: . . : . : .::... . .. . :... : : . . KIAA18 KPAASIIWLRKGEVINGATYSKTLLRDGKRESIVSTLFISPGDVENGQSIVCRATNKAIP 180 190 200 210 220 230 430 440 450 460 470 480 FLJ000 PRLSRPITLDVLYAPR-NLRLTY--LLESHGGQLALVLCTVDSRPPA-QLALSHAGRLLA .:.:. . : :: . .::.. .. :.. . : . : .. :... KIAA18 GGKETSVTIDIQHPPLVNLSVEPQPVLEDN---VVTFHCSAKANPAVTQYRWAKRGQIIK 240 250 260 270 280 290 490 500 510 520 530 FLJ000 SSTAASVPNTLRLELRGPQPRDEGFYSCSARSPLGQANTSLELRLE-GVRVILAPEAA-V ... .:. . .: :: . . ::..: : . . : :. :.. : KIAA18 EASGEVYRTTVDYTYFS-EP-----VSCEVTNALGSTNLSRTVDVYFGPRMTTEPQSLLV 300 310 320 330 340 540 550 560 570 580 590 FLJ000 PEGAPITVTCADPAAHAPTL-YTWYHNGRWLQEGPAASLSFLVATRAHAGAYSCQAQDAQ :. .:: . :.: .:.. : . . .:.. . . :: : :.: . KIAA18 DLGSDAIFSCA--WTGNPSLTIVWMKRGSGVVLSNEKTLTLKSVRQEDAGKYVCRAVVPR 350 360 370 380 390 400 600 610 620 630 640 650 FLJ000 GTRSSRPAALQVLYAPQDAVLSSFRDSRARS--MAVIQCTVDSEPPAE-LALSHDGKVLA . : ..: : : ..:: . ..: . :.: . : :: . .: : .:: KIAA18 VGAGEREVTLTVNGPP---IISSTQTQHALHGEKGQIKCFIRSTPPPDRIAWSWKENVLE 410 420 430 440 450 460 660 670 680 690 700 FLJ000 T-SSG---VHSLASGTGHVQV--ARNALRLQVQDVPAGDDTYVCTAQNLLGSISTIGRLQ . .:: :..... : ... : .: . : . : ::: : .:: . : ::. KIAA18 SGTSGRYTVETISTEEGVISTLTISNIVRADFQTI------YNCTAWNSFGSDTEIIRLK 470 480 490 500 510 710 720 730 740 750 760 FLJ000 VEGARVVAEPGLDVPEGAALNLSCRLLGGPGPVGNSTFAWFWNDRRLHAEPVPTLAFTHV .:... . ::. KIAA18 EQGSEMKSGAGLEAESVPMAVIIGVAVGAGVAFLVLMATIVAFCCARSQRNLKGVVSAKN 520 530 540 550 560 570 >>KIAA1132 ( 2092 res) hh01132s1 (2092 aa) initn: 226 init1: 95 opt: 182 Z-score: 169.9 bits: 44.0 E(): 0.00029 Smith-Waterman score: 427; 24.053% identity (49.443% similar) in 898 aa overlap (3-808:88-934) 10 20 FLJ000 REAAGSP-ANFSWFR---NGV--------LWA ::::: : . :. . . . : KIAA11 EDVGTSLYFVNDSLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPHIRHVHA 60 70 80 90 100 110 30 40 50 60 70 FLJ000 QGPLETVTLLPVARTDAAL---YACRILTEAGAQLSTPVLL--SVLYPPDRPKLSALLDM .: :. . : : .. : : . :: .. .: . .:. : .. .: KIAA11 NGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAG-KIRSPNIRVKAVFREPYTVRVEDQRSM 120 130 140 150 160 170 80 90 100 110 120 130 FLJ000 GQGHMALFICTVDSRPLALLALFHGEHLLATSLGPQVPSHGRFQAKAEANSLKLEVRELG .:..:.: : . : ... :. ..:. :. .:: ... : . .. KIAA11 -RGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKD-TVSIIPE----NRFFITYHGG---LYISDVQ 180 190 200 210 220 140 150 160 170 180 FLJ000 LGDS-GSYRCEATNVLGSSNTSLFFQVRGAWVQVS-P------------SPELQEGQAVV :. ..::: :. :..: : :: ..:. : : :. :..: KIAA11 KEDALSTYRC-ITKHKYSGETR---QSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVE 230 240 250 260 270 280 190 200 210 220 230 FLJ000 LSCQVHTGVPEGTSYRWYRDGQPLQESTSATLRFAAITLTQ-----AGAYHCQAQAPGSA : : . .: : . :: .::.:: .. : :....:... .:.: :.. . KIAA11 LPCTA-SGYPI-PAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEV----TN 290 300 310 320 330 240 250 260 270 280 290 FLJ000 