# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00052.fasta.huge -Q ../query/FLJ00052.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00052, 368 aa vs ./tmplib.10216 library 2210626 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4719+/-0.00683; mu= 5.6914+/- 0.458 mean_var=267.9683+/-61.203, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 80 in 1/39 Lambda= 0.078349 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0449 ( 1628 res) ff06247 (1628) 177 33.1 0.16 KIAA0775 ( 639 res) hk05255 ( 639) 155 30.1 0.5 KIAA1328 ( 585 res) fh14746s1 ( 585) 152 29.7 0.6 KIAA1708 ( 1657 res) fj17878y1 (1657) 159 31.1 0.64 KIAA1446 ( 645 res) fg06734 ( 645) 151 29.7 0.69 KIAA0670 ( 1286 res) hk02359s1 (1286) 149 29.8 1.2 KIAA1937 ( 704 res) fk04595 ( 704) 135 27.9 2.6 KIAA1167 ( 834 res) hj01786(revised) ( 834) 136 28.1 2.6 KIAA0866 ( 1984 res) hk00546s1 (1984) 142 29.3 2.7 KIAA1256 ( 1676 res) hh15293 (1676) 140 29.0 2.9 FLJ00125 ( 156 res) sh01178 ( 156) 122 25.5 2.9 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 135 28.2 3.4 KIAA1398 ( 1586 res) ha02572 (1586) 136 28.5 3.8 KIAA0105 ( 192 res) ha00682 ( 192) 120 25.4 3.9 KIAA2012 ( 555 res) ah04096 ( 555) 122 26.3 6.1 KIAA0445 ( 1919 res) hg00102s1 (1919) 130 27.9 6.8 KIAA0985 ( 697 res) hj08038 ( 697) 122 26.4 7 KIAA0268 ( 1193 res) ha07061 (1193) 125 27.1 7.6 FLJ00155 ( 612 res) sh06465 ( 612) 119 26.0 8.2 KIAA0004 ( 1307 res) ha00065 (1307) 124 27.0 8.7 KIAA0949 ( 1559 res) af07325 (1559) 124 27.1 9.6 KIAA1482 ( 818 res) fj06205 ( 818) 119 26.2 9.8 KIAA1052 ( 1456 res) hh04964 (1456) 123 27.0 10 KIAA0864 ( 1402 res) hk06577s1 (1402) 122 26.8 11 FLJ00316 ( 649 res) sh06964 ( 649) 116 25.7 11 KIAA1009 ( 1345 res) hj03795(revised) (1345) 121 26.7 11 KIAA1561 ( 1416 res) fh20178s1 (1416) 120 26.6 12 KIAA1537 ( 619 res) fj02581s1 ( 619) 113 25.3 13 KIAA0314 ( 1899 res) af02425 (1899) 121 26.9 14 FLJ00279 ( 563 res) sh01691 ( 563) 110 24.9 16 FLJ00085 ( 292 res) as00085 ( 292) 105 24.0 16 KIAA1273 ( 606 res) hk09394 ( 606) 108 24.8 19 FLJ00150 ( 1793 res) sh05613 (1793) 115 26.2 21 KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 111 25.5 24 KIAA0374 ( 584 res) hh00327 ( 584) 105 24.4 24 KIAA1764 ( 1029 res) fj10485(revised) (1029) 109 25.2 24 KIAA0521 ( 1050 res) hg01387 (1050) 109 25.2 25 KIAA0148 ( 704 res) fh23975 ( 704) 106 24.6 25 KIAA0562 ( 931 res) hh01779 ( 931) 108 25.0 25 KIAA0378 ( 970 res) hh00502s1 ( 970) 108 25.0 25 KIAA1074 ( 1715 res) hj06637 (1715) 112 25.8 26 KIAA1118 ( 1165 res) hk07196(revised) (1165) 109 25.3 26 KIAA0394 ( 417 res) hf00236 ( 417) 101 23.7 27 KIAA0912 ( 1300 res) hk03560(revised) (1300) 109 25.3 28 KIAA0471 ( 413 res) hg03220 ( 413) 100 23.6 29 KIAA0802 ( 1578 res) hh07536 (1578) 110 25.6 29 KIAA1476 ( 2142 res) fj04778s1 (2142) 112 26.0 29 KIAA1574 ( 670 res) fh24775 ( 670) 103 24.2 30 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 106 24.8 30 KIAA1379 ( 457 res) fj05092s1 ( 457) 100 23.7 31 >>KIAA0449 ( 1628 res) ff06247 (1628 aa) initn: 126 init1: 75 opt: 177 Z-score: 120.9 bits: 33.1 E(): 0.16 Smith-Waterman score: 190; 27.542% identity (55.085% similar) in 236 aa overlap (61-271:584-810) 40 50 60 70 80 FLJ000 GPRSAAVRGDMSAAGLLAPAPAQAGAPPAPEYYPEEDEELESAEDDERSCR---GRESDE : :.. : : : :: .:. ::: :: KIAA04 RLKKKEVRQRRKSPEKEAFKKRAKLQQENSEETDENEAEEEEEERDESGCEEEEGRE-DE 560 570 580 590 600 610 90 100 110 120 130 140 FLJ000 DTEDASETDLAKHDEEDYVEMKEQMYQDKLASLKRQLQQLQE--GTLQEYQKRMKKLDQQ : ...:: .:. : . : :: .: ::.: ... :. :.. :.:.. : .: KIAA04 DEDSGSEESLVDSDSDP--EEKEVNFQADLADLTCEIEIKQKLIDELENSQRRLQTLKHQ 620 630 640 650 660 670 150 160 170 180 190 FLJ000 YKERI---RNAELFLQLETEQVERN------YIKEKKAAVK-EFEDKKVELKENLI---A :.:.. .: ::: ..: .: : .:: .: ..: . :....: : KIAA04 YEEKLILLQNKIRDTQLERDRVLQNLSTMECYTEEKANKIKADYEKRLREMNRDLQKLQA 680 690 700 710 720 730 200 210 220 230 240 FLJ000 ELEEKKKMIEN----EKLTMELTGDSMEVKPI---MTRKLRRRPNDPVPIPDKRRKPAPA .:. ....: :. .: .. :.: . ...:.. . . :: . : KIAA04 AQKEHARLLKNQSRYERELKKLQAEVAEMKKAKVALMKQMREEQQRRRLVETKRNREI-A 740 750 760 770 780 250 260 270 280 290 300 FLJ000 QLNYLLTDEQIMEDLRTLNKLKSPKRPASPSSPEHLPATPAESPAQRFEARIEDGKLYYD ::. :: .... . :.: :: KIAA04 QLK----KEQRRQEFQ-IRALESQKRQQEMVLRRKTQEVSALRRLAKPMSERVAGRAGLK 790 800 810 820 830 840 >>KIAA0775 ( 639 res) hk05255 (639 aa) initn: 144 init1: 76 opt: 155 Z-score: 111.7 bits: 30.1 E(): 0.5 Smith-Waterman score: 155; 20.213% identity (50.355% similar) in 282 aa overlap (85-355:246-520) 60 70 80 90 100 110 FLJ000 GAPPAPEYYPEEDEELESAEDDERSCRGRESDEDTEDASETDLAKHDEEDYVEMKEQMYQ :: . . :. : . : ....:.. : KIAA07 PCTDLDLHYLALRGGSGLSHAGWPGSTPSVSDLERRRLEEALEAAQGEARGAQLREEQLQ 220 230 240 250 260 270 120 130 140 150 160 170 FLJ000 DKLASLKRQLQQLQEGTLQEYQKRMKKLDQQYKERIRNAELFLQLETEQVERNYIKEKKA . :. .:.:::: :. . ... :. . .:. . .. : : .. .. . .. 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KIAA13 IANLIKEL--ARVSEEKEVTEERLKAEQESFEKKIRQLEEQNELIIKEREA-LQLQYREC 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 FLJ000 ERNYIKEKKAAVKEFEDKKVELKENLIAELEEKKKMIENEKL---TMELTGDSMEV-KPI .. .: .. : . :.: :...:.. .. : ..:: :. . . .: KIAA13 QELLSLYQKYLSEQQEKLTMSLSELGAARMQEQQVSSRKSTLQCSSVELDGSYLSIARPQ 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 FLJ000 MTRKLRRRPNDPVPIPDKRRKPAPAQLNYLLTDEQIMEDLRTLNKLKSPKRPASPSSPEH . ..::.. : :. . : : : . . :.:. : . :: . KIAA13 TYYQTKQRPKSAVQ--DSASESLIAFRNNSLKPVTLHHPKDDLDKIPSETTTCNCESPGR 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 FLJ000 