# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00044.fasta.huge -Q ../query/FLJ00044.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00044, 1051 aa vs ./tmplib.10216 library 2209943 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4030+/-0.00605; mu= 19.5485+/- 0.408 mean_var=227.3186+/-51.261, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.085066 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1511 ( 1253 res) fg04486(revised) (1253) 2782 355.5 3.2e-98 KIAA1577 ( 743 res) fj03457 ( 743) 2605 333.3 8.8e-92 KIAA0913 ( 1881 res) fh07519s2 (1881) 545 81.2 1.7e-15 KIAA0306 ( 1451 res) hg00063 (1451) 138 31.1 1.6 KIAA1120 ( 1024 res) hg02941 (1024) 136 30.6 1.7 KIAA0176 ( 265 res) ha03941 ( 265) 123 27.9 2.7 FLJ00201 ( 705 res) sj04110 ( 705) 128 29.3 2.8 KIAA0953 ( 789 res) hj05484 ( 789) 128 29.4 2.9 KIAA1690 ( 482 res) fh27434 ( 482) 124 28.5 3.3 KIAA0608 ( 775 res) hh00889b ( 775) 124 28.9 4.1 KIAA1423 ( 616 res) fh08369(revised) ( 616) 122 28.5 4.3 KIAA1147 ( 451 res) pf02131 ( 451) 117 27.6 5.7 KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315) 120 28.8 7.3 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 118 28.5 8.6 KIAA0442 ( 1266 res) hh03913 (1266) 117 28.4 9.2 KIAA1870 ( 832 res) hh05136b ( 832) 113 27.6 11 KIAA1866 ( 1783 res) pf09734 (1783) 117 28.7 11 FLJ00322 ( 659 res) sh08187 ( 659) 111 27.2 11 KIAA0584 ( 738 res) hj00933 ( 738) 107 26.8 17 KIAA0945 ( 797 res) hj04760 ( 797) 107 26.8 17 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 112 28.2 18 KIAA1059 ( 1297 res) hh12158 (1297) 109 27.4 18 KIAA1750 ( 431 res) pj02374 ( 431) 103 25.8 19 KIAA0991 ( 630 res) hk06065 ( 630) 105 26.4 19 KIAA1598 ( 446 res) fj09914 ( 446) 103 25.9 19 KIAA1986 ( 334 res) pg00636 ( 334) 101 25.4 20 FLJ00245 ( 167 res) sj07825 ( 167) 97 24.4 20 KIAA0199 ( 1283 res) ha03150s1 (1283) 108 27.3 20 KIAA1026 ( 519 res) fh00114 ( 519) 103 26.0 20 KIAA1614 ( 1208 res) fj12973 (1208) 107 27.1 21 FLJ00139 ( 585 res) sh03241 ( 585) 103 26.1 21 KIAA1859 ( 761 res) bm01165 ( 761) 104 26.4 22 KIAA0533 ( 1645 res) hg03784 (1645) 108 27.5 22 KIAA0602 ( 962 res) hg01082b ( 962) 105 26.7 23 KIAA0810 ( 824 res) hk05647s1 ( 824) 104 26.5 23 KIAA0487 ( 234 res) fk08362 ( 234) 97 24.6 23 KIAA1441 ( 1258 res) hg02860b (1258) 106 27.0 23 KIAA1983 ( 418 