TTSLAAPISLHVSYAPRHVTLTTL-MDTGPGRLGLLLCRVDSDPPAQLRLLHGDRLVAST : . : .. . : ::::: . :: : .: : . ..: .: .. .:: KIAA11 TFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPD 340 350 360 370 380 390 300 310 320 330 340 350 FLJ000 LQGVGGPEGSSPRLHVAVAPNTLRLEIHGAMLEDEGVYICEASNTLGQASASADFDAQAV :. : : ... .:: : .:. :.: : :. .:... :: :. KIAA11 -------EAISIR---GLSNETLL--ITSAQKSHSGAYQCFATR---KAQTAQDFAIIAL 400 410 420 430 440 360 370 380 390 FLJ000 N------VQVWPGATVREGQLVNLTCLVWTTHPAQLTYTW-------YQDGQQRL----- . :. . .: :. .: : . . : : :: .::..: KIAA11 EDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPP--TVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTM 450 460 470 480 490 500 400 410 420 430 440 450 FLJ000 -DAHSIPLPNVT---VRDATSYRCGV-GPPGRAPRLSRPITLDVLYAPRNLRLTYLLESH :. .: ::: .::. ::: . . : : .: ..: .: ..: . . KIAA11 SDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQAR---INV-RGPPSIRAMRNITAV 510 520 530 540 550 460 470 480 490 500 510 FLJ000 GGQLALVLCTVDSRPPAQLALSHAGRLLASSTAASVPNTLRLELRGPQP-RDEGFYSCSA .:. .:. : : . : .. . . :: .. : .. :.: : ::: : ::. KIAA11 AGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDEGEYLCSV 560 570 580 590 600 610 520 530 540 550 560 FLJ000 R-SPLGQANTSLELRLEGVRVILAPEAAVPE--GAPITVTCADPAAHAPTLYTWYHNGRW .: . . :... .. : .. : : : . . :. .. : :: ..:. KIAA11 LIQPQLSISQSVHVAVK-VPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQV 620 630 640 650 660 670 570 580 590 600 610 FLJ000 LQEGPA---------ASLSFLVATRAHAGAYSCQAQDAQGTRSSRPAALQVLYAPQDAVL . : . .::.. .. : : :.: :..: .: :: : : :. .: KIAA11 IISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAAT-VSRERQLIVRVPPRFVVQ 680 690 700 710 720 730 620 630 640 650 660 670 FLJ000 SSFRDSRARSMAVIQCTVDSEPPAELALSHDGKVLATSSGVHSLASGTGHVQVARNALRL . .:. . .:..:.::. :: .. .: .: .. . : . ::..:. :. : KIAA11 PNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKH-AKGSGNPQQYHPVPL-TGRIQILPNS-SL 740 750 760 770 780 790 680 690 700 710 720 730 FLJ000 QVQDVPAGD-DTYVCTAQNLLGS-ISTIGRLQVE-GARVVAEPGLDVP-EGAALNLSCRL .. : : :.: :.: .:. :: : :. : ....:. . .: : .:.: KIAA11 LIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTA 800 810 820 830 840 850 740 750 760 770 780 FLJ000 LGGPGPV------GNSTFAWFWNDRRLHA---------EPVPTLAFTHVARAQAGMYHCL : :. :.... :: .. : : :: . . :... .. : KIAA11 RG-ERPIIIRWEKGDTVID---PDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCH 860 870 880 890 900 790 800 810 820 830 840 FLJ000 AELPTGAAASAPVMLRVLYPPKTPTMMVFVEPEGGLRGILDCRVDSEPLASLTLHLGSRL : . . . . ..: : :: : . . KIAA11 A-INSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNK 910 920 930 940 950 960 >>KIAA1496 ( 920 res) fj09513 (920 aa) initn: 127 init1: 60 opt: 169 Z-score: 160.8 bits: 41.1 E(): 0.00093 Smith-Waterman score: 256; 21.696% identity (47.732% similar) in 507 aa overlap (174-628:26-507) 150 160 170 180 190 200 FLJ000 