LPATPAESPAQRFEARIEDGKLYYDKRWYHKSQAIYLESKDNQKLSCVISSVGANEIWVR ::.:.:. : KIAA13 KPAVPTEKMPQEELHMKECPHLKPTPSQCCGHRLAADRVHDSHPTNMTPQHPKTHPESCS 290 300 310 320 330 340 >>KIAA1708 ( 1657 res) fj17878y1 (1657 aa) initn: 130 init1: 60 opt: 159 Z-score: 109.8 bits: 31.1 E(): 0.64 Smith-Waterman score: 194; 26.752% identity (53.822% similar) in 314 aa overlap (66-356:578-873) 40 50 60 70 80 90 FLJ000 AVRGDMSAAGLLAPAPAQAGAPPAPEYYPEEDEELESAEDDERSCRGRESDEDTEDASET :..::: :..: : . : .:. :. .. KIAA17 EKRKKKSVAGKEDNTDTDQEKKEEKGVSERENNELEVEESQEVSDHEDEEEEEEEEEDDI 550 560 570 580 590 600 100 110 120 130 140 150 FLJ000 DLAKHDEEDYVEMKEQM-YQDKLASLKRQLQQLQE--GTLQEYQKRMKKLDQQYKERIRN : .. ..:. : :. :: ::.. .. :. :.. :::.. : .::.:.. 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KIAA17 LLKNQSQYEKQLKKLQQDVMEMKKTKVRLMKQMKEEQEKARLTESRRNREIAQLK----K 730 740 750 760 770 780 260 270 280 290 300 310 FLJ000 EQIMEDLRTLNKLKSPKRPASPSSPEHLPATPAESPAQRFEARIEDGKLYYD-KRWYHKS .: .: . : :.. :: .. : : : : ..: . :. : .: KIAA17 DQRKRD-HQLRLLEAQKR----NQEVVLRRKTEEVTALRRQVRPMSDKVAGKVTRKLSSS 790 800 810 820 830 320 330 340 350 360 FLJ000 QAIYLESKDNQKLSCVISSVGANEIWVRKTSDSTKMRIYLGQLQRGLFVIRRRSAA .: ..:. ::..: : . .:. . :::: ....: KIAA17 DA---PAQDTG------SSAAAVETDASRTGAQQKMRIPVARVQALPTPATNGNRKKYQR 840 850 860 870 880 KIAA17 KGLTGRVFISKTARMKWQLLERRVTDIIMQKMTISNMEADMNRLLKQREELTKRREKLSK 890 900 910 920 930 940 >>KIAA1446 ( 645 res) fg06734 (645 aa) initn: 79 init1: 48 opt: 151 Z-score: 109.2 bits: 29.7 E(): 0.69 Smith-Waterman score: 151; 24.483% identity (50.345% similar) in 290 aa overlap (27-296:21-295) 10 20 30 40 50 60 FLJ000 RRGCRSSSWGLPRTLLGRRRVPSAGGRGVRGPRSAAVRGDMSAAGLLAPAPAQAGAPPAP :. : : .:.: : :: : : .:: : KIAA14 RPGGWVCVSVCVCVCVCVRARARRYSRVSAARPGWPA-GLSFPRSAPRPGPPPP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 FLJ000 EYYPEEDEELESAEDDERSCRGRESDEDTEDASETDLAKHDEEDYVEMKEQMYQDKLASL .:. ..: .: .. : : .: : ..: :.:.. . :..: .. KIAA14 CRCSALQEQ--KGELRKRLSYTTHKLEKLE--TEFDSTRH----YLEIELRRAQEELEKV 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 FLJ000 KRQLQQLQEGTL------QEYQKRMKKLDQQYKERIRNAELFLQLETEQVERNYIKEKKA ..:...: . . :: . .. .. :.:.:. : :. : .. . .. : . KIAA14 TEKLRRIQSNYMALQRINQELEDKLYRMGQHYEEEKRA----LSHEIVALNSHLLEAKVT 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 FLJ000 AVKEFEDKKVELKE-NLIAELEEKKKMIENEKLTMELTGDSME-VKPIMTRKLRRRPN-- : ::... :. :: :.: . .. . . :: .: .: :. : .. :. KIAA14 IDKLSEDNELYRKDCNLAAQLLQCSQTYGRVHKVSELPSDFQERVSLHMEKHGCSLPSPL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 FLJ000 ------DPVP---IPDKRRKPAPAQLNYLLTDEQIMEDLRTLNKLKSPKRPASPSSPE-H : :: : .:: ::.:. :.: . .:: . ...: : : . . . KIAA14 CHPAYADSVPTCVIAKVLEKPDPASLSSRLSDASA-RDLAFCDGVEKPG-PRPPYKGDIY 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 