res) fk09737(revised) ( 418) 100 25.4 24 KIAA1856 ( 1134 res) fh03203 (1134) 105 26.8 24 KIAA0601 ( 886 res) hg00838a ( 886) 103 26.4 26 KIAA1442 ( 627 res) hh10127b ( 627) 101 25.9 26 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 103 26.5 26 KIAA1831 ( 663 res) hk00543 ( 663) 101 25.9 27 KIAA1187 ( 813 res) fk03027 ( 813) 102 26.2 27 KIAA1927 ( 1325 res) hj03131 (1325) 104 26.8 28 KIAA0838 ( 677 res) hk03864 ( 677) 99 25.7 32 FLJ00353 ( 1766 res) sh01144 (1766) 104 27.1 32 KIAA1029 ( 1015 res) fh00363 (1015) 101 26.3 32 KIAA1788 ( 413 res) fh22801 ( 413) 96 24.9 33 KIAA1539 ( 543 res) fg02356 ( 543) 97 25.3 34 >>KIAA1511 ( 1253 res) fg04486(revised) (1253 aa) initn: 3908 init1: 1504 opt: 2782 Z-score: 1856.7 bits: 355.5 E(): 3.2e-98 Smith-Waterman score: 4334; 56.909% identity (73.835% similar) in 1223 aa overlap (7-1051:32-1253) 10 20 30 FLJ000 RGRITLPARRGSGVGAVGV---PGRPSAEDGREGGQ : :: . : :. :: : . : KIAA15 GRPRLPSRRAPGPGRGSPLGPAGSRVLSPRPPRRHRWALARGAWPWPGSPPQPEQPPPPQ 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 FLJ000 GARE-PA-KRSGHRTEPPKEAPPRPWPRPGRMEPPAAKRSRGCPAGPEERDAGAGA---- .. . :: .:.: : . .: : : : :.. :: :.. .:.:. KIAA15 SVSQSPAMADGGEREELLSPSPVSPAKRQCSWPSPQAHHPRGSPGAAGGGAGGVGSSCLV 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 FLJ000 --ARGRGRPEALLDLSAKRVAESWAFEQVEERFSRVPEPVQKRIVFWSFPRSEREICMYS :: . .:..::: .:: :::.::.:.::::: :.:::::.:::.:::::.:::::::: KIAA15 LGARPHLQPDSLLDCAAKTVAEKWAYERVEERFERIPEPVQRRIVYWSFPRNEREICMYS 130 140 150 160 170 180 150 FLJ000 SLGY-----------------------PPP---------------------------EGE :. : ::: : KIAA15 SFQYRGGPGAGAAGGAAGASPAEEGPQPPPGAAAPAGSAPGGVAAGASPGLGAGAGAAGC 190 200 210 220 230 240 160 170 180 190 200 210 FLJ000 HDARVPFTRGLHLLQSGAVDRVLQVGFHLSGNIREPGSPGEPERLYHVSISFDRCKITSV .:: ::..::.::.:. ::::::::::.. : .. .:: :.:.::::::::::: KIAA15 GGEGLPFRRGIRLLDSGSVENVLQVGFHLSGTVTELATASEPAVTYKVAISFDRCKITSV 250 260 270 280 290 300 220 230 240 250 260 270 FLJ000 SCGCDNRDLFYCAHVVALSLYRIRHAHQVELRLPISETLSQMNRDQLQKFVQYLISAHHT .::: :.:.:::::::::::::::. ::.::::::::: ::::::::::.::::.:::: KIAA15 TCGCGNKDIFYCAHVVALSLYRIRKPDQVKLRLPISETLFQMNRDQLQKFIQYLITAHHT 310 320 330 340 350 360 280 290 300 310 320 330 FLJ000 EVLPTAQRLADEILLLGSEINLVNGAPDPTAGAGIEDANCWHLDEEQIQEQVKQLLSNGG :::::::.:::::: .:::: :::::::::::.:.: :::::::::..:::: .::.:: KIAA15 