CEATNVLGSSNTSLFFQVRGAWVQVSPSPELQEGQAVVLSC--QVHTGVPEGTSYRWYRD ..:::.::: : :.: :: : . KIAA14 IVSREAKLQFAYLENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHSGE---LSYAWIFN 10 20 30 40 50 210 220 230 240 FLJ000 GQP--LQEST-------SATLRFAAITLTQAGAYHCQAQAPGSATTSLAAPISLHVS--- : ..:.. .. : .. . ...: : : . . . . :..: : . KIAA14 EYPSFVEEDSRRFVSQETGHLYISKVEPSDVGNYTCVVTSMVTNARVLGSPTPLVLRSDG 60 70 80 90 100 110 250 260 270 280 290 300 FLJ000 ----YAPR-HVTLTTLMDTGPGRLGLLLCRVDSDPPAQLRLLHGDRLVASTLQGVGGPEG : :. .: . . .. : : : . ..: :. ..: : : . KIAA14 VMGEYEPKIEVQFPETLPAAKGSTVKLECFALGNPIPQINWRRSD----------GLPFS 120 130 140 150 160 310 320 330 340 350 360 FLJ000 SSPRLHVAVAPNTLRLEIHGAMLEDEGVYICEASNTLGQASASADFDAQAVNVQVWPGAT :. .:. . ::: . . :: : : : : :. :. : . . : : KIAA14 SKIKLR----KFSGVLEIPNFQQEDAGSYECIAENSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQ---L 170 180 190 200 210 370 380 390 400 410 FLJ000 VREGQLVNLTCLVWTTHPA---QLTYTWYQDG-----QQR--LDAHSIPLPNVTVRDATS ... ... : : . . . .: : ..: ..: .. .. . :..: :. KIAA14 IKDVEIAVEDSLYWECRASGKPKPSYRWLKNGAALVLEERTQIENGALTISNLSVTDSGM 220 230 240 250 260 270 420 430 440 450 460 470 FLJ000 YRCGVGPPGRAPRLSRPITLDVLYAPRNLR--LTYLLESHGGQLALVLCTVDSRPPAQLA ..: .. .. : : :: . . :.. . :.:. . : . : : . KIAA14 FQC-IAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPMKKLVQVQVGSLVSLDCKPRASPRALSS 280 290 300 310 320 330 480 490 500 510 520 530 FLJ000 LSHAGRLLASSTAASVPNTLRLELRGPQPRDEGFYSCSARSPLGQANTSLELRL-EGVRV ... . :. : :.. . : : :.: :.. .:.:: . .: . : .:. KIAA14 WKKGDVSVQEHERISLLNDGGLKIANVTKADAGTYTCMAENQFGKANGTTHLVVTEPTRI 340 350 360 370 380 390 540 550 560 570 FLJ000 ILAPEAA-VPEGAPITVTCADPAAHAPTL---YTWYHNG----------RWLQEGPAASL ::: : : . . : . : : : .::: :: .. . : ..: KIAA14 TLAPSNMDVSVGESVILPCQ--VQHDPLLDIIFTWYFNGALADFKKDGSHFEKVGGSSSG 400 410 420 430 440 450 580 590 600 610 620 630 FLJ000 SFLVAT--RAHAGAYSCQAQDAQGTRSSRPAALQVLYA----PQDAVLSSFRDSRARSMA .... . :.: : :..: :. : :: .. . :... .. . :. :. KIAA14 DLMIRNIQLKHSGKYVCMVQ--TGVDSVSSAADLIVRGSPGPPENVKVDEITDTTAQLSW 460 470 480 490 500 510 640 650 660 670 680 690 FLJ000 VIQCTVDSEPPAELALSHDGKVLATSSGVHSLASGTGHVQVARNALRLQVQDVPAGDDTY KIAA14 KEGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQTVTTVPEVIDGKTHTATVVELNPWVEYEFRVVAS 520 530 540 550 560 570 >>KIAA0657 ( 1237 res) hk01859s1 (1237 aa) initn: 283 init1: 87 opt: 167 Z-score: 157.8 bits: 41.0 E(): 0.0014 Smith-Waterman score: 318; 23.783% identity (50.348% similar) in 719 aa overlap (40-695:424-1087) 10 20 30 40 50 60 FLJ000 FSWFRNGVLWAQGPLETVTLLPVARTDAALYACRILTEAGAQLSTPVLL--SVLYPPDRP : :: : .: : :.. :. : KIAA06 VGSEDWIQCFSIEKAGAVEVPGDCVPSEGDYRFRICTVSGHGRSPHVVFHGSAHLVPTAR 400 410 420 430 440 450 70 80 90 100 110 120 FLJ000 KLSALLDMG--QGHMALFICTVDSRPLALLALF-HGEHLLATSLGPQV-PSHGRFQAKAE ...: :. .:. :.: ..: . . : .::.: .. :: :. :.. . . 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