FLJ000 LPATPAESPAQRFEARIEDGKLYYDKRWYHKSQAIYLESKDNQKLSCVISSVGANEIWVR : : .: . : KIAA14 CSDTALYCPEERRRDRRPSVDAPVTDVGFLRAQNSTDSAAEEEEEAEAAAFPAGFQHEAF 280 290 300 310 320 330 >>KIAA0670 ( 1286 res) hk02359s1 (1286 aa) initn: 113 init1: 61 opt: 149 Z-score: 104.9 bits: 29.8 E(): 1.2 Smith-Waterman score: 149; 23.707% identity (56.034% similar) in 232 aa overlap (65-282:217-441) 40 50 60 70 80 90 FLJ000 AAVRGDMSAAGLLAPAPAQAGAPPAPEYYPEEDEELESAEDDERSCRGRESDEDTEDASE ::.:: : ::::. .:.:.. . . : KIAA06 GSQPAEEEEDQETPSRNLRVRADRNLKTEEEEEEEEEEEEDDEE----EEGDDEGQKSRE 190 200 210 220 230 240 100 110 120 130 140 FLJ000 TDLAKHDEEDYVEM---KEQMYQDKLASLKRQLQQLQE--GTLQEYQKRMKK--LDQQYK . . :. .:. :. : . ..:. . . : :.. : : . . :.. .: : .: . KIAA06 APILKEFKEEGEEIPRVKPEEMMDERPKTRSQEQEVLERGGRFTRSQEEARKSHLARQQQ 250 260 270 280 290 300 150 160 170 180 190 200 FLJ000 ERIRNAELFLQLETEQVERNY-IKEKKAAV---KEFEDKKVELKENLIAELEEKKKMIEN :. .. :. : .... . .:::. . . ::.: : .:.: :. . :. KIAA06 EKEMKTTSPLEEEEREIKSSQGLKEKSKSPSPPRLTEDRK---KASLVALPEQTASEEET 310 320 330 340 350 210 220 230 240 250 260 FLJ000 EKLTMELTGDSMEVKPIMTRKLRRRPND-PVPIPDKRRKP--APAQLNYLLTDEQIMEDL . ..: .: . . . .: . :.: . .: . :. ::.... .. . KIAA06 PPPLLTKEASSPPPHPQLHSEEEIEPMEGPAPPVLIQLSPPNTDADTRELLVSQHTVQLV 360 370 380 390 400 410 270 280 290 300 310 320 FLJ000 RTLNKLKSPKRPASPSSPEHLPATPAESPAQRFEARIEDGKLYYDKRWYHKSQAIYLESK :. :.::. . : :..: KIAA06 GGLSPLSSPSDTKAESPAEKVPEESVLPLVQKSTLADYSAQKDLEPESDRSAQPLPLKIE 420 430 440 450 460 470 >>KIAA1937 ( 704 res) fk04595 (704 aa) initn: 87 init1: 59 opt: 135 Z-score: 99.1 bits: 27.9 E(): 2.6 Smith-Waterman score: 135; 20.192% identity (55.769% similar) in 208 aa overlap (66-270:18-217) 40 50 60 70 80 90 FLJ000 AVRGDMSAAGLLAPAPAQAGAPPAPEYYPEEDEELESAEDDERSCRGRESDEDTEDASET :.. : . :. . : .:. :. 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KIAA19 -----LEEEQTRVQELEERLARQKEISESNIAYEKRKAKEAMEKEKKKVQDLENRLTKQK 110 120 130 140 150 160 220 230 240 250 260 270 FLJ000 DSMEVKPIMTRKLRRRPNDPVPIPDKRRKPAPAQLNYLLTDEQIMEDLRTLNKLKSPKRP . .:.: : . .: . . .. .: .. : .. .. .:: .:.. : KIAA19 EELELKEQKEDVLNNKLSDALAMVEETQKTKATE--SLKAESLALKLNETLAELETTKTK 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 FLJ000 ASPSSPEHLPATPAESPAQRFEARIEDGKLYYDKRWYHKSQAIYLESKDNQKLSCVISSV KIAA19 MIMVEERLILQQKMVKALQDEQESQRHGFGEEIMEYKEQIKQHAQTIVSLEEKLQKVTQH 220 230 240 250 260 270 >>KIAA1167 ( 834 res) hj01786(revised) (834 aa) initn: 89 init1: 54 opt: 136 Z-score: 98.9 bits: 28.1 E(): 2.6 Smith-Waterman score: 140; 21.203% identity (53.797% similar) in 316 aa overlap (73-366:305-618) 50 60 70 80 90 FLJ000 AAGLLAPAPAQAGAPPAPEYYPEEDEELESAEDDERSCRGRESDEDTE------DASETD : .:. : .. ...:..: .: .:. 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