EVLPTAQKLADEILSSNSEINQVNGAPDPTAGASIDDENCWHLDEEQVKEQVKLFLSQGG 370 380 390 400 410 420 340 350 360 370 380 390 FLJ000 YYGASQQLRSMFSKVREMLRMRDSNGARMLILMTEQFLQDTRLALWRQQGAGMTDKCRQL : :...:: :::.::::::::::::::::: :.::::. : ::.::::::..:::::::: KIAA15 YCGSGKQLNSMFAKVREMLRMRDSNGARMLTLITEQFVADPRLTLWRQQGTNMTDKCRQL 430 440 450 460 470 480 400 410 420 430 440 450 FLJ000 WDELGALWVCVVLSPHCKPEERAGWLQLLSRWDKLDVCPLEEGNYSFDGPSLQPTM---- ::::::::::..:.:::: ::.. ::: :..:. :::::::.:::. . :.. .. KIAA15 WDELGALWVCIILNPHCKLEEKSCWLQQLQKWSDLDVCPLEDGNYGHELPNITNALPQSA 490 500 510 520 530 540 FLJ000 -----------------------------------------APA---------------P ::: : KIAA15 IHSPDSLSRPRRTVFTRAIEGRELHWQDSHLQRIISSDVYTAPACQRESERLLFNSQGQP 550 560 570 580 590 600 460 FLJ000 ----------------------------------------------------ELLQKGST ::::.:.: KIAA15 LWLEHVPTACARVDALRSHGYPKEALRLTVAIINTLRLQQQRQLEIYKHQKKELLQRGTT 610 620 630 640 650 660 470 480 490 500 510 520 FLJ000 CITNTEGWVGHPLDPIGCLCRALLEACRLEEETLTLYPDSGPEKRKVAYQHVPVP-GSPG ::: ::::::::::: :: .: :::::... . : . :.: .:::::: :::. 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KIAA15 REALRLAIAIVNTLRRQQQKQLEMFRTQKKELPHKNITSITNLEGWVGHPLDPVGTLFSS 120 130 140 150 160 170 490 500 510 520 530 540 FLJ000 LLEACRLEEETLTLYPD---SGPEKRKVAYQHVPVPG--SPGESYLVLALEVALLGLGQQ :.::::...:.:. . : . . ... :::.:. :::::.::.::::.::::: KIAA15 LMEACRIDDENLSGFSDFTENMGQCKSLEYQHLPAHKFLEEGESYLTLAVEVALIGLGQQ 180 190 200 210 220 230 550 560 570 580 590 600 FLJ000 RALPEGLYAQDKVVRNEEQLLALLEEVELDERLVQVLRKQAGLLLEGGPFSGFGEVLFRE : .:.:::.:.:: ::::::.. :.:.:::. ::...:::: .:::.::.::.::.. :: KIAA15 RIMPDGLYTQEKVCRNEEQLISKLQEIELDDTLVKIFRKQAVFLLEAGPYSGLGEIIHRE 240 250 260 270 280 290 610 620 630 640 650 FLJ000 SVPMHTCARYLFTALLPHDPDLAYRLALRAMRLPILETAFPAGE-PHPSPLDSIMSNRFP :::::: :.::::.::::: .:::..::::::: .::.. :.:. .: . :.. ::.: KIAA15 SVPMHTFAKYLFTSLLPHDAELAYKIALRAMRLLVLESTAPSGDLTRPHHIASVVPNRYP 300 310 320 330 340 350 660 670 680 690 700 710 FLJ000 RWFILGHLETRQCELASTMLTAAKGDPKWLHMVLGSIQQNIHSPALLFKLAQDACKTATP ::: :.:.:..::::::::::::::: . :. :: :::.:::: . .::::::: : :: KIAA15 RWFTLSHIESQQCELASTMLTAAKGDVRRLETVLESIQKNIHSSSHIFKLAQDAFKIATL 360 370 380 390 400 410 720 730 740 750 760 770 FLJ000 VSAPPDTTLLGIALELGLQVMRMTLNVMTWRRREMVRWLVSCATEIGPQALMNIMQNWYS ... :: ::: ..::::::::::::....:::::::::::.::::.: :: .:::.:.. KIAA15 MDSLPDITLLKVSLELGLQVMRMTLSTLNWRRREMVRWLVTCATEVGVYALDSIMQTWFT 420 430 440 450 460 470 780 790 800 810 820 830 FLJ000 LFTPVEAATIVAVTGTTHATLLRLQLDTSRREELWACARTLALQCAMKDPQNCALPALTL ::::.::..:::.: ...:..::.:: ..:.: . :::::::::::::::::: :::: KIAA15 LFTPTEATSIVATTVMSNSTIVRLHLDCHQQEKLASSARTLALQCAMKDPQNCALSALTL 480 490 500 510 520 530 840 850 860 870 880 890 FLJ000 CEKNHSAFEAAYQIVLDAAAGGLGHAHLFTVARYMEHRGLPLRAYKLATLALAQLSIAFN :::.: :::.:::::::::. :.....:::.:::::::: :.:::::::::...:....: KIAA15 CEKDHIAFETAYQIVLDAATTGMSYTQLFTIARYMEHRGYPMRAYKLATLAMTHLNLSYN 540 550 560 570 580 590 900 910 920 930 940 950 FLJ000 QDSHPAVNDVLWACSLSHSLGRHELSAIVPLIIRSIHCAPMLSDILRRWTLSAPGL-GPL ::.:::.:::::::.::::::..::.::.::...:..:: .::::::: ::..::. : KIAA15 QDTHPAINDVLWACALSHSLGKNELAAIIPLVVKSVKCATVLSDILRRCTLTTPGMVGLH 600 610 620 630 640 650 960 970 980 990 1000 1010 FLJ000 GARRAAKPLGADRAPLCQLLDAAVTAYITTSHSRLTHISPRHYGDFIEFLGKARETFLLA : : ..: .. :.::: :::::.. :::.:.::::::::::::..:::::.:::::::.: KIAA15 GRRNSGKLMSLDKAPLRQLLDATIGAYINTTHSRLTHISPRHYSEFIEFLSKARETFLMA 660 670 680 690 700 710 1020 1030 1040 1050 FLJ000 PDGHLQFSQFLENLKQTYKGKKKLMLLVRERFG :::.::.::..:::: ::::::::.::::::: KIAA15 HDGHIQFTQFIDNLKQIYKGKKKLMMLVRERFG 720 730 740 >>KIAA0913 ( 1881 res) fh07519s2 (1881 aa) initn: 856 init1: 247 opt: 545 Z-score: 371.5 bits: 81.2 E(): 1.7e-15 Smith-Waterman score: 761; 36.404% identity (58.427% similar) in 445 aa overlap (69-456:131-565) 40 50 60 70 80 90 FLJ000 AKRSGHRTEPPKEAPPRPWPRPGRMEPPAAKRSRGCPAGPEERDAGAGAARGRGRPE--- :.: : : .: .:.:.. : : KIAA09 FEDSDRFEEDSLCSFISEAESLCQNWRGWRKQSAG-PNSPTGGGGGGGSGGTRMRDGLVI 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 FLJ000 ALLDLSAKRVAESWAFEQVEERFSRVPEPVQKRIVFWSFPRSEREICMYSSLGYPPPEGE :..::::.:: :: ::. . ::: .: ::.:::::..:..: .:: :. .: KIAA09 PLVELSAKQVAFHIPFEVVEKVYPPVPEQLQLRIAFWSFPENEEDIRLYSCLA----NGS 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 FLJ000 HDARVPFTRGLHLLQSGAVDRVLQVGFHLSGNIREPGSPGEPERLYHVSISFDRCKITSV : : :: .:.. :: ::.:::::... : . :. :.:.. ::::..:: KIAA09 ADE---FQRGDQLFRMRAVKDPLQIGFHLSATVVPP-QMVPPKGAYNVAVMFDRCRVTSC 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 FLJ000 SCGCDNRDLFYCAHVVALSLYRIRHAHQVELRLPISETLSQMNRDQLQKFVQYLISAHHT :: : :.::::: :.::..: : :: :.::.::...:::::::.::::: KIAA09 SCTCGAGAKC-CTHVVALCLFRIHNASAVCLRAPVSESLSRLQRDQLQKFAQYLISELPQ 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 FLJ000 EVLPTAQRLADEILLLGSE-INLVNGAPDPTAGAGIEDANCWHLDEEQIQEQVKQLLS-- ..::::::: ::.: : :: : :::::::: . : . :.::: . ...:. : KIAA09 QILPTAQRLLDELLSSQSTAINTVCGAPDPTAGPSASDQSTWYLDESTLTDNIKKTLHKF 340 350 360 370 380 390 340 350 360 FLJ000 -----------NGGYYGASQQ---------LR-----------SMFSKVREMLRMRDSNG :. : .... :: ...: ::::.. ::::. KIAA09 CGPSPVVFSDVNSMYLSSTEPPAAAEWACLLRPLRGREPEGVWNLLSIVREMFKRRDSNA 400 410 420 430 440 450 370 380 390 400 FLJ000 ARMLILMTEQFLQDTRLALW---------RQQGAGMTDK-----------CRQLWDELGA : .: ..:.: : ... : .....: : . : .. ::. . KIAA09 APLLEILTDQCLTYEQITGWWYSVRTSASHSSASGHTGRSNGQSEVAAHACASMCDEMVT 460 470 480 490 500 510 410 420 430 440 450 460 FLJ000 LWVCVVLSPHCKPEERAGWLQLLSRWDKLDVCPLEEGNYSFDGPSLQPTMAPAPELLQKG :: .::.: .:..: : .:. . ...:... : : . :: : KIAA09 LWRLAVLDPALSPQRRRELCTQLRQWQLKVIENVKRGQHKKTLERLFPGFRPAVEACYFN 520 530 540 550 560 570 470 480 490 500 510 520 FLJ000 STCITNTEGWVGHPLDPIGCLCRALLEACRLEEETLTLYPDSGPEKRKVAYQHVPVPGSP KIAA09 WEEAYPLPGVTYSGTDRKLALCWARALPSRPGASRSGGLEESRDRPRPLPTEPAVRPKEP 580 590 600 610 620 630 >>KIAA0306 ( 1451 res) hg00063 (1451 aa) initn: 94 init1: 94 opt: 138 Z-score: 102.5 bits: 31.1 E(): 1.6 Smith-Waterman score: 138; 32.800% identity (53.600% similar) in 125 aa overlap (7-123:1095-1207) 10 20 30 FLJ000 RGRITLPAR-RGSGVGAVGVPGR-PSAE-DGREGGQ ::. : :. : . .. ::. : : :: KIAA03 ELEGQPTPPAPPPLPETWTPTARSSPPLPPPAEERTSAKGPETMASKFPSSSSDWRVPGQ 1070 1080 1090 1100 1110 1120 40 50 60 70 80 90 FLJ000 GAREPAKRSGHRTEPPKEAPPRPWPRPGRMEPPAAKRSRGCPAG--PEERDAGAGAARGR : . .: ::: .:: : : :. ... : : :: ::...:.. . . . KIAA03 GLE-------NRGEPP--TPPSPAPAPAVAPGGSSESSSGRAAGDTPERKEAAGTGKKVK 1130 1140 1150 1160 1170 100 110 120 130 140 FLJ000 GRPEAL---LDLSAKRVAESWAFEQVEERFSRVPEPVQKRIVFWSFPRSEREICMYSSLG :: : .: .:: :: :::...:: KIAA03 VRPPPLKKTFDSVDNRVLSEVDFE---ERFAELPEFRPEEVLPSPTLQSLATSPRAILGS 1180 1190 1200 1210 1220 1230 150 160 170 180 190 200 FLJ000 YPPPEGEHDARVPFTRGLHLLQSGAVDRVLQVGFHLSGNIREPGSPGEPERLYHVSISFD KIAA03 YRKKRKNSTDLDSAPEDPTSPKRKMRRRSSCSSEPNTPKSAKCEGDIFTFDRTGTEAEDV 1240 1250 1260 1270 1280 1290 >>KIAA1120 ( 1024 res) hg02941 (1024 aa) initn: 67 init1: 67 opt: 136 Z-score: 102.4 bits: 30.6 E(): 1.7 Smith-Waterman score: 141; 36.364% identity (59.740% similar) in 77 aa overlap (7-72:950-1024) 10 20 30 FLJ000 RGRITLPARRGSGVGAVGVPGRPSAEDGREGGQGAR :::. :.......:::: : .: :: KIAA11 AGSEHSETLSSLSLTSLFCPPPPPPAPGLTPARKFSSTSSLAAPGRPHAAALAHGL--AR 920 930 940 950 960 970 40 50 60 70 80 FLJ000 EPAKRSGHRTEPPKEAP---------PRPWPRPGRMEP--PAAKRSRGCPAGPEERDAGA :. . . .:: .:: : : : ::..:: :.::.: KIAA11 SPSWAADRSKDPPGRAPLPMGLGPLAPPPQPLPGELEPGDAASKRKR 980 990 1000 1010 1020 90 100 110 120 130 140 FLJ000 GAARGRGRPEALLDLSAKRVAESWAFEQVEERFSRVPEPVQKRIVFWSFPRSEREICMYS >>KIAA0176 ( 265 res) ha03941 (265 aa) initn: 97 init1: 97 opt: 123 Z-score: 98.6 bits: 27.9 E(): 2.7 Smith-Waterman score: 123; 41.667% identity (58.333% similar) in 60 aa overlap (31-89:16-74) 10 20 30 40 50 60 FLJ000 RGRITLPARRGSGVGAVGVPGRPSAEDGREGGQGAREPAKRSGHRTEPPKEAPPRPWPRP :: :. . .: ::. : : :: KIAA01 SKMAELQLDPAMAGLGGGGGSGVGDGGGPVRGPPSPRPAGPTPR- 10 20 30 40 70 80 90 100 110 FLJ000 GRMEPPAAKRSRGCPA-GPEERDAGAGAARGRGRPEALLDLSAKRVAESWAFEQVEERFS :. .: :: .: :. :: :: .:.:::: KIAA01 GHGRPAAAVAQRLEPGPGPPERAGGGGAARWVRLNVGGTYFVTTRQTLGREPKSFLCRLC 50 60 70 80 90 100 >>FLJ00201 ( 705 res) sj04110 (705 aa) initn: 150 init1: 90 opt: 128 Z-score: 98.4 bits: 29.3 E(): 2.8 Smith-Waterman score: 128; 32.039% identity (48.544% similar) in 103 aa overlap (2-96:318-418) 10 20 FLJ000 RGRITLPARRGSGVGAVGVPG------RPS- : ::. .:. : .:::: .:. FLJ002 AGLPGPQGPSGAKGEPGTRGPPGLIGPTGYGMPGLPGPKGDR-GPAGVPGLLGDRGEPGE 290 300 310 320 330 340 30 40 50 60 70 80 FLJ000 -AEDGREGGQGAREPAKRSGHRTEPPKEAPPRPWPRPGRMEPPAAKRSRGCPAGPEERDA .: :..: :: : : : ...:: : . : ::.. :: :: . FLJ002 DGEPGEQGPQGLGGPPGLPGSAGLPGRRGPPGPKGEAGPGGPPGVPGIRG-DQGPSGLAG 350 360 370 380 390 400 90 100 110 120 130 140 FLJ000 GAGAARGRGRPEALLDLSAKRVAESWAFEQVEERFSRVPEPVQKRIVFWSFPRSEREICM :. :: : : FLJ002 KPGVPGERGLPGAHGPPGPTGPKGEPGFTGRPGGPGVAGALGQKGDLGLPGQPGLRGPSG 410 420 430 440 450 460 >>KIAA0953 ( 789 res) hj05484 (789 aa) initn: 117 init1: 71 opt: 128 Z-score: 98.0 bits: 29.4 E(): 2.9 Smith-Waterman score: 128; 39.394% identity (60.606% similar) in 66 aa overlap (34-97:3-62) 10 20 30 40 50 60 FLJ000 ITLPARRGSGVGAVGVPGRPSAEDGREGGQGAR-EPAKRSGHRTEPPKEAPPRPWP-RPG ::: .:: : .::. :::: : :: KIAA09 AGGARLRPA-----RGRPPRLLPPRPGPCRPP 10 20 70 80 90 100 110 120 FLJ000 RMEPPAAKRSRGCPAGPEERDAGAGAARGRGRPEALLDLSAKRVAESWAFEQVEERFSRV . :.... :. : . :: . :: .:: .:: . KIAA09 PVPAPTVNERRAPPRAGWERRSDAGLSRG-ARPAEMYGVCGCCGALRPRYKRLVDNIFPE 30 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 FLJ000 PEPVQKRIVFWSFPRSEREICMYSSLGYPPPEGEHDARVPFTRGLHLLQSGAVDRVLQVG KIAA09 DPEDGLVKTNMEKLTFYALSAPEKLDRIGAYLSERLIRDVGRHRYGYVCIAMEALDQLLM 90 100 110 120 130 140 >>KIAA1690 ( 482 res) fh27434 (482 aa) initn: 119 init1: 82 opt: 124 Z-score: 97.1 bits: 28.5 E(): 3.3 Smith-Waterman score: 125; 28.378% identity (49.324% similar) in 148 aa overlap (4-137:98-241) 10 20 30 FLJ000 RGRITLPARRGS---GVGAVGVPGRPSAEDGRE .: : ..: : . ... : .:: KIAA16 PSQAAAPMATLTPRAEGHPPTHTISTIAATVTAPHSESSLSTGPAPAAMATTSSKPEGRP 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 FLJ000 GGQGA------REPAKRSGHRTEPPKEAPPRPWPRP-GRMEPPAAKRSRGCPAGPEERDA ::.: . :. : : ::. . :: ::: : . :.. :: : .: .. KIAA16 RGQAAPTILLTKPPGATSRPTTAPPRTTTRRP-PRPPGSSRKGAGNSSRPVPPAPGGHSR 130 140 150 160 170 180 90 100 110 120 130 FLJ000 GAGAARGRGRPEALLDLSAKRVAESWAFEQVEERF--SRVPEP--VQKRIVFWSFPRSER . . :::. : . :. :: . :. . : : ::: . : .:.. : KIAA16 SKEGQRGRN-PSST-PLGQKR-PLGKIFQIYKGNFTGSVEPEPSTLTPRTPLWGYSSSPQ 190 200 210 220 230 240 140 150 160 170 180 190 FLJ000 EICMYSSLGYPPPEGEHDARVPFTRGLHLLQSGAVDRVLQVGFHLSGNIREPGSPGEPER KIAA16 PQTVAATTVPSNTSWAPTTTSLGPAKDKPGLRRAAQGGGSTFTSQGGTPDATAASGAPVS 250 260 270 280 290 300 >>KIAA0608 ( 775 res) hh00889b (775 aa) initn: 146 init1: 121 opt: 124 Z-score: 95.4 bits: 28.9 E(): 4.1 Smith-Waterman score: 124; 32.222% identity (51.111% similar) in 90 aa overlap (11-99:46-135) 10 20 30 40 FLJ000 RGRITLPARRGSGVGAVGVPGRPSAEDGREGGQGAREPAK :.::::: : . . :. : .. KIAA06 CSGRNPKLLPVPAPDPVGQDRKVIRATGGFGGGVGAVEPPEEADEEEETPPRQLLQRYLA 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 FLJ000 RSGHRTEPPKEAPPRPWPRPGRMEPPAAKRSRGCPAGPEERDAGAGAARGRG-RPEALLD .:.. :: : : . : : :: :: .: : . :: .: ::. : :.. . KIAA06 AAGEQLEPGLCYCPLPAGQAGAPPPSAAPRSDACLLGSGSKHRGAEVADGRAPRHEGMTN 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 FLJ000 LSAKRVAESWAFEQVEERFSRVPEPVQKRIVFWSFPRSEREICMYSSLGYPPPEGEHDAR KIAA06 GDSGFLPGRDCRDLEEARGLARAGGRESRRRRPYGRLRLEGPGDEDADGAGSPSDWASPL 140 150 160 170 180 190 1051 residues in 1 query sequences 2209943 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:30:37 2009 done: Fri Feb 27 10:30:37 2009 Total Scan time: 0.820 Total Display time: 0.260 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]